Doublet Group distance statistics: 49712

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.019, 0.037, 0.055, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.037 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.013, 0.032, 0.050, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.013, 0.032, 0.052, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.012, 0.032, 0.051, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.032 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.024, 0.048, 0.072, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.048 std_dev=0.024
N9	A	0, 0.028, 0.057, 0.086, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.057 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.037, 0.079, 0.120, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.079 std_dev=0.042
N7	A	0, 0.035, 0.078, 0.121, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.078 std_dev=0.043
C8	A	0, 0.046, 0.097, 0.148, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.097 std_dev=0.051
N3	B	0, 0.135, 0.268, 0.402, 0.409 max_d=0.409 avg_d=0.268 std_dev=0.134
N2	B	0, 0.157, 0.337, 0.517, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.337 std_dev=0.180
C2	B	0, 0.072, 0.324, 0.576, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.324 std_dev=0.252
C4	B	0, 0.245, 0.517, 0.788, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.517 std_dev=0.272
O4'	A	0, 0.275, 0.553, 0.831, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.553 std_dev=0.278
O2'	A	0, 0.248, 0.527, 0.806, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.527 std_dev=0.279
C2'	A	0, 0.276, 0.559, 0.843, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.559 std_dev=0.284
N9	B	0, 0.378, 0.709, 1.041, 1.001 max_d=1.001 avg_d=0.709 std_dev=0.331
N1	B	0, 0.329, 0.772, 1.214, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.772 std_dev=0.442
C4'	A	0, 0.453, 0.898, 1.343, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.898 std_dev=0.445
C1'	B	0, 0.521, 0.972, 1.423, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.972 std_dev=0.451
C5	B	0, 0.372, 0.834, 1.295, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.834 std_dev=0.461
C3'	A	0, 0.459, 0.921, 1.384, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.921 std_dev=0.462
C2'	B	0, 0.458, 0.925, 1.393, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.925 std_dev=0.468
C8	B	0, 0.471, 0.940, 1.410, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.940 std_dev=0.470
O5'	B	0, 0.538, 1.010, 1.482, 1.400 max_d=1.400 avg_d=1.010 std_dev=0.472
C3'	B	0, 0.471, 0.958, 1.445, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.958 std_dev=0.487
C6	B	0, 0.455, 1.009, 1.563, 1.537 max_d=1.537 avg_d=1.009 std_dev=0.554
N7	B	0, 0.504, 1.069, 1.634, 1.612 max_d=1.612 avg_d=1.069 std_dev=0.565
P	B	0, 0.658, 1.231, 1.803, 1.787 max_d=1.787 avg_d=1.231 std_dev=0.572
OP2	B	0, 0.621, 1.198, 1.775, 1.896 max_d=1.896 avg_d=1.198 std_dev=0.577
C5'	B	0, 0.714, 1.357, 1.999, 1.854 max_d=1.854 avg_d=1.357 std_dev=0.643
C4'	B	0, 0.704, 1.349, 1.993, 1.902 max_d=1.902 avg_d=1.349 std_dev=0.644
O4'	B	0, 0.735, 1.380, 2.026, 1.870 max_d=1.870 avg_d=1.380 std_dev=0.645
OP1	B	0, 0.677, 1.328, 1.979, 2.106 max_d=2.106 avg_d=1.328 std_dev=0.651
O3'	A	0, 0.663, 1.342, 2.022, 2.262 max_d=2.262 avg_d=1.342 std_dev=0.679
C5'	A	0, 0.672, 1.358, 2.043, 2.303 max_d=2.303 avg_d=1.358 std_dev=0.685
O6	B	0, 0.660, 1.387, 2.113, 2.018 max_d=2.018 avg_d=1.387 std_dev=0.727
O2'	B	0, 0.803, 1.550, 2.297, 2.352 max_d=2.352 avg_d=1.550 std_dev=0.747
O3'	B	0, 0.811, 1.562, 2.313, 2.277 max_d=2.277 avg_d=1.562 std_dev=0.751
O5'	A	0, 1.019, 1.851, 2.683, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.851 std_dev=0.832
OP1	A	0, 1.835, 3.323, 4.811, 4.065 max_d=4.065 avg_d=3.323 std_dev=1.488
P	A	0, 2.001, 3.627, 5.252, 4.590 max_d=4.590 avg_d=3.627 std_dev=1.626
OP2	A	0, 3.015, 5.456, 7.898, 6.674 max_d=6.674 avg_d=5.456 std_dev=2.441

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.10	0.06	0.08	0.09
C2	0.03	0.00	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.09	0.19	0.15	0.27	0.24
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.07	0.08	0.10	0.11	0.07	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.12	0.10	0.09	0.06
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.08	0.06	0.09	0.09	0.08	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.14	0.17	0.09	0.07
C4	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.06	0.20	0.18	0.30	0.26
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.03	0.05	0.05	0.05	0.03	0.03	0.05	0.03	0.00	0.01	0.04	0.21	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.04	0.25	0.27	0.47	0.36
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.04	0.06	0.06	0.05	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.01	0.14	0.14	0.02
C6	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.06	0.26	0.28	0.49	0.38
C8	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.06	0.02	0.27	0.29	0.46	0.36
N1	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.08	0.23	0.22	0.39	0.32
N3	0.02	0.00	0.11	0.09	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.08	0.16	0.11	0.20	0.19
N6	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.10	0.06	0.29	0.34	0.60	0.44
N7	0.01	0.01	0.07	0.06	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01	0.29	0.34	0.58	0.43
N9	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.19	0.17	0.26	0.23
O2'	0.03	0.11	0.00	0.01	0.05	0.05	0.05	0.05	0.06	0.07	0.09	0.10	0.06	0.06	0.02	0.00	0.05	0.06	0.05	0.07	0.27	0.10
O3'	0.03	0.13	0.02	0.01	0.08	0.03	0.08	0.04	0.10	0.06	0.13	0.11	0.10	0.06	0.04	0.05	0.00	0.03	0.09	0.15	0.26	0.06
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.08	0.08	0.06	0.01	0.02	0.06	0.03	0.00	0.05	0.02	0.08	0.04
O5'	0.10	0.19	0.12	0.14	0.20	0.01	0.25	0.01	0.26	0.27	0.23	0.16	0.29	0.29	0.19	0.05	0.09	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.15	0.10	0.17	0.18	0.04	0.27	0.14	0.28	0.29	0.22	0.11	0.34	0.34	0.17	0.07	0.15	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.27	0.09	0.09	0.30	0.21	0.47	0.14	0.49	0.46	0.39	0.20	0.60	0.58	0.26	0.27	0.26	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.24	0.06	0.07	0.26	0.05	0.36	0.02	0.38	0.36	0.32	0.19	0.44	0.43	0.23	0.10	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.10	0.07	0.07	0.07	0.10	0.10	0.10	0.13	0.07	0.14	0.11	0.07	0.09	0.07	0.09	0.09	0.11	0.11	0.15	0.12	0.17	0.13
C2	0.13	0.06	0.08	0.07	0.05	0.13	0.04	0.14	0.05	0.09	0.07	0.09	0.04	0.05	0.09	0.10	0.05	0.18	0.13	0.06	0.14	0.16	0.14
C2'	0.09	0.16	0.04	0.04	0.13	0.09	0.16	0.09	0.19	0.12	0.19	0.17	0.13	0.15	0.11	0.06	0.04	0.11	0.08	0.21	0.09	0.16	0.10
C3'	0.09	0.17	0.06	0.05	0.15	0.09	0.18	0.08	0.21	0.14	0.21	0.17	0.14	0.17	0.12	0.08	0.05	0.11	0.06	0.23	0.07	0.16	0.09
C4	0.10	0.07	0.07	0.06	0.05	0.10	0.05	0.11	0.07	0.06	0.09	0.09	0.05	0.05	0.07	0.08	0.05	0.13	0.12	0.09	0.12	0.17	0.13
C4'	0.10	0.14	0.10	0.09	0.13	0.10	0.15	0.09	0.18	0.13	0.18	0.13	0.12	0.15	0.11	0.13	0.12	0.11	0.08	0.20	0.10	0.16	0.10
C5	0.10	0.05	0.07	0.06	0.04	0.09	0.04	0.10	0.05	0.06	0.06	0.08	0.04	0.04	0.07	0.07	0.05	0.13	0.12	0.05	0.12	0.18	0.14
C5'	0.11	0.12	0.13	0.13	0.12	0.11	0.15	0.09	0.17	0.13	0.16	0.11	0.11	0.15	0.11	0.16	0.17	0.11	0.10	0.19	0.12	0.17	0.11
C6	0.12	0.04	0.09	0.07	0.06	0.10	0.04	0.12	0.03	0.09	0.04	0.07	0.04	0.07	0.09	0.10	0.05	0.16	0.13	0.03	0.13	0.17	0.14
C8	0.07	0.07	0.06	0.07	0.05	0.07	0.06	0.08	0.09	0.05	0.10	0.09	0.05	0.06	0.05	0.05	0.09	0.09	0.12	0.10	0.14	0.20	0.15
N1	0.14	0.04	0.09	0.07	0.06	0.13	0.05	0.14	0.03	0.10	0.05	0.08	0.04	0.07	0.10	0.12	0.06	0.19	0.13	0.03	0.14	0.16	0.14
N3	0.12	0.07	0.07	0.07	0.05	0.12	0.05	0.13	0.07	0.07	0.09	0.10	0.05	0.05	0.08	0.09	0.05	0.16	0.12	0.09	0.12	0.16	0.13
N6	0.13	0.04	0.12	0.09	0.07	0.10	0.07	0.11	0.04	0.11	0.03	0.06	0.05	0.09	0.11	0.15	0.09	0.16	0.13	0.04	0.13	0.17	0.14
N7	0.07	0.05	0.06	0.06	0.04	0.07	0.04	0.08	0.05	0.05	0.06	0.08	0.04	0.04	0.05	0.04	0.08	0.09	0.12	0.06	0.13	0.20	0.15
N9	0.08	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.07	0.09	0.10	0.05	0.11	0.10	0.06	0.06	0.06	0.07	0.08	0.11	0.11	0.12	0.12	0.18	0.13
O2'	0.09	0.15	0.04	0.04	0.12	0.09	0.15	0.10	0.18	0.11	0.19	0.16	0.11	0.14	0.10	0.06	0.07	0.11	0.09	0.21	0.10	0.16	0.11
O3'	0.09	0.18	0.05	0.05	0.15	0.09	0.19	0.07	0.23	0.15	0.22	0.18	0.14	0.18	0.12	0.08	0.03	0.11	0.05	0.26	0.07	0.16	0.09
O4'	0.10	0.11	0.10	0.10	0.09	0.11	0.12	0.10	0.16	0.09	0.16	0.12	0.09	0.12	0.08	0.14	0.13	0.11	0.10	0.18	0.11	0.16	0.11
O5'	0.36	0.32	0.39	0.39	0.33	0.37	0.29	0.36	0.27	0.32	0.28	0.33	0.34	0.30	0.34	0.41	0.41	0.36	0.36	0.24	0.36	0.34	0.35
OP1	0.52	0.51	0.55	0.56	0.51	0.54	0.50	0.54	0.48	0.51	0.49	0.51	0.51	0.50	0.51	0.54	0.58	0.52	0.56	0.45	0.57	0.57	0.57
OP2	0.91	0.92	0.93	0.95	0.93	0.92	0.93	0.94	0.91	0.93	0.92	0.90	0.92	0.93	0.93	0.87	0.95	0.90	0.97	0.87	0.98	0.98	0.98
P	0.63	0.60	0.67	0.68	0.60	0.64	0.58	0.65	0.55	0.60	0.56	0.60	0.61	0.58	0.61	0.66	0.71	0.61	0.66	0.50	0.66	0.64	0.65

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.10	0.12	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.20	0.00	0.25	0.30	0.24
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.06	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.07	0.07	0.09	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.11	0.07	0.11	0.09	0.08	0.09	0.06	0.02	0.00	0.01	0.04	0.13	0.06	0.09	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.02	0.21	0.01	0.24	0.27	0.24
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.08	0.06	0.04	0.04	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.05	0.01
C5	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.01	0.25	0.01	0.32	0.35	0.30
C5'	0.03	0.10	0.01	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.15	0.15	0.13	0.08	0.08	0.17	0.10	0.02	0.04	0.02	0.01	0.18	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.14	0.01	0.26	0.01	0.34	0.39	0.33
C8	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.02	0.24	0.01	0.28	0.27	0.27
N1	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.01	0.24	0.00	0.30	0.35	0.29
N2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.02	0.19	0.01	0.23	0.29	0.23
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.02	0.18	0.01	0.21	0.25	0.21
N7	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.28	0.01	0.35	0.37	0.33
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.18	0.01	0.20	0.21	0.20
O2'	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.03	0.05	0.07	0.09	0.03
O3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.09	0.01	0.12	0.04	0.14	0.08	0.13	0.11	0.09	0.11	0.06	0.06	0.00	0.01	0.10	0.15	0.11	0.16	0.11
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.02	0.09	0.09	0.07
O5'	0.08	0.20	0.03	0.04	0.21	0.01	0.25	0.01	0.26	0.24	0.24	0.19	0.18	0.28	0.18	0.03	0.10	0.06	0.00	0.29	0.03	0.03	0.00
O6	0.02	0.00	0.07	0.13	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.02	0.29	0.00	0.39	0.43	0.36
OP1	0.10	0.25	0.07	0.06	0.24	0.07	0.32	0.08	0.34	0.28	0.30	0.23	0.21	0.35	0.20	0.07	0.11	0.09	0.03	0.39	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.30	0.09	0.09	0.27	0.05	0.35	0.02	0.39	0.27	0.35	0.29	0.25	0.37	0.21	0.09	0.16	0.09	0.03	0.43	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.24	0.04	0.04	0.24	0.01	0.30	0.01	0.33	0.27	0.29	0.23	0.21	0.33	0.20	0.03	0.11	0.07	0.00	0.36	0.01	0.00	0.00