Doublet Group distance statistics: 49720

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.008, 0.026, 0.045, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N7	B	0, 0.063, 0.217, 0.371, 0.336 max_d=0.336 avg_d=0.217 std_dev=0.154
C5	B	0, 0.070, 0.250, 0.429, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.250 std_dev=0.179
C8	B	0, 0.093, 0.317, 0.541, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.317 std_dev=0.224
C4	B	0, 0.102, 0.354, 0.605, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.354 std_dev=0.251
O4'	A	0, 0.085, 0.378, 0.672, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.378 std_dev=0.294
N9	B	0, 0.049, 0.359, 0.669, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.359 std_dev=0.310
C6	B	0, 0.124, 0.439, 0.755, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.439 std_dev=0.315
C2'	A	0, 0.028, 0.350, 0.673, 0.778 max_d=0.778 avg_d=0.350 std_dev=0.322
O6	B	0, 0.131, 0.534, 0.937, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.534 std_dev=0.403
N3	B	0, 0.131, 0.551, 0.971, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.551 std_dev=0.420
N1	B	0, 0.072, 0.573, 1.075, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.573 std_dev=0.501
C1'	B	0, 0.054, 0.589, 1.123, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.589 std_dev=0.535
C4'	A	0, 0.053, 0.599, 1.144, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.599 std_dev=0.545
O4'	B	0, 0.200, 0.767, 1.333, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.767 std_dev=0.567
C2	B	0, 0.017, 0.587, 1.156, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.587 std_dev=0.569
O5'	B	0, 0.243, 0.833, 1.424, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.833 std_dev=0.591
C4'	B	0, 0.220, 0.826, 1.433, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.826 std_dev=0.606
C3'	B	0, 0.073, 0.690, 1.308, 1.499 max_d=1.499 avg_d=0.690 std_dev=0.617
O2'	A	0, 0.257, 0.893, 1.529, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.893 std_dev=0.636
C5'	A	0, 0.255, 0.936, 1.617, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.936 std_dev=0.681
C2'	B	0, -0.120, 0.576, 1.272, 1.555 max_d=1.555 avg_d=0.576 std_dev=0.696
C5'	B	0, 0.287, 1.016, 1.744, 1.671 max_d=1.671 avg_d=1.016 std_dev=0.728
C3'	A	0, 0.282, 1.032, 1.782, 1.761 max_d=1.761 avg_d=1.032 std_dev=0.750
O3'	B	0, 0.153, 0.929, 1.706, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.929 std_dev=0.777
N2	B	0, -0.017, 0.783, 1.583, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.783 std_dev=0.800
P	B	0, 0.148, 1.009, 1.869, 2.103 max_d=2.103 avg_d=1.009 std_dev=0.860
OP1	B	0, 0.322, 1.268, 2.213, 2.271 max_d=2.271 avg_d=1.268 std_dev=0.946
OP2	B	0, -0.074, 0.940, 1.953, 2.347 max_d=2.347 avg_d=0.940 std_dev=1.013
O2'	B	0, -0.074, 1.203, 2.479, 2.969 max_d=2.969 avg_d=1.203 std_dev=1.276
O5'	A	0, 0.561, 1.932, 3.302, 3.033 max_d=3.033 avg_d=1.932 std_dev=1.370
O3'	A	0, 0.565, 1.969, 3.373, 3.172 max_d=3.172 avg_d=1.969 std_dev=1.404
OP1	A	0, 0.587, 2.007, 3.427, 3.061 max_d=3.061 avg_d=2.007 std_dev=1.420
P	A	0, 0.713, 2.562, 4.411, 4.296 max_d=4.296 avg_d=2.562 std_dev=1.849
OP2	A	0, 1.187, 4.071, 6.955, 6.331 max_d=6.331 avg_d=4.071 std_dev=2.884

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.00	0.19	0.08	0.35	0.21
C2	0.01	0.00	0.32	0.47	0.00	0.20	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.56	0.04	0.53	0.42	0.85	0.53
C2'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.17	0.02	0.10	0.15	0.17	0.10	0.26	0.32	0.13	0.03	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06	0.04
C3'	0.02	0.47	0.00	0.00	0.31	0.00	0.29	0.01	0.37	0.18	0.45	0.42	0.36	0.21	0.16	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.10	0.07
C4	0.01	0.00	0.17	0.31	0.00	0.13	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.31	0.02	0.46	0.30	0.80	0.48
C4'	0.00	0.20	0.02	0.00	0.13	0.00	0.12	0.01	0.15	0.04	0.19	0.18	0.15	0.06	0.06	0.18	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03
C5	0.01	0.00	0.10	0.29	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.27	0.01	0.54	0.35	1.02	0.60
C5'	0.06	0.23	0.15	0.01	0.15	0.01	0.13	0.00	0.18	0.04	0.23	0.20	0.17	0.05	0.07	0.08	0.16	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.17	0.37	0.01	0.15	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.39	0.02	0.59	0.42	1.10	0.65
C8	0.01	0.01	0.10	0.18	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.06	0.03	0.49	0.24	0.93	0.55
N1	0.01	0.00	0.26	0.45	0.00	0.19	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.51	0.03	0.58	0.45	1.01	0.61
N3	0.01	0.00	0.32	0.42	0.00	0.18	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.25	0.49	0.03	0.45	0.34	0.71	0.45
N6	0.01	0.00	0.13	0.36	0.01	0.15	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.37	0.02	0.63	0.46	1.24	0.72
N7	0.00	0.01	0.03	0.21	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.10	0.01	0.54	0.31	1.10	0.64
N9	0.00	0.00	0.02	0.16	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.11	0.00	0.38	0.20	0.68	0.41
O2'	0.00	0.28	0.00	0.01	0.20	0.18	0.21	0.08	0.24	0.13	0.27	0.25	0.24	0.17	0.12	0.00	0.03	0.12	0.08	0.08	0.04	0.06
O3'	0.20	0.56	0.01	0.01	0.31	0.00	0.27	0.16	0.39	0.06	0.51	0.49	0.37	0.10	0.11	0.03	0.00	0.15	0.19	0.30	0.19	0.18
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.12	0.15	0.00	0.19	0.09	0.33	0.23
O5'	0.19	0.53	0.03	0.10	0.46	0.01	0.54	0.00	0.59	0.49	0.58	0.45	0.63	0.54	0.38	0.08	0.19	0.19	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.08	0.42	0.04	0.12	0.30	0.03	0.35	0.05	0.42	0.24	0.45	0.34	0.46	0.31	0.20	0.08	0.30	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.85	0.06	0.10	0.80	0.04	1.02	0.02	1.10	0.93	1.01	0.71	1.24	1.10	0.68	0.04	0.19	0.33	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.53	0.04	0.07	0.48	0.03	0.60	0.01	0.65	0.55	0.61	0.45	0.72	0.64	0.41	0.06	0.18	0.23	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.25	0.27	0.28	0.19	0.43	0.23	0.46	0.28	0.17	0.29	0.27	0.20	0.21	0.16	0.45	0.84	0.40	0.38	0.31	0.42	0.61	0.57
C2	0.08	0.29	0.41	0.27	0.18	0.46	0.20	0.56	0.26	0.10	0.30	0.35	0.22	0.15	0.10	0.96	0.73	0.40	0.47	0.28	0.49	0.66	0.67
C2'	0.12	0.18	0.29	0.32	0.12	0.47	0.13	0.51	0.17	0.08	0.19	0.23	0.15	0.11	0.09	0.51	0.89	0.39	0.42	0.19	0.51	0.67	0.64
C3'	0.38	0.42	0.37	0.46	0.38	0.68	0.36	0.74	0.37	0.35	0.39	0.46	0.40	0.35	0.37	0.43	0.92	0.64	0.65	0.35	0.78	0.93	0.89
C4	0.11	0.28	0.33	0.27	0.19	0.45	0.22	0.50	0.27	0.15	0.29	0.32	0.22	0.19	0.14	0.66	0.80	0.42	0.42	0.29	0.45	0.63	0.61
C4'	0.21	0.31	0.25	0.28	0.27	0.50	0.30	0.55	0.35	0.25	0.35	0.32	0.26	0.29	0.23	0.35	0.80	0.50	0.47	0.38	0.57	0.75	0.70
C5	0.11	0.26	0.34	0.25	0.19	0.44	0.21	0.48	0.25	0.15	0.26	0.28	0.21	0.18	0.14	0.64	0.76	0.43	0.41	0.26	0.43	0.61	0.59
C5'	0.21	0.33	0.19	0.24	0.30	0.49	0.35	0.54	0.40	0.30	0.40	0.33	0.28	0.35	0.26	0.25	0.74	0.53	0.47	0.44	0.60	0.78	0.72
C6	0.09	0.25	0.41	0.24	0.17	0.46	0.19	0.53	0.23	0.11	0.25	0.28	0.21	0.15	0.11	0.89	0.70	0.44	0.45	0.24	0.46	0.63	0.63
C8	0.15	0.21	0.23	0.24	0.19	0.40	0.22	0.41	0.25	0.19	0.24	0.20	0.18	0.22	0.17	0.32	0.79	0.39	0.35	0.27	0.38	0.57	0.52
N1	0.07	0.27	0.44	0.25	0.16	0.47	0.18	0.57	0.24	0.09	0.27	0.32	0.21	0.14	0.09	1.04	0.68	0.41	0.48	0.25	0.49	0.65	0.67
N3	0.09	0.29	0.37	0.28	0.19	0.46	0.22	0.53	0.27	0.12	0.31	0.35	0.23	0.17	0.12	0.80	0.78	0.41	0.45	0.30	0.48	0.65	0.64
N6	0.08	0.20	0.44	0.21	0.15	0.46	0.16	0.52	0.19	0.10	0.20	0.21	0.18	0.13	0.10	0.97	0.62	0.47	0.45	0.19	0.45	0.62	0.62
N7	0.15	0.22	0.26	0.23	0.19	0.40	0.22	0.41	0.23	0.18	0.23	0.20	0.19	0.21	0.17	0.38	0.75	0.41	0.36	0.25	0.38	0.57	0.53
N9	0.13	0.25	0.28	0.27	0.19	0.43	0.23	0.45	0.27	0.17	0.28	0.28	0.20	0.21	0.16	0.47	0.82	0.41	0.38	0.29	0.42	0.60	0.57
O2'	0.12	0.22	0.31	0.30	0.19	0.38	0.23	0.41	0.26	0.21	0.26	0.24	0.17	0.24	0.17	0.59	0.90	0.30	0.36	0.29	0.40	0.60	0.55
O3'	0.31	0.42	0.22	0.43	0.36	0.68	0.37	0.76	0.40	0.33	0.42	0.45	0.38	0.35	0.33	0.35	0.97	0.64	0.68	0.40	0.85	1.01	0.96
O4'	0.15	0.30	0.26	0.22	0.25	0.41	0.31	0.44	0.36	0.24	0.36	0.30	0.23	0.29	0.20	0.37	0.75	0.42	0.37	0.41	0.42	0.61	0.57
O5'	0.73	0.74	0.72	0.73	0.72	0.90	0.69	0.95	0.68	0.70	0.71	0.77	0.74	0.68	0.71	0.61	0.90	0.92	0.89	0.64	1.02	1.13	1.09
OP1	0.54	0.57	0.48	0.52	0.56	0.72	0.59	0.78	0.60	0.57	0.60	0.55	0.54	0.59	0.55	0.32	0.71	0.78	0.72	0.61	0.90	1.03	0.97
OP2	1.52	1.59	1.53	1.51	1.55	1.60	1.52	1.66	1.50	1.52	1.55	1.60	1.56	1.50	1.53	1.36	1.44	1.63	1.65	1.42	1.77	1.85	1.81
P	0.90	0.94	0.89	0.89	0.91	1.01	0.90	1.06	0.90	0.88	0.93	0.96	0.92	0.88	0.89	0.75	0.96	1.05	1.02	0.86	1.15	1.26	1.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.29	0.00	0.13	0.02	0.10	0.33	0.22
C2	0.02	0.00	0.25	0.13	0.00	0.15	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.30	0.25	0.10	0.01	0.22	0.40	0.31
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.01	0.05	0.16	0.09	0.15	0.18	0.30	0.25	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.28	0.05	0.21	0.34	0.30
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.20	0.01	0.30	0.03	0.29	0.34	0.22	0.07	0.10	0.37	0.21	0.03	0.00	0.02	0.17	0.33	0.26	0.31	0.22
C4	0.01	0.00	0.13	0.20	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.15	0.12	0.03	0.01	0.12	0.34	0.20
C4'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.08	0.27	0.08	0.23	0.16	0.24	0.10	0.29	0.00	0.01	0.02	0.11	0.13	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.05	0.30	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	0.04	0.02	0.12	0.01	0.05	0.25	0.08
C5'	0.03	0.16	0.16	0.03	0.06	0.01	0.14	0.00	0.11	0.31	0.08	0.25	0.17	0.30	0.09	0.10	0.22	0.01	0.01	0.17	0.10	0.00	0.00
C6	0.02	0.00	0.09	0.29	0.01	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.05	0.08	0.11	0.00	0.08	0.25	0.11
C8	0.01	0.00	0.15	0.34	0.00	0.27	0.00	0.31	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.45	0.17	0.18	0.23	0.01	0.08	0.18	0.06
N1	0.02	0.00	0.18	0.22	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.17	0.18	0.05	0.01	0.16	0.34	0.22
N2	0.03	0.00	0.30	0.07	0.01	0.23	0.00	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.41	0.32	0.17	0.01	0.29	0.44	0.38
N3	0.02	0.00	0.25	0.10	0.00	0.16	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.33	0.25	0.13	0.01	0.22	0.41	0.32
N7	0.00	0.00	0.09	0.37	0.00	0.24	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.46	0.18	0.12	0.26	0.01	0.09	0.14	0.10
N9	0.00	0.01	0.01	0.21	0.00	0.10	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.08	0.02	0.02	0.01	0.06	0.31	0.14
O2'	0.01	0.21	0.00	0.03	0.17	0.29	0.31	0.10	0.29	0.45	0.19	0.30	0.21	0.46	0.22	0.00	0.02	0.20	0.18	0.37	0.05	0.37	0.21
O3'	0.29	0.30	0.01	0.00	0.15	0.00	0.04	0.22	0.05	0.17	0.17	0.41	0.33	0.18	0.08	0.02	0.00	0.19	0.40	0.07	0.74	0.65	0.55
O4'	0.00	0.25	0.02	0.02	0.12	0.01	0.02	0.01	0.08	0.18	0.18	0.32	0.25	0.12	0.02	0.20	0.19	0.00	0.09	0.04	0.04	0.31	0.20
O5'	0.13	0.10	0.28	0.17	0.03	0.02	0.12	0.01	0.11	0.23	0.05	0.17	0.13	0.26	0.02	0.18	0.40	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.33	0.01	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.37	0.07	0.04	0.18	0.00	0.06	0.19	0.06
OP1	0.10	0.22	0.21	0.26	0.12	0.13	0.05	0.10	0.08	0.08	0.16	0.29	0.22	0.09	0.06	0.05	0.74	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.40	0.34	0.31	0.34	0.03	0.25	0.00	0.25	0.18	0.34	0.44	0.41	0.14	0.31	0.37	0.65	0.31	0.01	0.19	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.31	0.30	0.22	0.20	0.01	0.08	0.00	0.11	0.06	0.22	0.38	0.32	0.10	0.14	0.21	0.55	0.20	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00