Doublet Group distance statistics: 49705

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.007, 0.015, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.011, 0.019, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.015, 0.026, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.019, 0.030, 0.042, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.030 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.014, 0.026, 0.039, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.013, 0.028, 0.044, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.020, 0.040, 0.060, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.040 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.019, 0.045, 0.070, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.045 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.039, 0.065, 0.092, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.065 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.035, 0.063, 0.091, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.063 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.086, 0.177, 0.267, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.177 std_dev=0.091
C2'	A	0, 0.092, 0.186, 0.279, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.186 std_dev=0.093
C4'	A	0, 0.208, 0.352, 0.496, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.352 std_dev=0.144
O2'	A	0, 0.035, 0.186, 0.338, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.186 std_dev=0.151
C3'	A	0, 0.194, 0.351, 0.508, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.351 std_dev=0.157
C5'	A	0, 0.312, 0.529, 0.745, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.529 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.320, 0.549, 0.779, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.549 std_dev=0.229
C1'	B	0, 0.340, 0.572, 0.805, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.572 std_dev=0.233
C2	B	0, 0.331, 0.573, 0.815, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.573 std_dev=0.242
C4	B	0, 0.358, 0.603, 0.848, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.603 std_dev=0.245
N9	B	0, 0.362, 0.613, 0.864, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.613 std_dev=0.251
N1	B	0, 0.454, 0.707, 0.961, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.707 std_dev=0.253
O4'	B	0, 0.479, 0.743, 1.007, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.743 std_dev=0.264
N2	B	0, 0.275, 0.544, 0.813, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.544 std_dev=0.269
C5	B	0, 0.436, 0.717, 0.997, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.717 std_dev=0.280
O3'	A	0, 0.339, 0.624, 0.909, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.624 std_dev=0.285
C6	B	0, 0.509, 0.797, 1.084, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.797 std_dev=0.287
C8	B	0, 0.396, 0.704, 1.013, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.704 std_dev=0.309
N7	B	0, 0.447, 0.771, 1.094, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.771 std_dev=0.323
C4'	B	0, 0.478, 0.816, 1.154, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.816 std_dev=0.338
O3'	B	0, 0.241, 0.589, 0.936, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.589 std_dev=0.347
O6	B	0, 0.621, 0.974, 1.327, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.974 std_dev=0.353
C3'	B	0, 0.358, 0.751, 1.145, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.751 std_dev=0.394
C5'	B	0, 0.725, 1.188, 1.651, 1.832 max_d=1.832 avg_d=1.188 std_dev=0.463
O5'	B	0, 0.932, 1.421, 1.910, 2.011 max_d=2.011 avg_d=1.421 std_dev=0.489
O5'	A	0, 0.270, 0.766, 1.261, 2.049 max_d=2.049 avg_d=0.766 std_dev=0.496
C2'	B	0, 0.283, 0.780, 1.276, 2.152 max_d=2.152 avg_d=0.780 std_dev=0.496
P	B	0, 0.772, 1.348, 1.923, 2.184 max_d=2.184 avg_d=1.348 std_dev=0.575
OP2	B	0, 0.856, 1.438, 2.021, 2.251 max_d=2.251 avg_d=1.438 std_dev=0.582
O2'	B	0, 0.177, 0.946, 1.714, 2.992 max_d=2.992 avg_d=0.946 std_dev=0.768
OP1	B	0, 0.894, 1.807, 2.721, 2.861 max_d=2.861 avg_d=1.807 std_dev=0.914
P	A	0, -0.004, 0.921, 1.846, 3.765 max_d=3.765 avg_d=0.921 std_dev=0.925
OP1	A	0, 0.026, 1.055, 2.085, 4.203 max_d=4.203 avg_d=1.055 std_dev=1.030
OP2	A	0, -0.187, 1.095, 2.377, 5.094 max_d=5.094 avg_d=1.095 std_dev=1.282

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.18	0.27	0.13
C2	0.01	0.00	0.08	0.11	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.01	0.26	0.11	0.68	0.37
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.08	0.04	0.08	0.07	0.08	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.17	0.26	0.28	0.09
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.14	0.10	0.13	0.08	0.16	0.13	0.07	0.01	0.00	0.01	0.25	0.19	0.26	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.10	0.01	0.26	0.14	0.64	0.38
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.09	0.06	0.03	0.10	0.10	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.30	0.07	0.11
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.02	0.31	0.28	0.80	0.52
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.16	0.12	0.07	0.18	0.18	0.09	0.03	0.03	0.02	0.01	0.08	0.10	0.02
C6	0.02	0.00	0.08	0.14	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.17	0.02	0.33	0.31	0.87	0.55
C8	0.01	0.02	0.04	0.10	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.11	0.03	0.29	0.29	0.68	0.49
N1	0.01	0.00	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.02	0.31	0.22	0.80	0.48
N3	0.01	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.23	0.08	0.58	0.30
N6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.02	0.10	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.07	0.20	0.03	0.37	0.43	0.97	0.63
N7	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.15	0.03	0.33	0.39	0.85	0.59
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.22	0.12	0.53	0.33
O2'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.07	0.02	0.10	0.10	0.07	0.03	0.03	0.00	0.05	0.04	0.03	0.52	0.09	0.18
O3'	0.02	0.13	0.02	0.00	0.10	0.02	0.15	0.03	0.17	0.11	0.16	0.09	0.20	0.15	0.07	0.05	0.00	0.02	0.24	0.37	0.19	0.12
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.22	0.13	0.10
O5'	0.11	0.26	0.17	0.25	0.26	0.01	0.31	0.01	0.33	0.29	0.31	0.23	0.37	0.33	0.22	0.03	0.24	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.11	0.26	0.19	0.14	0.30	0.28	0.08	0.31	0.29	0.22	0.08	0.43	0.39	0.12	0.52	0.37	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.68	0.28	0.26	0.64	0.07	0.80	0.10	0.87	0.68	0.80	0.58	0.97	0.85	0.53	0.09	0.19	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.37	0.09	0.13	0.38	0.11	0.52	0.02	0.55	0.49	0.48	0.30	0.63	0.59	0.33	0.18	0.12	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.13	0.56	0.27	0.09	0.26	0.10	0.34	0.13	0.10	0.15	0.16	0.09	0.09	0.10	1.04	0.44	0.20	0.18	0.15	0.28	0.16	0.24
C2	0.10	0.10	0.36	0.26	0.04	0.35	0.05	0.48	0.08	0.06	0.10	0.14	0.07	0.05	0.04	0.91	0.42	0.25	0.38	0.09	0.51	0.37	0.45
C2'	0.15	0.08	0.51	0.25	0.06	0.34	0.05	0.45	0.08	0.08	0.10	0.11	0.05	0.06	0.09	1.02	0.43	0.29	0.30	0.10	0.46	0.28	0.40
C3'	0.22	0.09	0.57	0.31	0.12	0.39	0.09	0.50	0.08	0.15	0.08	0.09	0.12	0.11	0.16	1.04	0.45	0.34	0.32	0.08	0.48	0.30	0.42
C4	0.13	0.11	0.48	0.24	0.05	0.30	0.06	0.37	0.10	0.07	0.12	0.15	0.06	0.06	0.07	1.01	0.43	0.23	0.22	0.11	0.33	0.21	0.29
C4'	0.21	0.10	0.62	0.31	0.13	0.29	0.11	0.36	0.10	0.15	0.10	0.10	0.12	0.13	0.16	1.06	0.45	0.23	0.18	0.11	0.29	0.19	0.25
C5	0.14	0.10	0.47	0.22	0.06	0.28	0.06	0.34	0.09	0.07	0.11	0.14	0.07	0.06	0.07	0.97	0.40	0.23	0.17	0.10	0.28	0.16	0.23
C5'	0.30	0.18	0.70	0.39	0.22	0.33	0.20	0.38	0.17	0.25	0.16	0.17	0.22	0.22	0.26	1.08	0.47	0.26	0.21	0.16	0.26	0.26	0.26
C6	0.13	0.10	0.38	0.21	0.05	0.32	0.05	0.38	0.08	0.06	0.10	0.13	0.07	0.05	0.06	0.88	0.40	0.26	0.24	0.09	0.34	0.22	0.30
C8	0.17	0.13	0.56	0.25	0.10	0.24	0.10	0.27	0.13	0.11	0.15	0.16	0.10	0.10	0.12	0.99	0.40	0.20	0.10	0.15	0.18	0.12	0.13
N1	0.11	0.10	0.32	0.26	0.05	0.36	0.05	0.47	0.08	0.06	0.10	0.13	0.08	0.05	0.05	0.85	0.41	0.27	0.36	0.09	0.47	0.35	0.43
N3	0.12	0.10	0.43	0.25	0.04	0.33	0.05	0.44	0.09	0.06	0.11	0.14	0.06	0.05	0.05	0.98	0.43	0.25	0.32	0.10	0.44	0.30	0.39
N6	0.15	0.09	0.31	0.20	0.06	0.30	0.05	0.35	0.08	0.07	0.09	0.12	0.10	0.05	0.07	0.73	0.37	0.27	0.23	0.09	0.30	0.19	0.25
N7	0.16	0.12	0.52	0.22	0.09	0.23	0.09	0.27	0.12	0.10	0.13	0.15	0.09	0.09	0.11	0.95	0.38	0.20	0.10	0.13	0.18	0.10	0.12
N9	0.15	0.12	0.54	0.25	0.08	0.27	0.09	0.33	0.12	0.09	0.14	0.16	0.08	0.08	0.09	1.03	0.43	0.21	0.16	0.13	0.26	0.15	0.22
O2'	0.12	0.11	0.48	0.21	0.08	0.29	0.09	0.42	0.11	0.08	0.13	0.14	0.09	0.08	0.08	1.00	0.42	0.26	0.28	0.13	0.44	0.25	0.37
O3'	0.23	0.11	0.55	0.31	0.14	0.43	0.12	0.56	0.10	0.17	0.10	0.11	0.14	0.14	0.18	1.03	0.45	0.38	0.39	0.10	0.59	0.38	0.51
O4'	0.18	0.15	0.62	0.31	0.13	0.24	0.14	0.28	0.16	0.14	0.18	0.18	0.13	0.14	0.14	1.04	0.46	0.16	0.13	0.18	0.19	0.16	0.16
O5'	0.30	0.28	0.60	0.34	0.25	0.41	0.25	0.49	0.27	0.25	0.29	0.30	0.26	0.24	0.26	0.95	0.43	0.45	0.27	0.29	0.38	0.29	0.37
OP1	0.34	0.69	0.30	0.16	0.56	0.37	0.66	0.45	0.79	0.51	0.81	0.72	0.55	0.62	0.46	0.59	0.46	0.55	0.31	0.88	0.36	0.39	0.38
OP2	0.79	1.03	0.49	0.52	0.93	0.83	0.98	0.93	1.05	0.89	1.08	1.06	0.94	0.95	0.87	0.54	0.58	1.03	0.82	1.07	0.88	0.84	0.90
P	0.47	0.76	0.30	0.23	0.64	0.52	0.70	0.60	0.79	0.58	0.83	0.80	0.65	0.66	0.56	0.54	0.47	0.70	0.47	0.84	0.52	0.50	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.26	0.00	0.26	0.02	0.27	0.17	0.19
C2	0.04	0.00	0.19	0.05	0.01	0.12	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.28	0.37	0.17	0.26	0.01	0.22	0.24	0.18
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.08	0.02	0.04	0.20	0.05	0.17	0.12	0.26	0.20	0.14	0.04	0.00	0.05	0.03	0.38	0.05	0.44	0.42	0.39
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.03	0.05	0.12	0.03	0.08	0.05	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.10	0.07	0.24	0.14	0.10
C4	0.01	0.01	0.08	0.03	0.00	0.06	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.27	0.09	0.31	0.01	0.28	0.27	0.24
C4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.12	0.09	0.16	0.12	0.10	0.04	0.21	0.03	0.01	0.02	0.07	0.15	0.16	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.22	0.23	0.03	0.38	0.01	0.34	0.37	0.32
C5'	0.10	0.20	0.20	0.03	0.19	0.01	0.25	0.00	0.25	0.30	0.22	0.22	0.19	0.30	0.20	0.10	0.17	0.03	0.01	0.27	0.21	0.26	0.03
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.06	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.27	0.06	0.37	0.00	0.33	0.38	0.31
C8	0.01	0.01	0.17	0.12	0.00	0.12	0.01	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.38	0.13	0.10	0.43	0.02	0.41	0.38	0.38
N1	0.03	0.00	0.12	0.03	0.01	0.09	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.33	0.12	0.31	0.01	0.26	0.32	0.24
N2	0.05	0.00	0.26	0.08	0.01	0.16	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.42	0.42	0.21	0.22	0.01	0.20	0.20	0.15
N3	0.03	0.01	0.20	0.05	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.30	0.36	0.17	0.25	0.01	0.22	0.21	0.17
N7	0.01	0.01	0.14	0.11	0.00	0.10	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.38	0.15	0.07	0.44	0.02	0.42	0.44	0.41
N9	0.00	0.02	0.04	0.06	0.01	0.04	0.01	0.20	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.15	0.20	0.01	0.33	0.02	0.30	0.26	0.26
O2'	0.03	0.28	0.00	0.02	0.11	0.21	0.22	0.10	0.19	0.38	0.16	0.42	0.30	0.38	0.15	0.00	0.08	0.13	0.33	0.26	0.43	0.52	0.37
O3'	0.26	0.37	0.05	0.01	0.27	0.03	0.23	0.17	0.27	0.13	0.33	0.42	0.36	0.15	0.20	0.08	0.00	0.17	0.18	0.25	0.33	0.23	0.21
O4'	0.00	0.17	0.03	0.01	0.09	0.01	0.03	0.03	0.06	0.10	0.12	0.21	0.17	0.07	0.01	0.13	0.17	0.00	0.21	0.05	0.22	0.20	0.18
O5'	0.26	0.26	0.38	0.10	0.31	0.02	0.38	0.01	0.37	0.43	0.31	0.22	0.25	0.44	0.33	0.33	0.18	0.21	0.00	0.40	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.07	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.26	0.25	0.05	0.40	0.00	0.38	0.44	0.37
OP1	0.27	0.22	0.44	0.24	0.28	0.15	0.34	0.21	0.33	0.41	0.26	0.20	0.22	0.42	0.30	0.43	0.33	0.22	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.24	0.42	0.14	0.27	0.16	0.37	0.26	0.38	0.38	0.32	0.20	0.21	0.44	0.26	0.52	0.23	0.20	0.02	0.44	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.18	0.39	0.10	0.24	0.04	0.32	0.03	0.31	0.38	0.24	0.15	0.17	0.41	0.26	0.37	0.21	0.18	0.01	0.37	0.00	0.01	0.00