Doublet Group distance statistics: 49751

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 13, 23, 14, 1, 3, 0, 2, 1, 2, 1, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.001, 0.008, 0.016, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.008 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.026, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.016 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.023, 0.043, 0.063, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.043 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.008, 0.045, 0.081, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.045 std_dev=0.037
C2'	A	0, 0.010, 0.092, 0.173, 0.453 max_d=0.453 avg_d=0.092 std_dev=0.081
C4'	A	0, 0.032, 0.123, 0.214, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.123 std_dev=0.091
O4'	A	0, -0.007, 0.095, 0.198, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.095 std_dev=0.103
C3'	A	0, 0.022, 0.128, 0.234, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.128 std_dev=0.106
O5'	A	0, 0.136, 0.290, 0.445, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.290 std_dev=0.155
C5'	A	0, 0.068, 0.238, 0.408, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.238 std_dev=0.170
O2'	A	0, -0.010, 0.181, 0.371, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.181 std_dev=0.191
O3'	A	0, -0.047, 0.165, 0.377, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.165 std_dev=0.212
OP2	B	0, 0.044, 0.257, 0.470, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.257 std_dev=0.213
P	A	0, 0.115, 0.421, 0.728, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.421 std_dev=0.307
OP1	B	0, 0.140, 0.475, 0.810, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.475 std_dev=0.335
P	B	0, 0.020, 0.371, 0.722, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.371 std_dev=0.351
O6	B	0, 0.090, 0.570, 1.050, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.570 std_dev=0.480
N7	B	0, -0.006, 0.475, 0.955, 1.897 max_d=1.897 avg_d=0.475 std_dev=0.481
O5'	B	0, -0.056, 0.444, 0.945, 1.841 max_d=1.841 avg_d=0.444 std_dev=0.500
C8	B	0, -0.054, 0.510, 1.073, 2.168 max_d=2.168 avg_d=0.510 std_dev=0.564
C6	B	0, 0.004, 0.627, 1.250, 2.490 max_d=2.490 avg_d=0.627 std_dev=0.623
C5	B	0, -0.031, 0.594, 1.219, 2.440 max_d=2.440 avg_d=0.594 std_dev=0.625
C5'	B	0, -0.134, 0.586, 1.306, 2.565 max_d=2.565 avg_d=0.586 std_dev=0.720
OP2	A	0, -0.047, 0.708, 1.462, 2.709 max_d=2.709 avg_d=0.708 std_dev=0.755
N9	B	0, -0.109, 0.685, 1.479, 2.988 max_d=2.988 avg_d=0.685 std_dev=0.794
C4	B	0, -0.105, 0.743, 1.590, 3.224 max_d=3.224 avg_d=0.743 std_dev=0.848
N1	B	0, -0.049, 0.812, 1.674, 3.373 max_d=3.373 avg_d=0.812 std_dev=0.862
O4'	B	0, -0.170, 0.744, 1.659, 3.307 max_d=3.307 avg_d=0.744 std_dev=0.914
C4'	B	0, -0.193, 0.722, 1.636, 3.264 max_d=3.264 avg_d=0.722 std_dev=0.915
C3'	B	0, -0.207, 0.750, 1.708, 3.386 max_d=3.386 avg_d=0.750 std_dev=0.957
C1'	B	0, -0.168, 0.811, 1.791, 3.609 max_d=3.609 avg_d=0.811 std_dev=0.979
C2'	B	0, -0.215, 0.857, 1.929, 3.893 max_d=3.893 avg_d=0.857 std_dev=1.072
C2	B	0, -0.144, 0.957, 2.058, 4.154 max_d=4.154 avg_d=0.957 std_dev=1.101
N3	B	0, -0.173, 0.933, 2.039, 4.114 max_d=4.114 avg_d=0.933 std_dev=1.106
O3'	B	0, -0.276, 0.869, 2.013, 3.991 max_d=3.991 avg_d=0.869 std_dev=1.144
OP1	A	0, -0.319, 0.921, 2.162, 4.052 max_d=4.052 avg_d=0.921 std_dev=1.240
O2'	B	0, -0.296, 1.011, 2.318, 4.669 max_d=4.669 avg_d=1.011 std_dev=1.307
N2	B	0, -0.208, 1.150, 2.508, 5.023 max_d=5.023 avg_d=1.150 std_dev=1.358

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.09	0.00	0.08	0.54	0.13	0.16
C2	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.10	0.03	0.11	0.87	0.31	0.24
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.05	0.02	0.04	0.04	0.07	0.00	0.01	0.01	0.14	0.31	0.18	0.18
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.03	0.05	0.05	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.08	0.08
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.06	0.03	0.12	1.12	0.45	0.27
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.12	0.16	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.05	0.12	1.16	0.43	0.28
C5'	0.03	0.04	0.07	0.02	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.05	0.05	0.07	0.05	0.04	0.06	0.01	0.01	0.10	0.31	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.05	0.12	1.02	0.33	0.27
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.11	0.83	0.26	0.23
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.09	0.03	0.12	1.01	0.40	0.26
N4	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.11	0.06	0.04	0.12	1.17	0.51	0.27
O2	0.03	0.01	0.07	0.05	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.13	0.15	0.05	0.11	0.75	0.26	0.22
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.10	0.05	0.09	0.04	0.08	0.05	0.10	0.11	0.13	0.00	0.04	0.04	0.15	0.29	0.25	0.20
O3'	0.09	0.10	0.01	0.00	0.06	0.02	0.04	0.06	0.04	0.07	0.09	0.06	0.15	0.04	0.00	0.07	0.09	0.24	0.12	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.03	0.04	0.05	0.04	0.07	0.00	0.07	0.48	0.11	0.12
O5'	0.08	0.11	0.14	0.07	0.12	0.01	0.12	0.01	0.12	0.11	0.12	0.12	0.11	0.15	0.09	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.54	0.87	0.31	0.16	1.12	0.12	1.16	0.10	1.02	0.83	1.01	1.17	0.75	0.29	0.24	0.48	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.31	0.18	0.08	0.45	0.16	0.43	0.31	0.33	0.26	0.40	0.51	0.26	0.25	0.12	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.24	0.18	0.08	0.27	0.03	0.28	0.01	0.27	0.23	0.26	0.27	0.22	0.20	0.12	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.35	0.12	0.14	0.28	0.09	0.31	0.11	0.37	0.21	0.38	0.37	0.31	0.26	0.23	0.14	0.23	0.19	0.16	0.42	0.15	0.16	0.14
C2	0.22	0.36	0.13	0.13	0.31	0.09	0.36	0.11	0.42	0.27	0.40	0.36	0.32	0.34	0.26	0.13	0.22	0.20	0.14	0.48	0.14	0.15	0.12
C2'	0.12	0.24	0.14	0.22	0.19	0.13	0.23	0.18	0.29	0.16	0.29	0.25	0.20	0.21	0.15	0.12	0.34	0.11	0.22	0.37	0.17	0.19	0.17
C3'	0.16	0.27	0.17	0.24	0.21	0.14	0.22	0.18	0.28	0.16	0.30	0.29	0.23	0.19	0.17	0.16	0.35	0.14	0.23	0.33	0.17	0.19	0.17
C4	0.19	0.35	0.14	0.13	0.30	0.09	0.36	0.14	0.42	0.24	0.40	0.35	0.31	0.34	0.24	0.14	0.18	0.15	0.18	0.48	0.20	0.18	0.18
C4'	0.20	0.35	0.13	0.16	0.26	0.10	0.25	0.13	0.32	0.17	0.36	0.39	0.31	0.18	0.21	0.15	0.24	0.18	0.19	0.34	0.17	0.18	0.16
C5	0.19	0.38	0.14	0.13	0.30	0.10	0.34	0.15	0.43	0.19	0.42	0.39	0.33	0.26	0.22	0.16	0.18	0.15	0.20	0.49	0.21	0.19	0.20
C5'	0.20	0.35	0.14	0.16	0.25	0.12	0.23	0.15	0.29	0.15	0.35	0.40	0.30	0.16	0.20	0.16	0.23	0.17	0.20	0.30	0.19	0.18	0.19
C6	0.20	0.38	0.14	0.14	0.29	0.10	0.32	0.14	0.41	0.19	0.42	0.40	0.33	0.24	0.22	0.15	0.20	0.16	0.19	0.47	0.19	0.18	0.18
N1	0.21	0.37	0.13	0.14	0.30	0.09	0.33	0.12	0.41	0.23	0.41	0.38	0.32	0.28	0.24	0.14	0.22	0.18	0.17	0.47	0.16	0.17	0.15
N3	0.21	0.34	0.13	0.13	0.31	0.09	0.37	0.12	0.42	0.28	0.39	0.34	0.30	0.36	0.26	0.13	0.20	0.18	0.15	0.48	0.16	0.16	0.14
N4	0.17	0.31	0.14	0.12	0.28	0.10	0.35	0.16	0.39	0.24	0.36	0.31	0.28	0.35	0.22	0.13	0.15	0.12	0.20	0.44	0.22	0.18	0.22
O2	0.23	0.35	0.13	0.14	0.32	0.10	0.37	0.10	0.42	0.29	0.40	0.35	0.31	0.36	0.28	0.13	0.23	0.22	0.13	0.48	0.13	0.14	0.11
O2'	0.13	0.22	0.16	0.24	0.20	0.14	0.25	0.18	0.31	0.20	0.28	0.22	0.19	0.26	0.17	0.15	0.36	0.12	0.20	0.40	0.14	0.16	0.14
O3'	0.20	0.31	0.12	0.16	0.25	0.07	0.27	0.08	0.32	0.21	0.34	0.33	0.27	0.24	0.22	0.12	0.28	0.19	0.13	0.36	0.10	0.11	0.08
O4'	0.24	0.39	0.14	0.13	0.30	0.10	0.29	0.11	0.36	0.19	0.40	0.43	0.35	0.21	0.24	0.17	0.20	0.22	0.17	0.38	0.17	0.17	0.15
O5'	0.18	0.27	0.17	0.21	0.21	0.16	0.21	0.19	0.26	0.16	0.29	0.30	0.24	0.17	0.18	0.17	0.27	0.17	0.23	0.28	0.19	0.19	0.19
OP1	1.28	1.28	1.14	1.03	1.29	1.14	1.29	1.06	1.29	1.24	1.27	1.24	1.29	1.24	1.27	1.19	0.93	1.27	0.99	1.29	0.99	0.99	1.00
OP2	0.56	0.42	0.71	0.82	0.52	0.71	0.53	0.76	0.47	0.59	0.41	0.36	0.47	0.58	0.56	0.65	0.91	0.57	0.81	0.46	0.71	0.70	0.73
P	0.28	0.39	0.19	0.11	0.32	0.16	0.31	0.10	0.36	0.24	0.40	0.42	0.36	0.25	0.28	0.24	0.09	0.26	0.09	0.37	0.10	0.13	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.13	0.06
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.02	0.09	0.01	0.06	0.15	0.07
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.06	0.12	0.09	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.10	0.05
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.06	0.07	0.08	0.14	0.10	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.06	0.07	0.05
C4	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.08	0.01	0.06	0.17	0.07
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.04	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.09	0.02	0.08	0.21	0.09
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.06	0.06	0.07	0.05	0.07	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.02	0.10	0.00	0.09	0.21	0.10
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.09	0.03	0.08	0.22	0.10
N1	0.02	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02	0.10	0.01	0.07	0.18	0.08
N2	0.03	0.00	0.12	0.14	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.19	0.03	0.10	0.02	0.07	0.14	0.06
N3	0.02	0.00	0.09	0.10	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.02	0.08	0.01	0.06	0.14	0.06
N7	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.10	0.03	0.10	0.25	0.11
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.07	0.02	0.05	0.17	0.07
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.06	0.10	0.07	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.04	0.08	0.07	0.03
O3'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.07	0.11	0.19	0.13	0.06	0.02	0.04	0.00	0.01	0.06	0.07	0.08	0.10	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.03	0.08	0.12	0.07
O5'	0.05	0.09	0.04	0.04	0.08	0.01	0.09	0.01	0.10	0.09	0.10	0.10	0.08	0.10	0.07	0.03	0.06	0.05	0.00	0.11	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.02	0.07	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.03	0.11	0.00	0.12	0.24	0.12
OP1	0.06	0.06	0.05	0.06	0.06	0.06	0.08	0.07	0.09	0.08	0.07	0.07	0.06	0.10	0.05	0.08	0.08	0.08	0.02	0.12	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.15	0.10	0.07	0.17	0.05	0.21	0.03	0.21	0.22	0.18	0.14	0.14	0.25	0.17	0.07	0.10	0.12	0.02	0.24	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.07	0.05	0.05	0.07	0.03	0.09	0.01	0.10	0.10	0.08	0.06	0.06	0.11	0.07	0.03	0.06	0.07	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00