Doublet Group distance statistics: 49790

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.000, 0.032, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.032 std_dev=0.032
O6	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N7	A	0, 0.000, 0.042, 0.084, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.042 std_dev=0.042
N2	A	0, 0.000, 0.082, 0.163, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.082 std_dev=0.082
O4'	A	0, 0.000, 0.088, 0.176, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.088 std_dev=0.088
C2'	A	0, 0.000, 0.271, 0.542, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.271 std_dev=0.271
O2'	A	0, 0.000, 0.373, 0.746, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.373 std_dev=0.373
C3'	A	0, 0.000, 0.402, 0.805, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.402 std_dev=0.402
O3'	A	0, 0.000, 0.447, 0.893, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.447 std_dev=0.447
O4'	B	0, 0.000, 0.462, 0.925, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.462 std_dev=0.462
C4'	A	0, 0.000, 0.499, 0.999, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.499 std_dev=0.499
C1'	B	0, 0.000, 0.508, 1.015, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.508 std_dev=0.508
O2'	B	0, 0.000, 0.523, 1.046, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.523 std_dev=0.523
C4'	B	0, 0.000, 0.570, 1.141, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.570 std_dev=0.570
C2'	B	0, 0.000, 0.598, 1.197, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.598 std_dev=0.598
N1	B	0, 0.000, 0.645, 1.291, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.645 std_dev=0.645
C3'	B	0, 0.000, 0.658, 1.317, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.658 std_dev=0.658
C6	B	0, 0.000, 0.660, 1.319, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.660 std_dev=0.660
C5'	B	0, 0.000, 0.690, 1.380, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.690 std_dev=0.690
O3'	B	0, 0.000, 0.781, 1.562, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.781 std_dev=0.781
O5'	B	0, 0.000, 0.804, 1.609, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.804 std_dev=0.804
C5	B	0, 0.000, 0.813, 1.626, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.813 std_dev=0.813
C2	B	0, 0.000, 0.842, 1.683, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.842 std_dev=0.842
O2	B	0, 0.000, 0.850, 1.699, 1.699 max_d=1.699 avg_d=0.850 std_dev=0.850
C4	B	0, 0.000, 0.999, 1.998, 1.998 max_d=1.998 avg_d=0.999 std_dev=0.999
N3	B	0, 0.000, 1.035, 2.070, 2.070 max_d=2.070 avg_d=1.035 std_dev=1.035
C5'	A	0, 0.000, 1.051, 2.102, 2.102 max_d=2.102 avg_d=1.051 std_dev=1.051
OP2	A	0, 0.000, 1.056, 2.112, 2.112 max_d=2.112 avg_d=1.056 std_dev=1.056
P	B	0, 0.000, 1.092, 2.183, 2.183 max_d=2.183 avg_d=1.092 std_dev=1.092
N4	B	0, 0.000, 1.159, 2.317, 2.317 max_d=2.317 avg_d=1.159 std_dev=1.159
O5'	A	0, 0.000, 1.248, 2.496, 2.496 max_d=2.496 avg_d=1.248 std_dev=1.248
OP1	B	0, 0.000, 1.343, 2.685, 2.685 max_d=2.685 avg_d=1.343 std_dev=1.343
P	A	0, 0.000, 1.412, 2.824, 2.824 max_d=2.824 avg_d=1.412 std_dev=1.412
OP2	B	0, 0.000, 1.514, 3.027, 3.027 max_d=3.027 avg_d=1.514 std_dev=1.514
OP1	A	0, 0.000, 2.282, 4.564, 4.564 max_d=4.564 avg_d=2.282 std_dev=2.282

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.06	0.00	0.35	0.73	0.12
C2	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.04	0.00	0.01	0.56	0.68	0.17
C2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.07	0.16	0.06	0.13	0.02	0.01	0.02	0.12	0.06	0.00	0.00	0.01	0.13	0.08	0.41	0.60	0.04
C3'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.04	0.14	0.01	0.05	0.05	0.13	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.10	0.53	0.06
C4	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.16	0.01	0.70	0.67	0.02
C4'	0.03	0.10	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.16	0.05	0.12	0.11	0.14	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.49	0.11
C5	0.00	0.01	0.07	0.06	0.00	0.04	0.00	0.31	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.31	0.00	0.95	0.60	0.14
C5'	0.08	0.06	0.16	0.01	0.19	0.00	0.31	0.00	0.27	0.46	0.16	0.00	0.04	0.46	0.26	0.09	0.11	0.00	0.00	0.32	0.02	0.36	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.04	0.01	0.01	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.26	0.00	0.94	0.59	0.10
C8	0.00	0.00	0.13	0.14	0.00	0.16	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.14	0.01	0.47	0.00	1.02	0.57	0.30
N1	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.11	0.01	0.75	0.64	0.05
N2	0.05	0.00	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.11	0.08	0.08	0.08	0.04	0.43	0.67	0.25
N3	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.11	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.06	0.04	0.01	0.01	0.49	0.70	0.18
N7	0.00	0.00	0.12	0.13	0.01	0.14	0.00	0.46	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.11	0.00	0.48	0.01	1.15	0.52	0.33
N9	0.00	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.24	0.00	0.70	0.67	0.05
O2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.09	0.00	0.09	0.05	0.11	0.11	0.08	0.01	0.00	0.05	0.02	0.02	0.03	0.36	0.63	0.03
O3'	0.07	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.02	0.14	0.04	0.08	0.06	0.11	0.07	0.05	0.00	0.11	0.14	0.03	0.06	0.47	0.16
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.04	0.00	0.00	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.18	0.75	0.21
O5'	0.06	0.00	0.13	0.01	0.16	0.01	0.31	0.00	0.26	0.47	0.11	0.08	0.01	0.48	0.24	0.02	0.14	0.05	0.00	0.32	0.02	0.04	0.00
O6	0.00	0.01	0.08	0.06	0.01	0.04	0.00	0.32	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.32	0.00	1.06	0.54	0.17
OP1	0.35	0.56	0.41	0.10	0.70	0.06	0.95	0.02	0.94	1.02	0.75	0.43	0.49	1.15	0.70	0.36	0.06	0.18	0.02	1.06	0.00	0.01	0.01
OP2	0.73	0.68	0.60	0.53	0.67	0.49	0.60	0.36	0.59	0.57	0.64	0.67	0.70	0.52	0.67	0.63	0.47	0.75	0.04	0.54	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.17	0.04	0.06	0.02	0.11	0.14	0.01	0.10	0.30	0.05	0.25	0.18	0.33	0.05	0.03	0.16	0.21	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.16	0.00	0.03	0.14	0.05	0.11	0.05	0.10	0.11	0.17	0.15	0.19	0.04	0.08	0.11	0.02	0.14	0.03	0.01
C2	0.14	0.21	0.01	0.01	0.20	0.07	0.17	0.08	0.16	0.17	0.22	0.20	0.25	0.02	0.07	0.14	0.07	0.17	0.02	0.05
C2'	0.13	0.24	0.01	0.06	0.24	0.03	0.18	0.02	0.15	0.17	0.29	0.28	0.28	0.01	0.15	0.13	0.01	0.09	0.02	0.00
C3'	0.15	0.22	0.01	0.04	0.22	0.07	0.17	0.06	0.15	0.17	0.25	0.24	0.25	0.04	0.12	0.16	0.04	0.12	0.03	0.02
C4	0.17	0.27	0.07	0.03	0.25	0.10	0.20	0.09	0.18	0.20	0.29	0.26	0.31	0.08	0.03	0.16	0.09	0.21	0.08	0.09
C4'	0.22	0.27	0.09	0.05	0.26	0.16	0.23	0.16	0.22	0.23	0.28	0.27	0.29	0.11	0.03	0.24	0.13	0.24	0.06	0.12
C5	0.24	0.36	0.17	0.11	0.34	0.15	0.28	0.14	0.25	0.28	0.38	0.34	0.40	0.17	0.05	0.21	0.16	0.30	0.21	0.18
C5'	0.07	0.16	0.09	0.15	0.16	0.02	0.11	0.02	0.09	0.10	0.19	0.19	0.18	0.08	0.25	0.09	0.04	0.06	0.09	0.05
C6	0.27	0.38	0.21	0.15	0.35	0.17	0.30	0.16	0.28	0.30	0.39	0.36	0.42	0.21	0.08	0.23	0.19	0.33	0.25	0.21
C8	0.21	0.32	0.14	0.10	0.31	0.14	0.25	0.13	0.23	0.25	0.35	0.33	0.36	0.16	0.04	0.19	0.14	0.28	0.18	0.16
N1	0.22	0.32	0.12	0.07	0.29	0.13	0.25	0.13	0.23	0.25	0.33	0.29	0.36	0.09	0.00	0.19	0.14	0.25	0.14	0.14
N2	0.09	0.10	0.06	0.04	0.12	0.06	0.12	0.08	0.12	0.10	0.11	0.11	0.08	0.09	0.09	0.13	0.05	0.13	0.06	0.01
N3	0.12	0.19	0.01	0.03	0.18	0.06	0.14	0.06	0.13	0.14	0.20	0.18	0.22	0.01	0.09	0.13	0.04	0.14	0.01	0.02
N7	0.26	0.38	0.21	0.15	0.37	0.18	0.30	0.16	0.28	0.30	0.41	0.38	0.42	0.22	0.10	0.23	0.19	0.34	0.27	0.22
N9	0.16	0.25	0.07	0.03	0.23	0.09	0.18	0.09	0.17	0.18	0.27	0.25	0.29	0.09	0.03	0.15	0.08	0.20	0.08	0.08
O2'	0.18	0.31	0.01	0.05	0.30	0.06	0.23	0.05	0.20	0.22	0.36	0.34	0.36	0.03	0.16	0.18	0.03	0.09	0.01	0.02
O3'	0.16	0.20	0.01	0.03	0.20	0.09	0.17	0.09	0.17	0.17	0.22	0.22	0.22	0.03	0.11	0.18	0.05	0.12	0.05	0.03
O4'	0.09	0.11	0.01	0.01	0.09	0.06	0.07	0.06	0.07	0.08	0.11	0.10	0.13	0.05	0.04	0.10	0.03	0.16	0.03	0.02
O5'	0.15	0.22	0.02	0.06	0.24	0.07	0.20	0.08	0.18	0.18	0.25	0.26	0.24	0.02	0.17	0.18	0.06	0.17	0.00	0.05
O6	0.31	0.42	0.29	0.22	0.40	0.22	0.35	0.20	0.32	0.35	0.44	0.40	0.45	0.30	0.17	0.26	0.25	0.40	0.35	0.29
OP1	0.44	0.29	0.64	0.72	0.27	0.59	0.35	0.58	0.40	0.38	0.24	0.22	0.26	0.65	0.86	0.43	0.59	0.48	0.60	0.58
OP2	0.83	0.87	0.76	0.73	0.86	0.78	0.84	0.79	0.83	0.84	0.87	0.86	0.88	0.77	0.68	0.83	0.78	0.93	0.76	0.78
P	0.33	0.38	0.16	0.11	0.37	0.24	0.34	0.26	0.33	0.34	0.39	0.38	0.40	0.17	0.01	0.35	0.23	0.36	0.19	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.13	0.08
C2	0.03	0.00	0.06	0.07	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.03	0.03	0.20	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.04	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.12	0.02	0.02
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.08	0.05	0.07	0.02	0.00	0.00	0.04	0.16	0.13	0.08
C4	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.13	0.29	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.12	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.07	0.16	0.31	0.18
C5'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.11	0.26	0.16
N1	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.04	0.20	0.12
N3	0.03	0.01	0.07	0.08	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.08	0.09	0.02	0.03	0.07	0.24	0.14
N4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.00	0.07	0.18	0.33	0.19
O2	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.09	0.01	0.02	0.01	0.17	0.10
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.05	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.14	0.03	0.01
O3'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.06	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.09	0.05	0.09	0.00	0.00	0.01	0.06	0.25	0.24	0.16
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.02	0.14	0.10
O5'	0.03	0.03	0.01	0.04	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.05	0.03	0.07	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01
OP1	0.03	0.03	0.12	0.16	0.13	0.12	0.16	0.09	0.11	0.04	0.07	0.18	0.01	0.14	0.25	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.13	0.20	0.02	0.13	0.29	0.02	0.31	0.02	0.26	0.20	0.24	0.33	0.17	0.03	0.24	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.12	0.02	0.08	0.16	0.01	0.18	0.02	0.16	0.12	0.14	0.19	0.10	0.01	0.16	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00