Doublet Group distance statistics: 49759

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.003, 0.005, 0.004 max_d=0.004 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.019, 0.036, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.006, 0.023, 0.041, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.005, 0.025, 0.044, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.025 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.017, 0.063, 0.108, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.063 std_dev=0.045
N4	A	0, 0.015, 0.068, 0.120, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.068 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.035, 0.111, 0.187, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.111 std_dev=0.076
C2'	A	0, 0.027, 0.166, 0.305, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.166 std_dev=0.139
C4'	A	0, 0.058, 0.246, 0.434, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.246 std_dev=0.188
O5'	B	0, 0.269, 0.606, 0.943, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.606 std_dev=0.337
C5'	A	0, 0.115, 0.453, 0.791, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.453 std_dev=0.338
P	B	0, 0.265, 0.613, 0.962, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.613 std_dev=0.349
C3'	A	0, 0.033, 0.424, 0.815, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.424 std_dev=0.391
OP1	B	0, 0.303, 0.700, 1.098, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.700 std_dev=0.397
OP2	B	0, 0.248, 0.663, 1.078, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.663 std_dev=0.415
C5'	B	0, 0.228, 0.656, 1.084, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.656 std_dev=0.428
O4'	B	0, 0.260, 0.813, 1.366, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.813 std_dev=0.553
C4'	B	0, 0.284, 0.873, 1.461, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.873 std_dev=0.588
O2'	A	0, -0.027, 0.621, 1.269, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.621 std_dev=0.648
O5'	A	0, 0.067, 0.723, 1.379, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.723 std_dev=0.656
N1	B	0, 0.060, 0.755, 1.451, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.755 std_dev=0.695
N9	B	0, 0.222, 0.939, 1.656, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.939 std_dev=0.717
C4	B	0, 0.163, 0.880, 1.596, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.880 std_dev=0.717
C1'	B	0, 0.276, 0.995, 1.714, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.995 std_dev=0.719
C2	B	0, 0.111, 0.854, 1.596, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.854 std_dev=0.743
C3'	B	0, 0.324, 1.085, 1.846, 1.917 max_d=1.917 avg_d=1.085 std_dev=0.761
C6	B	0, 0.095, 0.857, 1.619, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.857 std_dev=0.762
C5	B	0, 0.145, 0.909, 1.673, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.909 std_dev=0.764
N3	B	0, 0.154, 0.922, 1.691, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.922 std_dev=0.769
C8	B	0, 0.235, 1.034, 1.833, 1.958 max_d=1.958 avg_d=1.034 std_dev=0.799
O3'	B	0, 0.391, 1.194, 1.997, 2.031 max_d=2.031 avg_d=1.194 std_dev=0.803
N2	B	0, 0.146, 0.984, 1.823, 1.971 max_d=1.971 avg_d=0.984 std_dev=0.838
O3'	A	0, -0.044, 0.827, 1.697, 1.904 max_d=1.904 avg_d=0.827 std_dev=0.871
O6	B	0, 0.107, 0.978, 1.849, 2.037 max_d=2.037 avg_d=0.978 std_dev=0.871
N7	B	0, 0.199, 1.072, 1.946, 2.095 max_d=2.095 avg_d=1.072 std_dev=0.873
C2'	B	0, 0.344, 1.220, 2.096, 2.172 max_d=2.172 avg_d=1.220 std_dev=0.876
P	A	0, 0.074, 1.017, 1.960, 2.157 max_d=2.157 avg_d=1.017 std_dev=0.943
O2'	B	0, 0.388, 1.376, 2.365, 2.431 max_d=2.431 avg_d=1.376 std_dev=0.988
OP2	A	0, 0.055, 1.206, 2.358, 2.604 max_d=2.604 avg_d=1.206 std_dev=1.152
OP1	A	0, 0.065, 1.239, 2.414, 2.676 max_d=2.676 avg_d=1.239 std_dev=1.175

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.00	0.37	0.61	0.04	0.30
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.28	0.06	0.39	0.48	0.06	0.22
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.11	0.01	0.11	0.11	0.09	0.06	0.08	0.12	0.01	0.00	0.04	0.02	0.45	0.83	0.36	0.54
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.19	0.00	0.26	0.02	0.25	0.12	0.10	0.20	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.58	0.12	0.17
C4	0.00	0.00	0.11	0.19	0.00	0.13	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.39	0.06	0.06	0.45	0.36	0.08	0.21
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.13	0.00	0.14	0.00	0.11	0.07	0.10	0.15	0.03	0.20	0.05	0.01	0.00	0.43	0.23	0.06
C5	0.00	0.00	0.11	0.26	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.10	0.02	0.50	0.37	0.03	0.27
C5'	0.02	0.17	0.11	0.02	0.26	0.00	0.23	0.00	0.17	0.13	0.23	0.29	0.12	0.07	0.19	0.04	0.00	0.37	0.37	0.00
C6	0.00	0.00	0.09	0.25	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.27	0.10	0.01	0.52	0.46	0.05	0.32
N1	0.00	0.00	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.21	0.13	0.02	0.44	0.52	0.02	0.28
N3	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.10	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.21	0.07	0.41	0.41	0.09	0.19
N4	0.00	0.00	0.12	0.20	0.00	0.15	0.00	0.29	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.43	0.05	0.07	0.44	0.30	0.10	0.17
O2	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.44	0.06	0.34	0.52	0.07	0.20
O2'	0.01	0.25	0.00	0.01	0.39	0.20	0.36	0.07	0.27	0.21	0.34	0.43	0.14	0.00	0.05	0.16	0.22	0.72	0.37	0.40
O3'	0.23	0.28	0.04	0.01	0.06	0.05	0.10	0.19	0.10	0.13	0.21	0.05	0.44	0.05	0.00	0.11	0.51	0.08	0.45	0.30
O4'	0.00	0.06	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.07	0.07	0.06	0.16	0.11	0.00	0.26	0.46	0.15	0.15
O5'	0.37	0.39	0.45	0.02	0.45	0.00	0.50	0.00	0.52	0.44	0.41	0.44	0.34	0.22	0.51	0.26	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.61	0.48	0.83	0.58	0.36	0.43	0.37	0.37	0.46	0.52	0.41	0.30	0.52	0.72	0.08	0.46	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.06	0.36	0.12	0.08	0.23	0.03	0.37	0.05	0.02	0.09	0.10	0.07	0.37	0.45	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.30	0.22	0.54	0.17	0.21	0.06	0.27	0.00	0.32	0.28	0.19	0.17	0.20	0.40	0.30	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.26	0.14	0.21	0.15	0.25	0.08	0.31	0.08	0.06	0.18	0.34	0.24	0.05	0.13	0.11	0.21	0.24	0.27	0.08	0.31	0.26	0.27
C2	0.25	0.34	0.25	0.31	0.26	0.33	0.18	0.37	0.17	0.15	0.24	0.37	0.35	0.12	0.23	0.21	0.31	0.31	0.30	0.12	0.30	0.28	0.27
C2'	0.03	0.16	0.00	0.07	0.01	0.13	0.14	0.17	0.15	0.17	0.04	0.32	0.14	0.24	0.05	0.01	0.08	0.11	0.17	0.28	0.23	0.20	0.20
C3'	0.21	0.24	0.18	0.29	0.21	0.33	0.17	0.43	0.16	0.17	0.20	0.25	0.24	0.15	0.20	0.13	0.29	0.31	0.39	0.12	0.45	0.35	0.38
C4	0.07	0.07	0.05	0.09	0.12	0.13	0.17	0.24	0.16	0.16	0.11	0.03	0.06	0.20	0.12	0.09	0.12	0.05	0.20	0.18	0.25	0.12	0.17
C4'	0.20	0.21	0.16	0.26	0.21	0.30	0.21	0.39	0.21	0.20	0.22	0.20	0.21	0.20	0.20	0.09	0.24	0.28	0.33	0.20	0.39	0.30	0.32
C5	0.25	0.24	0.24	0.09	0.33	0.03	0.42	0.13	0.40	0.37	0.30	0.18	0.25	0.43	0.32	0.27	0.05	0.10	0.13	0.41	0.26	0.09	0.15
C5'	0.27	0.19	0.23	0.35	0.27	0.39	0.30	0.50	0.29	0.32	0.22	0.11	0.22	0.33	0.29	0.14	0.33	0.37	0.45	0.31	0.50	0.39	0.43
C6	0.16	0.17	0.17	0.04	0.23	0.05	0.31	0.17	0.34	0.27	0.25	0.11	0.16	0.33	0.21	0.20	0.03	0.03	0.16	0.39	0.29	0.15	0.19
N1	0.07	0.13	0.06	0.15	0.06	0.20	0.05	0.28	0.08	0.05	0.07	0.18	0.13	0.09	0.04	0.03	0.16	0.17	0.24	0.14	0.30	0.23	0.24
N3	0.22	0.24	0.23	0.30	0.22	0.32	0.16	0.37	0.15	0.14	0.18	0.24	0.28	0.12	0.20	0.19	0.31	0.29	0.29	0.12	0.27	0.24	0.25
N4	0.15	0.11	0.10	0.08	0.17	0.09	0.20	0.22	0.17	0.23	0.13	0.08	0.12	0.23	0.19	0.14	0.12	0.06	0.16	0.17	0.19	0.05	0.10
O2	0.43	0.55	0.42	0.45	0.43	0.44	0.32	0.44	0.30	0.28	0.41	0.63	0.57	0.24	0.39	0.40	0.44	0.45	0.36	0.21	0.31	0.34	0.32
O2'	0.01	0.35	0.02	0.02	0.04	0.01	0.13	0.05	0.08	0.25	0.20	0.61	0.25	0.30	0.08	0.05	0.01	0.01	0.10	0.20	0.17	0.09	0.10
O3'	0.03	0.13	0.02	0.10	0.09	0.10	0.12	0.19	0.16	0.07	0.17	0.13	0.09	0.10	0.06	0.08	0.08	0.08	0.11	0.20	0.15	0.06	0.07
O4'	0.18	0.24	0.15	0.23	0.20	0.27	0.18	0.34	0.18	0.16	0.22	0.24	0.22	0.16	0.18	0.09	0.22	0.26	0.29	0.15	0.33	0.26	0.27
O5'	0.41	0.32	0.43	0.35	0.40	0.32	0.42	0.25	0.41	0.44	0.35	0.25	0.35	0.44	0.41	0.46	0.35	0.34	0.28	0.42	0.23	0.31	0.29
OP1	0.21	0.23	0.19	0.10	0.20	0.12	0.17	0.06	0.17	0.15	0.21	0.26	0.23	0.14	0.18	0.26	0.08	0.16	0.12	0.14	0.13	0.23	0.18
OP2	0.13	0.16	0.13	0.20	0.14	0.22	0.12	0.29	0.13	0.11	0.15	0.17	0.15	0.11	0.13	0.10	0.23	0.18	0.24	0.11	0.23	0.17	0.20
P	0.10	0.09	0.11	0.03	0.10	0.02	0.10	0.07	0.10	0.10	0.09	0.08	0.09	0.10	0.10	0.16	0.02	0.05	0.03	0.10	0.04	0.07	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.17	0.10
C2	0.01	0.00	0.09	0.02	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.06	0.08	0.10	0.01	0.16	0.16	0.13
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.06	0.12	0.09	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.17	0.09
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.02	0.08	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.06	0.05	0.15	0.07
C4	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.11	0.07
C4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.03	0.06	0.05	0.04	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.07	0.01	0.15	0.08
C5	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.03	0.04	0.01	0.02	0.10	0.06
C5'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.12	0.08	0.12	0.12	0.09	0.09	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.13	0.10	0.05	0.01
C6	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.05	0.07	0.00	0.06	0.09	0.07
C8	0.00	0.00	0.07	0.08	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.12	0.04	0.08	0.01	0.14	0.18	0.13
N1	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.02	0.07	0.08	0.01	0.13	0.12	0.11
N2	0.01	0.00	0.12	0.04	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.10	0.09	0.12	0.01	0.21	0.20	0.16
N3	0.01	0.00	0.09	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.06	0.08	0.08	0.01	0.12	0.15	0.11
N7	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.07	0.01	0.11	0.15	0.11
N9	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.14	0.08
O2'	0.00	0.13	0.00	0.02	0.06	0.02	0.03	0.02	0.06	0.06	0.10	0.17	0.13	0.04	0.01	0.00	0.07	0.01	0.03	0.04	0.06	0.21	0.13
O3'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.12	0.02	0.10	0.06	0.11	0.04	0.07	0.00	0.01	0.08	0.06	0.07	0.16	0.10
O4'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.09	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.05	0.16	0.09
O5'	0.03	0.10	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01	0.07	0.08	0.08	0.12	0.08	0.07	0.02	0.03	0.08	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00
O6	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.04	0.08	0.00	0.05	0.08	0.07
OP1	0.05	0.16	0.02	0.05	0.04	0.01	0.02	0.10	0.06	0.14	0.13	0.21	0.12	0.11	0.05	0.06	0.07	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01
OP2	0.17	0.16	0.17	0.15	0.11	0.15	0.10	0.05	0.09	0.18	0.12	0.20	0.15	0.15	0.14	0.21	0.16	0.16	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01
P	0.10	0.13	0.09	0.07	0.07	0.08	0.06	0.01	0.07	0.13	0.11	0.16	0.11	0.11	0.08	0.13	0.10	0.09	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00