Doublet Group distance statistics: 49777

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.016, 0.038, 0.061, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.038 std_dev=0.022
C3'	A	0, 0.059, 0.122, 0.185, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.122 std_dev=0.063
O4'	A	0, 0.043, 0.136, 0.228, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.136 std_dev=0.093
C2'	A	0, 0.030, 0.135, 0.239, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.135 std_dev=0.104
O3'	A	0, 0.064, 0.187, 0.311, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.187 std_dev=0.123
C6	B	0, 0.088, 0.211, 0.335, 0.356 max_d=0.356 avg_d=0.211 std_dev=0.124
O5'	B	0, 0.065, 0.205, 0.345, 0.377 max_d=0.377 avg_d=0.205 std_dev=0.140
C4'	A	0, 0.071, 0.214, 0.357, 0.396 max_d=0.396 avg_d=0.214 std_dev=0.143
OP2	B	0, 0.092, 0.253, 0.414, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.253 std_dev=0.161
C5	B	0, 0.131, 0.292, 0.454, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.292 std_dev=0.162
P	B	0, 0.032, 0.204, 0.376, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.204 std_dev=0.172
C4	B	0, 0.181, 0.382, 0.584, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.382 std_dev=0.201
OP1	B	0, 0.084, 0.287, 0.490, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.287 std_dev=0.203
O2'	A	0, 0.056, 0.262, 0.468, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.262 std_dev=0.206
O4'	B	0, 0.106, 0.319, 0.532, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.319 std_dev=0.213
C5'	B	0, 0.085, 0.299, 0.514, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.299 std_dev=0.214
N1	B	0, 0.077, 0.296, 0.515, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.296 std_dev=0.219
N3	B	0, 0.193, 0.442, 0.691, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.442 std_dev=0.249
N4	B	0, 0.210, 0.468, 0.726, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.468 std_dev=0.258
C4'	B	0, 0.124, 0.389, 0.654, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.389 std_dev=0.265
C5'	A	0, 0.126, 0.398, 0.669, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.398 std_dev=0.271
C2	B	0, 0.150, 0.425, 0.700, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.425 std_dev=0.275
C1'	B	0, 0.101, 0.392, 0.682, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.392 std_dev=0.291
O5'	A	0, 0.158, 0.480, 0.803, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.480 std_dev=0.323
C3'	B	0, 0.123, 0.472, 0.821, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.472 std_dev=0.349
O2	B	0, 0.194, 0.562, 0.930, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.562 std_dev=0.368
C2'	B	0, 0.105, 0.496, 0.887, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.496 std_dev=0.391
P	A	0, 0.252, 0.681, 1.110, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.681 std_dev=0.429
OP1	A	0, 0.273, 0.728, 1.183, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.728 std_dev=0.455
OP2	A	0, 0.234, 0.690, 1.147, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.690 std_dev=0.457
O3'	B	0, 0.136, 0.678, 1.220, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.678 std_dev=0.542
O2'	B	0, 0.100, 0.671, 1.242, 1.551 max_d=1.551 avg_d=0.671 std_dev=0.571

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.06	0.06	0.13	0.05
C2	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.07	0.05	0.16	0.06
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.01	0.06	0.13	0.13	0.07
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.11	0.09	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.02	0.04	0.11	0.06	0.16	0.09
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.02	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.02	0.05	0.13	0.06	0.16	0.09
C5'	0.01	0.04	0.02	0.04	0.10	0.01	0.11	0.00	0.09	0.05	0.07	0.11	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.05	0.11	0.05	0.15	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.08	0.05	0.15	0.06
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.09	0.05	0.17	0.07
N4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.03	0.04	0.12	0.07	0.16	0.10
O2	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.02	0.05	0.06	0.06	0.16	0.05
O2'	0.02	0.03	0.00	0.03	0.08	0.03	0.10	0.03	0.09	0.03	0.03	0.09	0.11	0.00	0.10	0.02	0.06	0.15	0.14	0.08
O3'	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.10	0.00	0.05	0.03	0.07	0.07	0.02
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.05	0.00	0.06	0.04	0.12	0.05
O5'	0.06	0.07	0.06	0.04	0.11	0.01	0.13	0.01	0.11	0.08	0.09	0.12	0.06	0.06	0.03	0.06	0.00	0.01	0.05	0.00
OP1	0.06	0.05	0.13	0.11	0.06	0.03	0.06	0.04	0.05	0.05	0.05	0.07	0.06	0.15	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.16	0.13	0.09	0.16	0.06	0.16	0.04	0.15	0.15	0.17	0.16	0.16	0.14	0.07	0.12	0.05	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.06	0.07	0.06	0.09	0.02	0.09	0.01	0.07	0.06	0.07	0.10	0.05	0.08	0.02	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.08	0.09	0.17	0.13	0.12	0.09	0.12	0.06	0.06	0.12	0.19	0.08	0.07	0.22	0.10	0.06	0.07	0.12	0.08
C2	0.06	0.10	0.10	0.17	0.17	0.12	0.14	0.13	0.08	0.07	0.14	0.20	0.08	0.10	0.21	0.09	0.05	0.07	0.12	0.08
C2'	0.08	0.06	0.12	0.20	0.10	0.14	0.06	0.14	0.08	0.06	0.09	0.16	0.07	0.09	0.25	0.11	0.06	0.08	0.11	0.07
C3'	0.08	0.06	0.10	0.19	0.08	0.13	0.07	0.13	0.08	0.06	0.09	0.14	0.06	0.08	0.24	0.11	0.06	0.08	0.12	0.07
C4	0.11	0.11	0.06	0.05	0.13	0.05	0.11	0.06	0.08	0.10	0.13	0.15	0.12	0.09	0.06	0.11	0.04	0.04	0.06	0.07
C4'	0.07	0.07	0.11	0.18	0.09	0.13	0.06	0.13	0.06	0.06	0.09	0.14	0.07	0.09	0.23	0.10	0.05	0.07	0.12	0.07
C5	0.13	0.13	0.07	0.05	0.12	0.05	0.08	0.07	0.06	0.11	0.13	0.14	0.14	0.11	0.07	0.12	0.04	0.04	0.06	0.06
C5'	0.11	0.10	0.15	0.22	0.10	0.17	0.11	0.17	0.12	0.11	0.11	0.12	0.11	0.12	0.26	0.13	0.08	0.09	0.08	0.06
C6	0.10	0.11	0.06	0.10	0.12	0.07	0.07	0.09	0.06	0.09	0.12	0.15	0.11	0.08	0.13	0.11	0.05	0.05	0.09	0.07
N1	0.07	0.09	0.08	0.15	0.14	0.10	0.10	0.12	0.06	0.06	0.12	0.18	0.08	0.07	0.19	0.10	0.05	0.06	0.11	0.08
N3	0.06	0.09	0.07	0.12	0.15	0.09	0.15	0.11	0.09	0.07	0.13	0.18	0.08	0.07	0.14	0.09	0.05	0.05	0.10	0.07
N4	0.15	0.14	0.11	0.05	0.13	0.07	0.12	0.03	0.11	0.13	0.14	0.14	0.15	0.14	0.04	0.14	0.05	0.07	0.05	0.07
O2	0.09	0.13	0.17	0.24	0.19	0.17	0.16	0.15	0.10	0.10	0.17	0.23	0.12	0.17	0.29	0.10	0.06	0.09	0.14	0.08
O2'	0.06	0.10	0.09	0.19	0.16	0.11	0.11	0.12	0.08	0.07	0.15	0.24	0.10	0.06	0.26	0.09	0.05	0.08	0.09	0.04
O3'	0.11	0.12	0.09	0.15	0.15	0.12	0.14	0.11	0.13	0.11	0.14	0.20	0.11	0.08	0.22	0.14	0.07	0.09	0.12	0.08
O4'	0.07	0.08	0.09	0.16	0.11	0.11	0.07	0.12	0.06	0.06	0.11	0.16	0.08	0.08	0.21	0.10	0.05	0.07	0.12	0.08
O5'	0.06	0.10	0.11	0.19	0.12	0.12	0.09	0.16	0.07	0.08	0.12	0.14	0.11	0.08	0.23	0.06	0.05	0.05	0.06	0.03
OP1	0.13	0.11	0.13	0.15	0.10	0.12	0.13	0.12	0.13	0.12	0.10	0.09	0.11	0.13	0.16	0.14	0.09	0.08	0.10	0.09
OP2	0.07	0.07	0.07	0.14	0.08	0.10	0.08	0.16	0.07	0.06	0.09	0.10	0.08	0.07	0.17	0.07	0.15	0.15	0.16	0.16
P	0.04	0.06	0.08	0.15	0.07	0.09	0.06	0.13	0.06	0.05	0.08	0.08	0.07	0.04	0.18	0.05	0.05	0.03	0.06	0.04

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.09	0.03	0.05
C2	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.05	0.08	0.07	0.06
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.05
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.08	0.04	0.06	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.09	0.10	0.12	0.09
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.06	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.08	0.03	0.04
C5	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.01	0.10	0.10	0.13	0.10
C5'	0.03	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.09	0.06	0.08	0.11	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02
C6	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.09	0.10	0.11	0.09
N1	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.06	0.09	0.07	0.06
N3	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.07	0.09	0.10	0.07
N4	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.10	0.10	0.14	0.10
O2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.03	0.00	0.03	0.09	0.04	0.05
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.03	0.02	0.03	0.14	0.07	0.08
O3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.00	0.11	0.02	0.09	0.04	0.06	0.12	0.03	0.03	0.00	0.01	0.02	0.06	0.07	0.04
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.03	0.05
O5'	0.03	0.05	0.01	0.02	0.09	0.01	0.10	0.01	0.09	0.06	0.07	0.10	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.08	0.09	0.07	0.10	0.08	0.10	0.01	0.10	0.09	0.09	0.10	0.09	0.14	0.06	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.07	0.04	0.05	0.12	0.03	0.13	0.03	0.11	0.07	0.10	0.14	0.04	0.07	0.07	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.06	0.05	0.04	0.09	0.04	0.10	0.02	0.09	0.06	0.07	0.10	0.05	0.08	0.04	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00