Doublet Group distance statistics: 49735

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 4, 4, 7, 7, 10, 4, 8, 34, 11, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.016, 0.021, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.021 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.019, 0.027, 0.035, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.015, 0.023, 0.032, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.023 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.028, 0.037, 0.046, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.037 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.020, 0.030, 0.040, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.030, 0.042, 0.053, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.042 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.026, 0.039, 0.053, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.039 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.026, 0.041, 0.055, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.041 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.026, 0.043, 0.059, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.043 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.067, 0.086, 0.105, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.086 std_dev=0.019
O2'	A	0, 0.090, 0.218, 0.346, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.218 std_dev=0.128
C2'	A	0, 0.098, 0.245, 0.392, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.245 std_dev=0.147
O4'	A	0, 0.067, 0.218, 0.369, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.218 std_dev=0.151
C4	B	0, 0.148, 0.313, 0.478, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.313 std_dev=0.165
N3	B	0, 0.243, 0.411, 0.580, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.411 std_dev=0.169
C2	B	0, 0.241, 0.438, 0.636, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.438 std_dev=0.198
N9	B	0, 0.309, 0.518, 0.726, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.518 std_dev=0.208
C3'	A	0, 0.181, 0.426, 0.671, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.426 std_dev=0.245
C4'	A	0, 0.172, 0.419, 0.667, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.419 std_dev=0.248
C8	B	0, 0.242, 0.501, 0.761, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.501 std_dev=0.260
C5	B	0, 0.334, 0.614, 0.894, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.614 std_dev=0.280
O3'	A	0, 0.298, 0.615, 0.933, 1.718 max_d=1.718 avg_d=0.615 std_dev=0.318
C4'	B	0, 0.537, 0.856, 1.175, 2.222 max_d=2.222 avg_d=0.856 std_dev=0.319
N7	B	0, 0.441, 0.761, 1.081, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.761 std_dev=0.320
N1	B	0, 0.474, 0.795, 1.116, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.795 std_dev=0.321
O5'	B	0, 0.734, 1.087, 1.440, 2.801 max_d=2.801 avg_d=1.087 std_dev=0.353
C3'	B	0, 0.661, 1.017, 1.374, 1.993 max_d=1.993 avg_d=1.017 std_dev=0.357
O4'	B	0, 0.625, 0.994, 1.363, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.994 std_dev=0.369
O3'	B	0, 0.399, 0.783, 1.167, 2.480 max_d=2.480 avg_d=0.783 std_dev=0.384
C6	B	0, 0.484, 0.909, 1.333, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.909 std_dev=0.425
C1'	B	0, 0.630, 1.074, 1.519, 1.972 max_d=1.972 avg_d=1.074 std_dev=0.444
C5'	A	0, 0.190, 0.654, 1.118, 2.517 max_d=2.517 avg_d=0.654 std_dev=0.464
O5'	A	0, 0.181, 0.831, 1.481, 3.127 max_d=3.127 avg_d=0.831 std_dev=0.650
N6	B	0, 0.695, 1.360, 2.025, 2.551 max_d=2.551 avg_d=1.360 std_dev=0.665
C5'	B	0, 1.076, 1.751, 2.426, 3.069 max_d=3.069 avg_d=1.751 std_dev=0.675
OP2	A	0, 0.522, 1.253, 1.983, 3.944 max_d=3.944 avg_d=1.253 std_dev=0.730
C2'	B	0, 0.870, 1.726, 2.581, 2.999 max_d=2.999 avg_d=1.726 std_dev=0.855
P	A	0, 0.147, 1.032, 1.917, 4.223 max_d=4.223 avg_d=1.032 std_dev=0.885
P	B	0, 0.709, 1.606, 2.503, 3.079 max_d=3.079 avg_d=1.606 std_dev=0.897
OP2	B	0, 1.150, 2.060, 2.971, 3.480 max_d=3.480 avg_d=2.060 std_dev=0.910
OP1	B	0, 1.010, 2.107, 3.204, 3.870 max_d=3.870 avg_d=2.107 std_dev=1.097
OP1	A	0, 1.041, 2.398, 3.755, 6.880 max_d=6.880 avg_d=2.398 std_dev=1.357
O2'	B	0, 1.259, 2.993, 4.727, 5.184 max_d=5.184 avg_d=2.993 std_dev=1.734

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.20	0.31	0.11
C2	0.04	0.00	0.15	0.18	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.14	0.22	0.04	0.25	0.33	0.50	0.19
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.02	0.07	0.02	0.10	0.06	0.13	0.15	0.09	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.14	0.22	0.09
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.13	0.08	0.16	0.16	0.12	0.07	0.04	0.02	0.01	0.02	0.14	0.17	0.17	0.11
C4	0.02	0.01	0.09	0.11	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.02	0.25	0.31	0.47	0.19
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.08	0.07	0.09	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.15	0.18	0.06
C5	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.11	0.02	0.31	0.41	0.57	0.27
C5'	0.03	0.12	0.02	0.02	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.17	0.15	0.10	0.20	0.20	0.11	0.05	0.04	0.02	0.01	0.19	0.15	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.13	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.15	0.02	0.32	0.45	0.61	0.29
C8	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.08	0.04	0.29	0.36	0.51	0.25
N1	0.03	0.00	0.13	0.16	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.20	0.03	0.30	0.40	0.57	0.25
N3	0.04	0.01	0.15	0.16	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.19	0.04	0.22	0.29	0.44	0.15
N6	0.02	0.02	0.09	0.12	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.15	0.03	0.35	0.52	0.67	0.34
N7	0.02	0.02	0.06	0.07	0.01	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.06	0.08	0.04	0.33	0.46	0.61	0.31
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.21	0.26	0.42	0.16
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.05	0.07	0.05	0.10	0.05	0.12	0.12	0.09	0.06	0.03	0.00	0.04	0.04	0.05	0.16	0.21	0.09
O3'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.12	0.02	0.11	0.04	0.15	0.08	0.20	0.19	0.15	0.08	0.04	0.04	0.00	0.01	0.17	0.23	0.17	0.13
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.25	0.30	0.16
O5'	0.10	0.25	0.10	0.14	0.25	0.01	0.31	0.01	0.32	0.29	0.30	0.22	0.35	0.33	0.21	0.05	0.17	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.33	0.14	0.17	0.31	0.15	0.41	0.19	0.45	0.36	0.40	0.29	0.52	0.46	0.26	0.16	0.23	0.25	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.50	0.22	0.17	0.47	0.18	0.57	0.15	0.61	0.51	0.57	0.44	0.67	0.61	0.42	0.21	0.17	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.19	0.09	0.11	0.19	0.06	0.27	0.01	0.29	0.25	0.25	0.15	0.34	0.31	0.16	0.09	0.13	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.18	0.77	0.35	0.16	0.23	0.18	0.25	0.22	0.16	0.23	0.16	0.26	0.17	0.16	0.81	0.34	0.34	0.19	0.17	0.32	0.16
C2	0.21	0.17	0.88	0.29	0.13	0.36	0.13	0.43	0.16	0.15	0.19	0.14	0.18	0.13	0.16	1.32	0.35	0.47	0.31	0.37	0.31	0.34
C2'	0.25	0.19	0.87	0.39	0.17	0.20	0.17	0.25	0.20	0.16	0.21	0.19	0.24	0.16	0.18	1.02	0.30	0.30	0.18	0.18	0.28	0.16
C3'	0.24	0.17	0.80	0.39	0.15	0.20	0.16	0.25	0.20	0.16	0.20	0.17	0.26	0.17	0.17	0.89	0.31	0.28	0.16	0.15	0.29	0.15
C4	0.20	0.18	0.83	0.34	0.14	0.26	0.15	0.30	0.18	0.15	0.20	0.15	0.21	0.14	0.16	1.01	0.33	0.38	0.21	0.22	0.27	0.20
C4'	0.19	0.16	0.71	0.36	0.16	0.19	0.18	0.22	0.22	0.17	0.21	0.15	0.27	0.19	0.16	0.67	0.33	0.30	0.16	0.15	0.35	0.16
C5	0.21	0.17	0.82	0.35	0.14	0.23	0.14	0.27	0.17	0.15	0.19	0.15	0.19	0.14	0.16	0.97	0.31	0.37	0.20	0.20	0.28	0.19
C5'	0.23	0.21	0.63	0.37	0.22	0.25	0.25	0.27	0.28	0.24	0.26	0.21	0.33	0.26	0.23	0.49	0.37	0.34	0.21	0.22	0.40	0.24
C6	0.21	0.17	0.87	0.33	0.13	0.28	0.13	0.34	0.15	0.15	0.18	0.14	0.17	0.14	0.16	1.20	0.31	0.42	0.25	0.27	0.28	0.26
C8	0.20	0.19	0.72	0.38	0.17	0.19	0.18	0.20	0.21	0.17	0.22	0.17	0.24	0.18	0.18	0.66	0.31	0.30	0.19	0.17	0.35	0.17
N1	0.22	0.17	0.89	0.29	0.14	0.35	0.14	0.43	0.15	0.16	0.18	0.14	0.16	0.15	0.16	1.39	0.33	0.48	0.32	0.37	0.32	0.35
N3	0.21	0.17	0.86	0.31	0.13	0.32	0.14	0.37	0.17	0.15	0.20	0.14	0.20	0.13	0.15	1.17	0.34	0.43	0.26	0.30	0.27	0.27
N6	0.22	0.17	0.88	0.35	0.14	0.26	0.15	0.32	0.16	0.16	0.17	0.14	0.17	0.16	0.16	1.22	0.28	0.41	0.25	0.26	0.29	0.26
N7	0.21	0.18	0.74	0.38	0.16	0.18	0.16	0.20	0.19	0.16	0.20	0.17	0.21	0.16	0.17	0.70	0.29	0.30	0.19	0.17	0.32	0.17
N9	0.20	0.18	0.78	0.36	0.16	0.22	0.17	0.24	0.21	0.16	0.22	0.16	0.24	0.16	0.17	0.83	0.33	0.34	0.19	0.17	0.31	0.16
O2'	0.26	0.19	0.88	0.39	0.18	0.23	0.17	0.27	0.20	0.18	0.22	0.19	0.24	0.17	0.20	1.06	0.31	0.33	0.21	0.21	0.28	0.18
O3'	0.27	0.17	0.84	0.41	0.16	0.20	0.17	0.26	0.21	0.16	0.20	0.18	0.28	0.18	0.18	0.98	0.30	0.27	0.16	0.17	0.29	0.17
O4'	0.18	0.18	0.69	0.35	0.16	0.20	0.19	0.21	0.24	0.17	0.24	0.16	0.29	0.19	0.16	0.61	0.35	0.31	0.19	0.17	0.37	0.17
O5'	0.36	0.31	0.62	0.42	0.33	0.39	0.32	0.41	0.32	0.34	0.31	0.33	0.34	0.34	0.34	0.50	0.45	0.47	0.32	0.33	0.46	0.35
OP1	0.64	0.57	0.75	0.68	0.63	0.62	0.65	0.64	0.65	0.67	0.61	0.59	0.69	0.68	0.65	0.63	0.62	0.68	0.55	0.62	0.75	0.65
OP2	0.64	0.63	0.56	0.57	0.65	0.69	0.65	0.71	0.64	0.66	0.64	0.64	0.62	0.66	0.65	0.57	0.78	0.79	0.56	0.57	0.64	0.58
P	0.37	0.36	0.51	0.42	0.38	0.39	0.41	0.41	0.42	0.41	0.40	0.36	0.46	0.43	0.39	0.35	0.47	0.49	0.30	0.34	0.49	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.32	0.00	0.12	0.11	0.24	0.10
C2	0.03	0.00	0.38	0.36	0.01	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.30	0.14	0.19	0.22	0.41	0.24
C2'	0.00	0.38	0.00	0.00	0.19	0.02	0.07	0.18	0.14	0.20	0.28	0.39	0.09	0.14	0.02	0.00	0.03	0.03	0.47	0.51	0.55	0.47
C3'	0.01	0.36	0.00	0.00	0.32	0.01	0.38	0.02	0.41	0.32	0.40	0.31	0.43	0.38	0.25	0.02	0.01	0.03	0.18	0.21	0.15	0.11
C4	0.01	0.01	0.19	0.32	0.00	0.10	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.22	0.17	0.07	0.20	0.22	0.37	0.24
C4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.16	0.24	0.12	0.08	0.20	0.24	0.11	0.34	0.02	0.01	0.02	0.09	0.19	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.38	0.01	0.17	0.00	0.23	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.42	0.14	0.02	0.32	0.36	0.48	0.38
C5'	0.05	0.13	0.18	0.02	0.13	0.01	0.23	0.00	0.23	0.27	0.18	0.10	0.29	0.30	0.12	0.15	0.22	0.02	0.01	0.11	0.17	0.01
C6	0.02	0.01	0.14	0.41	0.01	0.16	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.40	0.18	0.04	0.33	0.41	0.54	0.41
C8	0.01	0.02	0.20	0.32	0.01	0.24	0.01	0.27	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.47	0.15	0.14	0.33	0.33	0.38	0.34
N1	0.03	0.00	0.28	0.40	0.01	0.12	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.25	0.24	0.09	0.27	0.33	0.49	0.34
N3	0.03	0.00	0.39	0.31	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.13	0.31	0.16	0.15	0.15	0.34	0.18
N6	0.02	0.01	0.09	0.43	0.02	0.20	0.01	0.29	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.51	0.20	0.04	0.40	0.51	0.63	0.51
N7	0.01	0.01	0.14	0.38	0.01	0.24	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.54	0.18	0.11	0.40	0.44	0.52	0.45
N9	0.00	0.02	0.02	0.25	0.01	0.11	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.26	0.10	0.02	0.18	0.17	0.29	0.19
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.22	0.34	0.42	0.15	0.40	0.47	0.25	0.13	0.51	0.54	0.26	0.00	0.05	0.23	0.29	0.37	0.57	0.34
O3'	0.32	0.30	0.03	0.01	0.17	0.02	0.14	0.22	0.18	0.15	0.24	0.31	0.20	0.18	0.10	0.05	0.00	0.19	0.23	0.32	0.31	0.25
O4'	0.00	0.14	0.03	0.03	0.07	0.01	0.02	0.02	0.04	0.14	0.09	0.16	0.04	0.11	0.02	0.23	0.19	0.00	0.10	0.13	0.26	0.15
O5'	0.12	0.19	0.47	0.18	0.20	0.02	0.32	0.01	0.33	0.33	0.27	0.15	0.40	0.40	0.18	0.29	0.23	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.22	0.51	0.21	0.22	0.09	0.36	0.11	0.41	0.33	0.33	0.15	0.51	0.44	0.17	0.37	0.32	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.41	0.55	0.15	0.37	0.19	0.48	0.17	0.54	0.38	0.49	0.34	0.63	0.52	0.29	0.57	0.31	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.47	0.11	0.24	0.04	0.38	0.01	0.41	0.34	0.34	0.18	0.51	0.45	0.19	0.34	0.25	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00