Doublet Group distance statistics: 49710

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 1, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.001, 0.014, 0.026, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.012, 0.029, 0.045, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.014, 0.047, 0.079, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.047 std_dev=0.032
N6	A	0, 0.011, 0.044, 0.078, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.044 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.019, 0.055, 0.092, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.055 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.028, 0.155, 0.282, 0.324 max_d=0.324 avg_d=0.155 std_dev=0.127
C2'	A	0, 0.032, 0.176, 0.321, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.176 std_dev=0.144
N1	B	0, 0.074, 0.239, 0.404, 0.505 max_d=0.505 avg_d=0.239 std_dev=0.165
C2	B	0, 0.081, 0.246, 0.411, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.246 std_dev=0.165
N3	B	0, 0.073, 0.258, 0.443, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.258 std_dev=0.185
C4	B	0, 0.055, 0.250, 0.445, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.250 std_dev=0.195
C1'	B	0, 0.076, 0.285, 0.495, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.285 std_dev=0.210
N9	B	0, 0.074, 0.286, 0.498, 0.548 max_d=0.548 avg_d=0.286 std_dev=0.212
C3'	A	0, 0.043, 0.282, 0.521, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.282 std_dev=0.239
C4'	A	0, 0.031, 0.287, 0.544, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.287 std_dev=0.256
O2'	A	0, -0.001, 0.256, 0.513, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.256 std_dev=0.257
N2	B	0, 0.057, 0.318, 0.579, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.318 std_dev=0.261
C6	B	0, 0.064, 0.326, 0.587, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.326 std_dev=0.261
C5	B	0, 0.048, 0.317, 0.585, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.317 std_dev=0.268
C8	B	0, 0.067, 0.378, 0.688, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.378 std_dev=0.310
O6	B	0, 0.047, 0.425, 0.803, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.425 std_dev=0.378
N7	B	0, 0.029, 0.408, 0.788, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.408 std_dev=0.379
O3'	A	0, 0.061, 0.460, 0.859, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.460 std_dev=0.399
C5'	A	0, 0.002, 0.466, 0.931, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.466 std_dev=0.464
C2'	B	0, 0.032, 0.535, 1.038, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.535 std_dev=0.503
O5'	A	0, -0.059, 0.464, 0.988, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.464 std_dev=0.523
O4'	B	0, -0.053, 0.631, 1.316, 1.965 max_d=1.965 avg_d=0.631 std_dev=0.684
C3'	B	0, -0.122, 0.718, 1.559, 2.677 max_d=2.677 avg_d=0.718 std_dev=0.840
O2'	B	0, -0.101, 0.747, 1.595, 2.615 max_d=2.615 avg_d=0.747 std_dev=0.848
P	A	0, -0.190, 0.660, 1.510, 2.675 max_d=2.675 avg_d=0.660 std_dev=0.850
OP1	A	0, -0.057, 0.801, 1.660, 2.862 max_d=2.862 avg_d=0.801 std_dev=0.858
C4'	B	0, -0.133, 0.793, 1.719, 2.773 max_d=2.773 avg_d=0.793 std_dev=0.926
OP2	A	0, -0.275, 0.717, 1.709, 3.051 max_d=3.051 avg_d=0.717 std_dev=0.992
O3'	B	0, -0.251, 0.779, 1.808, 3.256 max_d=3.256 avg_d=0.779 std_dev=1.029
O5'	B	0, -0.172, 1.032, 2.236, 3.408 max_d=3.408 avg_d=1.032 std_dev=1.204
C5'	B	0, -0.231, 1.065, 2.360, 3.700 max_d=3.700 avg_d=1.065 std_dev=1.296
OP2	B	0, -0.275, 1.244, 2.763, 4.280 max_d=4.280 avg_d=1.244 std_dev=1.519
P	B	0, -0.299, 1.239, 2.777, 4.319 max_d=4.319 avg_d=1.239 std_dev=1.538
OP1	B	0, -0.389, 1.366, 3.120, 4.885 max_d=4.885 avg_d=1.366 std_dev=1.754

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.06	0.11	0.07
C2	0.04	0.00	0.16	0.14	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.20	0.02	0.27	0.31	0.50	0.36
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.06	0.13	0.15	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.10	0.19	0.12
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.02	0.12	0.17	0.13	0.13	0.14	0.16	0.07	0.01	0.01	0.01	0.14	0.12	0.21	0.14
C4	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.08	0.01	0.26	0.29	0.40	0.33
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.09	0.17	0.06	0.06	0.12	0.17	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.10	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.11	0.03	0.36	0.43	0.54	0.47
C5'	0.04	0.12	0.02	0.02	0.16	0.00	0.25	0.00	0.25	0.31	0.18	0.09	0.31	0.34	0.16	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.12	0.00	0.09	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.14	0.02	0.38	0.48	0.63	0.53
C8	0.02	0.00	0.06	0.17	0.00	0.17	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.17	0.05	0.33	0.37	0.34	0.38
N1	0.03	0.00	0.13	0.13	0.01	0.06	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.17	0.01	0.34	0.41	0.60	0.47
N3	0.03	0.00	0.15	0.13	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.18	0.02	0.22	0.23	0.40	0.28
N6	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.12	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.13	0.16	0.04	0.43	0.58	0.72	0.62
N7	0.01	0.00	0.04	0.16	0.00	0.17	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.05	0.40	0.49	0.52	0.52
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.21	0.22	0.26	0.24
O2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.13	0.02	0.10	0.02	0.15	0.03	0.20	0.22	0.13	0.04	0.04	0.00	0.04	0.04	0.08	0.05	0.13	0.05
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.14	0.17	0.17	0.18	0.16	0.17	0.06	0.04	0.00	0.02	0.15	0.15	0.27	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.10	0.08	0.16	0.13
O5'	0.07	0.27	0.12	0.14	0.26	0.01	0.36	0.01	0.38	0.33	0.34	0.22	0.43	0.40	0.21	0.08	0.15	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.31	0.10	0.12	0.29	0.03	0.43	0.03	0.48	0.37	0.41	0.23	0.58	0.49	0.22	0.05	0.15	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.50	0.19	0.21	0.40	0.02	0.54	0.01	0.63	0.34	0.60	0.40	0.72	0.52	0.26	0.13	0.27	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.36	0.12	0.14	0.33	0.02	0.47	0.01	0.53	0.38	0.47	0.28	0.62	0.52	0.24	0.05	0.16	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.13	0.45	0.22	0.15	0.58	0.14	0.69	0.12	0.16	0.12	0.12	0.15	0.14	0.16	0.76	0.67	0.64	0.60	0.12	0.66	0.69	0.71
C2	0.21	0.16	0.36	0.53	0.19	0.81	0.20	0.95	0.18	0.23	0.16	0.18	0.17	0.22	0.22	0.94	0.94	0.72	0.85	0.18	0.94	0.92	0.95
C2'	0.12	0.15	0.45	0.24	0.13	0.62	0.14	0.76	0.15	0.13	0.16	0.17	0.13	0.13	0.12	0.82	0.70	0.64	0.66	0.16	0.76	0.76	0.80
C3'	0.18	0.25	0.39	0.23	0.23	0.63	0.26	0.78	0.28	0.24	0.28	0.25	0.22	0.26	0.22	0.69	0.67	0.69	0.69	0.29	0.81	0.80	0.84
C4	0.17	0.15	0.41	0.32	0.17	0.66	0.17	0.78	0.16	0.19	0.15	0.15	0.16	0.18	0.18	0.84	0.77	0.68	0.70	0.16	0.76	0.78	0.80
C4'	0.23	0.28	0.40	0.21	0.26	0.59	0.26	0.71	0.27	0.26	0.27	0.29	0.27	0.26	0.25	0.61	0.62	0.70	0.63	0.26	0.71	0.74	0.76
C5	0.16	0.15	0.39	0.28	0.18	0.63	0.18	0.74	0.16	0.19	0.15	0.16	0.16	0.19	0.18	0.79	0.73	0.67	0.67	0.16	0.72	0.77	0.78
C5'	0.44	0.51	0.40	0.39	0.49	0.72	0.49	0.83	0.49	0.48	0.50	0.52	0.50	0.49	0.47	0.47	0.72	0.85	0.76	0.48	0.84	0.87	0.89
C6	0.19	0.16	0.34	0.42	0.20	0.73	0.20	0.85	0.18	0.23	0.16	0.18	0.17	0.22	0.21	0.85	0.84	0.71	0.78	0.18	0.83	0.86	0.87
C8	0.13	0.13	0.45	0.12	0.14	0.48	0.13	0.58	0.13	0.14	0.13	0.13	0.14	0.14	0.14	0.66	0.57	0.59	0.52	0.14	0.56	0.63	0.63
N1	0.21	0.16	0.33	0.55	0.20	0.83	0.21	0.97	0.18	0.25	0.16	0.19	0.18	0.24	0.22	0.93	0.95	0.72	0.87	0.18	0.95	0.93	0.96
N3	0.19	0.15	0.39	0.43	0.18	0.74	0.18	0.87	0.17	0.21	0.15	0.16	0.17	0.20	0.20	0.91	0.87	0.70	0.78	0.16	0.86	0.85	0.89
N6	0.20	0.16	0.30	0.41	0.21	0.72	0.21	0.84	0.19	0.25	0.15	0.18	0.18	0.24	0.23	0.77	0.80	0.72	0.79	0.19	0.82	0.87	0.87
N7	0.13	0.14	0.42	0.13	0.15	0.49	0.15	0.59	0.15	0.15	0.15	0.14	0.15	0.15	0.15	0.65	0.58	0.60	0.54	0.15	0.58	0.66	0.65
N9	0.16	0.14	0.44	0.21	0.15	0.58	0.15	0.68	0.14	0.16	0.14	0.13	0.15	0.15	0.16	0.76	0.67	0.64	0.61	0.14	0.66	0.70	0.72
O2'	0.17	0.14	0.52	0.28	0.13	0.61	0.13	0.74	0.14	0.14	0.15	0.16	0.13	0.13	0.14	0.91	0.71	0.62	0.64	0.15	0.73	0.74	0.77
O3'	0.17	0.30	0.40	0.23	0.27	0.64	0.32	0.81	0.36	0.28	0.36	0.30	0.25	0.32	0.24	0.71	0.66	0.69	0.71	0.40	0.87	0.85	0.89
O4'	0.18	0.14	0.45	0.16	0.16	0.52	0.13	0.61	0.10	0.15	0.10	0.15	0.17	0.13	0.17	0.66	0.59	0.63	0.53	0.08	0.58	0.62	0.64
O5'	0.51	0.53	0.45	0.47	0.53	0.79	0.52	0.90	0.50	0.53	0.50	0.53	0.54	0.52	0.53	0.49	0.76	0.91	0.82	0.47	0.92	0.92	0.96
OP1	0.74	0.83	0.56	0.65	0.82	0.93	0.85	1.05	0.87	0.83	0.86	0.81	0.80	0.85	0.80	0.50	0.86	1.08	1.01	0.87	1.12	1.14	1.16
OP2	0.77	0.77	0.63	0.69	0.79	0.98	0.78	1.11	0.74	0.80	0.75	0.74	0.78	0.78	0.79	0.58	0.88	1.12	1.04	0.68	1.16	1.14	1.19
P	0.73	0.80	0.56	0.64	0.79	0.93	0.79	1.05	0.78	0.78	0.79	0.80	0.78	0.78	0.77	0.51	0.86	1.09	0.99	0.75	1.09	1.11	1.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.30	0.00	0.23	0.01	0.21	0.37	0.26
C2	0.02	0.00	0.35	0.23	0.01	0.11	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.21	0.26	0.21	0.01	0.27	0.41	0.34
C2'	0.00	0.35	0.00	0.00	0.19	0.01	0.12	0.23	0.19	0.14	0.29	0.40	0.33	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.47	0.17	0.49	0.61	0.51
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.26	0.00	0.36	0.02	0.39	0.34	0.32	0.17	0.17	0.40	0.23	0.02	0.01	0.02	0.02	0.44	0.09	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.19	0.26	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.10	0.13	0.16	0.01	0.22	0.39	0.28
C4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.08	0.23	0.05	0.17	0.12	0.21	0.08	0.27	0.02	0.00	0.01	0.12	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.12	0.36	0.00	0.10	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.23	0.11	0.05	0.08	0.01	0.18	0.34	0.22
C5'	0.10	0.21	0.23	0.02	0.11	0.00	0.04	0.00	0.06	0.14	0.14	0.26	0.21	0.12	0.04	0.05	0.19	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.19	0.39	0.01	0.08	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.13	0.10	0.09	0.00	0.18	0.32	0.23
C8	0.00	0.01	0.14	0.34	0.00	0.23	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.43	0.16	0.17	0.07	0.01	0.13	0.32	0.16
N1	0.02	0.00	0.29	0.32	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.19	0.14	0.01	0.23	0.37	0.29
N2	0.03	0.00	0.40	0.17	0.01	0.17	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.30	0.31	0.25	0.01	0.31	0.43	0.38
N3	0.02	0.00	0.33	0.17	0.00	0.12	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.25	0.26	0.23	0.01	0.27	0.42	0.34
N7	0.00	0.01	0.05	0.40	0.00	0.21	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.41	0.22	0.10	0.10	0.01	0.13	0.28	0.14
N9	0.00	0.01	0.03	0.23	0.01	0.08	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.07	0.01	0.14	0.01	0.19	0.38	0.25
O2'	0.01	0.20	0.01	0.02	0.08	0.27	0.23	0.05	0.17	0.43	0.09	0.33	0.21	0.41	0.19	0.00	0.04	0.18	0.36	0.24	0.37	0.67	0.42
O3'	0.30	0.21	0.01	0.01	0.10	0.02	0.11	0.19	0.13	0.16	0.10	0.30	0.25	0.22	0.07	0.04	0.00	0.22	0.19	0.21	0.38	0.26	0.25
O4'	0.00	0.26	0.01	0.02	0.13	0.00	0.05	0.01	0.10	0.17	0.19	0.31	0.26	0.10	0.01	0.18	0.22	0.00	0.05	0.07	0.04	0.16	0.10
O5'	0.23	0.21	0.47	0.02	0.16	0.01	0.08	0.01	0.09	0.07	0.14	0.25	0.23	0.10	0.14	0.36	0.19	0.05	0.00	0.08	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.17	0.44	0.01	0.12	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.21	0.07	0.08	0.00	0.15	0.27	0.19
OP1	0.21	0.27	0.49	0.09	0.22	0.05	0.18	0.07	0.18	0.13	0.23	0.31	0.27	0.13	0.19	0.37	0.38	0.04	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01
OP2	0.37	0.41	0.61	0.04	0.39	0.03	0.34	0.01	0.32	0.32	0.37	0.43	0.42	0.28	0.38	0.67	0.26	0.16	0.02	0.27	0.01	0.00	0.00
P	0.26	0.34	0.51	0.03	0.28	0.02	0.22	0.01	0.23	0.16	0.29	0.38	0.34	0.14	0.25	0.42	0.25	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00