Doublet Group distance statistics: 49715

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N9	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.004, 0.019, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C2'	A	0, -0.028, 0.192, 0.412, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.192 std_dev=0.220
O4'	A	0, -0.032, 0.194, 0.420, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.194 std_dev=0.226
O2'	A	0, -0.006, 0.220, 0.447, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.220 std_dev=0.227
N3	B	0, 0.134, 0.410, 0.685, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.410 std_dev=0.275
N9	B	0, 0.144, 0.459, 0.774, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.459 std_dev=0.315
C4	B	0, 0.152, 0.476, 0.800, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.476 std_dev=0.324
C1'	B	0, 0.108, 0.446, 0.784, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.446 std_dev=0.338
C2'	B	0, 0.118, 0.459, 0.800, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.459 std_dev=0.341
O2'	B	0, 0.095, 0.450, 0.805, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.450 std_dev=0.355
C4'	A	0, -0.053, 0.303, 0.660, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.303 std_dev=0.357
C3'	A	0, -0.053, 0.305, 0.663, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.305 std_dev=0.358
C2	B	0, 0.136, 0.528, 0.919, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.528 std_dev=0.392
O5'	B	0, 0.126, 0.520, 0.914, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.520 std_dev=0.394
C8	B	0, 0.173, 0.580, 0.988, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.580 std_dev=0.407
C3'	B	0, 0.135, 0.544, 0.954, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.544 std_dev=0.409
N2	B	0, 0.128, 0.542, 0.955, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.542 std_dev=0.413
O5'	A	0, -0.024, 0.405, 0.834, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.405 std_dev=0.429
C5	B	0, 0.166, 0.629, 1.092, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.629 std_dev=0.463
N7	B	0, 0.185, 0.680, 1.174, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.680 std_dev=0.494
O3'	A	0, -0.078, 0.423, 0.924, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.423 std_dev=0.501
O4'	B	0, 0.077, 0.581, 1.085, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.581 std_dev=0.504
P	B	0, 0.144, 0.659, 1.173, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.659 std_dev=0.514
C4'	B	0, 0.079, 0.606, 1.134, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.606 std_dev=0.528
O3'	B	0, 0.126, 0.676, 1.226, 1.428 max_d=1.428 avg_d=0.676 std_dev=0.550
N1	B	0, 0.129, 0.682, 1.236, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.682 std_dev=0.554
OP2	A	0, 0.129, 0.687, 1.245, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.687 std_dev=0.558
C5'	A	0, -0.068, 0.492, 1.051, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.492 std_dev=0.559
OP2	B	0, 0.155, 0.722, 1.289, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.722 std_dev=0.567
P	A	0, 0.035, 0.605, 1.176, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.605 std_dev=0.570
C6	B	0, 0.148, 0.742, 1.336, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.742 std_dev=0.594
C5'	B	0, 0.058, 0.679, 1.300, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.679 std_dev=0.621
OP1	B	0, 0.104, 0.776, 1.447, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.776 std_dev=0.671
OP1	A	0, -0.025, 0.708, 1.440, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.708 std_dev=0.732
O6	B	0, 0.153, 0.899, 1.645, 2.051 max_d=2.051 avg_d=0.899 std_dev=0.746

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.07	0.06	0.02
C2	0.01	0.00	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.10	0.09	0.07	0.05	0.04
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.06	0.09	0.01	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.03	0.15	0.07
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.09	0.03	0.10	0.08	0.09	0.05	0.05	0.01	0.01	0.00	0.07	0.04	0.11	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.06	0.11	0.09	0.04	0.06
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.07	0.03	0.01	0.01	0.08	0.05	0.02
C5	0.02	0.00	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.04	0.15	0.13	0.07	0.10
C5'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.10	0.06	0.07	0.07	0.09	0.04	0.07	0.01	0.00	0.01	0.10	0.03	0.01
C6	0.02	0.00	0.02	0.09	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.06	0.15	0.12	0.09	0.10
C8	0.02	0.00	0.11	0.03	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.04	0.04	0.18	0.16	0.06	0.14
N1	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.09	0.12	0.09	0.07	0.07
N3	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.10	0.07	0.06	0.04	0.03
N6	0.02	0.00	0.01	0.09	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.12	0.05	0.17	0.14	0.12	0.13
N7	0.02	0.00	0.08	0.05	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.07	0.01	0.19	0.17	0.11	0.15
N9	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.11	0.11	0.02	0.06
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.07	0.07	0.07	0.05	0.11	0.03	0.04	0.07	0.11	0.05	0.00	0.08	0.06	0.02	0.07	0.11	0.02
O3'	0.05	0.08	0.03	0.01	0.06	0.03	0.08	0.01	0.10	0.04	0.10	0.05	0.12	0.07	0.02	0.08	0.00	0.05	0.07	0.06	0.06	0.04
O4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.06	0.01	0.04	0.00	0.06	0.04	0.09	0.10	0.05	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.06	0.10	0.06	0.05
O5'	0.04	0.09	0.06	0.07	0.11	0.01	0.15	0.01	0.15	0.18	0.12	0.07	0.17	0.19	0.11	0.02	0.07	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.07	0.03	0.04	0.09	0.08	0.13	0.10	0.12	0.16	0.09	0.06	0.14	0.17	0.11	0.07	0.06	0.10	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.06	0.05	0.15	0.11	0.04	0.05	0.07	0.03	0.09	0.06	0.07	0.04	0.12	0.11	0.02	0.11	0.06	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.04	0.07	0.06	0.06	0.02	0.10	0.01	0.10	0.14	0.07	0.03	0.13	0.15	0.06	0.02	0.04	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.05	0.39	0.38	0.11	0.33	0.05	0.33	0.07	0.18	0.12	0.13	0.09	0.10	0.21	0.37	0.33	0.35	0.41	0.11	0.45	0.31	0.36
C2	0.39	0.10	0.36	0.34	0.19	0.38	0.17	0.37	0.10	0.32	0.09	0.20	0.11	0.25	0.30	0.34	0.21	0.48	0.41	0.10	0.51	0.29	0.39
C2'	0.26	0.13	0.32	0.31	0.08	0.27	0.09	0.27	0.17	0.13	0.20	0.18	0.07	0.09	0.15	0.32	0.27	0.29	0.35	0.22	0.38	0.29	0.30
C3'	0.26	0.06	0.32	0.31	0.07	0.26	0.05	0.27	0.14	0.11	0.16	0.10	0.07	0.04	0.15	0.30	0.28	0.27	0.37	0.20	0.38	0.27	0.31
C4	0.35	0.07	0.37	0.35	0.15	0.33	0.11	0.33	0.05	0.25	0.08	0.17	0.10	0.17	0.25	0.34	0.26	0.39	0.40	0.06	0.46	0.29	0.36
C4'	0.25	0.07	0.31	0.31	0.06	0.26	0.05	0.27	0.14	0.10	0.17	0.10	0.07	0.04	0.14	0.29	0.29	0.27	0.35	0.21	0.38	0.28	0.31
C5	0.32	0.10	0.32	0.30	0.16	0.28	0.14	0.28	0.09	0.24	0.10	0.19	0.11	0.19	0.24	0.27	0.19	0.35	0.38	0.10	0.42	0.27	0.34
C5'	0.18	0.09	0.24	0.25	0.03	0.19	0.10	0.21	0.19	0.04	0.20	0.09	0.04	0.08	0.08	0.20	0.23	0.19	0.30	0.26	0.31	0.25	0.25
C6	0.33	0.13	0.28	0.25	0.19	0.27	0.19	0.28	0.14	0.29	0.13	0.21	0.12	0.25	0.27	0.21	0.13	0.39	0.36	0.15	0.43	0.26	0.34
C8	0.28	0.04	0.33	0.32	0.12	0.26	0.06	0.27	0.04	0.17	0.08	0.12	0.11	0.10	0.19	0.29	0.26	0.28	0.38	0.07	0.40	0.29	0.33
N1	0.36	0.12	0.30	0.28	0.19	0.33	0.19	0.33	0.14	0.33	0.11	0.21	0.12	0.27	0.29	0.26	0.14	0.46	0.38	0.14	0.48	0.27	0.37
N3	0.38	0.07	0.39	0.37	0.16	0.38	0.13	0.37	0.06	0.28	0.08	0.18	0.10	0.20	0.28	0.38	0.26	0.45	0.42	0.06	0.51	0.30	0.39
N6	0.27	0.16	0.17	0.16	0.20	0.19	0.23	0.22	0.20	0.30	0.17	0.22	0.15	0.28	0.26	0.06	0.11	0.34	0.32	0.21	0.38	0.23	0.30
N7	0.26	0.09	0.29	0.27	0.14	0.23	0.10	0.24	0.08	0.19	0.10	0.17	0.11	0.14	0.20	0.23	0.20	0.27	0.36	0.09	0.38	0.27	0.31
N9	0.32	0.04	0.37	0.36	0.13	0.31	0.07	0.31	0.03	0.20	0.09	0.14	0.10	0.12	0.22	0.35	0.29	0.34	0.40	0.07	0.44	0.30	0.35
O2'	0.27	0.11	0.34	0.34	0.09	0.29	0.09	0.28	0.16	0.14	0.19	0.17	0.07	0.09	0.16	0.35	0.30	0.30	0.36	0.21	0.40	0.30	0.31
O3'	0.26	0.04	0.32	0.31	0.08	0.26	0.02	0.27	0.12	0.11	0.13	0.07	0.09	0.03	0.15	0.30	0.27	0.28	0.37	0.18	0.39	0.26	0.31
O4'	0.29	0.05	0.36	0.36	0.10	0.31	0.05	0.31	0.09	0.15	0.12	0.10	0.10	0.07	0.19	0.33	0.32	0.32	0.39	0.14	0.43	0.32	0.35
O5'	0.22	0.07	0.29	0.31	0.07	0.22	0.08	0.25	0.16	0.07	0.17	0.08	0.11	0.06	0.12	0.25	0.29	0.21	0.36	0.23	0.35	0.22	0.28
OP1	0.10	0.08	0.17	0.19	0.08	0.12	0.19	0.15	0.27	0.11	0.23	0.04	0.05	0.20	0.05	0.13	0.22	0.09	0.26	0.37	0.23	0.24	0.21
OP2	0.11	0.06	0.18	0.21	0.06	0.12	0.12	0.16	0.19	0.07	0.18	0.07	0.07	0.12	0.06	0.13	0.21	0.10	0.29	0.25	0.27	0.24	0.23
P	0.13	0.07	0.21	0.23	0.04	0.15	0.14	0.18	0.22	0.06	0.21	0.04	0.06	0.13	0.04	0.16	0.24	0.12	0.29	0.30	0.28	0.22	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.01	0.13	0.19	0.06
C2	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.07	0.02	0.27	0.01	0.25	0.24	0.23
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.24	0.09
C3'	0.03	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.11	0.08	0.10	0.08	0.07	0.10	0.08	0.01	0.00	0.01	0.09	0.12	0.07	0.20	0.09
C4	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.08	0.01	0.29	0.01	0.25	0.22	0.23
C4'	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.06	0.09	0.04	0.02	0.01	0.09	0.04	0.04	0.01	0.00	0.02	0.08	0.14	0.17	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.10	0.00	0.07	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.12	0.01	0.37	0.01	0.31	0.28	0.32
C5'	0.03	0.09	0.01	0.01	0.12	0.00	0.18	0.00	0.19	0.20	0.14	0.06	0.07	0.22	0.12	0.04	0.02	0.01	0.02	0.21	0.18	0.09	0.01
C6	0.00	0.01	0.02	0.11	0.01	0.06	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02	0.38	0.00	0.33	0.32	0.35
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.02	0.37	0.01	0.29	0.20	0.27
N1	0.00	0.00	0.01	0.10	0.00	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.10	0.01	0.33	0.01	0.30	0.29	0.30
N2	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02	0.24	0.02	0.22	0.24	0.21
N3	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.05	0.02	0.23	0.02	0.21	0.21	0.18
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.13	0.02	0.41	0.01	0.34	0.28	0.35
N9	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.26	0.01	0.22	0.18	0.18
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.08	0.04	0.08	0.04	0.09	0.05	0.10	0.10	0.09	0.07	0.04	0.00	0.10	0.08	0.05	0.09	0.10	0.21	0.06
O3'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.08	0.01	0.12	0.02	0.13	0.10	0.10	0.05	0.05	0.13	0.07	0.10	0.00	0.00	0.11	0.15	0.10	0.13	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.02	0.12	0.23	0.03
O5'	0.11	0.27	0.06	0.09	0.29	0.02	0.37	0.02	0.38	0.37	0.33	0.24	0.23	0.41	0.26	0.05	0.11	0.07	0.00	0.41	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.12	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.15	0.02	0.41	0.00	0.37	0.37	0.39
OP1	0.13	0.25	0.07	0.07	0.25	0.14	0.31	0.18	0.33	0.29	0.30	0.22	0.21	0.34	0.22	0.10	0.10	0.12	0.01	0.37	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.24	0.24	0.20	0.22	0.17	0.28	0.09	0.32	0.20	0.29	0.24	0.21	0.28	0.18	0.21	0.13	0.23	0.02	0.37	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.23	0.09	0.09	0.23	0.04	0.32	0.01	0.35	0.27	0.30	0.21	0.18	0.35	0.18	0.06	0.06	0.03	0.00	0.39	0.00	0.00	0.00