Doublet Group distance statistics: 49789

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.001, 0.006, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.001, 0.016, 0.030, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.001, 0.016, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.006, 0.024, 0.042, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.005, 0.024, 0.042, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.004, 0.029, 0.055, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.029 std_dev=0.026
N2	A	0, -0.005, 0.030, 0.065, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.030 std_dev=0.035
O6	A	0, -0.003, 0.032, 0.067, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.032 std_dev=0.035
O2'	A	0, 0.020, 0.071, 0.122, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.071 std_dev=0.051
C2'	A	0, 0.049, 0.177, 0.306, 0.300 max_d=0.300 avg_d=0.177 std_dev=0.128
O4'	A	0, 0.050, 0.202, 0.354, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.202 std_dev=0.152
C4'	A	0, 0.098, 0.369, 0.641, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.369 std_dev=0.272
C3'	A	0, 0.101, 0.376, 0.650, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.376 std_dev=0.274
O2	B	0, 0.095, 0.408, 0.722, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.408 std_dev=0.313
C2	B	0, 0.159, 0.561, 0.963, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.561 std_dev=0.402
C5'	A	0, 0.151, 0.558, 0.964, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.558 std_dev=0.407
O3'	A	0, 0.152, 0.576, 0.999, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.576 std_dev=0.423
N1	B	0, 0.187, 0.650, 1.112, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.650 std_dev=0.463
C1'	B	0, 0.257, 0.878, 1.499, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.878 std_dev=0.621
C6	B	0, 0.266, 0.916, 1.566, 1.440 max_d=1.440 avg_d=0.916 std_dev=0.650
N3	B	0, 0.286, 0.976, 1.666, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.976 std_dev=0.690
C5	B	0, 0.338, 1.173, 2.008, 1.877 max_d=1.877 avg_d=1.173 std_dev=0.835
C4	B	0, 0.368, 1.261, 2.155, 1.948 max_d=1.948 avg_d=1.261 std_dev=0.893
O4'	B	0, 0.379, 1.298, 2.216, 1.988 max_d=1.988 avg_d=1.298 std_dev=0.918
C2'	B	0, 0.395, 1.349, 2.303, 2.041 max_d=2.041 avg_d=1.349 std_dev=0.954
O2'	B	0, 0.429, 1.464, 2.500, 2.225 max_d=2.225 avg_d=1.464 std_dev=1.036
OP1	A	0, 0.481, 1.649, 2.816, 2.554 max_d=2.554 avg_d=1.649 std_dev=1.168
O5'	A	0, 0.484, 1.653, 2.822, 2.516 max_d=2.516 avg_d=1.653 std_dev=1.169
N4	B	0, 0.512, 1.747, 2.982, 2.626 max_d=2.626 avg_d=1.747 std_dev=1.235
C3'	B	0, 0.527, 1.800, 3.072, 2.721 max_d=2.721 avg_d=1.800 std_dev=1.273
C4'	B	0, 0.531, 1.814, 3.097, 2.725 max_d=2.725 avg_d=1.814 std_dev=1.283
OP2	B	0, 0.581, 2.024, 3.467, 3.261 max_d=3.261 avg_d=2.024 std_dev=1.443
C5'	B	0, 0.635, 2.169, 3.702, 3.257 max_d=3.257 avg_d=2.169 std_dev=1.533
P	A	0, 0.645, 2.202, 3.760, 3.351 max_d=3.351 avg_d=2.202 std_dev=1.558
O5'	B	0, 0.646, 2.207, 3.767, 3.344 max_d=3.344 avg_d=2.207 std_dev=1.561
O3'	B	0, 0.653, 2.232, 3.811, 3.396 max_d=3.396 avg_d=2.232 std_dev=1.579
P	B	0, 0.720, 2.460, 4.200, 3.754 max_d=3.754 avg_d=2.460 std_dev=1.740
OP1	B	0, 1.010, 3.450, 5.890, 5.252 max_d=5.252 avg_d=3.450 std_dev=2.440
OP2	A	0, 1.167, 3.987, 6.807, 6.040 max_d=6.040 avg_d=3.987 std_dev=2.820

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.27	0.05	0.06	0.41	0.23
C2	0.03	0.00	0.06	0.11	0.02	0.05	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.13	0.05	0.38	0.02	0.13	0.81	0.43
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.05	0.08	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.04	0.05	0.23	0.13
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.10	0.03	0.11	0.12	0.10	0.05	0.04	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.08	0.10	0.07
C4	0.01	0.02	0.03	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.02	0.42	0.03	0.14	0.83	0.46
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.04	0.06	0.04	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.03	0.03
C5	0.01	0.02	0.02	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.02	0.51	0.03	0.24	1.07	0.59
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.04	0.07	0.08	0.06	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.00	0.10	0.04	0.01	0.01
C6	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.12	0.03	0.50	0.01	0.27	1.13	0.61
C8	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.55	0.05	0.22	1.00	0.58
N1	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.03	0.45	0.01	0.21	1.00	0.54
N2	0.05	0.00	0.08	0.12	0.02	0.06	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.14	0.06	0.33	0.01	0.10	0.73	0.38
N3	0.03	0.00	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.04	0.35	0.02	0.08	0.70	0.38
N7	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.58	0.05	0.30	1.20	0.67
N9	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.43	0.04	0.10	0.74	0.43
O2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.05	0.03	0.20	0.10	0.09
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.09	0.01	0.09	0.01	0.12	0.03	0.13	0.14	0.10	0.06	0.04	0.04	0.00	0.01	0.18	0.13	0.04	0.25	0.15
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.06	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.23	0.05	0.14	0.29	0.16
O5'	0.27	0.38	0.14	0.06	0.42	0.01	0.51	0.00	0.50	0.55	0.45	0.33	0.35	0.58	0.43	0.05	0.18	0.23	0.00	0.53	0.00	0.01	0.00
O6	0.05	0.02	0.04	0.10	0.03	0.07	0.03	0.10	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03	0.13	0.05	0.53	0.00	0.33	1.25	0.67
OP1	0.06	0.13	0.05	0.08	0.14	0.13	0.24	0.04	0.27	0.22	0.21	0.10	0.08	0.30	0.10	0.20	0.04	0.14	0.00	0.33	0.00	0.00	0.00
OP2	0.41	0.81	0.23	0.10	0.83	0.03	1.07	0.01	1.13	1.00	1.00	0.73	0.70	1.20	0.74	0.10	0.25	0.29	0.01	1.25	0.00	0.00	0.00
P	0.23	0.43	0.13	0.07	0.46	0.03	0.59	0.01	0.61	0.58	0.54	0.38	0.38	0.67	0.43	0.09	0.15	0.16	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.08	0.17	0.19	0.16	0.24	0.11	0.25	0.09	0.07	0.16	0.22	0.08	0.20	0.18	0.23	0.26	0.37	0.12	0.24
C2	0.10	0.05	0.11	0.11	0.06	0.11	0.05	0.11	0.05	0.04	0.08	0.09	0.07	0.11	0.09	0.12	0.14	0.20	0.06	0.11
C2'	0.16	0.04	0.13	0.15	0.13	0.22	0.08	0.23	0.06	0.06	0.13	0.19	0.04	0.16	0.13	0.23	0.24	0.33	0.10	0.23
C3'	0.18	0.02	0.17	0.18	0.06	0.23	0.05	0.24	0.10	0.10	0.06	0.12	0.02	0.19	0.17	0.24	0.24	0.33	0.12	0.23
C4	0.13	0.05	0.15	0.16	0.07	0.17	0.06	0.17	0.08	0.07	0.10	0.10	0.07	0.17	0.15	0.16	0.18	0.27	0.08	0.16
C4'	0.17	0.05	0.18	0.19	0.13	0.24	0.09	0.25	0.09	0.08	0.13	0.19	0.04	0.20	0.19	0.23	0.25	0.36	0.12	0.24
C5	0.11	0.05	0.16	0.15	0.04	0.12	0.08	0.11	0.10	0.08	0.06	0.03	0.08	0.15	0.15	0.13	0.13	0.21	0.06	0.11
C5'	0.18	0.05	0.21	0.22	0.09	0.24	0.09	0.25	0.12	0.11	0.09	0.13	0.03	0.22	0.21	0.23	0.25	0.36	0.14	0.24
C6	0.09	0.06	0.14	0.11	0.07	0.05	0.11	0.04	0.11	0.08	0.06	0.07	0.09	0.10	0.11	0.09	0.08	0.14	0.03	0.05
C8	0.14	0.05	0.18	0.18	0.06	0.18	0.07	0.18	0.10	0.08	0.09	0.08	0.08	0.19	0.19	0.17	0.19	0.29	0.09	0.17
N1	0.09	0.04	0.12	0.10	0.05	0.06	0.08	0.06	0.09	0.07	0.05	0.03	0.07	0.08	0.08	0.10	0.10	0.15	0.05	0.07
N2	0.07	0.07	0.06	0.06	0.10	0.08	0.08	0.09	0.05	0.03	0.11	0.13	0.09	0.07	0.06	0.10	0.14	0.17	0.07	0.10
N3	0.12	0.07	0.13	0.14	0.11	0.17	0.07	0.17	0.06	0.05	0.12	0.15	0.08	0.15	0.13	0.17	0.19	0.26	0.07	0.16
N7	0.12	0.06	0.18	0.17	0.05	0.14	0.09	0.13	0.12	0.09	0.07	0.04	0.09	0.17	0.18	0.14	0.14	0.23	0.08	0.12
N9	0.14	0.06	0.17	0.18	0.10	0.20	0.07	0.21	0.09	0.07	0.12	0.14	0.07	0.19	0.18	0.19	0.21	0.31	0.10	0.19
O2'	0.13	0.13	0.09	0.12	0.25	0.21	0.18	0.23	0.10	0.07	0.24	0.34	0.11	0.13	0.09	0.22	0.24	0.34	0.11	0.23
O3'	0.19	0.03	0.17	0.17	0.06	0.23	0.05	0.24	0.10	0.11	0.06	0.12	0.04	0.18	0.16	0.25	0.24	0.32	0.11	0.23
O4'	0.16	0.09	0.18	0.21	0.16	0.24	0.12	0.26	0.11	0.09	0.17	0.22	0.09	0.21	0.21	0.23	0.26	0.39	0.13	0.24
O5'	0.34	0.40	0.34	0.34	0.42	0.32	0.40	0.31	0.36	0.37	0.43	0.44	0.41	0.35	0.38	0.32	0.31	0.23	0.39	0.30
O6	0.05	0.06	0.12	0.08	0.12	0.03	0.15	0.04	0.13	0.07	0.09	0.14	0.10	0.04	0.11	0.07	0.02	0.05	0.01	0.03
OP1	0.14	0.20	0.13	0.10	0.23	0.09	0.18	0.09	0.14	0.14	0.25	0.26	0.21	0.11	0.10	0.15	0.13	0.22	0.11	0.11
OP2	0.89	0.85	0.95	1.00	0.83	0.96	0.85	0.96	0.86	0.87	0.82	0.81	0.85	0.99	1.09	0.89	0.93	0.87	0.96	0.91
P	0.43	0.47	0.44	0.45	0.48	0.43	0.46	0.42	0.44	0.44	0.49	0.49	0.48	0.45	0.49	0.42	0.41	0.32	0.47	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.07	0.02
C2	0.01	0.00	0.07	0.08	0.02	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.09	0.03	0.16	0.16	0.10	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.05	0.02	0.15	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.07	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.07	0.00	0.12	0.02	0.12	0.05	0.08	0.07	0.14	0.01	0.00	0.00	0.07	0.09	0.03	0.06
C4	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.10	0.07	0.14	0.13	0.10	0.11
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.07	0.03	0.01	0.00	0.01	0.09	0.04	0.01
C5	0.03	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.15	0.05	0.13	0.12	0.10	0.11
C5'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.08	0.07	0.08	0.08	0.10	0.03	0.01	0.01	0.00	0.10	0.03	0.00
C6	0.03	0.02	0.08	0.12	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.06	0.14	0.04	0.13	0.11	0.09	0.09
N1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.05	0.03	0.02	0.05	0.01	0.13	0.13	0.09	0.09
N3	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.09	0.05	0.16	0.16	0.11	0.12
N4	0.06	0.04	0.02	0.07	0.01	0.05	0.02	0.08	0.03	0.05	0.03	0.00	0.05	0.04	0.10	0.08	0.14	0.13	0.11	0.12
O2	0.06	0.00	0.15	0.14	0.02	0.07	0.01	0.10	0.03	0.03	0.02	0.05	0.00	0.15	0.16	0.05	0.17	0.19	0.11	0.13
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.06	0.02	0.06	0.04	0.15	0.00	0.04	0.02	0.01	0.08	0.05	0.01
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.10	0.01	0.15	0.01	0.14	0.05	0.09	0.10	0.16	0.04	0.00	0.02	0.08	0.11	0.03	0.06
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.08	0.05	0.02	0.02	0.00	0.04	0.09	0.10	0.03
O5'	0.06	0.16	0.05	0.07	0.14	0.01	0.13	0.00	0.13	0.13	0.16	0.14	0.17	0.01	0.08	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.16	0.08	0.09	0.13	0.09	0.12	0.10	0.11	0.13	0.16	0.13	0.19	0.08	0.11	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.07	0.10	0.07	0.03	0.10	0.04	0.10	0.03	0.09	0.09	0.11	0.11	0.11	0.05	0.03	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.02	0.12	0.05	0.06	0.11	0.01	0.11	0.00	0.09	0.09	0.12	0.12	0.13	0.01	0.06	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00