Doublet Group distance statistics: 49716

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.012 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.007, 0.021, 0.036, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C4	B	0, 0.075, 0.184, 0.294, 0.287 max_d=0.287 avg_d=0.184 std_dev=0.110
C5	B	0, 0.089, 0.258, 0.427, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.258 std_dev=0.169
O4'	A	0, 0.012, 0.241, 0.470, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.241 std_dev=0.229
N3	B	0, 0.105, 0.335, 0.564, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.335 std_dev=0.229
C2'	A	0, 0.017, 0.265, 0.514, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.265 std_dev=0.249
N9	B	0, 0.052, 0.339, 0.625, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.339 std_dev=0.286
C6	B	0, 0.022, 0.354, 0.686, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.354 std_dev=0.332
C4'	A	0, 0.065, 0.408, 0.751, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.408 std_dev=0.343
C1'	B	0, 0.111, 0.468, 0.826, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.468 std_dev=0.357
C3'	A	0, 0.073, 0.469, 0.866, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.469 std_dev=0.396
O6	B	0, -0.023, 0.403, 0.829, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.403 std_dev=0.426
N7	B	0, -0.047, 0.384, 0.815, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.384 std_dev=0.431
O2'	A	0, -0.089, 0.345, 0.779, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.345 std_dev=0.434
C2	B	0, 0.126, 0.574, 1.022, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.574 std_dev=0.448
N1	B	0, 0.128, 0.584, 1.040, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.584 std_dev=0.456
C8	B	0, -0.052, 0.475, 1.003, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.475 std_dev=0.527
O3'	A	0, 0.099, 0.664, 1.229, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.664 std_dev=0.565
C2'	B	0, 0.154, 0.771, 1.388, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.771 std_dev=0.617
C5'	A	0, 0.064, 0.698, 1.333, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.698 std_dev=0.635
O2'	B	0, 0.137, 0.831, 1.526, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.831 std_dev=0.694
N2	B	0, 0.111, 0.845, 1.580, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.845 std_dev=0.734
O5'	A	0, 0.068, 0.815, 1.562, 1.668 max_d=1.668 avg_d=0.815 std_dev=0.747
P	A	0, 0.036, 0.792, 1.549, 1.867 max_d=1.867 avg_d=0.792 std_dev=0.756
O4'	B	0, 0.158, 0.957, 1.756, 1.893 max_d=1.893 avg_d=0.957 std_dev=0.799
C3'	B	0, 0.221, 1.211, 2.202, 2.237 max_d=2.237 avg_d=1.211 std_dev=0.991
OP1	A	0, 0.126, 1.124, 2.123, 2.312 max_d=2.312 avg_d=1.124 std_dev=0.998
C4'	B	0, 0.224, 1.248, 2.273, 2.276 max_d=2.276 avg_d=1.248 std_dev=1.024
OP2	A	0, 0.130, 1.309, 2.489, 2.735 max_d=2.735 avg_d=1.309 std_dev=1.180
O3'	B	0, 0.267, 1.661, 3.054, 3.095 max_d=3.095 avg_d=1.661 std_dev=1.393
C5'	B	0, 0.271, 1.711, 3.151, 3.418 max_d=3.418 avg_d=1.711 std_dev=1.440
O5'	B	0, 0.213, 1.715, 3.216, 3.665 max_d=3.665 avg_d=1.715 std_dev=1.502
OP2	B	0, 0.175, 2.076, 3.977, 4.588 max_d=4.588 avg_d=2.076 std_dev=1.901
P	B	0, 0.219, 2.244, 4.270, 4.797 max_d=4.797 avg_d=2.244 std_dev=2.025
OP1	B	0, 0.284, 2.775, 5.265, 5.786 max_d=5.786 avg_d=2.775 std_dev=2.490

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.14	0.43	0.90	0.29
C2	0.02	0.00	0.20	0.25	0.01	0.10	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.29	0.04	0.33	0.71	0.61	0.22
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.04	0.02	0.08	0.09	0.14	0.21	0.05	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.24	0.34	0.60	0.16
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.13	0.01	0.10	0.04	0.13	0.16	0.20	0.24	0.11	0.12	0.06	0.03	0.00	0.01	0.30	0.24	0.35	0.09
C4	0.01	0.01	0.10	0.13	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.13	0.02	0.37	0.64	0.67	0.21
C4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.05	0.10	0.08	0.10	0.05	0.08	0.03	0.08	0.03	0.00	0.01	0.17	0.60	0.19
C5	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.00	0.47	0.67	0.50	0.16
C5'	0.02	0.11	0.02	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.16	0.09	0.10	0.08	0.14	0.06	0.08	0.10	0.02	0.01	0.03	0.24	0.03
C6	0.01	0.00	0.08	0.13	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.16	0.02	0.47	0.73	0.42	0.16
C8	0.01	0.01	0.09	0.16	0.00	0.10	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.17	0.03	0.49	0.53	0.65	0.14
N1	0.02	0.00	0.14	0.20	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.24	0.03	0.41	0.74	0.50	0.19
N3	0.01	0.00	0.21	0.24	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.26	0.04	0.29	0.65	0.70	0.24
N6	0.01	0.00	0.05	0.11	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.09	0.15	0.02	0.52	0.74	0.27	0.15
N7	0.00	0.01	0.05	0.12	0.00	0.08	0.00	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.14	0.02	0.54	0.61	0.42	0.13
N9	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.35	0.54	0.77	0.22
O2'	0.01	0.19	0.00	0.03	0.10	0.08	0.06	0.08	0.10	0.05	0.15	0.19	0.09	0.03	0.02	0.00	0.09	0.07	0.15	0.21	0.68	0.17
O3'	0.02	0.29	0.04	0.00	0.13	0.03	0.11	0.10	0.16	0.17	0.24	0.26	0.15	0.14	0.06	0.09	0.00	0.02	0.23	0.15	0.28	0.13
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.07	0.02	0.00	0.06	0.37	1.01	0.38
O5'	0.14	0.33	0.24	0.30	0.37	0.01	0.47	0.01	0.47	0.49	0.41	0.29	0.52	0.54	0.35	0.15	0.23	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.43	0.71	0.34	0.24	0.64	0.17	0.67	0.03	0.73	0.53	0.74	0.65	0.74	0.61	0.54	0.21	0.15	0.37	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.90	0.61	0.60	0.35	0.67	0.60	0.50	0.24	0.42	0.65	0.50	0.70	0.27	0.42	0.77	0.68	0.28	1.01	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.29	0.22	0.16	0.09	0.21	0.19	0.16	0.03	0.16	0.14	0.19	0.24	0.15	0.13	0.22	0.17	0.13	0.38	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.08	0.36	0.37	0.06	0.05	0.06	0.08	0.07	0.05	0.07	0.11	0.09	0.06	0.05	0.46	0.63	0.24	0.11	0.08	0.12	0.25	0.25
C2	0.11	0.07	0.29	0.34	0.08	0.10	0.07	0.10	0.07	0.09	0.07	0.07	0.08	0.08	0.10	0.38	0.59	0.24	0.12	0.07	0.12	0.19	0.19
C2'	0.14	0.16	0.31	0.30	0.15	0.13	0.16	0.22	0.16	0.15	0.16	0.17	0.16	0.16	0.15	0.44	0.58	0.35	0.23	0.17	0.31	0.39	0.41
C3'	0.26	0.27	0.18	0.13	0.29	0.27	0.31	0.41	0.31	0.31	0.30	0.25	0.27	0.32	0.29	0.35	0.39	0.50	0.43	0.33	0.54	0.62	0.64
C4	0.09	0.07	0.32	0.33	0.08	0.06	0.07	0.09	0.07	0.07	0.07	0.07	0.09	0.07	0.08	0.42	0.57	0.24	0.12	0.07	0.12	0.22	0.22
C4'	0.18	0.20	0.27	0.22	0.20	0.13	0.20	0.26	0.19	0.20	0.18	0.20	0.21	0.20	0.19	0.40	0.47	0.39	0.28	0.18	0.36	0.47	0.48
C5	0.09	0.07	0.30	0.30	0.08	0.06	0.07	0.09	0.07	0.08	0.07	0.06	0.09	0.07	0.09	0.43	0.52	0.24	0.12	0.07	0.14	0.22	0.23
C5'	0.27	0.30	0.24	0.19	0.31	0.25	0.33	0.38	0.33	0.33	0.31	0.28	0.30	0.34	0.31	0.35	0.38	0.47	0.43	0.33	0.52	0.63	0.63
C6	0.11	0.07	0.28	0.29	0.09	0.09	0.08	0.10	0.06	0.10	0.07	0.09	0.08	0.08	0.10	0.41	0.51	0.24	0.13	0.06	0.14	0.20	0.20
C8	0.06	0.08	0.35	0.33	0.06	0.03	0.06	0.08	0.07	0.05	0.06	0.10	0.09	0.06	0.06	0.46	0.54	0.23	0.11	0.07	0.14	0.25	0.25
N1	0.12	0.07	0.29	0.32	0.08	0.11	0.07	0.10	0.06	0.10	0.07	0.09	0.08	0.08	0.10	0.39	0.56	0.23	0.13	0.06	0.12	0.18	0.18
N3	0.09	0.07	0.31	0.35	0.08	0.08	0.07	0.09	0.07	0.07	0.07	0.07	0.09	0.07	0.08	0.40	0.60	0.24	0.12	0.07	0.12	0.20	0.21
N6	0.13	0.08	0.28	0.27	0.08	0.11	0.07	0.11	0.06	0.11	0.07	0.13	0.08	0.09	0.11	0.44	0.45	0.23	0.14	0.06	0.15	0.19	0.20
N7	0.07	0.07	0.32	0.29	0.07	0.04	0.07	0.09	0.07	0.07	0.07	0.06	0.09	0.07	0.07	0.44	0.49	0.23	0.12	0.07	0.15	0.25	0.25
N9	0.07	0.08	0.34	0.35	0.07	0.05	0.06	0.08	0.07	0.05	0.06	0.09	0.09	0.06	0.06	0.45	0.59	0.24	0.11	0.07	0.12	0.24	0.24
O2'	0.07	0.13	0.40	0.42	0.10	0.11	0.10	0.15	0.11	0.07	0.12	0.15	0.12	0.08	0.08	0.52	0.72	0.27	0.17	0.11	0.22	0.31	0.32
O3'	0.33	0.30	0.13	0.12	0.34	0.38	0.38	0.54	0.39	0.40	0.35	0.27	0.30	0.41	0.35	0.32	0.35	0.61	0.57	0.42	0.72	0.78	0.80
O4'	0.07	0.10	0.36	0.35	0.07	0.03	0.09	0.06	0.12	0.06	0.11	0.13	0.10	0.08	0.06	0.47	0.59	0.23	0.09	0.14	0.11	0.26	0.25
O5'	0.71	0.65	0.49	0.49	0.68	0.70	0.64	0.82	0.58	0.69	0.58	0.65	0.70	0.65	0.70	0.43	0.44	0.90	0.83	0.52	0.91	0.96	0.99
OP1	0.42	0.34	0.63	0.53	0.32	0.41	0.24	0.37	0.19	0.29	0.22	0.44	0.38	0.23	0.35	0.83	0.73	0.44	0.33	0.15	0.35	0.49	0.49
OP2	0.27	0.43	0.40	0.30	0.41	0.26	0.51	0.45	0.57	0.45	0.55	0.43	0.34	0.52	0.37	0.54	0.52	0.52	0.53	0.63	0.65	0.81	0.78
P	0.27	0.28	0.27	0.22	0.32	0.28	0.35	0.44	0.34	0.35	0.31	0.22	0.28	0.36	0.32	0.37	0.40	0.50	0.49	0.35	0.59	0.71	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.05	0.07	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.08	0.08
C2	0.05	0.00	0.22	0.17	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.30	0.25	0.07	0.09	0.01	0.12	0.20	0.19
C2'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.12	0.01	0.09	0.02	0.13	0.05	0.19	0.26	0.21	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.12	0.09	0.03	0.03
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.10	0.10	0.14	0.21	0.15	0.09	0.02	0.03	0.01	0.02	0.05	0.09	0.13	0.09	0.07
C4	0.02	0.02	0.12	0.08	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.16	0.12	0.05	0.10	0.02	0.12	0.17	0.18
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.08	0.01	0.08	0.05	0.08	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.01
C5	0.02	0.01	0.09	0.07	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.11	0.05	0.15	0.01	0.18	0.23	0.23
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.12	0.08	0.05	0.04	0.14	0.07	0.04	0.03	0.01	0.00	0.14	0.05	0.01	0.01
C6	0.03	0.01	0.13	0.10	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.16	0.06	0.16	0.00	0.20	0.27	0.26
C8	0.01	0.02	0.05	0.10	0.01	0.08	0.00	0.12	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.14	0.02	0.15	0.14	0.16
N1	0.05	0.00	0.19	0.14	0.02	0.01	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.26	0.22	0.07	0.12	0.00	0.17	0.24	0.24
N2	0.07	0.01	0.26	0.21	0.02	0.08	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.36	0.32	0.07	0.07	0.01	0.10	0.19	0.18
N3	0.05	0.01	0.21	0.15	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.27	0.22	0.06	0.07	0.01	0.09	0.16	0.16
N7	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.02	0.18	0.02	0.20	0.22	0.23
N9	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.04	0.03	0.02	0.09	0.03	0.10	0.12	0.13
O2'	0.02	0.30	0.00	0.03	0.16	0.04	0.12	0.04	0.18	0.03	0.26	0.36	0.27	0.03	0.04	0.00	0.03	0.05	0.05	0.17	0.13	0.04	0.05
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.12	0.03	0.11	0.03	0.16	0.10	0.22	0.32	0.22	0.10	0.03	0.03	0.00	0.02	0.08	0.16	0.23	0.18	0.14
O4'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.07	0.07	0.06	0.02	0.02	0.05	0.02	0.00	0.07	0.06	0.06	0.13	0.11
O5'	0.04	0.09	0.03	0.05	0.10	0.00	0.15	0.00	0.16	0.14	0.12	0.07	0.07	0.18	0.09	0.05	0.08	0.07	0.00	0.18	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.01	0.12	0.09	0.02	0.04	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.17	0.16	0.06	0.18	0.00	0.24	0.31	0.29
OP1	0.05	0.12	0.09	0.13	0.12	0.06	0.18	0.05	0.20	0.15	0.17	0.10	0.09	0.20	0.10	0.13	0.23	0.06	0.02	0.24	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.20	0.03	0.09	0.17	0.01	0.23	0.01	0.27	0.14	0.24	0.19	0.16	0.22	0.12	0.04	0.18	0.13	0.02	0.31	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.19	0.03	0.07	0.18	0.01	0.23	0.01	0.26	0.16	0.24	0.18	0.16	0.23	0.13	0.05	0.14	0.11	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00