Doublet Group distance statistics: 49776

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 1, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, -0.002, 0.009, 0.019, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.009 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.014 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.014, 0.029, 0.045, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.014, 0.039, 0.063, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.039 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.060, 0.148, 0.236, 0.279 max_d=0.279 avg_d=0.148 std_dev=0.088
C2'	A	0, 0.050, 0.147, 0.244, 0.308 max_d=0.308 avg_d=0.147 std_dev=0.097
O2'	A	0, 0.139, 0.288, 0.438, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.288 std_dev=0.149
C3'	A	0, 0.121, 0.284, 0.446, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.284 std_dev=0.163
O5'	A	0, 0.217, 0.415, 0.613, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.415 std_dev=0.198
O3'	A	0, 0.165, 0.366, 0.567, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.366 std_dev=0.201
P	B	0, 0.200, 0.432, 0.663, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.432 std_dev=0.232
C4'	A	0, 0.139, 0.376, 0.614, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.376 std_dev=0.238
OP2	B	0, 0.113, 0.354, 0.595, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.354 std_dev=0.241
O5'	B	0, 0.281, 0.583, 0.886, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.583 std_dev=0.303
OP1	B	0, 0.212, 0.522, 0.832, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.522 std_dev=0.310
C5	B	0, 0.192, 0.529, 0.866, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.529 std_dev=0.337
C5'	B	0, 0.318, 0.661, 1.005, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.661 std_dev=0.344
C6	B	0, 0.234, 0.587, 0.940, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.587 std_dev=0.353
N4	B	0, 0.163, 0.518, 0.872, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.518 std_dev=0.354
C3'	B	0, 0.352, 0.715, 1.078, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.715 std_dev=0.363
C4	B	0, 0.186, 0.556, 0.926, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.556 std_dev=0.370
C4'	B	0, 0.340, 0.711, 1.082, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.711 std_dev=0.371
O3'	B	0, 0.389, 0.767, 1.145, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.767 std_dev=0.378
O4'	B	0, 0.319, 0.713, 1.107, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.713 std_dev=0.394
N1	B	0, 0.266, 0.665, 1.063, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.665 std_dev=0.399
C1'	B	0, 0.314, 0.736, 1.158, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.736 std_dev=0.422
N3	B	0, 0.232, 0.655, 1.077, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.655 std_dev=0.422
C2'	B	0, 0.341, 0.764, 1.188, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.764 std_dev=0.423
C2	B	0, 0.273, 0.710, 1.147, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.710 std_dev=0.437
O2	B	0, 0.327, 0.815, 1.303, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.815 std_dev=0.488
O2'	B	0, 0.344, 0.836, 1.329, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.836 std_dev=0.493
C5'	A	0, 0.239, 0.755, 1.271, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.755 std_dev=0.516
P	A	0, 0.185, 0.744, 1.303, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.744 std_dev=0.559
OP1	A	0, 0.156, 1.031, 1.906, 2.933 max_d=2.933 avg_d=1.031 std_dev=0.875
OP2	A	0, 0.032, 1.109, 2.186, 3.349 max_d=3.349 avg_d=1.109 std_dev=1.077

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.16	0.44	0.35	0.08
C2	0.02	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.03	0.23	0.27	0.71	0.29
C2'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.03	0.05	0.02	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.25	0.46	0.31	0.09
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.04	0.06	0.06	0.07	0.02	0.01	0.02	0.33	0.34	0.30	0.15
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.08	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.04	0.25	0.26	1.03	0.51
C4'	0.02	0.03	0.03	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.09	0.02	0.08	0.04	0.01	0.05	0.52	0.10	0.17
C5	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.10	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.04	0.24	0.30	1.05	0.55
C5'	0.04	0.15	0.02	0.03	0.26	0.01	0.28	0.00	0.23	0.15	0.21	0.28	0.09	0.09	0.11	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.09	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.04	0.23	0.21	0.86	0.44
N1	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.21	0.25	0.66	0.27
N3	0.02	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03	0.25	0.22	0.88	0.40
N4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.09	0.01	0.28	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.07	0.04	0.25	0.33	1.13	0.58
O2	0.03	0.00	0.04	0.07	0.01	0.02	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.07	0.03	0.22	0.38	0.58	0.19
O2'	0.03	0.07	0.00	0.02	0.06	0.08	0.06	0.09	0.05	0.05	0.07	0.07	0.08	0.00	0.03	0.04	0.16	0.68	0.12	0.18
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.06	0.04	0.06	0.11	0.05	0.04	0.06	0.07	0.07	0.03	0.00	0.01	0.31	0.44	0.23	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.00	0.12	0.45	0.22	0.07
O5'	0.16	0.23	0.25	0.33	0.25	0.05	0.24	0.01	0.23	0.21	0.25	0.25	0.22	0.16	0.31	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.44	0.27	0.46	0.34	0.26	0.52	0.30	0.10	0.21	0.25	0.22	0.33	0.38	0.68	0.44	0.45	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.35	0.71	0.31	0.30	1.03	0.10	1.05	0.10	0.86	0.66	0.88	1.13	0.58	0.12	0.23	0.22	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.29	0.09	0.15	0.51	0.17	0.55	0.02	0.44	0.27	0.40	0.58	0.19	0.18	0.12	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.18	0.19	0.16	0.18	0.17	0.19	0.17	0.20	0.19	0.18	0.18	0.19	0.20	0.17	0.20	0.17	0.19	0.19	0.17
C2	0.18	0.17	0.16	0.13	0.16	0.15	0.18	0.16	0.19	0.18	0.16	0.17	0.17	0.17	0.14	0.19	0.17	0.19	0.20	0.18
C2'	0.19	0.18	0.19	0.17	0.17	0.17	0.19	0.16	0.20	0.19	0.17	0.16	0.17	0.20	0.18	0.19	0.16	0.16	0.17	0.15
C3'	0.22	0.22	0.22	0.20	0.21	0.19	0.22	0.17	0.23	0.22	0.21	0.21	0.21	0.23	0.21	0.21	0.18	0.17	0.16	0.16
C4	0.19	0.19	0.16	0.12	0.18	0.13	0.18	0.12	0.19	0.19	0.18	0.19	0.19	0.15	0.12	0.18	0.10	0.13	0.12	0.13
C4'	0.19	0.17	0.18	0.16	0.17	0.17	0.20	0.17	0.20	0.19	0.16	0.16	0.17	0.19	0.17	0.20	0.17	0.18	0.17	0.17
C5	0.19	0.18	0.16	0.12	0.17	0.13	0.18	0.12	0.19	0.19	0.17	0.17	0.18	0.15	0.12	0.18	0.10	0.14	0.11	0.14
C5'	0.31	0.26	0.27	0.25	0.26	0.28	0.31	0.26	0.33	0.31	0.24	0.23	0.25	0.28	0.25	0.33	0.25	0.30	0.26	0.29
C6	0.17	0.16	0.15	0.11	0.15	0.13	0.16	0.12	0.18	0.17	0.15	0.14	0.16	0.15	0.12	0.17	0.11	0.14	0.14	0.14
N1	0.18	0.16	0.16	0.13	0.15	0.15	0.17	0.15	0.18	0.17	0.16	0.15	0.16	0.17	0.14	0.18	0.15	0.17	0.17	0.16
N3	0.17	0.17	0.14	0.11	0.17	0.12	0.16	0.13	0.17	0.17	0.17	0.19	0.18	0.14	0.11	0.17	0.13	0.17	0.18	0.16
N4	0.21	0.22	0.19	0.16	0.22	0.16	0.22	0.14	0.22	0.22	0.22	0.22	0.22	0.18	0.16	0.20	0.12	0.14	0.09	0.14
O2	0.22	0.20	0.20	0.18	0.22	0.21	0.24	0.22	0.24	0.22	0.21	0.23	0.20	0.21	0.18	0.24	0.22	0.24	0.24	0.21
O2'	0.26	0.27	0.25	0.21	0.28	0.22	0.27	0.20	0.26	0.27	0.28	0.29	0.27	0.27	0.21	0.26	0.20	0.18	0.18	0.17
O3'	0.22	0.22	0.23	0.21	0.22	0.19	0.22	0.18	0.22	0.23	0.22	0.22	0.22	0.25	0.22	0.20	0.19	0.16	0.16	0.15
O4'	0.18	0.17	0.18	0.16	0.16	0.17	0.18	0.17	0.19	0.18	0.17	0.16	0.17	0.19	0.16	0.19	0.17	0.19	0.19	0.18
O5'	0.24	0.26	0.22	0.21	0.27	0.26	0.24	0.27	0.23	0.24	0.28	0.29	0.27	0.23	0.16	0.26	0.26	0.26	0.27	0.28
OP1	0.35	0.43	0.41	0.32	0.42	0.23	0.35	0.17	0.34	0.38	0.45	0.45	0.45	0.43	0.38	0.28	0.17	0.25	0.21	0.22
OP2	0.74	0.61	0.71	0.80	0.60	0.90	0.69	1.00	0.73	0.69	0.56	0.53	0.59	0.71	0.76	0.84	0.99	1.10	1.06	1.08
P	0.28	0.22	0.26	0.29	0.22	0.36	0.26	0.44	0.27	0.25	0.21	0.20	0.22	0.26	0.25	0.34	0.43	0.52	0.50	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.06	0.11
C2	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.01	0.05	0.04	0.06	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.07	0.05	0.05
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.11	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.05	0.04	0.12	0.08	0.12	0.09
C4'	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.04	0.03	0.06	0.03	0.05	0.02	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.04	0.13	0.08	0.09	0.09
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.10	0.06	0.07	0.11	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.07	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.04	0.11	0.06	0.05	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.06	0.04	0.05	0.08
N3	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.05	0.03	0.09	0.06	0.10	0.08
N4	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01	0.06	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.05	0.05	0.13	0.11	0.16	0.11
O2	0.03	0.01	0.08	0.06	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.13	0.07	0.03	0.02	0.04	0.06	0.10
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.07	0.05	0.04	0.05	0.02	0.03	0.09	0.08	0.13	0.00	0.06	0.05	0.02	0.10	0.03	0.03
O3'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.05	0.02	0.05	0.05	0.07	0.06	0.00	0.01	0.07	0.19	0.08	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.03	0.05	0.03	0.05	0.01	0.00	0.03	0.10	0.09	0.14
O5'	0.02	0.05	0.02	0.04	0.12	0.00	0.13	0.01	0.11	0.06	0.09	0.13	0.02	0.02	0.07	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.05	0.04	0.07	0.11	0.08	0.04	0.08	0.04	0.06	0.04	0.06	0.11	0.04	0.10	0.19	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00
OP2	0.06	0.06	0.05	0.06	0.12	0.02	0.09	0.01	0.05	0.05	0.10	0.16	0.06	0.03	0.08	0.09	0.02	0.04	0.00	0.00
P	0.11	0.08	0.05	0.04	0.09	0.05	0.09	0.01	0.08	0.08	0.08	0.11	0.10	0.03	0.07	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00