Doublet Group distance statistics: 49758

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.007, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.007 std_dev=0.003
C4	A	0, 0.008, 0.013, 0.018, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.013 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.008, 0.014, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.014 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.020, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.011, 0.019, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.019 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.014, 0.024, 0.035, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.024 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.019, 0.035, 0.050, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.035 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.030, 0.054, 0.077, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.054 std_dev=0.024
P	B	0, 0.344, 0.648, 0.951, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.648 std_dev=0.304
O5'	B	0, 0.537, 0.919, 1.301, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.919 std_dev=0.382
O4'	A	0, 0.569, 0.967, 1.364, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.967 std_dev=0.397
C2'	A	0, 0.616, 1.048, 1.480, 1.277 max_d=1.277 avg_d=1.048 std_dev=0.432
O2'	A	0, 0.683, 1.164, 1.645, 1.434 max_d=1.434 avg_d=1.164 std_dev=0.481
OP2	B	0, 0.707, 1.209, 1.710, 1.551 max_d=1.551 avg_d=1.209 std_dev=0.502
OP1	B	0, 0.764, 1.314, 1.863, 1.659 max_d=1.659 avg_d=1.314 std_dev=0.550
N7	B	0, 0.808, 1.401, 1.995, 1.842 max_d=1.842 avg_d=1.401 std_dev=0.593
C4'	A	0, 0.868, 1.476, 2.083, 1.784 max_d=1.784 avg_d=1.476 std_dev=0.607
C5	B	0, 0.851, 1.471, 2.090, 1.861 max_d=1.861 avg_d=1.471 std_dev=0.620
C3'	A	0, 0.969, 1.648, 2.328, 2.008 max_d=2.008 avg_d=1.648 std_dev=0.680
C4	B	0, 1.008, 1.718, 2.428, 2.134 max_d=2.134 avg_d=1.718 std_dev=0.710
C6	B	0, 1.033, 1.777, 2.521, 2.274 max_d=2.274 avg_d=1.777 std_dev=0.744
N3	B	0, 1.082, 1.838, 2.595, 2.238 max_d=2.238 avg_d=1.838 std_dev=0.756
C5'	B	0, 1.092, 1.855, 2.617, 2.271 max_d=2.271 avg_d=1.855 std_dev=0.763
C8	B	0, 1.115, 1.898, 2.680, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.898 std_dev=0.783
C2	B	0, 1.103, 1.889, 2.676, 2.429 max_d=2.429 avg_d=1.889 std_dev=0.786
N1	B	0, 1.181, 2.028, 2.875, 2.626 max_d=2.626 avg_d=2.028 std_dev=0.847
N9	B	0, 1.234, 2.095, 2.955, 2.601 max_d=2.601 avg_d=2.095 std_dev=0.860
O6	B	0, 1.234, 2.111, 2.988, 2.669 max_d=2.669 avg_d=2.111 std_dev=0.877
N2	B	0, 1.248, 2.141, 3.033, 2.792 max_d=2.792 avg_d=2.141 std_dev=0.893
O3'	A	0, 1.349, 2.303, 3.257, 2.843 max_d=2.843 avg_d=2.303 std_dev=0.954
O5'	A	0, 1.444, 2.448, 3.451, 2.948 max_d=2.948 avg_d=2.448 std_dev=1.004
O4'	B	0, 1.506, 2.546, 3.587, 3.055 max_d=3.055 avg_d=2.546 std_dev=1.040
C4'	B	0, 1.537, 2.603, 3.669, 3.159 max_d=3.159 avg_d=2.603 std_dev=1.066
C5'	A	0, 1.532, 2.600, 3.667, 3.127 max_d=3.127 avg_d=2.600 std_dev=1.067
C1'	B	0, 1.630, 2.758, 3.887, 3.356 max_d=3.356 avg_d=2.758 std_dev=1.129
C3'	B	0, 1.702, 2.890, 4.077, 3.554 max_d=3.554 avg_d=2.890 std_dev=1.188
C2'	B	0, 1.892, 3.208, 4.524, 3.940 max_d=3.940 avg_d=3.208 std_dev=1.316
OP2	A	0, 1.909, 3.281, 4.654, 4.081 max_d=4.081 avg_d=3.281 std_dev=1.372
O3'	B	0, 1.971, 3.345, 4.718, 4.086 max_d=4.086 avg_d=3.345 std_dev=1.373
P	A	0, 2.268, 3.853, 5.438, 4.674 max_d=4.674 avg_d=3.853 std_dev=1.585
O2'	B	0, 2.378, 4.027, 5.675, 4.887 max_d=4.887 avg_d=4.027 std_dev=1.648
OP1	A	0, 3.073, 5.201, 7.329, 6.237 max_d=6.237 avg_d=5.201 std_dev=2.128

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.08	0.09
C2	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.16	0.31	0.17	0.23
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.02	0.02	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.13	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.12	0.03	0.05	0.06	0.13	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.14	0.05
C4	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.14	0.39	0.16	0.23
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.04	0.05	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.02
C5	0.00	0.00	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.13	0.01	0.08	0.30	0.09	0.14
C5'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.04	0.08	0.10	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.06	0.00
C6	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.06	0.20	0.05	0.09
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.11	0.21	0.10	0.15
N3	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.01	0.17	0.39	0.19	0.26
N4	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.14	0.44	0.18	0.25
O2	0.02	0.00	0.10	0.13	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.14	0.02	0.18	0.31	0.19	0.25
O2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.08	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.14	0.04
O3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.13	0.03	0.05	0.08	0.14	0.01	0.00	0.00	0.12	0.14	0.24	0.12
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.08	0.04	0.06	0.07
O5'	0.07	0.16	0.01	0.04	0.14	0.00	0.08	0.00	0.06	0.11	0.17	0.14	0.18	0.02	0.12	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.10	0.31	0.04	0.04	0.39	0.06	0.30	0.10	0.20	0.21	0.39	0.44	0.31	0.04	0.14	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.17	0.13	0.14	0.16	0.04	0.09	0.06	0.05	0.10	0.19	0.18	0.19	0.14	0.24	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.09	0.23	0.05	0.05	0.23	0.02	0.14	0.00	0.09	0.15	0.26	0.25	0.25	0.04	0.12	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.27	0.30	0.28	0.27	0.30	0.26	0.23	0.25	0.26	0.26	0.28	0.28	0.25	0.27	0.31	0.28	0.30	0.13	0.25	0.10	0.14	0.07
C2	0.28	0.28	0.28	0.27	0.27	0.29	0.26	0.24	0.27	0.26	0.27	0.29	0.29	0.26	0.27	0.28	0.25	0.28	0.14	0.26	0.11	0.13	0.07
C2'	0.37	0.31	0.35	0.32	0.31	0.37	0.27	0.28	0.26	0.29	0.28	0.33	0.33	0.26	0.32	0.40	0.31	0.38	0.16	0.24	0.10	0.14	0.07
C3'	0.50	0.41	0.51	0.48	0.41	0.50	0.36	0.38	0.34	0.39	0.36	0.43	0.44	0.35	0.43	0.59	0.50	0.49	0.23	0.31	0.09	0.22	0.12
C4	0.27	0.27	0.29	0.30	0.27	0.28	0.26	0.26	0.26	0.26	0.27	0.28	0.28	0.26	0.27	0.29	0.29	0.25	0.16	0.26	0.07	0.13	0.08
C4'	0.46	0.39	0.49	0.46	0.39	0.45	0.36	0.35	0.34	0.38	0.36	0.40	0.41	0.35	0.41	0.54	0.50	0.44	0.22	0.32	0.09	0.23	0.12
C5	0.29	0.27	0.32	0.32	0.27	0.30	0.26	0.26	0.26	0.27	0.27	0.28	0.28	0.26	0.28	0.33	0.33	0.27	0.16	0.26	0.07	0.15	0.09
C5'	0.55	0.47	0.61	0.59	0.48	0.55	0.44	0.43	0.42	0.47	0.44	0.49	0.50	0.43	0.50	0.67	0.64	0.51	0.29	0.40	0.12	0.31	0.20
C6	0.30	0.28	0.32	0.32	0.27	0.31	0.26	0.26	0.26	0.27	0.26	0.28	0.28	0.26	0.28	0.34	0.33	0.28	0.15	0.25	0.07	0.15	0.08
N1	0.29	0.28	0.30	0.29	0.27	0.30	0.26	0.25	0.26	0.26	0.26	0.28	0.28	0.26	0.28	0.31	0.29	0.29	0.14	0.25	0.09	0.14	0.07
N3	0.27	0.28	0.27	0.26	0.27	0.28	0.26	0.25	0.27	0.25	0.27	0.29	0.28	0.26	0.26	0.26	0.24	0.26	0.15	0.26	0.09	0.12	0.07
N4	0.25	0.27	0.28	0.28	0.26	0.26	0.26	0.24	0.26	0.25	0.27	0.27	0.27	0.25	0.25	0.27	0.27	0.23	0.16	0.26	0.10	0.13	0.10
O2	0.28	0.29	0.25	0.24	0.28	0.28	0.27	0.22	0.27	0.26	0.28	0.30	0.29	0.26	0.27	0.26	0.21	0.29	0.14	0.27	0.14	0.13	0.09
O2'	0.31	0.26	0.27	0.24	0.25	0.30	0.22	0.22	0.21	0.24	0.23	0.28	0.28	0.22	0.26	0.31	0.22	0.33	0.13	0.20	0.12	0.11	0.06
O3'	0.54	0.43	0.55	0.49	0.43	0.53	0.37	0.39	0.34	0.40	0.37	0.45	0.46	0.35	0.46	0.64	0.52	0.53	0.23	0.30	0.10	0.22	0.12
O4'	0.34	0.31	0.37	0.36	0.31	0.35	0.29	0.27	0.28	0.30	0.29	0.32	0.32	0.28	0.32	0.40	0.38	0.33	0.16	0.27	0.09	0.17	0.08
O5'	0.65	0.54	0.71	0.69	0.56	0.65	0.51	0.54	0.48	0.56	0.50	0.55	0.58	0.51	0.59	0.77	0.75	0.61	0.39	0.45	0.15	0.40	0.28
OP1	1.01	0.92	1.10	1.08	0.94	0.98	0.90	0.85	0.87	0.95	0.88	0.92	0.95	0.91	0.97	1.14	1.13	0.94	0.73	0.83	0.48	0.79	0.64
OP2	0.76	0.61	0.84	0.79	0.64	0.73	0.58	0.59	0.53	0.64	0.56	0.62	0.66	0.58	0.68	0.92	0.86	0.70	0.44	0.48	0.18	0.47	0.33
P	0.85	0.72	0.94	0.90	0.75	0.83	0.69	0.70	0.65	0.74	0.67	0.73	0.76	0.68	0.79	1.00	0.97	0.79	0.54	0.60	0.27	0.56	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.12	0.07
C2	0.01	0.00	0.11	0.10	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.13	0.07	0.13	0.00	0.16	0.13	0.17
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.09	0.13	0.11	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.20	0.09
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.21	0.07
C4	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.04	0.11	0.00	0.14	0.13	0.16
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.12	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.12	0.00	0.17	0.13	0.18
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.06	0.08	0.07	0.06	0.07	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.08	0.02	0.09	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.04	0.13	0.00	0.19	0.14	0.20
C8	0.00	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.03	0.10	0.01	0.13	0.13	0.14
N1	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.11	0.06	0.13	0.00	0.18	0.14	0.19
N2	0.02	0.00	0.13	0.11	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.08	0.13	0.01	0.16	0.13	0.17
N3	0.01	0.00	0.11	0.09	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.11	0.07	0.11	0.01	0.13	0.13	0.15
N7	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.11	0.01	0.17	0.14	0.18
N9	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.11	0.13	0.12
O2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.08	0.12	0.09	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.19	0.05
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.08	0.05	0.11	0.16	0.11	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.07	0.09	0.21	0.04
O4'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.06	0.08	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.06	0.03
O5'	0.05	0.13	0.03	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.13	0.10	0.13	0.13	0.11	0.11	0.09	0.02	0.05	0.03	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.03	0.13	0.00	0.21	0.14	0.21
OP1	0.05	0.16	0.05	0.05	0.14	0.03	0.17	0.02	0.19	0.13	0.18	0.16	0.13	0.17	0.11	0.04	0.09	0.03	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00
OP2	0.12	0.13	0.20	0.21	0.13	0.12	0.13	0.09	0.14	0.13	0.14	0.13	0.13	0.14	0.13	0.19	0.21	0.06	0.01	0.14	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.17	0.09	0.07	0.16	0.02	0.18	0.01	0.20	0.14	0.19	0.17	0.15	0.18	0.12	0.05	0.04	0.03	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00