Doublet Group distance statistics: 49734

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 17, 24, 18, 19, 12, 19, 11, 11, 9, 8, 3, 1, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.021, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.009, 0.020, 0.030, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.017, 0.032, 0.047, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.032 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.030 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.029 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.032 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.015, 0.035, 0.054, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.035 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.019, 0.043, 0.066, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.043 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.021, 0.045, 0.069, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.045 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.046, 0.282, 0.518, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.282 std_dev=0.236
N3	B	0, 0.175, 0.461, 0.748, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.461 std_dev=0.287
C2	B	0, 0.138, 0.435, 0.731, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.435 std_dev=0.297
C2'	A	0, 0.050, 0.358, 0.667, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.358 std_dev=0.308
C4'	A	0, 0.141, 0.466, 0.790, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.466 std_dev=0.325
C4	B	0, 0.200, 0.533, 0.867, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.533 std_dev=0.333
N1	B	0, 0.130, 0.481, 0.831, 1.993 max_d=1.993 avg_d=0.481 std_dev=0.351
N9	B	0, 0.248, 0.610, 0.972, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.610 std_dev=0.362
C1'	B	0, 0.249, 0.614, 0.978, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.614 std_dev=0.364
O2'	A	0, 0.139, 0.526, 0.912, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.526 std_dev=0.386
C2'	B	0, 0.280, 0.669, 1.059, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.669 std_dev=0.389
C5	B	0, 0.192, 0.586, 0.981, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.586 std_dev=0.395
O2'	B	0, 0.255, 0.651, 1.047, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.651 std_dev=0.396
C6	B	0, 0.154, 0.558, 0.963, 2.154 max_d=2.154 avg_d=0.558 std_dev=0.404
C3'	A	0, 0.131, 0.559, 0.988, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.559 std_dev=0.429
C8	B	0, 0.280, 0.713, 1.146, 1.844 max_d=1.844 avg_d=0.713 std_dev=0.433
N7	B	0, 0.250, 0.703, 1.157, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.703 std_dev=0.454
O4'	B	0, 0.277, 0.750, 1.223, 2.284 max_d=2.284 avg_d=0.750 std_dev=0.473
N6	B	0, 0.180, 0.657, 1.134, 2.851 max_d=2.851 avg_d=0.657 std_dev=0.477
C3'	B	0, 0.305, 0.822, 1.339, 2.507 max_d=2.507 avg_d=0.822 std_dev=0.517
C4'	B	0, 0.301, 0.868, 1.434, 2.869 max_d=2.869 avg_d=0.868 std_dev=0.566
O3'	A	0, 0.223, 0.811, 1.398, 2.117 max_d=2.117 avg_d=0.811 std_dev=0.588
O3'	B	0, 0.324, 0.960, 1.596, 2.981 max_d=2.981 avg_d=0.960 std_dev=0.636
O5'	B	0, 0.356, 1.015, 1.675, 2.778 max_d=2.778 avg_d=1.015 std_dev=0.660
C5'	A	0, 0.209, 0.881, 1.553, 2.453 max_d=2.453 avg_d=0.881 std_dev=0.672
C5'	B	0, 0.327, 1.034, 1.741, 3.672 max_d=3.672 avg_d=1.034 std_dev=0.707
P	B	0, 0.439, 1.225, 2.010, 3.702 max_d=3.702 avg_d=1.225 std_dev=0.786
OP2	B	0, 0.456, 1.260, 2.064, 3.896 max_d=3.896 avg_d=1.260 std_dev=0.804
OP1	B	0, 0.512, 1.417, 2.322, 4.158 max_d=4.158 avg_d=1.417 std_dev=0.905
O5'	A	0, 0.321, 1.330, 2.339, 3.491 max_d=3.491 avg_d=1.330 std_dev=1.009
OP2	A	0, 0.458, 1.623, 2.787, 3.988 max_d=3.988 avg_d=1.623 std_dev=1.165
P	A	0, 0.439, 1.652, 2.866, 4.224 max_d=4.224 avg_d=1.652 std_dev=1.213
OP1	A	0, 0.636, 2.129, 3.622, 5.979 max_d=5.979 avg_d=2.129 std_dev=1.493

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.22	0.36	0.31	0.22
C2	0.04	0.00	0.21	0.24	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.29	0.08	0.50	0.60	0.62	0.54
C2'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.10	0.02	0.05	0.02	0.09	0.12	0.16	0.22	0.07	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.28	0.36	0.20	0.24
C3'	0.01	0.24	0.01	0.00	0.15	0.00	0.13	0.03	0.17	0.15	0.21	0.22	0.17	0.14	0.07	0.02	0.01	0.03	0.37	0.38	0.15	0.29
C4	0.02	0.01	0.10	0.15	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.15	0.04	0.53	0.58	0.58	0.53
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.13	0.09	0.06	0.13	0.14	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.25	0.33	0.07
C5	0.02	0.01	0.05	0.13	0.00	0.11	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.03	0.69	0.73	0.77	0.71
C5'	0.04	0.15	0.02	0.03	0.17	0.01	0.25	0.00	0.26	0.28	0.21	0.12	0.31	0.31	0.16	0.06	0.04	0.02	0.01	0.25	0.42	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.17	0.01	0.11	0.01	0.26	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.19	0.04	0.71	0.77	0.85	0.75
C8	0.02	0.02	0.12	0.15	0.01	0.13	0.01	0.28	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.08	0.17	0.07	0.71	0.67	0.66	0.66
N1	0.03	0.00	0.16	0.21	0.02	0.09	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.25	0.06	0.62	0.70	0.76	0.66
N3	0.04	0.01	0.22	0.22	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.26	0.08	0.43	0.53	0.51	0.45
N6	0.02	0.01	0.07	0.17	0.01	0.13	0.01	0.31	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.19	0.04	0.79	0.88	0.98	0.86
N7	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.14	0.01	0.31	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.08	0.16	0.06	0.79	0.80	0.85	0.79
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.50	0.51	0.48	0.46
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.09	0.06	0.07	0.06	0.09	0.08	0.14	0.18	0.08	0.08	0.03	0.00	0.05	0.06	0.08	0.33	0.22	0.11
O3'	0.02	0.29	0.02	0.01	0.15	0.02	0.14	0.04	0.19	0.17	0.25	0.26	0.19	0.16	0.07	0.05	0.00	0.02	0.27	0.35	0.21	0.23
O4'	0.01	0.08	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.06	0.08	0.04	0.06	0.02	0.06	0.02	0.00	0.11	0.35	0.37	0.17
O5'	0.22	0.50	0.28	0.37	0.53	0.02	0.69	0.01	0.71	0.71	0.62	0.43	0.79	0.79	0.50	0.08	0.27	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.36	0.60	0.36	0.38	0.58	0.25	0.73	0.25	0.77	0.67	0.70	0.53	0.88	0.80	0.51	0.33	0.35	0.35	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.62	0.20	0.15	0.58	0.33	0.77	0.42	0.85	0.66	0.76	0.51	0.98	0.85	0.48	0.22	0.21	0.37	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.54	0.24	0.29	0.53	0.07	0.71	0.02	0.75	0.66	0.66	0.45	0.86	0.79	0.46	0.11	0.23	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.20	0.27	0.29	0.18	0.26	0.19	0.24	0.22	0.19	0.23	0.19	0.24	0.19	0.19	0.30	0.37	0.23	0.20	0.22	0.27	0.19
C2	0.24	0.17	0.26	0.30	0.16	0.32	0.16	0.32	0.16	0.19	0.17	0.16	0.16	0.17	0.19	0.30	0.36	0.28	0.26	0.32	0.23	0.25
C2'	0.22	0.24	0.25	0.27	0.21	0.25	0.22	0.23	0.25	0.20	0.27	0.21	0.28	0.21	0.20	0.27	0.32	0.23	0.20	0.23	0.26	0.19
C3'	0.24	0.27	0.30	0.32	0.24	0.28	0.26	0.26	0.30	0.24	0.30	0.23	0.33	0.26	0.23	0.31	0.37	0.25	0.22	0.25	0.29	0.23
C4	0.22	0.18	0.26	0.28	0.17	0.27	0.17	0.26	0.18	0.18	0.19	0.18	0.19	0.17	0.19	0.30	0.35	0.24	0.21	0.24	0.24	0.19
C4'	0.23	0.24	0.30	0.32	0.23	0.27	0.25	0.25	0.28	0.23	0.28	0.22	0.31	0.25	0.23	0.31	0.39	0.24	0.23	0.24	0.33	0.24
C5	0.22	0.18	0.25	0.26	0.17	0.25	0.16	0.23	0.17	0.18	0.18	0.17	0.17	0.17	0.18	0.28	0.31	0.23	0.20	0.22	0.25	0.18
C5'	0.36	0.38	0.38	0.40	0.37	0.37	0.39	0.37	0.42	0.38	0.42	0.36	0.45	0.39	0.36	0.37	0.45	0.37	0.36	0.37	0.47	0.39
C6	0.23	0.16	0.24	0.25	0.16	0.27	0.15	0.26	0.15	0.18	0.16	0.15	0.15	0.16	0.19	0.27	0.29	0.25	0.21	0.24	0.22	0.20
C8	0.20	0.21	0.25	0.27	0.19	0.23	0.20	0.21	0.22	0.19	0.23	0.19	0.23	0.19	0.19	0.27	0.33	0.21	0.20	0.21	0.30	0.20
N1	0.24	0.16	0.25	0.28	0.16	0.31	0.15	0.31	0.15	0.19	0.16	0.15	0.15	0.17	0.19	0.29	0.32	0.28	0.25	0.31	0.23	0.24
N3	0.23	0.18	0.27	0.30	0.17	0.30	0.16	0.30	0.17	0.19	0.19	0.17	0.18	0.17	0.19	0.31	0.37	0.26	0.23	0.29	0.23	0.22
N6	0.22	0.15	0.21	0.22	0.15	0.25	0.14	0.23	0.14	0.18	0.15	0.14	0.14	0.16	0.18	0.24	0.24	0.25	0.20	0.22	0.22	0.18
N7	0.20	0.19	0.24	0.25	0.18	0.22	0.18	0.20	0.19	0.18	0.20	0.19	0.20	0.18	0.19	0.26	0.30	0.21	0.20	0.20	0.29	0.20
N9	0.22	0.20	0.26	0.28	0.18	0.25	0.19	0.23	0.21	0.18	0.22	0.19	0.22	0.18	0.19	0.29	0.35	0.23	0.20	0.22	0.27	0.19
O2'	0.23	0.23	0.24	0.25	0.20	0.26	0.21	0.25	0.24	0.20	0.25	0.21	0.26	0.20	0.21	0.26	0.30	0.26	0.22	0.24	0.26	0.20
O3'	0.27	0.31	0.32	0.33	0.27	0.30	0.30	0.29	0.35	0.28	0.36	0.27	0.39	0.30	0.27	0.32	0.37	0.27	0.24	0.28	0.30	0.25
O4'	0.21	0.21	0.29	0.31	0.19	0.26	0.21	0.23	0.24	0.19	0.25	0.19	0.28	0.21	0.19	0.32	0.40	0.22	0.21	0.22	0.30	0.20
O5'	0.95	0.94	0.96	0.97	0.95	0.97	0.95	0.96	0.94	0.96	0.94	0.94	0.92	0.96	0.96	0.93	0.99	0.96	0.90	0.92	0.89	0.91
OP1	1.09	1.09	1.09	1.12	1.12	1.10	1.15	1.11	1.16	1.15	1.13	1.08	1.18	1.17	1.12	1.04	1.14	1.10	1.07	1.10	1.13	1.12
OP2	1.16	1.16	1.10	1.13	1.19	1.16	1.20	1.19	1.19	1.21	1.18	1.15	1.17	1.21	1.19	1.03	1.10	1.19	1.18	1.20	1.21	1.22
P	1.06	1.07	1.06	1.08	1.08	1.07	1.11	1.08	1.11	1.11	1.09	1.05	1.10	1.12	1.08	1.00	1.09	1.07	1.04	1.06	1.06	1.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.10	0.10	0.18	0.09
C2	0.03	0.00	0.14	0.16	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.20	0.05	0.20	0.19	0.34	0.22
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.08	0.07	0.12	0.14	0.08	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.14	0.16	0.09
C3'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.12	0.11	0.15	0.14	0.13	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.14	0.17	0.13	0.11
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.08	0.11	0.03	0.20	0.19	0.31	0.21
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.06	0.05	0.09	0.09	0.04	0.06	0.03	0.01	0.02	0.11	0.13	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.26	0.26	0.38	0.28
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.15	0.13	0.08	0.18	0.17	0.09	0.06	0.04	0.02	0.01	0.09	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.15	0.04	0.26	0.29	0.41	0.31
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.13	0.04	0.26	0.24	0.31	0.25
N1	0.03	0.00	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.19	0.05	0.24	0.25	0.39	0.27
N3	0.03	0.01	0.14	0.14	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.05	0.17	0.16	0.29	0.18
N6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.02	0.09	0.02	0.18	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.16	0.04	0.29	0.34	0.46	0.35
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.29	0.30	0.40	0.32
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.19	0.16	0.25	0.17
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.05	0.13	0.15	0.08	0.04	0.03	0.00	0.05	0.05	0.06	0.15	0.14	0.07
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.11	0.03	0.12	0.04	0.15	0.13	0.19	0.18	0.16	0.13	0.06	0.05	0.00	0.02	0.14	0.24	0.15	0.14
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.05	0.02	0.00	0.08	0.11	0.19	0.11
O5'	0.10	0.20	0.11	0.14	0.20	0.02	0.26	0.01	0.26	0.26	0.24	0.17	0.29	0.29	0.19	0.06	0.14	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.10	0.19	0.14	0.17	0.19	0.11	0.26	0.09	0.29	0.24	0.25	0.16	0.34	0.30	0.16	0.15	0.24	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.34	0.16	0.13	0.31	0.13	0.38	0.13	0.41	0.31	0.39	0.29	0.46	0.40	0.25	0.14	0.15	0.19	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.22	0.09	0.11	0.21	0.05	0.28	0.02	0.31	0.25	0.27	0.18	0.35	0.32	0.17	0.07	0.14	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00