Doublet Group distance statistics: 49749

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.001, 0.015, 0.029, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N9	A	0, -0.001, 0.021, 0.042, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N7	A	0, -0.001, 0.020, 0.041, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.020 std_dev=0.021
C8	A	0, -0.004, 0.028, 0.059, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.028 std_dev=0.031
O4'	B	0, 0.006, 0.339, 0.672, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.339 std_dev=0.333
C1'	B	0, -0.003, 0.334, 0.670, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.334 std_dev=0.337
C2'	B	0, 0.003, 0.341, 0.680, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.341 std_dev=0.338
C4'	B	0, -0.016, 0.332, 0.681, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.332 std_dev=0.348
C3'	B	0, -0.002, 0.355, 0.712, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.355 std_dev=0.357
N1	B	0, -0.001, 0.368, 0.736, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.368 std_dev=0.368
O2'	B	0, 0.004, 0.394, 0.785, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.394 std_dev=0.390
C6	B	0, -0.007, 0.389, 0.784, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.389 std_dev=0.396
O3'	B	0, -0.023, 0.388, 0.800, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.388 std_dev=0.411
C5'	B	0, -0.032, 0.390, 0.812, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.390 std_dev=0.422
C2	B	0, 0.009, 0.432, 0.855, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.432 std_dev=0.423
C5	B	0, 0.006, 0.452, 0.898, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.452 std_dev=0.446
O2	B	0, 0.009, 0.483, 0.957, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.483 std_dev=0.474
N3	B	0, 0.010, 0.486, 0.961, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.486 std_dev=0.476
C4	B	0, 0.010, 0.498, 0.986, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.498 std_dev=0.488
O4'	A	0, -0.004, 0.500, 1.004, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.500 std_dev=0.504
C2'	A	0, -0.004, 0.530, 1.065, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.530 std_dev=0.535
O4	B	0, 0.009, 0.574, 1.140, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.574 std_dev=0.566
O5'	B	0, 0.000, 0.597, 1.193, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.597 std_dev=0.596
O2'	A	0, -0.003, 0.600, 1.202, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.600 std_dev=0.603
C4'	A	0, -0.003, 0.759, 1.521, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.759 std_dev=0.762
C3'	A	0, -0.004, 0.826, 1.656, 1.822 max_d=1.822 avg_d=0.826 std_dev=0.830
P	B	0, 0.008, 0.871, 1.734, 1.767 max_d=1.767 avg_d=0.871 std_dev=0.863
OP1	B	0, 0.001, 0.872, 1.743, 1.881 max_d=1.881 avg_d=0.872 std_dev=0.871
OP2	B	0, 0.005, 1.123, 2.241, 2.379 max_d=2.379 avg_d=1.123 std_dev=1.118
O3'	A	0, -0.009, 1.183, 2.376, 2.632 max_d=2.632 avg_d=1.183 std_dev=1.193
C5'	A	0, -0.005, 1.274, 2.554, 2.803 max_d=2.803 avg_d=1.274 std_dev=1.280
O5'	A	0, 0.002, 1.808, 3.613, 3.855 max_d=3.855 avg_d=1.808 std_dev=1.805
P	A	0, 0.010, 2.393, 4.776, 4.883 max_d=4.883 avg_d=2.393 std_dev=2.383
OP2	A	0, 0.010, 2.503, 4.995, 5.041 max_d=5.041 avg_d=2.503 std_dev=2.493
OP1	A	0, 0.013, 2.843, 5.673, 5.774 max_d=5.774 avg_d=2.843 std_dev=2.830

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.06	0.16	0.05
C2	0.02	0.00	0.34	0.28	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.36	0.37	0.14	0.22	0.22	0.14	0.23
C2'	0.00	0.34	0.00	0.00	0.19	0.01	0.11	0.01	0.19	0.12	0.28	0.32	0.15	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.11	0.07	0.29	0.14
C3'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.14	0.00	0.08	0.02	0.15	0.13	0.23	0.25	0.12	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.23	0.14	0.34	0.23
C4	0.01	0.00	0.19	0.14	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.18	0.09	0.18	0.12	0.03	0.09
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.07	0.01	0.02	0.03	0.06	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.10	0.12	0.04
C5	0.00	0.00	0.11	0.08	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.13	0.06	0.20	0.10	0.09	0.07
C5'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.09	0.01	0.12	0.00	0.12	0.12	0.11	0.07	0.14	0.14	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.13	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.19	0.15	0.00	0.02	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.22	0.09	0.22	0.13	0.04	0.12
C8	0.01	0.00	0.12	0.13	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.13	0.06	0.15	0.11	0.38	0.21
N1	0.01	0.00	0.28	0.23	0.00	0.01	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.29	0.33	0.13	0.24	0.19	0.12	0.21
N3	0.02	0.00	0.32	0.25	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.33	0.32	0.14	0.20	0.19	0.09	0.19
N6	0.01	0.01	0.15	0.12	0.01	0.03	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.19	0.07	0.22	0.11	0.06	0.10
N7	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.18	0.10	0.31	0.16
N9	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.13	0.05	0.18	0.04
O2'	0.01	0.36	0.00	0.02	0.18	0.03	0.12	0.04	0.19	0.09	0.29	0.33	0.16	0.02	0.03	0.00	0.07	0.04	0.07	0.04	0.20	0.07
O3'	0.02	0.37	0.02	0.00	0.18	0.02	0.13	0.04	0.22	0.13	0.33	0.32	0.19	0.04	0.02	0.07	0.00	0.02	0.32	0.21	0.40	0.28
O4'	0.00	0.14	0.01	0.02	0.09	0.00	0.06	0.01	0.09	0.06	0.13	0.14	0.07	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.12	0.14	0.14	0.10
O5'	0.07	0.22	0.11	0.23	0.18	0.02	0.20	0.00	0.22	0.15	0.24	0.20	0.22	0.18	0.13	0.07	0.32	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01
OP1	0.06	0.22	0.07	0.14	0.12	0.10	0.10	0.13	0.13	0.11	0.19	0.19	0.11	0.10	0.05	0.04	0.21	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.14	0.29	0.34	0.03	0.12	0.09	0.03	0.04	0.38	0.12	0.09	0.06	0.31	0.18	0.20	0.40	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.23	0.14	0.23	0.09	0.04	0.07	0.01	0.12	0.21	0.21	0.19	0.10	0.16	0.04	0.07	0.28	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.31	0.21	0.20	0.39	0.12	0.33	0.12	0.27	0.26	0.38	0.31	0.17	0.20	0.44	0.14	0.20	0.14	0.36	0.26
C2	0.22	0.30	0.24	0.17	0.31	0.12	0.27	0.11	0.25	0.26	0.32	0.32	0.18	0.16	0.33	0.16	0.16	0.08	0.27	0.21
C2'	0.18	0.38	0.22	0.19	0.54	0.11	0.43	0.10	0.33	0.29	0.51	0.35	0.26	0.25	0.63	0.12	0.19	0.14	0.42	0.28
C3'	0.20	0.43	0.22	0.21	0.66	0.10	0.55	0.10	0.43	0.36	0.60	0.36	0.17	0.16	0.78	0.13	0.24	0.19	0.49	0.33
C4	0.20	0.32	0.23	0.19	0.35	0.12	0.30	0.12	0.27	0.27	0.36	0.33	0.17	0.18	0.38	0.15	0.19	0.12	0.33	0.25
C4'	0.24	0.40	0.28	0.29	0.58	0.18	0.52	0.18	0.43	0.37	0.52	0.33	0.11	0.23	0.66	0.18	0.27	0.24	0.46	0.33
C5	0.21	0.32	0.23	0.19	0.35	0.12	0.30	0.12	0.27	0.27	0.36	0.33	0.16	0.16	0.37	0.14	0.19	0.13	0.34	0.25
C5'	0.34	0.48	0.40	0.44	0.71	0.31	0.67	0.30	0.57	0.48	0.61	0.36	0.20	0.41	0.79	0.27	0.38	0.36	0.54	0.41
C6	0.22	0.30	0.24	0.17	0.31	0.12	0.28	0.11	0.26	0.27	0.31	0.31	0.16	0.13	0.31	0.15	0.18	0.11	0.30	0.23
C8	0.18	0.30	0.21	0.20	0.38	0.12	0.32	0.12	0.27	0.26	0.37	0.29	0.17	0.18	0.42	0.13	0.21	0.17	0.39	0.28
N1	0.22	0.29	0.24	0.16	0.29	0.12	0.26	0.11	0.25	0.25	0.30	0.30	0.18	0.14	0.30	0.16	0.16	0.08	0.26	0.21
N3	0.21	0.32	0.23	0.18	0.34	0.13	0.29	0.12	0.26	0.26	0.35	0.33	0.17	0.18	0.37	0.15	0.18	0.10	0.30	0.23
N6	0.24	0.28	0.25	0.18	0.28	0.12	0.27	0.11	0.27	0.27	0.28	0.28	0.14	0.10	0.28	0.15	0.18	0.12	0.31	0.24
N7	0.18	0.32	0.21	0.20	0.37	0.12	0.32	0.12	0.28	0.27	0.38	0.31	0.15	0.16	0.40	0.13	0.21	0.17	0.38	0.28
N9	0.19	0.31	0.22	0.20	0.38	0.12	0.32	0.12	0.27	0.26	0.37	0.32	0.17	0.19	0.41	0.14	0.20	0.15	0.36	0.26
O2'	0.17	0.35	0.23	0.21	0.49	0.13	0.38	0.12	0.28	0.26	0.47	0.33	0.31	0.32	0.58	0.12	0.17	0.11	0.38	0.25
O3'	0.18	0.42	0.21	0.19	0.69	0.09	0.57	0.07	0.42	0.34	0.62	0.34	0.22	0.18	0.84	0.10	0.21	0.16	0.50	0.30
O4'	0.20	0.29	0.25	0.25	0.37	0.17	0.34	0.16	0.30	0.27	0.35	0.28	0.11	0.21	0.41	0.15	0.22	0.18	0.36	0.27
O5'	0.42	0.53	0.57	0.62	0.75	0.42	0.74	0.39	0.66	0.55	0.64	0.39	0.39	0.63	0.82	0.33	0.45	0.42	0.58	0.45
OP1	0.26	0.28	0.51	0.59	0.54	0.31	0.57	0.26	0.50	0.36	0.38	0.13	0.35	0.68	0.61	0.17	0.30	0.28	0.40	0.26
OP2	0.17	0.13	0.47	0.56	0.37	0.25	0.45	0.20	0.39	0.25	0.21	0.14	0.32	0.68	0.42	0.10	0.21	0.20	0.28	0.16
P	0.24	0.22	0.48	0.55	0.44	0.29	0.49	0.24	0.44	0.32	0.30	0.08	0.34	0.64	0.49	0.15	0.26	0.25	0.33	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.04
C2	0.02	0.00	0.11	0.13	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.14	0.01	0.05	0.09	0.09	0.19	0.11
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.03	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.08	0.18	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.11	0.08	0.06
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.13	0.00	0.11	0.01	0.10	0.08	0.14	0.15	0.00	0.01	0.14	0.01	0.05	0.13	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.03	0.13	0.00	0.08	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.15	0.00	0.02	0.20	0.25	0.35	0.28
C4'	0.00	0.03	0.03	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.11	0.05	0.05	0.02	0.09	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.11	0.01	0.11	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.15	0.00	0.08	0.25	0.30	0.38	0.34
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.14	0.00	0.20	0.00	0.18	0.08	0.09	0.05	0.09	0.04	0.16	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.11	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.00	0.10	0.22	0.23	0.27	0.27
N1	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.08	0.00	0.02	0.11	0.11	0.16	0.14
N3	0.01	0.00	0.08	0.14	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.01	0.03	0.14	0.16	0.26	0.18
O2	0.02	0.00	0.18	0.15	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.15	0.18	0.02	0.09	0.05	0.04	0.15	0.05
O2'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.04	0.09	0.06	0.09	0.05	0.03	0.06	0.15	0.00	0.04	0.06	0.06	0.02	0.04	0.00	0.04
O3'	0.02	0.14	0.01	0.01	0.15	0.01	0.15	0.04	0.12	0.08	0.15	0.18	0.04	0.00	0.17	0.01	0.02	0.15	0.09	0.07
O4	0.01	0.01	0.03	0.14	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.17	0.00	0.02	0.23	0.30	0.40	0.31
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.01	0.10	0.02	0.03	0.09	0.06	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.14	0.09
O5'	0.03	0.09	0.05	0.05	0.20	0.00	0.25	0.01	0.22	0.11	0.14	0.05	0.02	0.02	0.23	0.04	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.04	0.09	0.11	0.13	0.25	0.06	0.30	0.04	0.23	0.11	0.16	0.04	0.04	0.15	0.30	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.19	0.08	0.08	0.35	0.03	0.38	0.03	0.27	0.16	0.26	0.15	0.00	0.09	0.40	0.14	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.11	0.06	0.07	0.28	0.02	0.34	0.01	0.27	0.14	0.18	0.05	0.04	0.07	0.31	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00