Doublet Group distance statistics: 49711

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 3, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.007, 0.022, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.011, 0.030, 0.050, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.015, 0.035, 0.055, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.018, 0.048, 0.078, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.048 std_dev=0.030
N6	A	0, 0.018, 0.049, 0.080, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.049 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.023, 0.058, 0.093, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.058 std_dev=0.035
C2'	A	0, 0.060, 0.116, 0.172, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.116 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.043, 0.117, 0.192, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.117 std_dev=0.075
O2'	A	0, 0.033, 0.124, 0.215, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.124 std_dev=0.091
C3'	A	0, 0.093, 0.208, 0.323, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.208 std_dev=0.115
C4'	A	0, 0.051, 0.179, 0.307, 0.354 max_d=0.354 avg_d=0.179 std_dev=0.128
C5'	A	0, 0.092, 0.252, 0.413, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.252 std_dev=0.161
O5'	A	0, 0.098, 0.266, 0.434, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.266 std_dev=0.168
C4	B	0, 0.233, 0.428, 0.624, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.428 std_dev=0.196
N9	B	0, 0.187, 0.400, 0.613, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.400 std_dev=0.213
O3'	A	0, 0.164, 0.382, 0.601, 0.706 max_d=0.706 avg_d=0.382 std_dev=0.219
N3	B	0, 0.179, 0.416, 0.653, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.416 std_dev=0.237
N7	B	0, 0.289, 0.527, 0.765, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.527 std_dev=0.238
C1'	B	0, 0.139, 0.381, 0.622, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.381 std_dev=0.242
C5	B	0, 0.267, 0.509, 0.751, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.509 std_dev=0.242
C8	B	0, 0.230, 0.473, 0.717, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.473 std_dev=0.243
C2'	B	0, 0.149, 0.423, 0.696, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.423 std_dev=0.273
P	A	0, 0.173, 0.449, 0.725, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.449 std_dev=0.276
O4'	B	0, 0.198, 0.479, 0.760, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.479 std_dev=0.281
O2'	B	0, 0.177, 0.474, 0.771, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.474 std_dev=0.297
OP2	A	0, 0.173, 0.472, 0.772, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.472 std_dev=0.300
C3'	B	0, 0.220, 0.527, 0.835, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.527 std_dev=0.308
C2	B	0, 0.129, 0.484, 0.838, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.484 std_dev=0.355
C4'	B	0, 0.226, 0.582, 0.937, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.582 std_dev=0.356
OP1	A	0, 0.208, 0.568, 0.928, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.568 std_dev=0.360
C6	B	0, 0.233, 0.593, 0.954, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.593 std_dev=0.360
O3'	B	0, 0.274, 0.649, 1.024, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.649 std_dev=0.375
N1	B	0, 0.159, 0.570, 0.981, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.570 std_dev=0.411
N2	B	0, 0.065, 0.512, 0.960, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.512 std_dev=0.448
O6	B	0, 0.249, 0.704, 1.160, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.704 std_dev=0.456
O5'	B	0, 0.327, 0.789, 1.251, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.789 std_dev=0.462
C5'	B	0, 0.295, 0.781, 1.266, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.781 std_dev=0.486
P	B	0, 0.377, 1.004, 1.632, 1.947 max_d=1.947 avg_d=1.004 std_dev=0.627
OP2	B	0, 0.398, 1.046, 1.695, 2.012 max_d=2.012 avg_d=1.046 std_dev=0.648
OP1	B	0, 0.371, 1.130, 1.888, 2.553 max_d=2.553 avg_d=1.130 std_dev=0.759

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.05	0.04	0.06
C2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.05	0.06	0.07	0.06
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.08	0.09	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.07	0.07	0.05	0.08	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.12	0.14	0.08
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.06
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.07	0.08	0.07
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.06	0.04	0.03	0.07	0.07	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.07	0.08	0.10	0.08
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.06	0.06	0.07	0.06
N1	0.02	0.00	0.04	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.06	0.07	0.09	0.07
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.05	0.06	0.06
N6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.11	0.02	0.09	0.10	0.12	0.10
N7	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.07	0.08	0.08	0.08
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.05	0.05	0.06
O2'	0.02	0.04	0.00	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.07	0.04	0.04	0.09	0.08	0.05
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.03	0.09	0.08	0.08	0.05	0.11	0.09	0.04	0.07	0.00	0.02	0.10	0.21	0.23	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.07	0.09	0.08	0.10
O5'	0.04	0.05	0.02	0.05	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.06	0.06	0.04	0.09	0.07	0.04	0.04	0.10	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.05	0.06	0.08	0.12	0.05	0.05	0.07	0.05	0.08	0.06	0.07	0.05	0.10	0.08	0.05	0.09	0.21	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.07	0.09	0.14	0.06	0.03	0.08	0.02	0.10	0.07	0.09	0.06	0.12	0.08	0.05	0.08	0.23	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.06	0.04	0.08	0.06	0.02	0.07	0.01	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.08	0.06	0.05	0.16	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.30	0.27	0.27	0.21	0.23	0.24	0.22	0.30	0.18	0.33	0.35	0.23	0.21	0.18	0.28	0.32	0.20	0.20	0.32	0.18	0.22	0.23
C2	0.19	0.31	0.21	0.20	0.21	0.25	0.21	0.27	0.27	0.17	0.31	0.38	0.25	0.18	0.18	0.22	0.21	0.23	0.24	0.28	0.27	0.27	0.31
C2'	0.13	0.26	0.23	0.23	0.15	0.18	0.19	0.17	0.26	0.12	0.30	0.33	0.18	0.15	0.12	0.25	0.28	0.16	0.13	0.30	0.14	0.15	0.17
C3'	0.13	0.23	0.25	0.25	0.14	0.16	0.18	0.13	0.26	0.13	0.29	0.28	0.15	0.16	0.12	0.25	0.30	0.13	0.13	0.31	0.13	0.17	0.14
C4	0.18	0.31	0.23	0.22	0.21	0.22	0.23	0.23	0.28	0.17	0.32	0.38	0.24	0.19	0.18	0.24	0.25	0.21	0.20	0.30	0.19	0.22	0.24
C4'	0.13	0.24	0.24	0.26	0.16	0.18	0.21	0.16	0.28	0.15	0.30	0.27	0.16	0.19	0.13	0.24	0.32	0.14	0.17	0.33	0.16	0.22	0.18
C5	0.17	0.31	0.21	0.19	0.21	0.19	0.22	0.20	0.28	0.17	0.32	0.38	0.25	0.19	0.17	0.21	0.20	0.20	0.17	0.29	0.17	0.21	0.23
C5'	0.10	0.20	0.22	0.26	0.14	0.15	0.20	0.14	0.28	0.14	0.28	0.20	0.13	0.19	0.11	0.20	0.32	0.10	0.18	0.33	0.19	0.25	0.19
C6	0.16	0.31	0.17	0.15	0.20	0.20	0.21	0.22	0.26	0.17	0.30	0.37	0.25	0.18	0.17	0.18	0.15	0.21	0.19	0.27	0.21	0.24	0.26
C8	0.16	0.30	0.23	0.23	0.21	0.19	0.24	0.17	0.29	0.18	0.33	0.37	0.22	0.21	0.17	0.23	0.28	0.18	0.17	0.32	0.15	0.20	0.20
N1	0.17	0.31	0.18	0.16	0.20	0.23	0.21	0.26	0.26	0.17	0.30	0.37	0.25	0.18	0.17	0.18	0.16	0.23	0.23	0.27	0.27	0.27	0.31
N3	0.19	0.31	0.23	0.22	0.21	0.25	0.22	0.26	0.28	0.18	0.32	0.38	0.25	0.19	0.18	0.25	0.25	0.23	0.23	0.29	0.24	0.24	0.28
N6	0.14	0.29	0.13	0.10	0.19	0.17	0.21	0.20	0.25	0.16	0.29	0.34	0.24	0.17	0.15	0.15	0.10	0.20	0.17	0.26	0.21	0.24	0.25
N7	0.15	0.32	0.21	0.20	0.21	0.17	0.23	0.16	0.29	0.17	0.33	0.39	0.24	0.20	0.17	0.21	0.23	0.18	0.15	0.30	0.13	0.19	0.19
N9	0.18	0.30	0.25	0.24	0.21	0.21	0.23	0.21	0.29	0.18	0.33	0.37	0.23	0.20	0.18	0.26	0.29	0.20	0.19	0.31	0.17	0.21	0.22
O2'	0.15	0.26	0.24	0.24	0.16	0.20	0.19	0.20	0.26	0.13	0.30	0.32	0.18	0.16	0.13	0.27	0.31	0.17	0.16	0.30	0.16	0.17	0.20
O3'	0.15	0.23	0.26	0.26	0.16	0.16	0.20	0.13	0.27	0.16	0.29	0.26	0.15	0.18	0.14	0.25	0.31	0.13	0.14	0.32	0.14	0.18	0.14
O4'	0.19	0.29	0.27	0.29	0.22	0.23	0.26	0.22	0.32	0.21	0.33	0.32	0.22	0.24	0.19	0.27	0.34	0.19	0.22	0.35	0.19	0.25	0.23
O5'	0.08	0.19	0.19	0.22	0.13	0.12	0.20	0.11	0.28	0.12	0.28	0.18	0.10	0.18	0.09	0.16	0.28	0.08	0.15	0.34	0.17	0.23	0.16
OP1	0.07	0.13	0.15	0.20	0.12	0.10	0.20	0.14	0.27	0.14	0.24	0.10	0.09	0.20	0.09	0.10	0.24	0.06	0.22	0.36	0.27	0.34	0.25
OP2	0.09	0.11	0.15	0.18	0.10	0.10	0.18	0.13	0.27	0.12	0.25	0.09	0.08	0.18	0.08	0.14	0.22	0.08	0.20	0.34	0.23	0.29	0.21
P	0.06	0.15	0.14	0.20	0.12	0.09	0.20	0.12	0.28	0.13	0.27	0.12	0.08	0.20	0.08	0.10	0.24	0.05	0.19	0.36	0.23	0.30	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.08	0.07
C2	0.02	0.00	0.14	0.18	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.21	0.04	0.14	0.01	0.16	0.19	0.13
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.01	0.08	0.07	0.11	0.17	0.14	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.08	0.09	0.06	0.03
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.01	0.15	0.08	0.17	0.20	0.16	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.13	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.12	0.02	0.12	0.01	0.13	0.14	0.11
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.07	0.07	0.07	0.05	0.09	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.10	0.05	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.18	0.01	0.19	0.21	0.17
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.14	0.13	0.12	0.07	0.06	0.16	0.07	0.07	0.05	0.01	0.01	0.17	0.03	0.02	0.02
C6	0.02	0.00	0.08	0.15	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.17	0.01	0.20	0.00	0.23	0.26	0.21
C8	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.05	0.14	0.02	0.13	0.13	0.12
N1	0.02	0.00	0.11	0.17	0.00	0.07	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.20	0.03	0.18	0.01	0.21	0.24	0.18
N2	0.03	0.00	0.17	0.20	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.25	0.05	0.13	0.01	0.15	0.18	0.12
N3	0.02	0.00	0.14	0.16	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.18	0.04	0.11	0.01	0.12	0.14	0.10
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.04	0.19	0.02	0.19	0.20	0.19
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.09	0.10	0.08
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.07	0.05	0.05	0.08	0.15	0.11	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.05	0.11	0.06	0.05
O3'	0.01	0.21	0.01	0.01	0.12	0.02	0.12	0.05	0.17	0.09	0.20	0.25	0.18	0.10	0.05	0.02	0.00	0.02	0.08	0.19	0.21	0.15	0.13
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.05	0.04	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.01	0.07	0.14	0.12
O5'	0.04	0.14	0.03	0.05	0.12	0.02	0.18	0.01	0.20	0.14	0.18	0.13	0.11	0.19	0.09	0.04	0.08	0.07	0.00	0.23	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.19	0.01	0.23	0.00	0.28	0.31	0.26
OP1	0.04	0.16	0.09	0.13	0.13	0.05	0.19	0.03	0.23	0.13	0.21	0.15	0.12	0.19	0.09	0.11	0.21	0.07	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.19	0.06	0.08	0.14	0.03	0.21	0.02	0.26	0.13	0.24	0.18	0.14	0.20	0.10	0.06	0.15	0.14	0.01	0.31	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.13	0.03	0.07	0.11	0.03	0.17	0.02	0.21	0.12	0.18	0.12	0.10	0.19	0.08	0.05	0.13	0.12	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00