Doublet Group distance statistics: 49709

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 1, 1, 0, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.004, 0.018, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.031 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.008, 0.030, 0.053, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.030 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.008, 0.034, 0.060, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.034 std_dev=0.026
O4'	A	0, -0.007, 0.124, 0.254, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.124 std_dev=0.131
C5	B	0, 0.193, 0.351, 0.510, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.351 std_dev=0.158
C2'	A	0, -0.034, 0.127, 0.288, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.127 std_dev=0.161
C6	B	0, 0.222, 0.415, 0.608, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.415 std_dev=0.193
C4'	A	0, -0.012, 0.185, 0.383, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.185 std_dev=0.198
O2'	A	0, -0.022, 0.184, 0.390, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.184 std_dev=0.206
N1	B	0, 0.232, 0.443, 0.654, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.443 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.220, 0.435, 0.649, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.435 std_dev=0.215
C2	B	0, 0.173, 0.398, 0.623, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.398 std_dev=0.225
C3'	A	0, -0.032, 0.202, 0.437, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.202 std_dev=0.234
N7	B	0, 0.230, 0.485, 0.740, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.485 std_dev=0.255
N3	B	0, 0.183, 0.449, 0.715, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.449 std_dev=0.266
C2'	B	0, 0.215, 0.491, 0.767, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.491 std_dev=0.276
N2	B	0, 0.224, 0.526, 0.828, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.526 std_dev=0.302
O3'	A	0, -0.015, 0.310, 0.634, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.310 std_dev=0.325
O6	B	0, 0.272, 0.602, 0.931, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.602 std_dev=0.329
C8	B	0, 0.301, 0.631, 0.962, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.631 std_dev=0.331
N9	B	0, 0.273, 0.616, 0.958, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.616 std_dev=0.343
C5'	A	0, -0.009, 0.335, 0.680, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.335 std_dev=0.344
O5'	A	0, 0.113, 0.557, 1.002, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.557 std_dev=0.444
C1'	B	0, 0.307, 0.825, 1.344, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.825 std_dev=0.519
OP1	A	0, 0.398, 0.921, 1.444, 2.226 max_d=2.226 avg_d=0.921 std_dev=0.523
P	A	0, 0.469, 1.100, 1.731, 2.638 max_d=2.638 avg_d=1.100 std_dev=0.631
O4'	B	0, 0.483, 1.236, 1.989, 1.951 max_d=1.951 avg_d=1.236 std_dev=0.753
O5'	B	0, 0.612, 1.438, 2.264, 2.225 max_d=2.225 avg_d=1.438 std_dev=0.826
OP2	B	0, 0.736, 1.578, 2.419, 2.271 max_d=2.271 avg_d=1.578 std_dev=0.842
OP1	B	0, 0.757, 1.607, 2.457, 2.365 max_d=2.365 avg_d=1.607 std_dev=0.850
P	B	0, 0.715, 1.568, 2.422, 2.307 max_d=2.307 avg_d=1.568 std_dev=0.853
C4'	B	0, 0.578, 1.484, 2.390, 2.344 max_d=2.344 avg_d=1.484 std_dev=0.906
C5'	B	0, 0.643, 1.580, 2.517, 2.500 max_d=2.500 avg_d=1.580 std_dev=0.937
O2'	B	0, 0.520, 1.463, 2.406, 2.382 max_d=2.382 avg_d=1.463 std_dev=0.943
C3'	B	0, 0.577, 1.568, 2.559, 2.562 max_d=2.562 avg_d=1.568 std_dev=0.991
OP2	A	0, 1.043, 2.109, 3.175, 3.711 max_d=3.711 avg_d=2.109 std_dev=1.066
O3'	B	0, 0.901, 2.457, 4.014, 3.931 max_d=3.931 avg_d=2.457 std_dev=1.556

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.07	0.13	0.09
C2	0.02	0.00	0.11	0.10	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.02	0.07	0.10	0.16	0.09
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.08	0.11	0.04	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.17	0.16	0.07
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.10	0.07	0.10	0.05	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.21	0.29	0.15
C4	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.02	0.08	0.11	0.22	0.12
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.08	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.11	0.16	0.32	0.16
C5'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.04	0.01	0.08	0.09	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.12	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.06	0.02	0.11	0.16	0.30	0.15
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.14	0.17	0.40	0.20
N1	0.01	0.00	0.08	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02	0.09	0.13	0.22	0.12
N3	0.02	0.00	0.11	0.10	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.12	0.02	0.06	0.08	0.15	0.08
N6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.13	0.20	0.36	0.18
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.01	0.14	0.20	0.44	0.21
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.09	0.10	0.24	0.13
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.03	0.06	0.04	0.10	0.12	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.19	0.18	0.06
O3'	0.01	0.13	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.11	0.10	0.12	0.07	0.09	0.03	0.03	0.00	0.01	0.09	0.32	0.51	0.27
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.05	0.19	0.14
O5'	0.05	0.07	0.03	0.05	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.14	0.09	0.06	0.13	0.14	0.09	0.03	0.09	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.10	0.17	0.21	0.11	0.13	0.16	0.12	0.16	0.17	0.13	0.08	0.20	0.20	0.10	0.19	0.32	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.16	0.16	0.29	0.22	0.08	0.32	0.06	0.30	0.40	0.22	0.15	0.36	0.44	0.24	0.18	0.51	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.09	0.07	0.15	0.12	0.02	0.16	0.01	0.15	0.20	0.12	0.08	0.18	0.21	0.13	0.06	0.27	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.43	0.11	0.17	0.65	0.24	0.74	0.17	0.74	0.10	0.30	0.10	0.10	0.22	0.21	0.33	0.23	1.21	0.71	0.66	0.11	0.67	0.75	0.72
C2	0.35	0.11	0.11	0.80	0.16	0.85	0.15	0.87	0.10	0.30	0.12	0.22	0.10	0.23	0.27	0.43	1.36	0.71	0.78	0.10	0.79	0.82	0.83
C2'	0.41	0.15	0.14	0.68	0.24	0.79	0.19	0.79	0.14	0.31	0.13	0.14	0.22	0.24	0.32	0.21	1.27	0.73	0.69	0.13	0.71	0.76	0.76
C3'	0.41	0.24	0.20	0.62	0.29	0.75	0.26	0.75	0.22	0.33	0.22	0.23	0.29	0.28	0.35	0.26	1.19	0.71	0.64	0.22	0.68	0.72	0.71
C4	0.41	0.09	0.13	0.69	0.21	0.78	0.16	0.78	0.09	0.30	0.10	0.16	0.16	0.22	0.31	0.26	1.26	0.73	0.70	0.09	0.71	0.78	0.76
C4'	0.44	0.21	0.25	0.58	0.29	0.70	0.22	0.70	0.18	0.32	0.17	0.19	0.29	0.25	0.35	0.31	1.12	0.69	0.60	0.18	0.63	0.69	0.67
C5	0.39	0.09	0.11	0.62	0.21	0.74	0.17	0.75	0.10	0.30	0.10	0.19	0.15	0.23	0.31	0.25	1.17	0.71	0.67	0.09	0.69	0.78	0.75
C5'	0.47	0.29	0.36	0.55	0.35	0.67	0.29	0.66	0.25	0.36	0.24	0.28	0.36	0.31	0.40	0.41	1.03	0.68	0.56	0.24	0.59	0.64	0.63
C6	0.34	0.13	0.08	0.66	0.17	0.78	0.16	0.79	0.10	0.29	0.12	0.25	0.10	0.23	0.27	0.38	1.19	0.72	0.71	0.10	0.73	0.80	0.78
C8	0.42	0.12	0.18	0.54	0.25	0.67	0.18	0.67	0.11	0.30	0.10	0.10	0.25	0.22	0.33	0.23	1.08	0.68	0.60	0.10	0.62	0.73	0.68
N1	0.31	0.14	0.10	0.76	0.15	0.84	0.15	0.86	0.11	0.29	0.12	0.25	0.09	0.23	0.25	0.49	1.31	0.71	0.77	0.11	0.79	0.82	0.83
N3	0.39	0.09	0.13	0.77	0.19	0.83	0.16	0.84	0.09	0.30	0.11	0.18	0.13	0.23	0.30	0.32	1.34	0.73	0.75	0.09	0.76	0.81	0.80
N6	0.27	0.16	0.11	0.55	0.14	0.72	0.16	0.75	0.12	0.28	0.12	0.28	0.11	0.24	0.23	0.43	1.03	0.70	0.68	0.12	0.71	0.80	0.77
N7	0.40	0.10	0.16	0.52	0.24	0.66	0.18	0.66	0.10	0.30	0.09	0.15	0.22	0.23	0.32	0.20	1.04	0.67	0.60	0.09	0.63	0.74	0.69
N9	0.43	0.10	0.16	0.63	0.24	0.73	0.17	0.74	0.10	0.30	0.10	0.11	0.21	0.22	0.33	0.23	1.19	0.71	0.66	0.10	0.67	0.75	0.73
O2'	0.41	0.12	0.13	0.73	0.23	0.80	0.17	0.81	0.11	0.30	0.12	0.13	0.20	0.22	0.32	0.19	1.31	0.73	0.71	0.11	0.73	0.78	0.77
O3'	0.41	0.28	0.20	0.64	0.32	0.77	0.30	0.78	0.29	0.35	0.28	0.28	0.31	0.32	0.36	0.25	1.22	0.72	0.65	0.29	0.70	0.73	0.73
O4'	0.45	0.14	0.23	0.58	0.25	0.69	0.18	0.68	0.12	0.30	0.11	0.11	0.25	0.21	0.34	0.30	1.10	0.69	0.60	0.14	0.62	0.70	0.67
O5'	0.46	0.33	0.43	0.52	0.37	0.63	0.33	0.63	0.30	0.38	0.30	0.33	0.39	0.34	0.41	0.46	0.95	0.64	0.51	0.29	0.56	0.59	0.58
OP1	0.40	0.39	0.55	0.51	0.40	0.49	0.44	0.46	0.47	0.42	0.45	0.36	0.38	0.44	0.40	0.49	0.79	0.47	0.36	0.53	0.38	0.38	0.37
OP2	0.52	0.70	0.82	0.60	0.66	0.40	0.73	0.37	0.80	0.67	0.80	0.66	0.62	0.73	0.61	0.71	0.49	0.35	0.38	0.84	0.32	0.27	0.28
P	0.42	0.39	0.57	0.51	0.40	0.51	0.42	0.49	0.43	0.42	0.41	0.36	0.39	0.42	0.41	0.51	0.74	0.51	0.39	0.46	0.42	0.43	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.03	0.08	0.06	0.04	0.07	0.09	0.07	0.04	0.08	0.08	0.08	0.06	0.04	0.04	0.31	0.00	0.19	0.06	0.18	0.38	0.26
C2	0.08	0.00	0.29	0.29	0.01	0.15	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.37	0.20	0.19	0.01	0.27	0.47	0.35
C2'	0.03	0.29	0.00	0.01	0.23	0.01	0.24	0.20	0.26	0.26	0.28	0.30	0.27	0.26	0.17	0.00	0.06	0.02	0.41	0.25	0.40	0.56	0.46
C3'	0.08	0.29	0.01	0.00	0.34	0.01	0.46	0.02	0.46	0.48	0.39	0.23	0.25	0.53	0.32	0.02	0.04	0.04	0.05	0.51	0.16	0.06	0.08
C4	0.06	0.01	0.23	0.34	0.00	0.13	0.01	0.14	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.34	0.11	0.17	0.01	0.26	0.45	0.32
C4'	0.04	0.15	0.01	0.01	0.13	0.00	0.18	0.01	0.18	0.24	0.16	0.16	0.14	0.24	0.14	0.28	0.07	0.01	0.03	0.19	0.09	0.05	0.04
C5	0.07	0.01	0.24	0.46	0.01	0.18	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.25	0.42	0.07	0.19	0.01	0.29	0.47	0.33
C5'	0.09	0.18	0.20	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.17	0.19	0.18	0.20	0.17	0.20	0.11	0.08	0.17	0.02	0.01	0.18	0.08	0.02	0.02
C6	0.07	0.01	0.26	0.46	0.01	0.18	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.22	0.42	0.10	0.20	0.00	0.30	0.47	0.34
C8	0.04	0.01	0.26	0.48	0.02	0.24	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.33	0.46	0.10	0.22	0.01	0.29	0.46	0.31
N1	0.08	0.01	0.28	0.39	0.02	0.16	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.37	0.17	0.19	0.00	0.29	0.48	0.35
N2	0.08	0.00	0.30	0.23	0.02	0.16	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.41	0.23	0.19	0.01	0.27	0.47	0.35
N3	0.08	0.00	0.27	0.25	0.01	0.14	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.39	0.19	0.19	0.01	0.25	0.46	0.33
N7	0.06	0.01	0.26	0.53	0.00	0.24	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.35	0.52	0.05	0.24	0.01	0.32	0.49	0.33
N9	0.04	0.02	0.17	0.32	0.01	0.14	0.03	0.11	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.18	0.31	0.02	0.16	0.03	0.23	0.43	0.29
O2'	0.04	0.05	0.00	0.02	0.14	0.28	0.25	0.08	0.22	0.33	0.13	0.09	0.04	0.35	0.18	0.00	0.09	0.20	0.29	0.27	0.24	0.59	0.35
O3'	0.31	0.37	0.06	0.04	0.34	0.07	0.42	0.17	0.42	0.46	0.37	0.41	0.39	0.52	0.31	0.09	0.00	0.23	0.21	0.47	0.45	0.27	0.27
O4'	0.00	0.20	0.02	0.04	0.11	0.01	0.07	0.02	0.10	0.10	0.17	0.23	0.19	0.05	0.02	0.20	0.23	0.00	0.09	0.08	0.08	0.18	0.11
O5'	0.19	0.19	0.41	0.05	0.17	0.03	0.19	0.01	0.20	0.22	0.19	0.19	0.19	0.24	0.16	0.29	0.21	0.09	0.00	0.21	0.01	0.02	0.01
O6	0.06	0.01	0.25	0.51	0.01	0.19	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.27	0.47	0.08	0.21	0.00	0.32	0.46	0.34
OP1	0.18	0.27	0.40	0.16	0.26	0.09	0.29	0.08	0.30	0.29	0.29	0.27	0.25	0.32	0.23	0.24	0.45	0.08	0.01	0.32	0.00	0.04	0.01
OP2	0.38	0.47	0.56	0.06	0.45	0.05	0.47	0.02	0.47	0.46	0.48	0.47	0.46	0.49	0.43	0.59	0.27	0.18	0.02	0.46	0.04	0.00	0.00
P	0.26	0.35	0.46	0.08	0.32	0.04	0.33	0.02	0.34	0.31	0.35	0.35	0.33	0.33	0.29	0.35	0.27	0.11	0.01	0.34	0.01	0.00	0.00