Doublet Group distance statistics: 49756

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 4, 2, 1, 1, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.019 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.011, 0.024, 0.036, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N4	A	0, 0.027, 0.058, 0.089, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.058 std_dev=0.031
O2	A	0, 0.027, 0.063, 0.098, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.063 std_dev=0.036
C5'	B	0, 0.197, 0.321, 0.446, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.321 std_dev=0.125
C3'	B	0, 0.235, 0.392, 0.548, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.392 std_dev=0.156
C4'	B	0, 0.204, 0.367, 0.531, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.367 std_dev=0.164
O3'	B	0, 0.225, 0.390, 0.556, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.390 std_dev=0.166
O5'	B	0, 0.188, 0.385, 0.581, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.385 std_dev=0.196
O4'	A	0, 0.166, 0.366, 0.566, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.366 std_dev=0.200
C2'	B	0, 0.317, 0.520, 0.724, 0.935 max_d=0.935 avg_d=0.520 std_dev=0.203
OP2	B	0, 0.245, 0.469, 0.694, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.469 std_dev=0.224
O4'	B	0, 0.265, 0.491, 0.717, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.491 std_dev=0.226
C2'	A	0, 0.162, 0.398, 0.634, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.398 std_dev=0.236
P	B	0, 0.244, 0.488, 0.732, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.488 std_dev=0.244
O2'	B	0, 0.336, 0.600, 0.863, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.600 std_dev=0.263
C1'	B	0, 0.308, 0.595, 0.881, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.595 std_dev=0.286
OP1	B	0, 0.283, 0.601, 0.919, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.601 std_dev=0.318
P	A	0, 0.217, 0.542, 0.868, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.542 std_dev=0.325
O5'	A	0, 0.215, 0.545, 0.874, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.545 std_dev=0.330
OP1	A	0, 0.293, 0.640, 0.986, 1.179 max_d=1.179 avg_d=0.640 std_dev=0.347
N9	B	0, 0.325, 0.699, 1.074, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.699 std_dev=0.374
C8	B	0, 0.408, 0.783, 1.159, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.783 std_dev=0.376
OP2	A	0, 0.195, 0.575, 0.954, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.575 std_dev=0.379
C5'	A	0, 0.373, 0.773, 1.172, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.773 std_dev=0.399
C4'	A	0, 0.281, 0.698, 1.115, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.698 std_dev=0.417
N7	B	0, 0.477, 0.936, 1.395, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.936 std_dev=0.459
C4	B	0, 0.333, 0.816, 1.298, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.816 std_dev=0.483
N3	B	0, 0.367, 0.878, 1.388, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.878 std_dev=0.510
C5	B	0, 0.407, 0.927, 1.447, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.927 std_dev=0.520
C3'	A	0, 0.317, 0.904, 1.492, 1.539 max_d=1.539 avg_d=0.904 std_dev=0.587
C2	B	0, 0.384, 0.993, 1.601, 2.057 max_d=2.057 avg_d=0.993 std_dev=0.608
O2'	A	0, 0.260, 0.878, 1.497, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.878 std_dev=0.619
C6	B	0, 0.422, 1.043, 1.665, 2.016 max_d=2.016 avg_d=1.043 std_dev=0.621
N2	B	0, 0.453, 1.105, 1.757, 2.342 max_d=2.342 avg_d=1.105 std_dev=0.652
O6	B	0, 0.492, 1.157, 1.822, 2.240 max_d=2.240 avg_d=1.157 std_dev=0.665
N1	B	0, 0.375, 1.047, 1.719, 2.176 max_d=2.176 avg_d=1.047 std_dev=0.672
O3'	A	0, 0.514, 1.603, 2.692, 2.715 max_d=2.715 avg_d=1.603 std_dev=1.089

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.34	0.00	0.15	0.13	0.27	0.16
C2	0.03	0.00	0.09	0.20	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.29	0.24	0.09	0.05	0.06	0.17	0.09
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.02	0.10	0.18	0.12	0.02	0.07	0.04	0.16	0.00	0.03	0.01	0.39	0.39	0.55	0.42
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.39	0.01	0.44	0.03	0.39	0.23	0.30	0.43	0.09	0.01	0.01	0.02	0.17	0.18	0.20	0.18
C4	0.02	0.01	0.03	0.39	0.00	0.17	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.41	0.14	0.03	0.19	0.14	0.15	0.14
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.17	0.00	0.23	0.01	0.22	0.09	0.08	0.18	0.09	0.30	0.03	0.00	0.02	0.08	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.10	0.44	0.00	0.23	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.38	0.28	0.09	0.23	0.16	0.15	0.15
C5'	0.05	0.04	0.18	0.03	0.18	0.01	0.24	0.00	0.19	0.05	0.10	0.22	0.09	0.12	0.25	0.01	0.01	0.08	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.12	0.39	0.01	0.22	0.00	0.19	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.31	0.21	0.11	0.14	0.08	0.17	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.23	0.01	0.09	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.10	0.02	0.06	0.07	0.21	0.10
N3	0.03	0.00	0.07	0.30	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.37	0.11	0.06	0.11	0.08	0.13	0.09
N4	0.02	0.01	0.04	0.43	0.00	0.18	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.44	0.19	0.04	0.24	0.20	0.20	0.19
O2	0.06	0.00	0.16	0.09	0.01	0.09	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.21	0.49	0.17	0.09	0.10	0.20	0.13
O2'	0.02	0.29	0.00	0.01	0.41	0.30	0.38	0.12	0.31	0.24	0.37	0.44	0.21	0.00	0.05	0.21	0.23	0.20	0.55	0.28
O3'	0.34	0.24	0.03	0.01	0.14	0.03	0.28	0.25	0.21	0.10	0.11	0.19	0.49	0.05	0.00	0.23	0.35	0.55	0.44	0.43
O4'	0.00	0.09	0.01	0.02	0.03	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.06	0.04	0.17	0.21	0.23	0.00	0.12	0.15	0.16	0.14
O5'	0.15	0.05	0.39	0.17	0.19	0.02	0.23	0.01	0.14	0.06	0.11	0.24	0.09	0.23	0.35	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.13	0.06	0.39	0.18	0.14	0.08	0.16	0.08	0.08	0.07	0.08	0.20	0.10	0.20	0.55	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.17	0.55	0.20	0.15	0.02	0.15	0.04	0.17	0.21	0.13	0.20	0.20	0.55	0.44	0.16	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.09	0.42	0.18	0.14	0.02	0.15	0.02	0.08	0.10	0.09	0.19	0.13	0.28	0.43	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.39	0.61	0.36	0.28	0.49	0.26	0.45	0.19	0.48	0.36	0.56	0.68	0.57	0.39	0.41	0.36	0.24	0.34	0.18	0.43	0.19	0.08	0.11
C2	0.44	0.66	0.39	0.30	0.57	0.27	0.54	0.19	0.57	0.44	0.64	0.70	0.62	0.47	0.48	0.37	0.23	0.37	0.19	0.53	0.14	0.10	0.11
C2'	0.45	0.64	0.45	0.37	0.52	0.33	0.46	0.25	0.48	0.38	0.57	0.73	0.61	0.39	0.45	0.46	0.36	0.39	0.24	0.43	0.23	0.10	0.14
C3'	0.20	0.64	0.20	0.15	0.39	0.15	0.38	0.22	0.50	0.21	0.63	0.77	0.52	0.28	0.25	0.25	0.20	0.14	0.23	0.49	0.26	0.33	0.28
C4	0.38	0.49	0.34	0.27	0.45	0.25	0.42	0.20	0.41	0.38	0.46	0.52	0.49	0.39	0.41	0.30	0.20	0.34	0.22	0.36	0.19	0.10	0.14
C4'	0.38	0.79	0.34	0.20	0.56	0.18	0.52	0.09	0.61	0.35	0.75	0.91	0.69	0.40	0.43	0.35	0.12	0.29	0.13	0.58	0.09	0.14	0.09
C5	0.34	0.42	0.32	0.27	0.38	0.25	0.33	0.21	0.32	0.32	0.37	0.46	0.43	0.31	0.35	0.29	0.22	0.31	0.22	0.27	0.24	0.09	0.15
C5'	0.36	0.73	0.34	0.20	0.51	0.17	0.46	0.10	0.54	0.31	0.67	0.86	0.65	0.35	0.38	0.36	0.13	0.27	0.16	0.49	0.08	0.18	0.12
C6	0.35	0.47	0.33	0.28	0.41	0.25	0.36	0.20	0.35	0.32	0.42	0.53	0.47	0.32	0.36	0.32	0.24	0.31	0.20	0.30	0.23	0.08	0.13
N1	0.40	0.59	0.37	0.29	0.49	0.26	0.45	0.19	0.47	0.37	0.54	0.64	0.56	0.39	0.42	0.35	0.24	0.34	0.19	0.42	0.19	0.08	0.11
N3	0.43	0.61	0.37	0.28	0.55	0.26	0.53	0.18	0.54	0.45	0.59	0.63	0.58	0.48	0.48	0.34	0.20	0.37	0.20	0.50	0.14	0.10	0.11
N4	0.35	0.42	0.29	0.25	0.40	0.24	0.38	0.19	0.37	0.37	0.40	0.44	0.42	0.37	0.38	0.25	0.16	0.33	0.25	0.33	0.19	0.14	0.17
O2	0.46	0.75	0.41	0.30	0.62	0.26	0.61	0.17	0.67	0.47	0.74	0.80	0.69	0.52	0.52	0.39	0.23	0.38	0.17	0.64	0.12	0.12	0.10
O2'	0.55	0.54	0.52	0.54	0.54	0.54	0.51	0.55	0.48	0.54	0.49	0.55	0.56	0.53	0.55	0.49	0.53	0.57	0.55	0.44	0.68	0.46	0.54
O3'	0.45	1.07	0.35	0.18	0.79	0.15	0.85	0.07	1.04	0.56	1.14	1.18	0.89	0.72	0.59	0.33	0.16	0.33	0.13	1.09	0.09	0.11	0.07
O4'	0.44	0.73	0.39	0.28	0.57	0.27	0.53	0.19	0.58	0.40	0.69	0.82	0.67	0.43	0.47	0.39	0.22	0.37	0.19	0.52	0.18	0.08	0.12
O5'	0.17	0.45	0.16	0.09	0.29	0.09	0.27	0.11	0.32	0.20	0.41	0.55	0.38	0.24	0.20	0.19	0.10	0.12	0.12	0.31	0.09	0.21	0.13
OP1	0.12	0.31	0.14	0.11	0.16	0.11	0.14	0.11	0.18	0.11	0.26	0.42	0.27	0.14	0.10	0.21	0.14	0.10	0.10	0.19	0.14	0.17	0.11
OP2	0.16	0.29	0.18	0.17	0.18	0.18	0.16	0.17	0.19	0.14	0.25	0.36	0.25	0.15	0.14	0.23	0.20	0.16	0.15	0.19	0.18	0.19	0.16
P	0.11	0.32	0.13	0.09	0.18	0.09	0.15	0.09	0.19	0.11	0.27	0.42	0.28	0.14	0.10	0.19	0.11	0.09	0.10	0.18	0.12	0.17	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.01	0.09	0.10	0.07
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.09	0.02	0.11	0.01	0.14	0.16	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.09	0.07	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.09	0.08	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.08	0.05	0.09	0.07	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.09	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.04	0.02	0.11	0.01	0.12	0.14	0.11
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.02	0.04	0.03	0.07	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.02	0.13	0.01	0.14	0.15	0.13
C5'	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.04	0.04	0.10	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.13	0.00	0.14	0.16	0.14
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.03	0.14	0.02	0.13	0.13	0.12
N1	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.01	0.12	0.01	0.14	0.16	0.13
N2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.12	0.02	0.11	0.02	0.14	0.16	0.11
N3	0.02	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.02	0.10	0.01	0.13	0.15	0.11
N7	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.15	0.02	0.15	0.15	0.15
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.11	0.01	0.11	0.12	0.09
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.06	0.04	0.04	0.04	0.06	0.02	0.09	0.14	0.11	0.02	0.02	0.00	0.05	0.05	0.04	0.05	0.08	0.06	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.02	0.06	0.03	0.06	0.09	0.07	0.12	0.08	0.09	0.03	0.05	0.00	0.02	0.07	0.08	0.11	0.05	0.05
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.00	0.07	0.02	0.08	0.10	0.06
O5'	0.07	0.11	0.04	0.05	0.11	0.01	0.13	0.01	0.13	0.14	0.12	0.11	0.10	0.15	0.11	0.04	0.07	0.07	0.00	0.15	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.08	0.02	0.15	0.00	0.16	0.17	0.17
OP1	0.09	0.14	0.09	0.09	0.12	0.06	0.14	0.06	0.14	0.13	0.14	0.14	0.13	0.15	0.11	0.08	0.11	0.08	0.02	0.16	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.16	0.08	0.05	0.14	0.03	0.15	0.02	0.16	0.13	0.16	0.16	0.15	0.15	0.12	0.06	0.05	0.10	0.02	0.17	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.11	0.05	0.04	0.11	0.02	0.13	0.01	0.14	0.12	0.13	0.11	0.11	0.15	0.09	0.04	0.05	0.06	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00