Doublet Group distance statistics: 49780

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.003, 0.006, 0.006 max_d=0.006 avg_d=0.003 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C6	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.000, 0.051, 0.102, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.051 std_dev=0.051
O4'	A	0, 0.000, 0.058, 0.117, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.058 std_dev=0.058
C5'	A	0, 0.000, 0.060, 0.121, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.060 std_dev=0.060
N4	A	0, 0.000, 0.066, 0.132, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.066 std_dev=0.066
C2'	A	0, 0.000, 0.110, 0.221, 0.221 max_d=0.221 avg_d=0.110 std_dev=0.110
C4'	A	0, 0.000, 0.122, 0.245, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.122 std_dev=0.122
O2'	A	0, 0.000, 0.175, 0.349, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.175 std_dev=0.175
C3'	A	0, 0.000, 0.188, 0.376, 0.376 max_d=0.376 avg_d=0.188 std_dev=0.188
O3'	A	0, 0.000, 0.316, 0.632, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.316 std_dev=0.316
O5'	A	0, 0.000, 0.417, 0.835, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.417 std_dev=0.417
OP2	B	0, 0.000, 0.456, 0.912, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.456 std_dev=0.456
OP1	B	0, 0.000, 0.461, 0.923, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.461 std_dev=0.461
P	B	0, 0.000, 0.703, 1.406, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.703 std_dev=0.703
O5'	B	0, 0.000, 1.288, 2.575, 2.575 max_d=2.575 avg_d=1.288 std_dev=1.288
P	A	0, 0.000, 1.800, 3.601, 3.601 max_d=3.601 avg_d=1.800 std_dev=1.800
OP1	A	0, 0.000, 2.049, 4.097, 4.097 max_d=4.097 avg_d=2.049 std_dev=2.049
C5'	B	0, 0.000, 2.058, 4.115, 4.115 max_d=4.115 avg_d=2.058 std_dev=2.058
O3'	B	0, 0.000, 2.459, 4.919, 4.919 max_d=4.919 avg_d=2.459 std_dev=2.459
C3'	B	0, 0.000, 2.751, 5.503, 5.503 max_d=5.503 avg_d=2.751 std_dev=2.751
OP2	A	0, 0.000, 2.799, 5.597, 5.597 max_d=5.597 avg_d=2.799 std_dev=2.799
C4'	B	0, 0.000, 2.897, 5.793, 5.793 max_d=5.793 avg_d=2.897 std_dev=2.897
O4'	B	0, 0.000, 3.539, 7.078, 7.078 max_d=7.078 avg_d=3.539 std_dev=3.539
C6	B	0, 0.000, 3.570, 7.140, 7.140 max_d=7.140 avg_d=3.570 std_dev=3.570
C5	B	0, 0.000, 3.835, 7.671, 7.671 max_d=7.671 avg_d=3.835 std_dev=3.835
C2'	B	0, 0.000, 3.956, 7.912, 7.912 max_d=7.912 avg_d=3.956 std_dev=3.956
C1'	B	0, 0.000, 4.198, 8.396, 8.396 max_d=8.396 avg_d=4.198 std_dev=4.198
N1	B	0, 0.000, 4.292, 8.585, 8.585 max_d=8.585 avg_d=4.292 std_dev=4.292
O2'	B	0, 0.000, 4.650, 9.299, 9.299 max_d=9.299 avg_d=4.650 std_dev=4.650
C4	B	0, 0.000, 4.912, 9.823, 9.823 max_d=9.823 avg_d=4.912 std_dev=4.912
C2	B	0, 0.000, 5.258, 10.516, 10.516 max_d=10.516 avg_d=5.258 std_dev=5.258
N4	B	0, 0.000, 5.372, 10.744, 10.744 max_d=10.744 avg_d=5.372 std_dev=5.372
N3	B	0, 0.000, 5.554, 11.108, 11.108 max_d=11.108 avg_d=5.554 std_dev=5.554
O2	B	0, 0.000, 5.891, 11.782, 11.782 max_d=11.782 avg_d=5.891 std_dev=5.891

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.01	0.33	0.21
C2	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.15	0.27	0.87	0.53
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.06	0.04	0.08	0.10	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.07	0.02
C4	0.00	0.00	0.05	0.09	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.02	0.23	0.63	1.44	0.87
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.21	0.11
C5	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.02	0.25	0.70	1.55	0.94
C5'	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.17	0.02	0.00
C6	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.22	0.52	1.27	0.77
N1	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.16	0.27	0.85	0.52
N3	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.01	0.19	0.45	1.16	0.70
N4	0.00	0.00	0.06	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.13	0.02	0.25	0.75	1.58	0.97
O2	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.11	0.10	0.59	0.36
O2'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.33	0.42	0.24
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.11	0.00	0.09	0.01	0.06	0.05	0.10	0.13	0.04	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.52	0.27
O4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.25	0.17
O5'	0.08	0.15	0.03	0.02	0.23	0.01	0.25	0.00	0.22	0.16	0.19	0.25	0.11	0.05	0.04	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.01	0.27	0.05	0.06	0.63	0.09	0.70	0.17	0.52	0.27	0.45	0.75	0.10	0.33	0.06	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.33	0.87	0.01	0.07	1.44	0.21	1.55	0.02	1.27	0.85	1.16	1.58	0.59	0.42	0.52	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.21	0.53	0.02	0.02	0.87	0.11	0.94	0.00	0.77	0.52	0.70	0.97	0.36	0.24	0.27	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.81	1.42	0.86	0.58	1.46	0.17	1.10	0.11	0.89	1.06	1.60	1.62	1.51	0.62	0.29	0.49	0.39	0.02	0.08	0.12
C2	0.56	1.09	0.59	0.36	1.19	0.03	0.90	0.28	0.70	0.80	1.26	1.33	1.13	0.32	0.06	0.30	0.26	0.06	0.13	0.05
C2'	0.50	1.15	0.55	0.32	1.28	0.12	0.92	0.34	0.67	0.79	1.38	1.48	1.21	0.26	0.04	0.19	0.23	0.12	0.15	0.02
C3'	0.35	0.96	0.41	0.22	1.07	0.20	0.73	0.36	0.50	0.62	1.17	1.25	1.03	0.12	0.04	0.07	0.20	0.15	0.16	0.01
C4	0.35	0.66	0.35	0.21	0.67	0.06	0.49	0.21	0.38	0.48	0.74	0.73	0.70	0.12	0.06	0.20	0.30	0.02	0.07	0.13
C4'	0.72	1.32	0.79	0.54	1.33	0.14	0.97	0.07	0.78	0.95	1.49	1.48	1.43	0.56	0.29	0.42	0.40	0.03	0.06	0.14
C5	0.47	0.76	0.49	0.36	0.71	0.10	0.51	0.03	0.43	0.57	0.82	0.75	0.84	0.28	0.11	0.33	0.41	0.02	0.03	0.20
C5'	0.66	1.17	0.72	0.53	1.13	0.18	0.81	0.02	0.66	0.84	1.29	1.25	1.29	0.52	0.31	0.41	0.44	0.00	0.02	0.20
C6	0.62	1.03	0.66	0.48	0.99	0.16	0.73	0.03	0.61	0.77	1.12	1.06	1.12	0.45	0.22	0.42	0.42	0.01	0.04	0.18
N1	0.67	1.19	0.71	0.48	1.22	0.10	0.91	0.14	0.74	0.89	1.34	1.34	1.26	0.46	0.19	0.41	0.36	0.02	0.09	0.12
N3	0.40	0.84	0.41	0.23	0.92	0.12	0.69	0.33	0.53	0.61	0.98	1.03	0.86	0.16	0.06	0.19	0.22	0.06	0.13	0.05
N4	0.12	0.32	0.09	0.00	0.32	0.19	0.20	0.27	0.13	0.21	0.37	0.36	0.35	0.10	0.24	0.06	0.25	0.00	0.05	0.15
O2	0.58	1.19	0.61	0.35	1.35	0.07	1.02	0.35	0.77	0.87	1.41	1.54	1.22	0.33	0.05	0.28	0.21	0.09	0.17	0.01
O2'	0.68	1.42	0.74	0.45	1.57	0.02	1.16	0.29	0.88	1.01	1.68	1.81	1.49	0.44	0.15	0.32	0.28	0.08	0.12	0.04
O3'	0.23	0.89	0.30	0.12	1.04	0.32	0.69	0.46	0.43	0.53	1.13	1.26	0.95	0.02	0.13	0.06	0.13	0.19	0.20	0.04
O4'	0.95	1.53	1.01	0.73	1.50	0.33	1.12	0.06	0.96	1.16	1.68	1.63	1.66	0.81	0.46	0.64	0.49	0.03	0.03	0.20
O5'	1.20	1.67	1.28	1.03	1.53	0.70	1.20	0.48	1.10	1.34	1.75	1.61	1.85	1.14	0.83	0.94	0.81	0.29	0.28	0.51
OP1	1.90	2.17	2.01	1.79	1.85	1.53	1.55	1.28	1.57	1.89	2.13	1.82	2.41	2.00	1.72	1.68	1.46	0.74	0.79	1.07
OP2	2.48	2.80	2.56	2.42	2.62	2.10	2.36	1.92	2.32	2.55	2.82	2.63	2.96	2.40	2.28	2.27	2.25	1.55	1.67	1.88
P	2.04	2.40	2.13	1.92	2.18	1.61	1.88	1.38	1.84	2.11	2.42	2.20	2.60	2.03	1.78	1.80	1.66	1.00	1.08	1.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.19	0.35	0.07
C2	0.00	0.00	0.05	0.04	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.01	0.02	0.26	0.29	0.01	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.03	0.02	0.11	0.00	0.01	0.01	0.04	0.14	0.21	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.16	0.00	0.23	0.01	0.22	0.11	0.08	0.17	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.12	0.04
C4	0.00	0.00	0.02	0.16	0.00	0.13	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.17	0.02	0.45	0.29	0.34	0.28
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.13	0.00	0.18	0.00	0.17	0.08	0.07	0.14	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.11	0.38	0.06
C5	0.00	0.00	0.07	0.23	0.00	0.18	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.25	0.01	0.52	0.23	0.33	0.32
C5'	0.03	0.13	0.02	0.01	0.28	0.00	0.34	0.00	0.30	0.16	0.20	0.31	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.31	0.30	0.01
C6	0.00	0.00	0.08	0.22	0.00	0.17	0.00	0.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.23	0.01	0.46	0.21	0.06	0.20
N1	0.00	0.00	0.02	0.11	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01	0.28	0.24	0.10	0.07
N3	0.00	0.00	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.06	0.02	0.35	0.32	0.20	0.18
N4	0.00	0.00	0.02	0.17	0.00	0.14	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.18	0.02	0.48	0.30	0.49	0.34
O2	0.01	0.00	0.11	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.11	0.02	0.16	0.30	0.08	0.02
O2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.12	0.07	0.21	0.00	0.02	0.07	0.04	0.01	0.28	0.04
O3'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.00	0.25	0.02	0.23	0.09	0.06	0.18	0.11	0.02	0.00	0.01	0.05	0.16	0.05	0.00
O4'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.01	0.00	0.03	0.15	0.56	0.15
O5'	0.11	0.26	0.04	0.01	0.45	0.01	0.52	0.01	0.46	0.28	0.35	0.48	0.16	0.04	0.05	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.19	0.29	0.14	0.01	0.29	0.11	0.23	0.31	0.21	0.24	0.32	0.30	0.30	0.01	0.16	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.35	0.01	0.21	0.12	0.34	0.38	0.33	0.30	0.06	0.10	0.20	0.49	0.08	0.28	0.05	0.56	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.09	0.06	0.04	0.28	0.06	0.32	0.01	0.20	0.07	0.18	0.34	0.02	0.04	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00