Doublet Group distance statistics: 49704

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 6, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.028, 0.043, 0.059, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.043 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.030, 0.048, 0.065, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.048 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.028, 0.049, 0.069, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.049 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.032, 0.053, 0.074, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.053 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.037, 0.061, 0.086, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.061 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.035, 0.062, 0.089, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.062 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.041, 0.070, 0.100, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.070 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.042, 0.073, 0.105, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.073 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.058, 0.090, 0.122, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.090 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.039, 0.073, 0.106, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.073 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.121, 0.293, 0.465, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.293 std_dev=0.172
C4	B	0, 0.245, 0.444, 0.644, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.444 std_dev=0.199
N3	B	0, 0.225, 0.447, 0.669, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.447 std_dev=0.222
C6	B	0, 0.329, 0.568, 0.807, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.568 std_dev=0.239
C2'	A	0, 0.114, 0.380, 0.647, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.380 std_dev=0.266
C5	B	0, 0.224, 0.493, 0.762, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.493 std_dev=0.269
N1	B	0, 0.299, 0.574, 0.849, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.574 std_dev=0.275
C2	B	0, 0.231, 0.516, 0.801, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.516 std_dev=0.285
O2'	A	0, 0.147, 0.454, 0.761, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.454 std_dev=0.307
N9	B	0, 0.287, 0.595, 0.902, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.595 std_dev=0.308
C4'	A	0, 0.193, 0.516, 0.840, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.516 std_dev=0.324
O6	B	0, 0.374, 0.708, 1.042, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.708 std_dev=0.334
C8	B	0, 0.339, 0.722, 1.104, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.722 std_dev=0.383
C3'	A	0, 0.187, 0.577, 0.966, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.577 std_dev=0.390
C1'	B	0, 0.346, 0.737, 1.129, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.737 std_dev=0.391
N2	B	0, 0.241, 0.651, 1.061, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.651 std_dev=0.410
N7	B	0, 0.226, 0.640, 1.054, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.640 std_dev=0.414
C2'	B	0, 0.634, 1.125, 1.615, 1.620 max_d=1.620 avg_d=1.125 std_dev=0.491
C5'	A	0, 0.285, 0.812, 1.339, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.812 std_dev=0.527
O4'	B	0, 0.738, 1.267, 1.796, 1.875 max_d=1.875 avg_d=1.267 std_dev=0.529
O3'	A	0, 0.279, 0.826, 1.373, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.826 std_dev=0.547
O2'	B	0, 0.695, 1.292, 1.890, 1.918 max_d=1.918 avg_d=1.292 std_dev=0.597
C3'	B	0, 0.954, 1.616, 2.277, 2.351 max_d=2.351 avg_d=1.616 std_dev=0.661
C4'	B	0, 0.995, 1.685, 2.376, 2.339 max_d=2.339 avg_d=1.685 std_dev=0.691
OP1	A	0, 0.386, 1.166, 1.946, 2.593 max_d=2.593 avg_d=1.166 std_dev=0.780
O3'	B	0, 1.251, 2.118, 2.986, 3.067 max_d=3.067 avg_d=2.118 std_dev=0.867
O5'	B	0, 1.319, 2.230, 3.141, 3.306 max_d=3.306 avg_d=2.230 std_dev=0.911
C5'	B	0, 1.392, 2.316, 3.241, 3.265 max_d=3.265 avg_d=2.316 std_dev=0.924
O5'	A	0, 0.279, 1.341, 2.403, 2.676 max_d=2.676 avg_d=1.341 std_dev=1.062
OP2	B	0, 1.529, 2.600, 3.672, 3.926 max_d=3.926 avg_d=2.600 std_dev=1.072
P	B	0, 1.663, 2.837, 4.012, 4.209 max_d=4.209 avg_d=2.837 std_dev=1.174
P	A	0, 0.392, 1.828, 3.264, 3.565 max_d=3.565 avg_d=1.828 std_dev=1.436
OP1	B	0, 2.040, 3.527, 5.014, 5.140 max_d=5.140 avg_d=3.527 std_dev=1.487
OP2	A	0, 0.262, 2.740, 5.217, 5.810 max_d=5.810 avg_d=2.740 std_dev=2.477

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.43	0.13	0.70	0.40
C2	0.04	0.00	0.18	0.20	0.02	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.25	0.04	0.60	0.24	1.23	0.59
C2'	0.00	0.18	0.00	0.01	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.09	0.14	0.18	0.08	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.25	0.16	0.35	0.18
C3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.11	0.01	0.11	0.02	0.15	0.14	0.18	0.18	0.16	0.13	0.05	0.02	0.01	0.01	0.14	0.17	0.13	0.06
C4	0.02	0.02	0.09	0.11	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.67	0.23	1.28	0.65
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.10	0.11	0.09	0.08	0.12	0.12	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.07	0.06	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.11	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.79	0.28	1.61	0.80
C5'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.12	0.00	0.17	0.00	0.18	0.17	0.16	0.10	0.21	0.20	0.10	0.04	0.04	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.09	0.15	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.16	0.03	0.77	0.29	1.66	0.79
C8	0.01	0.02	0.09	0.14	0.00	0.11	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.16	0.03	0.87	0.28	1.56	0.85
N1	0.04	0.01	0.14	0.18	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.22	0.04	0.68	0.26	1.47	0.69
N3	0.04	0.01	0.18	0.18	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.17	0.22	0.04	0.55	0.21	1.08	0.54
N6	0.03	0.02	0.08	0.16	0.01	0.12	0.01	0.21	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.08	0.17	0.03	0.82	0.32	1.85	0.87
N7	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.12	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.90	0.32	1.82	0.92
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.67	0.21	1.17	0.63
O2'	0.01	0.18	0.01	0.02	0.08	0.04	0.06	0.04	0.09	0.06	0.14	0.17	0.08	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.08	0.10	0.04
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.11	0.02	0.11	0.04	0.16	0.16	0.22	0.22	0.17	0.14	0.05	0.04	0.00	0.02	0.24	0.14	0.52	0.33
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.35	0.08	0.55	0.36
O5'	0.43	0.60	0.25	0.14	0.67	0.02	0.79	0.01	0.77	0.87	0.68	0.55	0.82	0.90	0.67	0.04	0.24	0.35	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.13	0.24	0.16	0.17	0.23	0.07	0.28	0.08	0.29	0.28	0.26	0.21	0.32	0.32	0.21	0.08	0.14	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.70	1.23	0.35	0.13	1.28	0.06	1.61	0.02	1.66	1.56	1.47	1.08	1.85	1.82	1.17	0.10	0.52	0.55	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.40	0.59	0.18	0.06	0.65	0.02	0.80	0.01	0.79	0.85	0.69	0.54	0.87	0.92	0.63	0.04	0.33	0.36	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.16	0.32	0.32	0.14	0.18	0.14	0.17	0.19	0.15	0.20	0.19	0.13	0.14	0.15	0.39	0.52	0.25	0.12	0.22	0.13	0.24	0.12
C2	0.20	0.20	0.35	0.32	0.17	0.21	0.17	0.26	0.19	0.20	0.20	0.24	0.17	0.18	0.19	0.44	0.53	0.30	0.17	0.20	0.30	0.17	0.22
C2'	0.16	0.18	0.32	0.28	0.13	0.15	0.14	0.18	0.19	0.14	0.21	0.22	0.14	0.14	0.14	0.40	0.48	0.26	0.13	0.22	0.18	0.23	0.18
C3'	0.20	0.24	0.30	0.26	0.21	0.21	0.23	0.24	0.27	0.22	0.28	0.27	0.20	0.23	0.20	0.41	0.44	0.30	0.18	0.31	0.23	0.25	0.24
C4	0.18	0.17	0.32	0.31	0.14	0.18	0.15	0.19	0.18	0.16	0.19	0.21	0.14	0.15	0.16	0.39	0.50	0.26	0.12	0.20	0.17	0.18	0.12
C4'	0.23	0.24	0.32	0.31	0.22	0.24	0.24	0.23	0.28	0.22	0.28	0.25	0.21	0.24	0.22	0.43	0.49	0.29	0.16	0.32	0.17	0.25	0.18
C5	0.17	0.18	0.32	0.30	0.15	0.17	0.15	0.17	0.18	0.16	0.19	0.22	0.15	0.15	0.16	0.40	0.47	0.25	0.12	0.20	0.15	0.19	0.11
C5'	0.32	0.33	0.36	0.35	0.32	0.33	0.35	0.32	0.38	0.33	0.37	0.32	0.31	0.35	0.32	0.48	0.48	0.37	0.24	0.41	0.24	0.28	0.24
C6	0.19	0.20	0.35	0.30	0.17	0.18	0.17	0.20	0.19	0.19	0.20	0.23	0.17	0.18	0.19	0.45	0.49	0.28	0.13	0.20	0.20	0.16	0.15
C8	0.17	0.16	0.30	0.29	0.13	0.17	0.14	0.14	0.18	0.14	0.19	0.19	0.13	0.14	0.15	0.38	0.45	0.22	0.15	0.22	0.13	0.29	0.15
N1	0.20	0.20	0.37	0.32	0.18	0.20	0.18	0.26	0.19	0.21	0.20	0.24	0.18	0.20	0.20	0.48	0.52	0.30	0.18	0.20	0.29	0.17	0.22
N3	0.19	0.18	0.33	0.31	0.15	0.20	0.15	0.23	0.18	0.18	0.19	0.22	0.15	0.16	0.17	0.40	0.52	0.29	0.14	0.20	0.24	0.15	0.16
N6	0.19	0.21	0.38	0.30	0.19	0.16	0.20	0.19	0.21	0.21	0.21	0.24	0.19	0.20	0.20	0.49	0.46	0.28	0.14	0.21	0.19	0.17	0.15
N7	0.17	0.17	0.30	0.28	0.14	0.17	0.14	0.14	0.18	0.14	0.19	0.20	0.14	0.14	0.15	0.38	0.44	0.22	0.15	0.20	0.13	0.27	0.15
N9	0.17	0.17	0.31	0.31	0.13	0.18	0.14	0.16	0.18	0.14	0.20	0.20	0.13	0.14	0.15	0.39	0.49	0.24	0.12	0.21	0.13	0.24	0.11
O2'	0.17	0.18	0.35	0.33	0.13	0.16	0.14	0.17	0.19	0.14	0.21	0.22	0.13	0.13	0.15	0.42	0.54	0.26	0.14	0.23	0.18	0.24	0.17
O3'	0.19	0.27	0.29	0.24	0.23	0.20	0.27	0.26	0.32	0.25	0.33	0.31	0.22	0.27	0.22	0.41	0.42	0.31	0.21	0.37	0.29	0.29	0.30
O4'	0.19	0.17	0.33	0.34	0.15	0.21	0.17	0.18	0.21	0.16	0.22	0.19	0.15	0.16	0.16	0.41	0.53	0.24	0.16	0.26	0.16	0.30	0.15
O5'	0.96	1.00	1.17	1.15	0.97	0.96	0.95	0.94	0.95	0.94	0.97	1.03	0.99	0.94	0.96	1.19	1.27	0.87	1.04	0.92	1.02	1.19	1.04
OP1	0.51	0.56	0.64	0.64	0.55	0.53	0.58	0.55	0.60	0.56	0.60	0.54	0.54	0.58	0.54	0.67	0.72	0.48	0.64	0.63	0.66	0.83	0.69
OP2	2.28	2.45	2.46	2.46	2.38	2.26	2.37	2.26	2.36	2.33	2.42	2.47	2.39	2.33	2.34	2.39	2.53	2.17	2.41	2.27	2.39	2.58	2.40
P	1.11	1.19	1.33	1.32	1.15	1.12	1.14	1.11	1.14	1.12	1.18	1.22	1.16	1.12	1.13	1.33	1.43	1.01	1.22	1.11	1.21	1.38	1.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.07	0.17	0.11
C2	0.05	0.00	0.17	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.29	0.16	0.04	0.25	0.02	0.28	0.47	0.33
C2'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.01	0.09	0.11	0.13	0.20	0.17	0.09	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.09	0.07	0.07	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.11	0.02	0.09	0.21	0.06	0.15	0.11	0.20	0.08	0.02	0.01	0.01	0.04	0.14	0.09	0.07	0.04
C4	0.02	0.01	0.08	0.05	0.00	0.03	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.15	0.05	0.03	0.26	0.01	0.28	0.42	0.31
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.08	0.16	0.03	0.08	0.06	0.16	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.12	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.11	0.04	0.36	0.01	0.43	0.56	0.45
C5'	0.03	0.10	0.01	0.02	0.13	0.01	0.23	0.00	0.23	0.26	0.17	0.07	0.06	0.30	0.13	0.03	0.02	0.01	0.01	0.29	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.08	0.00	0.23	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.18	0.10	0.04	0.38	0.01	0.48	0.64	0.50
C8	0.02	0.01	0.11	0.21	0.01	0.16	0.01	0.26	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.23	0.05	0.35	0.03	0.38	0.43	0.38
N1	0.04	0.01	0.13	0.06	0.01	0.03	0.01	0.17	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.25	0.10	0.04	0.32	0.02	0.39	0.57	0.43
N2	0.07	0.01	0.20	0.15	0.02	0.08	0.01	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.35	0.23	0.06	0.22	0.03	0.24	0.45	0.30
N3	0.05	0.01	0.17	0.11	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.27	0.16	0.04	0.20	0.02	0.20	0.37	0.25
N7	0.01	0.01	0.09	0.20	0.01	0.16	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.23	0.05	0.42	0.03	0.50	0.60	0.50
N9	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.08	0.02	0.22	0.02	0.22	0.32	0.25
O2'	0.01	0.29	0.01	0.02	0.15	0.04	0.12	0.03	0.18	0.07	0.25	0.35	0.27	0.07	0.04	0.00	0.05	0.06	0.04	0.17	0.09	0.05	0.03
O3'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.10	0.23	0.10	0.23	0.16	0.23	0.08	0.05	0.00	0.01	0.09	0.16	0.15	0.18	0.11
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.05	0.02	0.06	0.01	0.00	0.06	0.06	0.04	0.16	0.10
O5'	0.09	0.25	0.04	0.04	0.26	0.01	0.36	0.01	0.38	0.35	0.32	0.22	0.20	0.42	0.22	0.04	0.09	0.06	0.00	0.44	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.02	0.09	0.14	0.01	0.12	0.01	0.29	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.17	0.16	0.06	0.44	0.00	0.58	0.74	0.60
OP1	0.07	0.28	0.07	0.09	0.28	0.06	0.43	0.06	0.48	0.38	0.39	0.24	0.20	0.50	0.22	0.09	0.15	0.04	0.02	0.58	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.47	0.07	0.07	0.42	0.03	0.56	0.02	0.64	0.43	0.57	0.45	0.37	0.60	0.32	0.05	0.18	0.16	0.01	0.74	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.33	0.05	0.04	0.31	0.02	0.45	0.02	0.50	0.38	0.43	0.30	0.25	0.50	0.25	0.03	0.11	0.10	0.01	0.60	0.01	0.00	0.00