Doublet Group distance statistics: 49707

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 4, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.014, 0.027, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N1	A	0, -0.001, 0.017, 0.034, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.004, 0.022, 0.041, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.022 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.006, 0.026, 0.045, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N3	A	0, -0.001, 0.019, 0.039, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.019 std_dev=0.020
C2	A	0, -0.010, 0.012, 0.034, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.012 std_dev=0.022
C1'	A	0, -0.007, 0.017, 0.042, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.017 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.008, 0.034, 0.061, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.034 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.004, 0.033, 0.061, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.033 std_dev=0.028
N2	B	0, 0.338, 0.527, 0.715, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.527 std_dev=0.189
C2	B	0, 0.307, 0.510, 0.712, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.510 std_dev=0.203
N3	B	0, 0.335, 0.538, 0.742, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.538 std_dev=0.204
C4	B	0, 0.297, 0.532, 0.768, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.532 std_dev=0.236
N9	B	0, 0.363, 0.608, 0.853, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.608 std_dev=0.245
N1	B	0, 0.255, 0.501, 0.746, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.501 std_dev=0.245
C1'	B	0, 0.466, 0.739, 1.012, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.739 std_dev=0.273
C5	B	0, 0.225, 0.515, 0.805, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.515 std_dev=0.290
C8	B	0, 0.313, 0.604, 0.895, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.604 std_dev=0.291
C6	B	0, 0.217, 0.516, 0.815, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.516 std_dev=0.299
C2'	B	0, 0.582, 0.899, 1.215, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.899 std_dev=0.317
O4'	B	0, 0.482, 0.801, 1.119, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.801 std_dev=0.318
N7	B	0, 0.242, 0.567, 0.893, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.567 std_dev=0.325
O6	B	0, 0.209, 0.571, 0.933, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.571 std_dev=0.362
C2'	A	0, 0.244, 0.644, 1.044, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.644 std_dev=0.400
O2'	B	0, 0.631, 1.044, 1.458, 1.761 max_d=1.761 avg_d=1.044 std_dev=0.414
C4'	B	0, 0.631, 1.055, 1.478, 1.603 max_d=1.603 avg_d=1.055 std_dev=0.423
C3'	B	0, 0.714, 1.140, 1.566, 1.626 max_d=1.626 avg_d=1.140 std_dev=0.426
O5'	B	0, 0.650, 1.082, 1.514, 1.648 max_d=1.648 avg_d=1.082 std_dev=0.432
O4'	A	0, 0.265, 0.709, 1.153, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.709 std_dev=0.444
C5'	B	0, 0.675, 1.147, 1.619, 1.764 max_d=1.764 avg_d=1.147 std_dev=0.472
O3'	B	0, 0.736, 1.298, 1.860, 2.064 max_d=2.064 avg_d=1.298 std_dev=0.562
P	B	0, 0.556, 1.219, 1.882, 2.747 max_d=2.747 avg_d=1.219 std_dev=0.663
C4'	A	0, 0.239, 0.955, 1.670, 2.298 max_d=2.298 avg_d=0.955 std_dev=0.716
O2'	A	0, 0.498, 1.259, 2.020, 1.934 max_d=1.934 avg_d=1.259 std_dev=0.761
OP2	B	0, 0.391, 1.255, 2.118, 3.255 max_d=3.255 avg_d=1.255 std_dev=0.863
C3'	A	0, 0.405, 1.302, 2.199, 2.231 max_d=2.231 avg_d=1.302 std_dev=0.897
OP1	B	0, 0.427, 1.369, 2.312, 3.852 max_d=3.852 avg_d=1.369 std_dev=0.942
C5'	A	0, 0.680, 1.877, 3.075, 3.020 max_d=3.020 avg_d=1.877 std_dev=1.198
O3'	A	0, 0.617, 2.077, 3.537, 3.300 max_d=3.300 avg_d=2.077 std_dev=1.460
O5'	A	0, 0.780, 3.026, 5.272, 5.447 max_d=5.447 avg_d=3.026 std_dev=2.246
P	A	0, 0.915, 3.947, 6.979, 7.326 max_d=7.326 avg_d=3.947 std_dev=3.032
OP1	A	0, 1.242, 4.910, 8.577, 8.886 max_d=8.886 avg_d=4.910 std_dev=3.668
OP2	A	0, 1.006, 4.681, 8.356, 8.799 max_d=8.799 avg_d=4.681 std_dev=3.675

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.33	0.00	0.28	0.14	0.49	0.30
C2	0.05	0.00	0.42	0.38	0.01	0.16	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.57	0.70	0.34	0.35	0.84	0.75	0.41
C2'	0.00	0.42	0.00	0.00	0.23	0.02	0.12	0.19	0.22	0.18	0.34	0.41	0.17	0.08	0.03	0.00	0.04	0.02	0.69	0.61	0.84	0.69
C3'	0.01	0.38	0.00	0.00	0.27	0.01	0.32	0.01	0.36	0.38	0.38	0.34	0.39	0.38	0.20	0.02	0.01	0.01	0.47	0.53	0.31	0.37
C4	0.02	0.01	0.23	0.27	0.00	0.13	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.39	0.38	0.18	0.35	0.29	0.84	0.34
C4'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.13	0.00	0.17	0.01	0.18	0.18	0.17	0.14	0.21	0.19	0.10	0.27	0.02	0.00	0.01	0.19	0.15	0.03
C5	0.01	0.01	0.12	0.32	0.00	0.17	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.38	0.22	0.07	0.56	0.35	1.18	0.61
C5'	0.06	0.29	0.19	0.01	0.19	0.01	0.27	0.00	0.30	0.30	0.30	0.23	0.35	0.32	0.14	0.07	0.22	0.01	0.01	0.41	0.36	0.01
C6	0.02	0.00	0.22	0.36	0.00	0.18	0.01	0.30	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.47	0.36	0.14	0.54	0.47	1.21	0.57
C8	0.02	0.01	0.18	0.38	0.00	0.18	0.01	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.23	0.20	0.21	0.83	0.75	1.25	0.95
N1	0.04	0.00	0.34	0.38	0.01	0.17	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.55	0.57	0.27	0.42	0.71	0.99	0.46
N3	0.05	0.00	0.41	0.34	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.51	0.68	0.34	0.26	0.68	0.61	0.29
N6	0.01	0.00	0.17	0.39	0.01	0.21	0.01	0.35	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.46	0.30	0.08	0.66	0.54	1.42	0.74
N7	0.01	0.01	0.08	0.38	0.01	0.19	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.30	0.15	0.11	0.81	0.70	1.42	0.95
N9	0.01	0.01	0.03	0.20	0.00	0.10	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.21	0.15	0.01	0.46	0.23	0.83	0.48
O2'	0.02	0.57	0.00	0.02	0.39	0.27	0.38	0.07	0.47	0.23	0.55	0.51	0.46	0.30	0.21	0.00	0.05	0.20	0.40	0.33	0.72	0.48
O3'	0.33	0.70	0.04	0.01	0.38	0.02	0.22	0.22	0.36	0.20	0.57	0.68	0.30	0.15	0.15	0.05	0.00	0.21	0.29	0.49	0.29	0.27
O4'	0.00	0.34	0.02	0.01	0.18	0.00	0.07	0.01	0.14	0.21	0.27	0.34	0.08	0.11	0.01	0.20	0.21	0.00	0.10	0.15	0.17	0.13
O5'	0.28	0.35	0.69	0.47	0.35	0.01	0.56	0.01	0.54	0.83	0.42	0.26	0.66	0.81	0.46	0.40	0.29	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.14	0.84	0.61	0.53	0.29	0.19	0.35	0.41	0.47	0.75	0.71	0.68	0.54	0.70	0.23	0.33	0.49	0.15	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.49	0.75	0.84	0.31	0.84	0.15	1.18	0.36	1.21	1.25	0.99	0.61	1.42	1.42	0.83	0.72	0.29	0.17	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.30	0.41	0.69	0.37	0.34	0.03	0.61	0.01	0.57	0.95	0.46	0.29	0.74	0.95	0.48	0.48	0.27	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.17	0.20	0.30	0.08	0.32	0.11	0.34	0.17	0.06	0.20	0.22	0.10	0.08	0.06	0.47	0.62	0.21	0.25	0.20	0.29	0.30	0.25
C2	0.12	0.12	0.24	0.25	0.09	0.32	0.10	0.41	0.10	0.13	0.12	0.17	0.09	0.12	0.11	0.66	0.42	0.24	0.34	0.11	0.45	0.31	0.36
C2'	0.13	0.16	0.27	0.14	0.07	0.16	0.11	0.20	0.17	0.07	0.20	0.21	0.08	0.09	0.07	0.55	0.42	0.12	0.17	0.20	0.17	0.46	0.35
C3'	0.46	0.40	0.51	0.49	0.43	0.50	0.44	0.54	0.43	0.45	0.41	0.39	0.42	0.45	0.45	0.61	0.70	0.48	0.51	0.44	0.51	0.81	0.71
C4	0.09	0.14	0.22	0.25	0.07	0.30	0.08	0.33	0.12	0.08	0.15	0.19	0.09	0.08	0.07	0.55	0.53	0.21	0.25	0.13	0.30	0.29	0.26
C4'	0.29	0.40	0.34	0.57	0.29	0.53	0.36	0.53	0.47	0.27	0.50	0.45	0.28	0.33	0.25	0.38	0.93	0.37	0.42	0.55	0.42	0.57	0.50
C5	0.08	0.13	0.22	0.20	0.07	0.25	0.08	0.27	0.11	0.07	0.14	0.18	0.09	0.08	0.06	0.52	0.50	0.18	0.21	0.12	0.22	0.29	0.22
C5'	0.45	0.68	0.53	0.81	0.48	0.72	0.61	0.70	0.79	0.45	0.84	0.76	0.48	0.55	0.42	0.50	1.21	0.53	0.60	0.92	0.62	0.76	0.69
C6	0.10	0.12	0.23	0.17	0.08	0.25	0.10	0.29	0.11	0.10	0.11	0.15	0.09	0.10	0.08	0.59	0.42	0.20	0.24	0.11	0.26	0.27	0.25
C8	0.07	0.16	0.19	0.21	0.09	0.24	0.12	0.24	0.17	0.07	0.19	0.20	0.10	0.10	0.06	0.40	0.58	0.16	0.18	0.19	0.15	0.35	0.22
N1	0.12	0.11	0.25	0.20	0.10	0.29	0.11	0.37	0.11	0.14	0.11	0.15	0.09	0.14	0.11	0.67	0.37	0.23	0.31	0.12	0.39	0.30	0.33
N3	0.11	0.13	0.23	0.27	0.08	0.33	0.09	0.39	0.11	0.11	0.13	0.18	0.09	0.09	0.09	0.61	0.49	0.23	0.31	0.12	0.40	0.29	0.32
N6	0.10	0.11	0.24	0.10	0.09	0.17	0.11	0.21	0.12	0.11	0.11	0.12	0.09	0.12	0.08	0.57	0.35	0.16	0.18	0.12	0.17	0.27	0.21
N7	0.07	0.15	0.19	0.17	0.09	0.21	0.11	0.21	0.15	0.06	0.16	0.19	0.10	0.09	0.06	0.40	0.53	0.15	0.17	0.16	0.12	0.34	0.21
N9	0.08	0.15	0.20	0.26	0.08	0.29	0.10	0.30	0.15	0.06	0.18	0.20	0.09	0.08	0.06	0.47	0.58	0.19	0.22	0.17	0.24	0.31	0.23
O2'	0.40	0.48	0.42	0.34	0.45	0.32	0.49	0.31	0.52	0.45	0.52	0.47	0.44	0.48	0.43	0.65	0.53	0.39	0.37	0.54	0.34	0.44	0.31
O3'	0.20	0.33	0.25	0.16	0.28	0.12	0.35	0.23	0.41	0.28	0.40	0.35	0.26	0.34	0.24	0.44	0.54	0.23	0.28	0.46	0.32	0.71	0.56
O4'	0.18	0.36	0.25	0.57	0.15	0.56	0.24	0.57	0.39	0.08	0.45	0.45	0.18	0.17	0.07	0.31	0.95	0.35	0.41	0.46	0.48	0.33	0.35
O5'	0.56	1.39	0.54	0.74	1.02	0.67	1.24	0.70	1.55	0.87	1.63	1.53	1.03	1.12	0.78	0.51	1.11	0.61	0.67	1.72	0.73	1.07	0.91
OP1	0.67	1.69	0.88	1.41	1.09	1.23	1.47	1.22	2.00	0.89	2.13	1.89	1.10	1.28	0.76	0.84	1.89	0.82	0.99	2.31	1.22	1.18	1.15
OP2	1.23	2.39	1.00	0.85	1.95	1.01	2.27	1.16	2.65	1.78	2.73	2.49	1.93	2.12	1.63	0.87	0.89	1.31	1.30	2.87	1.34	1.92	1.67
P	0.64	1.80	0.63	0.91	1.28	0.79	1.60	0.82	2.02	1.08	2.14	1.98	1.30	1.43	0.95	0.60	1.33	0.70	0.77	2.26	0.86	1.22	1.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.21	0.00	0.12	0.01	0.15	0.18	0.08
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.40	0.05	0.14	0.01	0.20	0.50	0.30
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.13	0.04	0.10	0.02	0.09	0.06	0.09	0.04	0.00	0.03	0.02	0.26	0.06	0.43	0.21	0.25
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.07	0.18	0.04	0.09	0.06	0.16	0.08	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.29	0.19	0.13
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.13	0.25	0.02	0.14	0.01	0.21	0.46	0.28
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.05	0.12	0.03	0.08	0.06	0.12	0.05	0.18	0.05	0.01	0.01	0.07	0.16	0.15	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.18	0.04	0.18	0.01	0.34	0.57	0.38
C5'	0.04	0.05	0.13	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.10	0.13	0.07	0.06	0.06	0.15	0.06	0.04	0.19	0.01	0.01	0.13	0.12	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.23	0.03	0.19	0.00	0.39	0.63	0.42
C8	0.00	0.01	0.10	0.18	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.27	0.04	0.07	0.18	0.01	0.30	0.45	0.30
N1	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.33	0.03	0.17	0.01	0.31	0.59	0.38
N2	0.03	0.01	0.09	0.09	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.47	0.07	0.13	0.02	0.16	0.48	0.28
N3	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.38	0.06	0.13	0.02	0.14	0.42	0.24
N7	0.01	0.00	0.09	0.16	0.00	0.12	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.30	0.05	0.07	0.20	0.02	0.41	0.59	0.40
N9	0.00	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.15	0.15	0.02	0.14	0.01	0.17	0.36	0.22
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.13	0.18	0.23	0.04	0.23	0.27	0.14	0.10	0.07	0.30	0.15	0.00	0.02	0.12	0.21	0.28	0.47	0.32	0.27
O3'	0.21	0.40	0.03	0.01	0.25	0.05	0.18	0.19	0.23	0.04	0.33	0.47	0.38	0.05	0.15	0.02	0.00	0.11	0.22	0.20	0.27	0.24	0.21
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.07	0.03	0.07	0.06	0.07	0.02	0.12	0.11	0.00	0.07	0.04	0.06	0.27	0.16
O5'	0.12	0.14	0.26	0.08	0.14	0.01	0.18	0.01	0.19	0.18	0.17	0.13	0.13	0.20	0.14	0.21	0.22	0.07	0.00	0.22	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.28	0.20	0.04	0.22	0.00	0.48	0.68	0.47
OP1	0.15	0.20	0.43	0.29	0.21	0.16	0.34	0.12	0.39	0.30	0.31	0.16	0.14	0.41	0.17	0.47	0.27	0.06	0.01	0.48	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.50	0.21	0.19	0.46	0.15	0.57	0.05	0.63	0.45	0.59	0.48	0.42	0.59	0.36	0.32	0.24	0.27	0.02	0.68	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.30	0.25	0.13	0.28	0.06	0.38	0.01	0.42	0.30	0.38	0.28	0.24	0.40	0.22	0.27	0.21	0.16	0.00	0.47	0.01	0.01	0.00