Doublet Group distance statistics: 49760

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.017 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.003, 0.023, 0.044, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.118, 0.292, 0.466, 0.459 max_d=0.459 avg_d=0.292 std_dev=0.174
C2'	A	0, 0.115, 0.293, 0.470, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.293 std_dev=0.178
O2'	A	0, 0.124, 0.310, 0.496, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.310 std_dev=0.186
O3'	B	0, 0.101, 0.311, 0.521, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.311 std_dev=0.210
C4'	A	0, 0.190, 0.464, 0.738, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.464 std_dev=0.274
C3'	A	0, 0.195, 0.484, 0.773, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.484 std_dev=0.289
C3'	B	0, 0.144, 0.451, 0.758, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.451 std_dev=0.307
O5'	B	0, 0.208, 0.538, 0.868, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.538 std_dev=0.330
OP1	B	0, 0.264, 0.629, 0.993, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.629 std_dev=0.365
P	B	0, 0.272, 0.646, 1.020, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.646 std_dev=0.374
O3'	A	0, 0.274, 0.670, 1.067, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.670 std_dev=0.396
C1'	B	0, 0.144, 0.543, 0.943, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.543 std_dev=0.399
O4'	B	0, 0.294, 0.707, 1.119, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.707 std_dev=0.412
OP2	B	0, 0.301, 0.727, 1.152, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.727 std_dev=0.425
C4'	B	0, 0.315, 0.753, 1.191, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.753 std_dev=0.438
C5'	A	0, 0.336, 0.805, 1.273, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.805 std_dev=0.468
O5'	A	0, 0.346, 0.864, 1.383, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.864 std_dev=0.518
N3	B	0, 0.367, 0.893, 1.420, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.893 std_dev=0.526
N9	B	0, 0.212, 0.760, 1.308, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.760 std_dev=0.548
C4	B	0, 0.361, 0.951, 1.541, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.951 std_dev=0.590
C2	B	0, 0.487, 1.160, 1.833, 1.639 max_d=1.639 avg_d=1.160 std_dev=0.673
N2	B	0, 0.472, 1.163, 1.855, 1.742 max_d=1.742 avg_d=1.163 std_dev=0.692
C8	B	0, 0.210, 0.915, 1.621, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.915 std_dev=0.706
P	A	0, 0.453, 1.172, 1.890, 1.787 max_d=1.787 avg_d=1.172 std_dev=0.718
OP2	A	0, 0.455, 1.178, 1.900, 1.803 max_d=1.803 avg_d=1.178 std_dev=0.723
C5	B	0, 0.496, 1.246, 1.996, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.246 std_dev=0.750
C5'	B	0, 0.379, 1.134, 1.889, 1.839 max_d=1.839 avg_d=1.134 std_dev=0.755
C2'	B	0, -0.265, 0.513, 1.290, 1.857 max_d=1.857 avg_d=0.513 std_dev=0.777
N7	B	0, 0.410, 1.215, 2.020, 2.263 max_d=2.263 avg_d=1.215 std_dev=0.805
N1	B	0, 0.612, 1.466, 2.321, 2.101 max_d=2.101 avg_d=1.466 std_dev=0.854
OP1	A	0, 0.576, 1.459, 2.342, 2.197 max_d=2.197 avg_d=1.459 std_dev=0.883
C6	B	0, 0.648, 1.536, 2.424, 2.087 max_d=2.087 avg_d=1.536 std_dev=0.888
O2'	B	0, 0.016, 1.021, 2.027, 2.692 max_d=2.692 avg_d=1.021 std_dev=1.005
O6	B	0, 0.772, 1.834, 2.895, 2.557 max_d=2.557 avg_d=1.834 std_dev=1.061

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.13	0.08	0.05
C2	0.01	0.00	0.15	0.19	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.21	0.03	0.32	0.28	0.16	0.21
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.09	0.02	0.12	0.04	0.26	0.00	0.02	0.01	0.04	0.09	0.12	0.03
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.10	0.00	0.02	0.01	0.06	0.06	0.18	0.10	0.27	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.12	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.01	0.37	0.31	0.24	0.29
C4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.04	0.05	0.08	0.08	0.08	0.03	0.01	0.00	0.00	0.11	0.11	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.06	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05	0.33	0.25	0.16	0.26
C5'	0.04	0.15	0.02	0.01	0.19	0.00	0.19	0.00	0.16	0.12	0.18	0.20	0.13	0.03	0.04	0.03	0.00	0.14	0.05	0.00
C6	0.00	0.01	0.09	0.06	0.00	0.04	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.06	0.27	0.19	0.05	0.18
N1	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.26	0.21	0.07	0.15
N3	0.01	0.00	0.12	0.18	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.20	0.03	0.36	0.32	0.22	0.27
N4	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.38	0.33	0.29	0.32
O2	0.02	0.01	0.26	0.27	0.01	0.08	0.02	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.32	0.05	0.31	0.29	0.16	0.20
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.16	0.00	0.04	0.04	0.02	0.11	0.10	0.02
O3'	0.02	0.21	0.02	0.00	0.11	0.01	0.03	0.04	0.07	0.06	0.20	0.12	0.32	0.04	0.00	0.01	0.15	0.02	0.15	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.01	0.00	0.11	0.12	0.12	0.02
O5'	0.13	0.32	0.04	0.06	0.37	0.00	0.33	0.00	0.27	0.26	0.36	0.38	0.31	0.02	0.15	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.13	0.28	0.09	0.08	0.31	0.11	0.25	0.14	0.19	0.21	0.32	0.33	0.29	0.11	0.02	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.16	0.12	0.12	0.24	0.11	0.16	0.05	0.05	0.07	0.22	0.29	0.16	0.10	0.15	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.21	0.03	0.05	0.29	0.03	0.26	0.00	0.18	0.15	0.27	0.32	0.20	0.02	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.14	0.65	0.23	0.12	0.20	0.12	0.32	0.13	0.10	0.13	0.17	0.15	0.14	0.11	0.77	0.10	0.23	0.07	0.16	0.12	0.20	0.13
C2	0.22	0.20	0.68	0.29	0.18	0.17	0.15	0.23	0.15	0.13	0.18	0.22	0.21	0.11	0.18	0.70	0.06	0.19	0.10	0.13	0.14	0.08	0.09
C2'	0.15	0.14	0.60	0.23	0.12	0.21	0.14	0.30	0.15	0.13	0.14	0.16	0.14	0.17	0.12	0.68	0.11	0.27	0.10	0.18	0.13	0.25	0.18
C3'	0.16	0.14	0.61	0.22	0.11	0.22	0.12	0.34	0.13	0.11	0.13	0.17	0.14	0.15	0.10	0.72	0.14	0.26	0.08	0.16	0.12	0.26	0.18
C4	0.20	0.16	0.62	0.28	0.13	0.17	0.10	0.25	0.11	0.08	0.13	0.18	0.17	0.08	0.14	0.64	0.09	0.18	0.08	0.11	0.10	0.17	0.06
C4'	0.21	0.18	0.68	0.24	0.13	0.21	0.10	0.36	0.11	0.07	0.14	0.22	0.18	0.10	0.12	0.86	0.12	0.21	0.06	0.13	0.10	0.19	0.12
C5	0.17	0.14	0.58	0.23	0.12	0.20	0.16	0.34	0.19	0.13	0.16	0.16	0.14	0.20	0.10	0.68	0.13	0.21	0.05	0.24	0.08	0.30	0.10
C5'	0.17	0.16	0.61	0.16	0.11	0.27	0.11	0.47	0.12	0.09	0.14	0.20	0.16	0.14	0.09	0.84	0.21	0.26	0.05	0.16	0.12	0.27	0.18
C6	0.16	0.15	0.60	0.22	0.13	0.21	0.17	0.36	0.20	0.14	0.17	0.16	0.14	0.21	0.11	0.73	0.12	0.23	0.05	0.26	0.09	0.29	0.12
N1	0.18	0.15	0.64	0.25	0.12	0.20	0.11	0.31	0.13	0.09	0.13	0.17	0.16	0.12	0.12	0.73	0.10	0.22	0.07	0.15	0.12	0.20	0.12
N3	0.23	0.22	0.67	0.31	0.20	0.16	0.17	0.20	0.17	0.15	0.19	0.23	0.22	0.13	0.19	0.65	0.06	0.17	0.11	0.15	0.14	0.04	0.08
N4	0.21	0.16	0.60	0.30	0.14	0.16	0.10	0.21	0.10	0.08	0.13	0.18	0.17	0.07	0.14	0.55	0.09	0.16	0.09	0.09	0.09	0.15	0.02
O2	0.24	0.26	0.71	0.31	0.24	0.16	0.22	0.19	0.23	0.20	0.25	0.27	0.25	0.20	0.23	0.71	0.04	0.17	0.12	0.22	0.15	0.06	0.11
O2'	0.16	0.14	0.62	0.24	0.12	0.20	0.13	0.27	0.14	0.12	0.13	0.15	0.14	0.15	0.12	0.69	0.09	0.26	0.11	0.17	0.14	0.21	0.17
O3'	0.15	0.14	0.59	0.22	0.11	0.23	0.13	0.33	0.14	0.12	0.13	0.17	0.14	0.16	0.11	0.69	0.15	0.27	0.11	0.17	0.15	0.27	0.21
O4'	0.24	0.19	0.73	0.27	0.14	0.17	0.10	0.33	0.11	0.07	0.15	0.22	0.20	0.09	0.14	0.91	0.06	0.17	0.09	0.12	0.12	0.15	0.08
O5'	0.08	0.14	0.41	0.03	0.18	0.41	0.26	0.62	0.27	0.28	0.20	0.12	0.12	0.34	0.17	0.62	0.37	0.41	0.22	0.32	0.27	0.48	0.36
OP1	0.15	0.15	0.53	0.12	0.08	0.33	0.12	0.56	0.13	0.14	0.12	0.20	0.15	0.19	0.07	0.80	0.26	0.28	0.10	0.18	0.20	0.37	0.26
OP2	0.14	0.14	0.51	0.11	0.09	0.33	0.12	0.54	0.14	0.13	0.12	0.18	0.13	0.18	0.08	0.72	0.28	0.28	0.08	0.18	0.16	0.33	0.21
P	0.11	0.12	0.50	0.08	0.08	0.35	0.15	0.58	0.16	0.16	0.12	0.15	0.11	0.22	0.07	0.75	0.30	0.31	0.10	0.21	0.19	0.37	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.00	0.12	0.01	0.11	0.13	0.12
C2	0.01	0.00	0.24	0.25	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.20	0.09	0.12	0.01	0.12	0.16	0.12
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.10	0.00	0.04	0.13	0.07	0.17	0.16	0.32	0.25	0.12	0.04	0.01	0.02	0.02	0.53	0.05	0.53	0.53	0.53
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.20	0.00	0.23	0.02	0.26	0.15	0.26	0.25	0.21	0.20	0.14	0.01	0.00	0.01	0.30	0.26	0.29	0.07	0.24
C4	0.00	0.01	0.10	0.20	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.15	0.05	0.13	0.00	0.11	0.15	0.12
C4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.11	0.08	0.05	0.05	0.13	0.07	0.21	0.02	0.00	0.03	0.12	0.04	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.23	0.00	0.11	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.33	0.09	0.03	0.12	0.00	0.12	0.16	0.13
C5'	0.03	0.14	0.13	0.02	0.15	0.00	0.20	0.00	0.21	0.19	0.18	0.13	0.11	0.22	0.13	0.05	0.16	0.02	0.01	0.23	0.01	0.31	0.03
C6	0.01	0.00	0.07	0.26	0.01	0.11	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.34	0.11	0.05	0.12	0.00	0.12	0.16	0.12
C8	0.00	0.01	0.17	0.15	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.31	0.02	0.05	0.11	0.01	0.11	0.14	0.13
N1	0.01	0.00	0.16	0.26	0.00	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.16	0.07	0.13	0.01	0.12	0.17	0.13
N2	0.02	0.00	0.32	0.25	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.23	0.09	0.12	0.02	0.11	0.16	0.12
N3	0.01	0.00	0.25	0.21	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.21	0.09	0.12	0.01	0.11	0.15	0.12
N7	0.00	0.01	0.12	0.20	0.01	0.13	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.37	0.04	0.03	0.11	0.01	0.11	0.15	0.12
N9	0.00	0.01	0.04	0.14	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.21	0.12	0.01	0.13	0.01	0.11	0.14	0.12
O2'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.22	0.21	0.33	0.05	0.34	0.31	0.25	0.05	0.09	0.37	0.21	0.00	0.01	0.16	0.32	0.39	0.34	0.53	0.37
O3'	0.26	0.20	0.02	0.00	0.15	0.02	0.09	0.16	0.11	0.02	0.16	0.23	0.21	0.04	0.12	0.01	0.00	0.17	0.15	0.10	0.16	0.13	0.12
O4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.05	0.07	0.09	0.09	0.03	0.01	0.16	0.17	0.00	0.16	0.04	0.15	0.16	0.13
O5'	0.12	0.12	0.53	0.30	0.13	0.03	0.12	0.01	0.12	0.11	0.13	0.12	0.12	0.11	0.13	0.32	0.15	0.16	0.00	0.11	0.01	0.03	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.26	0.00	0.12	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.39	0.10	0.04	0.11	0.00	0.12	0.16	0.12
OP1	0.11	0.12	0.53	0.29	0.11	0.04	0.12	0.01	0.12	0.11	0.12	0.11	0.11	0.11	0.11	0.34	0.16	0.15	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.16	0.53	0.07	0.15	0.17	0.16	0.31	0.16	0.14	0.17	0.16	0.15	0.15	0.14	0.53	0.13	0.16	0.03	0.16	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.12	0.53	0.24	0.12	0.03	0.13	0.03	0.12	0.13	0.13	0.12	0.12	0.12	0.12	0.37	0.12	0.13	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00