Doublet Group distance statistics: 49754

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 12, 10, 4, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.012 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.014, 0.036, 0.058, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.036 std_dev=0.022
P	B	0, 0.123, 0.285, 0.446, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.285 std_dev=0.161
OP2	B	0, 0.232, 0.400, 0.568, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.400 std_dev=0.168
O3'	A	0, -0.086, 0.146, 0.379, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.146 std_dev=0.233
C3'	A	0, -0.194, 0.140, 0.474, 2.067 max_d=2.067 avg_d=0.140 std_dev=0.334
OP1	B	0, -0.017, 0.383, 0.782, 2.526 max_d=2.526 avg_d=0.383 std_dev=0.399
O4'	A	0, -0.301, 0.112, 0.526, 2.517 max_d=2.517 avg_d=0.112 std_dev=0.414
C2'	A	0, -0.278, 0.146, 0.571, 2.607 max_d=2.607 avg_d=0.146 std_dev=0.424
C4'	A	0, -0.287, 0.174, 0.635, 2.847 max_d=2.847 avg_d=0.174 std_dev=0.461
O5'	B	0, -0.084, 0.405, 0.894, 2.968 max_d=2.968 avg_d=0.405 std_dev=0.489
C5'	B	0, -0.326, 0.395, 1.116, 4.480 max_d=4.480 avg_d=0.395 std_dev=0.721
O2'	A	0, -0.454, 0.276, 1.007, 4.503 max_d=4.503 avg_d=0.276 std_dev=0.731
C5'	A	0, -0.593, 0.325, 1.243, 5.660 max_d=5.660 avg_d=0.325 std_dev=0.918
O5'	A	0, -0.703, 0.336, 1.374, 6.369 max_d=6.369 avg_d=0.336 std_dev=1.039
C8	B	0, -0.631, 0.495, 1.621, 6.994 max_d=6.994 avg_d=0.495 std_dev=1.126
C4'	B	0, -0.755, 0.431, 1.618, 7.305 max_d=7.305 avg_d=0.431 std_dev=1.187
N7	B	0, -0.669, 0.532, 1.734, 7.461 max_d=7.461 avg_d=0.532 std_dev=1.202
O4'	B	0, -0.872, 0.468, 1.809, 8.252 max_d=8.252 avg_d=0.468 std_dev=1.340
C3'	B	0, -0.885, 0.485, 1.855, 8.419 max_d=8.419 avg_d=0.485 std_dev=1.370
O3'	B	0, -0.936, 0.508, 1.952, 8.864 max_d=8.864 avg_d=0.508 std_dev=1.444
N9	B	0, -0.986, 0.543, 2.072, 9.419 max_d=9.419 avg_d=0.543 std_dev=1.529
P	A	0, -1.102, 0.443, 1.988, 9.431 max_d=9.431 avg_d=0.443 std_dev=1.545
C1'	B	0, -1.118, 0.537, 2.193, 10.162 max_d=10.162 avg_d=0.537 std_dev=1.655
C5	B	0, -1.044, 0.613, 2.270, 10.220 max_d=10.220 avg_d=0.613 std_dev=1.657
OP1	A	0, -1.243, 0.497, 2.238, 10.626 max_d=10.626 avg_d=0.497 std_dev=1.741
C2'	B	0, -1.217, 0.577, 2.371, 11.003 max_d=11.003 avg_d=0.577 std_dev=1.794
OP2	A	0, -1.295, 0.536, 2.366, 11.182 max_d=11.182 avg_d=0.536 std_dev=1.830
C4	B	0, -1.226, 0.624, 2.473, 11.361 max_d=11.361 avg_d=0.624 std_dev=1.849
O6	B	0, -1.188, 0.734, 2.655, 11.854 max_d=11.854 avg_d=0.734 std_dev=1.921
C6	B	0, -1.259, 0.706, 2.672, 12.096 max_d=12.096 avg_d=0.706 std_dev=1.965
O2'	B	0, -1.478, 0.641, 2.760, 12.968 max_d=12.968 avg_d=0.641 std_dev=2.119
N3	B	0, -1.555, 0.731, 3.016, 14.010 max_d=14.010 avg_d=0.731 std_dev=2.285
N1	B	0, -1.580, 0.809, 3.198, 14.676 max_d=14.676 avg_d=0.809 std_dev=2.389
C2	B	0, -1.707, 0.821, 3.349, 15.506 max_d=15.506 avg_d=0.821 std_dev=2.528
N2	B	0, -2.021, 0.943, 3.906, 18.157 max_d=18.157 avg_d=0.943 std_dev=2.964

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.25	0.06	0.09
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.06	0.10	0.32	0.66	0.28	0.43
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.05	0.02	0.05	0.03	0.08	0.00	0.01	0.01	0.15	0.23	0.08	0.14
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.02	0.07	0.01	0.05	0.02	0.12	0.02	0.00	0.00	0.09	0.10	0.06	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.04	0.02	0.09	0.41	0.12	0.13
C4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.13	0.01	0.07	0.04	0.22	0.01	0.02	0.00	0.02	0.08	0.04	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.05	0.08	0.18	0.14	0.38	0.17
C5'	0.02	0.17	0.04	0.02	0.08	0.01	0.25	0.00	0.27	0.05	0.12	0.09	0.39	0.04	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.13	0.00	0.27	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.10	0.20	0.10	0.38	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.08	0.34	0.08	0.12
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.06	0.06	0.26	0.66	0.23	0.38
N4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.04	0.03	0.10	0.42	0.14	0.14
O2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.22	0.01	0.39	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.10	0.19	0.57	0.94	0.60	0.73
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.07	0.01	0.11	0.04	0.12	0.05	0.06	0.08	0.11	0.00	0.04	0.01	0.16	0.23	0.09	0.15
O3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.05	0.04	0.06	0.04	0.10	0.04	0.00	0.03	0.03	0.06	0.06	0.02
O4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.06	0.03	0.19	0.01	0.03	0.00	0.03	0.20	0.04	0.05
O5'	0.07	0.32	0.15	0.09	0.09	0.02	0.18	0.01	0.20	0.08	0.26	0.10	0.57	0.16	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.25	0.66	0.23	0.10	0.41	0.08	0.14	0.05	0.10	0.34	0.66	0.42	0.94	0.23	0.06	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.28	0.08	0.06	0.12	0.04	0.38	0.04	0.38	0.08	0.23	0.14	0.60	0.09	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.43	0.14	0.06	0.13	0.01	0.17	0.01	0.19	0.12	0.38	0.14	0.73	0.15	0.02	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.77	0.31	0.64	0.49	0.37	0.78	0.15	0.60	0.06	0.32	0.12	0.36	0.45	0.11	0.49	0.91	0.47	0.88	0.23	0.19	0.34	0.12	0.08
C2	0.62	0.20	0.49	0.38	0.26	0.67	0.09	0.55	0.08	0.25	0.07	0.23	0.32	0.08	0.38	0.69	0.34	0.76	0.19	0.21	0.32	0.13	0.07
C2'	0.67	0.27	0.55	0.40	0.31	0.66	0.10	0.48	0.07	0.24	0.09	0.33	0.40	0.07	0.41	0.82	0.38	0.76	0.13	0.22	0.48	0.15	0.13
C3'	0.73	0.35	0.60	0.42	0.37	0.67	0.15	0.46	0.06	0.27	0.16	0.42	0.48	0.09	0.46	0.90	0.39	0.79	0.12	0.16	0.52	0.15	0.14
C4	0.51	0.10	0.36	0.27	0.18	0.54	0.08	0.45	0.17	0.20	0.11	0.12	0.21	0.09	0.31	0.52	0.23	0.66	0.16	0.31	0.20	0.09	0.07
C4'	0.74	0.40	0.59	0.37	0.40	0.63	0.19	0.39	0.10	0.30	0.21	0.47	0.51	0.13	0.49	0.89	0.31	0.78	0.07	0.10	0.56	0.16	0.18
C5	0.61	0.16	0.44	0.32	0.24	0.61	0.10	0.49	0.16	0.25	0.11	0.19	0.29	0.11	0.38	0.64	0.28	0.74	0.17	0.33	0.21	0.09	0.07
C5'	0.62	0.40	0.44	0.17	0.37	0.41	0.19	0.16	0.12	0.24	0.24	0.48	0.48	0.12	0.41	0.71	0.08	0.63	0.16	0.07	0.76	0.25	0.35
C6	0.69	0.22	0.53	0.39	0.30	0.69	0.10	0.54	0.12	0.28	0.08	0.26	0.36	0.10	0.44	0.76	0.35	0.82	0.18	0.28	0.26	0.09	0.05
N1	0.70	0.24	0.56	0.42	0.31	0.72	0.11	0.56	0.08	0.28	0.08	0.28	0.38	0.08	0.44	0.79	0.38	0.83	0.19	0.23	0.31	0.11	0.06
N3	0.52	0.12	0.38	0.30	0.19	0.57	0.07	0.49	0.12	0.20	0.08	0.14	0.23	0.07	0.31	0.54	0.26	0.67	0.16	0.25	0.26	0.12	0.06
N4	0.38	0.09	0.24	0.19	0.11	0.41	0.13	0.37	0.23	0.15	0.18	0.09	0.12	0.14	0.21	0.37	0.17	0.52	0.16	0.36	0.14	0.11	0.12
O2	0.60	0.22	0.50	0.41	0.27	0.68	0.12	0.56	0.09	0.25	0.10	0.25	0.33	0.11	0.38	0.69	0.38	0.72	0.22	0.17	0.38	0.16	0.11
O2'	0.69	0.24	0.61	0.50	0.29	0.75	0.09	0.61	0.11	0.25	0.08	0.29	0.38	0.08	0.42	0.87	0.51	0.80	0.24	0.29	0.34	0.12	0.09
O3'	0.85	0.40	0.76	0.60	0.44	0.85	0.20	0.65	0.08	0.35	0.19	0.47	0.55	0.14	0.55	1.07	0.61	0.92	0.28	0.16	0.33	0.12	0.08
O4'	0.77	0.37	0.61	0.41	0.40	0.69	0.19	0.46	0.08	0.31	0.19	0.43	0.50	0.13	0.50	0.90	0.35	0.83	0.12	0.12	0.47	0.14	0.12
O5'	0.59	0.47	0.42	0.12	0.39	0.31	0.20	0.08	0.17	0.21	0.31	0.57	0.53	0.11	0.40	0.71	0.06	0.55	0.29	0.07	0.94	0.39	0.52
OP1	0.10	0.14	0.17	0.52	0.10	0.33	0.23	0.65	0.23	0.31	0.11	0.26	0.15	0.37	0.13	0.20	0.65	0.10	0.87	0.33	1.45	0.87	1.05
OP2	0.31	0.34	0.09	0.27	0.24	0.08	0.13	0.36	0.14	0.12	0.24	0.44	0.36	0.11	0.21	0.31	0.45	0.25	0.55	0.10	1.15	0.46	0.70
P	0.33	0.35	0.14	0.24	0.22	0.07	0.09	0.38	0.09	0.10	0.22	0.46	0.37	0.12	0.19	0.39	0.38	0.25	0.59	0.09	1.22	0.59	0.79

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.09	0.13	0.04
C2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.06	0.01	0.24	0.08	0.07
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.08	0.09	0.04
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.05	0.08	0.06	0.07	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.05	0.07	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.22	0.09	0.07
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.14	0.02
C5	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.09	0.01	0.28	0.11	0.10
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.09	0.04	0.05	0.03	0.08	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.12	0.13	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.08	0.00	0.30	0.12	0.10
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.25	0.11	0.13
N1	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.28	0.10	0.08
N2	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.07	0.01	0.24	0.08	0.07
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.06	0.01	0.21	0.08	0.06
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.31	0.12	0.14
N9	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.18	0.10	0.07
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.01	0.06	0.08	0.06	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.12	0.03
O3'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.08	0.07	0.11	0.07	0.08	0.03	0.03	0.00	0.01	0.05	0.07	0.08	0.07	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.18	0.05
O5'	0.04	0.06	0.03	0.03	0.06	0.01	0.09	0.00	0.08	0.12	0.07	0.07	0.06	0.12	0.07	0.02	0.05	0.04	0.00	0.10	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.02	0.10	0.00	0.33	0.15	0.12
OP1	0.09	0.24	0.08	0.05	0.22	0.06	0.28	0.12	0.30	0.25	0.28	0.24	0.21	0.31	0.18	0.05	0.08	0.05	0.02	0.33	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.08	0.09	0.07	0.09	0.14	0.11	0.13	0.12	0.11	0.10	0.08	0.08	0.12	0.10	0.12	0.07	0.18	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.04	0.03	0.07	0.02	0.10	0.01	0.10	0.13	0.08	0.07	0.06	0.14	0.07	0.03	0.04	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00