Doublet Group distance statistics: 49761

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.014, 0.036, 0.058, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.036 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.010, 0.034, 0.057, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.034 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.015, 0.043, 0.071, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.043 std_dev=0.028
N1	A	0, 0.019, 0.051, 0.082, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.051 std_dev=0.031
C1'	A	0, 0.023, 0.058, 0.094, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.058 std_dev=0.036
C2	A	0, 0.009, 0.051, 0.094, 0.103 max_d=0.103 avg_d=0.051 std_dev=0.042
O2	A	0, 0.024, 0.101, 0.179, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.101 std_dev=0.077
N4	A	0, 0.044, 0.144, 0.243, 0.255 max_d=0.255 avg_d=0.144 std_dev=0.099
O4'	B	0, 0.053, 0.200, 0.348, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.200 std_dev=0.147
O3'	A	0, 0.072, 0.253, 0.434, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.253 std_dev=0.181
C4'	B	0, 0.057, 0.264, 0.471, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.264 std_dev=0.207
N7	B	0, 0.098, 0.312, 0.525, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.312 std_dev=0.213
N1	B	0, 0.113, 0.326, 0.540, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.326 std_dev=0.214
N3	B	0, 0.081, 0.301, 0.520, 0.608 max_d=0.608 avg_d=0.301 std_dev=0.220
C3'	A	0, 0.148, 0.368, 0.588, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.368 std_dev=0.220
C8	B	0, 0.116, 0.336, 0.556, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.336 std_dev=0.220
C2	B	0, 0.137, 0.359, 0.580, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.359 std_dev=0.222
C5	B	0, 0.000, 0.223, 0.445, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.223 std_dev=0.222
C4	B	0, -0.009, 0.218, 0.445, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.218 std_dev=0.227
C6	B	0, 0.016, 0.245, 0.474, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.245 std_dev=0.229
N9	B	0, 0.029, 0.261, 0.492, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.261 std_dev=0.231
OP1	B	0, 0.067, 0.300, 0.534, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.300 std_dev=0.233
C1'	B	0, 0.032, 0.267, 0.502, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.267 std_dev=0.235
P	B	0, 0.102, 0.349, 0.595, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.349 std_dev=0.247
O5'	B	0, 0.139, 0.389, 0.639, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.389 std_dev=0.250
C2'	A	0, 0.080, 0.340, 0.601, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.340 std_dev=0.261
OP2	B	0, 0.150, 0.414, 0.679, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.414 std_dev=0.264
O5'	A	0, 0.179, 0.449, 0.719, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.449 std_dev=0.270
O6	B	0, 0.034, 0.307, 0.580, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.307 std_dev=0.273
C5'	B	0, 0.188, 0.467, 0.746, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.467 std_dev=0.279
N2	B	0, 0.193, 0.482, 0.771, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.482 std_dev=0.289
OP2	A	0, 0.106, 0.407, 0.707, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.407 std_dev=0.300
O4'	A	0, 0.123, 0.433, 0.743, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.433 std_dev=0.310
C3'	B	0, 0.103, 0.413, 0.723, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.413 std_dev=0.310
P	A	0, 0.086, 0.399, 0.711, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.399 std_dev=0.313
C2'	B	0, 0.053, 0.385, 0.716, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.385 std_dev=0.332
C4'	A	0, 0.155, 0.511, 0.868, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.511 std_dev=0.356
O2'	B	0, 0.191, 0.594, 0.997, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.594 std_dev=0.403
OP1	A	0, 0.176, 0.615, 1.054, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.615 std_dev=0.439
O3'	B	0, 0.236, 0.694, 1.153, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.694 std_dev=0.458
O2'	A	0, 0.066, 0.539, 1.012, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.539 std_dev=0.473
C5'	A	0, 0.226, 0.904, 1.582, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.904 std_dev=0.678

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.09	0.01	0.04	0.01	0.23	0.27	0.09	0.13
C2	0.04	0.00	0.05	0.05	0.03	0.06	0.04	0.11	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.11	0.11	0.08	0.29	0.27	0.08	0.15
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.06	0.00	0.11	0.07	0.11	0.02	0.03	0.07	0.12	0.00	0.02	0.01	0.42	0.41	0.19	0.33
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.10	0.03	0.09	0.02	0.02	0.07	0.12	0.02	0.01	0.01	0.37	0.40	0.11	0.28
C4	0.02	0.03	0.06	0.06	0.00	0.07	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.02	0.24	0.15	0.11	0.09
C4'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.02	0.05	0.08	0.15	0.02	0.03	0.00	0.03	0.22	0.24	0.04
C5	0.03	0.04	0.11	0.10	0.00	0.11	0.00	0.27	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.13	0.05	0.08	0.24	0.15	0.14	0.11
C5'	0.04	0.11	0.07	0.03	0.22	0.01	0.27	0.00	0.24	0.12	0.16	0.25	0.14	0.06	0.06	0.01	0.01	0.32	0.38	0.03
C6	0.03	0.04	0.11	0.09	0.01	0.11	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.14	0.06	0.09	0.26	0.18	0.08	0.11
N1	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.28	0.25	0.06	0.13
N3	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.05	0.02	0.16	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.08	0.09	0.06	0.26	0.21	0.05	0.10
N4	0.02	0.04	0.07	0.07	0.01	0.08	0.02	0.25	0.02	0.02	0.03	0.00	0.06	0.05	0.02	0.03	0.23	0.14	0.17	0.11
O2	0.09	0.02	0.12	0.12	0.05	0.15	0.05	0.14	0.05	0.04	0.03	0.06	0.00	0.21	0.18	0.16	0.32	0.35	0.14	0.21
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.04	0.02	0.13	0.06	0.14	0.02	0.08	0.05	0.21	0.00	0.06	0.01	0.47	0.46	0.32	0.40
O3'	0.04	0.11	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.06	0.06	0.04	0.09	0.02	0.18	0.06	0.00	0.05	0.23	0.30	0.07	0.19
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.06	0.03	0.16	0.01	0.05	0.00	0.30	0.29	0.32	0.23
O5'	0.23	0.29	0.42	0.37	0.24	0.03	0.24	0.01	0.26	0.28	0.26	0.23	0.32	0.47	0.23	0.30	0.00	0.00	0.02	0.02
OP1	0.27	0.27	0.41	0.40	0.15	0.22	0.15	0.32	0.18	0.25	0.21	0.14	0.35	0.46	0.30	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.08	0.19	0.11	0.11	0.24	0.14	0.38	0.08	0.06	0.05	0.17	0.14	0.32	0.07	0.32	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.15	0.33	0.28	0.09	0.04	0.11	0.03	0.11	0.13	0.10	0.11	0.21	0.40	0.19	0.23	0.02	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.13	0.04	0.02	0.10	0.03	0.11	0.05	0.12	0.11	0.12	0.15	0.13	0.10	0.10	0.06	0.08	0.13	0.06	0.13	0.06	0.10	0.08
C2	0.06	0.12	0.04	0.01	0.11	0.01	0.13	0.05	0.14	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.11	0.07	0.06	0.10	0.09	0.15	0.10	0.12	0.12
C2'	0.16	0.27	0.10	0.01	0.22	0.04	0.21	0.06	0.24	0.18	0.26	0.30	0.26	0.18	0.20	0.12	0.09	0.19	0.07	0.25	0.07	0.11	0.09
C3'	0.19	0.29	0.14	0.04	0.23	0.06	0.22	0.04	0.25	0.19	0.27	0.33	0.28	0.19	0.21	0.16	0.06	0.22	0.06	0.25	0.06	0.10	0.08
C4	0.09	0.16	0.08	0.07	0.15	0.07	0.15	0.09	0.16	0.14	0.17	0.17	0.17	0.14	0.14	0.09	0.09	0.07	0.10	0.18	0.05	0.07	0.06
C4'	0.26	0.31	0.25	0.18	0.26	0.18	0.24	0.14	0.26	0.21	0.29	0.36	0.32	0.20	0.25	0.28	0.14	0.31	0.17	0.26	0.11	0.10	0.14
C5	0.12	0.19	0.09	0.05	0.17	0.04	0.15	0.08	0.17	0.14	0.19	0.21	0.20	0.13	0.16	0.09	0.05	0.11	0.11	0.17	0.04	0.05	0.06
C5'	0.51	0.61	0.52	0.42	0.52	0.38	0.47	0.32	0.51	0.42	0.56	0.68	0.61	0.41	0.49	0.55	0.37	0.52	0.36	0.49	0.27	0.24	0.29
C6	0.12	0.19	0.10	0.04	0.16	0.03	0.15	0.06	0.16	0.14	0.18	0.22	0.20	0.13	0.16	0.10	0.03	0.14	0.10	0.17	0.06	0.08	0.08
N1	0.10	0.16	0.07	0.02	0.14	0.04	0.14	0.06	0.15	0.13	0.16	0.18	0.17	0.13	0.14	0.08	0.04	0.14	0.09	0.16	0.08	0.10	0.10
N3	0.06	0.13	0.06	0.05	0.13	0.05	0.14	0.06	0.15	0.14	0.14	0.14	0.13	0.14	0.12	0.08	0.09	0.06	0.08	0.17	0.08	0.12	0.10
N4	0.10	0.17	0.10	0.12	0.16	0.12	0.16	0.16	0.17	0.14	0.18	0.18	0.17	0.14	0.14	0.10	0.14	0.08	0.14	0.19	0.07	0.04	0.08
O2	0.03	0.09	0.04	0.05	0.08	0.02	0.10	0.08	0.11	0.11	0.09	0.09	0.09	0.11	0.08	0.08	0.09	0.07	0.09	0.13	0.13	0.14	0.15
O2'	0.06	0.17	0.04	0.15	0.13	0.12	0.14	0.17	0.17	0.12	0.18	0.20	0.16	0.13	0.11	0.02	0.26	0.08	0.14	0.19	0.11	0.13	0.12
O3'	0.06	0.09	0.08	0.16	0.07	0.13	0.08	0.15	0.10	0.08	0.10	0.13	0.08	0.08	0.07	0.07	0.26	0.09	0.13	0.12	0.10	0.14	0.10
O4'	0.19	0.20	0.20	0.17	0.17	0.18	0.15	0.17	0.17	0.15	0.18	0.24	0.21	0.13	0.18	0.22	0.14	0.27	0.19	0.16	0.12	0.09	0.15
O5'	0.15	0.10	0.17	0.19	0.12	0.17	0.13	0.17	0.10	0.15	0.09	0.06	0.11	0.15	0.14	0.18	0.23	0.15	0.16	0.10	0.21	0.21	0.19
OP1	0.19	0.16	0.24	0.23	0.12	0.20	0.07	0.19	0.06	0.09	0.10	0.19	0.18	0.06	0.14	0.28	0.28	0.22	0.19	0.04	0.14	0.13	0.15
OP2	0.11	0.20	0.07	0.01	0.15	0.04	0.15	0.09	0.17	0.14	0.19	0.25	0.19	0.14	0.14	0.07	0.08	0.16	0.13	0.18	0.08	0.12	0.10
P	0.11	0.13	0.11	0.09	0.08	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.10	0.18	0.13	0.05	0.09	0.13	0.13	0.15	0.10	0.07	0.05	0.06	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.07	0.09	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.20	0.21	0.13
C2	0.07	0.00	0.11	0.14	0.01	0.10	0.03	0.12	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.10	0.15	0.06	0.15	0.03	0.16	0.09	0.06
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.10	0.04	0.11	0.13	0.10	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.11	0.19	0.19	0.12
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.12	0.01	0.15	0.03	0.18	0.14	0.16	0.15	0.12	0.16	0.09	0.01	0.01	0.02	0.05	0.20	0.13	0.16	0.09
C4	0.04	0.01	0.07	0.12	0.00	0.09	0.01	0.13	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.04	0.17	0.05	0.13	0.08	0.04
C4'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.09	0.00	0.11	0.01	0.13	0.10	0.12	0.11	0.10	0.11	0.07	0.03	0.01	0.00	0.02	0.15	0.10	0.17	0.07
C5	0.03	0.03	0.07	0.15	0.01	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.17	0.02	0.24	0.04	0.07	0.04	0.05
C5'	0.01	0.12	0.01	0.03	0.13	0.01	0.17	0.00	0.18	0.19	0.16	0.12	0.11	0.20	0.12	0.03	0.05	0.02	0.01	0.22	0.01	0.07	0.01
C6	0.06	0.02	0.10	0.18	0.03	0.13	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.06	0.20	0.04	0.25	0.01	0.07	0.02	0.06
C8	0.02	0.02	0.04	0.14	0.01	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.03	0.26	0.04	0.06	0.06	0.05
N1	0.07	0.01	0.11	0.16	0.02	0.12	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.02	0.03	0.09	0.18	0.05	0.20	0.03	0.12	0.04	0.04
N2	0.09	0.01	0.13	0.15	0.01	0.11	0.04	0.12	0.05	0.02	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.12	0.17	0.09	0.14	0.06	0.19	0.10	0.08
N3	0.08	0.01	0.10	0.12	0.01	0.10	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.13	0.07	0.14	0.03	0.16	0.10	0.06
N7	0.01	0.03	0.05	0.16	0.01	0.11	0.01	0.20	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.18	0.02	0.28	0.03	0.02	0.03	0.09
N9	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.07	0.02	0.12	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.16	0.05	0.14	0.11	0.04
O2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.02	0.09	0.12	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.04	0.07	0.15	0.17	0.09
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.12	0.01	0.17	0.05	0.20	0.15	0.18	0.17	0.13	0.18	0.08	0.01	0.00	0.01	0.09	0.22	0.11	0.14	0.09
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03	0.05	0.09	0.07	0.02	0.02	0.06	0.01	0.00	0.05	0.04	0.24	0.27	0.18
O5'	0.04	0.15	0.04	0.05	0.17	0.02	0.24	0.01	0.25	0.26	0.20	0.14	0.14	0.28	0.16	0.04	0.09	0.05	0.00	0.29	0.02	0.01	0.00
O6	0.07	0.03	0.11	0.20	0.05	0.15	0.04	0.22	0.01	0.04	0.03	0.06	0.03	0.03	0.05	0.07	0.22	0.04	0.29	0.00	0.06	0.06	0.11
OP1	0.20	0.16	0.19	0.13	0.13	0.10	0.07	0.01	0.07	0.06	0.12	0.19	0.16	0.02	0.14	0.15	0.11	0.24	0.02	0.06	0.00	0.03	0.02
OP2	0.21	0.09	0.19	0.16	0.08	0.17	0.04	0.07	0.02	0.06	0.04	0.10	0.10	0.03	0.11	0.17	0.14	0.27	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02
P	0.13	0.06	0.12	0.09	0.04	0.07	0.05	0.01	0.06	0.05	0.04	0.08	0.06	0.09	0.04	0.09	0.09	0.18	0.00	0.11	0.02	0.02	0.00