Doublet Group distance statistics: 49791

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C6	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.000, 0.043, 0.085, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.043 std_dev=0.043
N9	A	0, 0.000, 0.047, 0.094, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.047 std_dev=0.047
C2	A	0, 0.000, 0.048, 0.097, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.048 std_dev=0.048
C1'	A	0, 0.000, 0.050, 0.101, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.050 std_dev=0.050
O6	A	0, 0.000, 0.056, 0.112, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.056 std_dev=0.056
N3	A	0, 0.000, 0.057, 0.113, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.057 std_dev=0.057
N2	A	0, 0.000, 0.104, 0.208, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.104 std_dev=0.104
O2'	B	0, 0.000, 0.104, 0.209, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.104 std_dev=0.104
C2'	B	0, 0.000, 0.435, 0.869, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.435 std_dev=0.435
N3	B	0, 0.000, 0.509, 1.018, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.509 std_dev=0.509
C1'	B	0, 0.000, 0.510, 1.020, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.510 std_dev=0.510
C2	B	0, 0.000, 0.511, 1.021, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.511 std_dev=0.511
N1	B	0, 0.000, 0.521, 1.042, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.521 std_dev=0.521
O2	B	0, 0.000, 0.540, 1.081, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.540 std_dev=0.540
C4	B	0, 0.000, 0.557, 1.115, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.557 std_dev=0.557
C6	B	0, 0.000, 0.561, 1.122, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.561 std_dev=0.561
C5	B	0, 0.000, 0.571, 1.142, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.571 std_dev=0.571
N4	B	0, 0.000, 0.606, 1.211, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.606 std_dev=0.606
O4'	B	0, 0.000, 0.994, 1.989, 1.989 max_d=1.989 avg_d=0.994 std_dev=0.994
C3'	B	0, 0.000, 1.012, 2.023, 2.023 max_d=2.023 avg_d=1.012 std_dev=1.012
C2'	A	0, 0.000, 1.172, 2.343, 2.343 max_d=2.343 avg_d=1.172 std_dev=1.172
C4'	B	0, 0.000, 1.210, 2.420, 2.420 max_d=2.420 avg_d=1.210 std_dev=1.210
O4'	A	0, 0.000, 1.245, 2.490, 2.490 max_d=2.490 avg_d=1.245 std_dev=1.245
O3'	B	0, 0.000, 1.291, 2.582, 2.582 max_d=2.582 avg_d=1.291 std_dev=1.291
O3'	A	0, 0.000, 1.408, 2.817, 2.817 max_d=2.817 avg_d=1.408 std_dev=1.408
C3'	A	0, 0.000, 1.521, 3.043, 3.043 max_d=3.043 avg_d=1.521 std_dev=1.521
C4'	A	0, 0.000, 1.663, 3.326, 3.326 max_d=3.326 avg_d=1.663 std_dev=1.663
O2'	A	0, 0.000, 1.728, 3.455, 3.455 max_d=3.455 avg_d=1.728 std_dev=1.728
C5'	B	0, 0.000, 1.741, 3.483, 3.483 max_d=3.483 avg_d=1.741 std_dev=1.741
O5'	B	0, 0.000, 2.099, 4.198, 4.198 max_d=4.198 avg_d=2.099 std_dev=2.099
OP1	B	0, 0.000, 2.226, 4.453, 4.453 max_d=4.453 avg_d=2.226 std_dev=2.226
P	B	0, 0.000, 2.240, 4.481, 4.481 max_d=4.481 avg_d=2.240 std_dev=2.240
OP2	B	0, 0.000, 3.048, 6.097, 6.097 max_d=6.097 avg_d=3.048 std_dev=3.048
C5'	A	0, 0.000, 3.108, 6.216, 6.216 max_d=6.216 avg_d=3.108 std_dev=3.108
O5'	A	0, 0.000, 3.544, 7.088, 7.088 max_d=7.088 avg_d=3.544 std_dev=3.544
P	A	0, 0.000, 5.015, 10.029, 10.029 max_d=10.029 avg_d=5.015 std_dev=5.015
OP2	A	0, 0.000, 5.525, 11.050, 11.050 max_d=11.050 avg_d=5.525 std_dev=5.525
OP1	A	0, 0.000, 5.713, 11.427, 11.427 max_d=11.427 avg_d=5.713 std_dev=5.713

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.09	0.00	0.03	0.04	0.08	0.07	0.01	0.00	0.03	0.24	0.01	0.31	0.02	0.20	0.34	0.36
C2	0.06	0.00	0.42	0.72	0.00	0.29	0.01	0.49	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.42	0.12	0.17	0.04	0.13	0.01	0.08
C2'	0.00	0.42	0.00	0.00	0.21	0.01	0.09	0.21	0.19	0.23	0.33	0.49	0.40	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.62	0.16	0.54	0.59	0.62
C3'	0.00	0.72	0.00	0.00	0.42	0.01	0.30	0.01	0.44	0.09	0.61	0.83	0.67	0.03	0.13	0.02	0.01	0.01	0.26	0.40	0.32	0.00	0.18
C4	0.03	0.00	0.21	0.42	0.00	0.15	0.00	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.13	0.06	0.20	0.03	0.35	0.53	0.48
C4'	0.01	0.29	0.01	0.01	0.15	0.00	0.07	0.01	0.14	0.10	0.22	0.34	0.28	0.06	0.02	0.23	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.31	0.06
C5	0.01	0.01	0.09	0.30	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.07	0.03	0.39	0.03	0.56	0.96	0.79
C5'	0.09	0.49	0.21	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.12	0.35	0.33	0.66	0.44	0.28	0.11	0.01	0.20	0.02	0.00	0.05	0.36	0.28	0.01
C6	0.00	0.02	0.19	0.44	0.02	0.14	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.07	0.20	0.04	0.25	0.02	0.52	0.83	0.68
C8	0.03	0.01	0.23	0.09	0.00	0.10	0.01	0.35	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.32	0.23	0.04	0.76	0.04	0.70	1.35	1.08
N1	0.04	0.02	0.33	0.61	0.01	0.22	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.35	0.09	0.00	0.02	0.32	0.38	0.35
N2	0.08	0.01	0.49	0.83	0.01	0.34	0.01	0.66	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.21	0.55	0.16	0.38	0.05	0.04	0.36	0.19
N3	0.07	0.01	0.40	0.67	0.01	0.28	0.01	0.44	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.13	0.34	0.13	0.12	0.05	0.12	0.02	0.10
N7	0.01	0.01	0.13	0.03	0.01	0.06	0.00	0.28	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.29	0.12	0.01	0.70	0.03	0.77	1.45	1.13
N9	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.09	0.00	0.45	0.04	0.43	0.75	0.66
O2'	0.03	0.13	0.00	0.02	0.02	0.23	0.13	0.01	0.07	0.32	0.04	0.21	0.13	0.29	0.12	0.00	0.04	0.17	0.38	0.10	0.20	0.36	0.36
O3'	0.24	0.42	0.00	0.01	0.13	0.01	0.07	0.20	0.20	0.23	0.35	0.55	0.34	0.12	0.09	0.04	0.00	0.19	0.04	0.19	0.04	0.48	0.15
O4'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.09	0.16	0.13	0.01	0.00	0.17	0.19	0.00	0.05	0.02	0.03	0.11	0.00
O5'	0.31	0.17	0.62	0.26	0.20	0.01	0.39	0.00	0.25	0.76	0.00	0.38	0.12	0.70	0.45	0.38	0.04	0.05	0.00	0.32	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.04	0.16	0.40	0.03	0.12	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.03	0.04	0.10	0.19	0.02	0.32	0.00	0.62	1.05	0.82
OP1	0.20	0.13	0.54	0.32	0.35	0.12	0.56	0.36	0.52	0.70	0.32	0.04	0.12	0.77	0.43	0.20	0.04	0.03	0.02	0.62	0.00	0.00	0.01
OP2	0.34	0.01	0.59	0.00	0.53	0.31	0.96	0.28	0.83	1.35	0.38	0.36	0.02	1.45	0.75	0.36	0.48	0.11	0.02	1.05	0.00	0.00	0.00
P	0.36	0.08	0.62	0.18	0.48	0.06	0.79	0.01	0.68	1.08	0.35	0.19	0.10	1.13	0.66	0.36	0.15	0.00	0.00	0.82	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.07	0.14	0.25	0.01	0.00	0.07	0.03	0.12	0.13	0.01	0.01	0.09	0.03	0.40	0.18	0.17	0.18	0.14	0.09
C2	0.12	0.05	0.15	0.20	0.01	0.03	0.06	0.03	0.11	0.11	0.02	0.01	0.06	0.01	0.29	0.18	0.22	0.21	0.27	0.03
C2'	0.17	0.36	0.35	0.40	0.43	0.20	0.33	0.23	0.24	0.24	0.47	0.48	0.35	0.13	0.45	0.11	0.05	0.05	0.42	0.16
C3'	0.51	0.74	0.72	0.79	0.90	0.52	0.79	0.56	0.67	0.63	0.90	0.97	0.68	0.44	0.83	0.42	0.32	0.36	0.72	0.45
C4	0.11	0.01	0.16	0.24	0.03	0.01	0.03	0.03	0.09	0.09	0.06	0.05	0.01	0.01	0.36	0.15	0.15	0.16	0.21	0.04
C4'	0.13	0.35	0.45	0.56	0.58	0.20	0.49	0.24	0.34	0.27	0.54	0.69	0.24	0.15	0.68	0.02	0.07	0.02	0.26	0.03
C5	0.11	0.01	0.14	0.22	0.02	0.02	0.05	0.04	0.10	0.08	0.06	0.04	0.04	0.02	0.33	0.13	0.10	0.14	0.20	0.04
C5'	0.28	0.69	0.60	0.72	1.07	0.29	0.92	0.36	0.69	0.55	0.99	1.26	0.50	0.18	0.79	0.13	0.02	0.07	0.33	0.08
C6	0.12	0.00	0.12	0.16	0.00	0.02	0.07	0.00	0.12	0.10	0.05	0.01	0.07	0.03	0.25	0.14	0.12	0.17	0.22	0.04
C8	0.09	0.02	0.17	0.27	0.05	0.06	0.01	0.10	0.07	0.06	0.09	0.08	0.04	0.01	0.39	0.10	0.04	0.09	0.18	0.03
N1	0.13	0.03	0.12	0.15	0.02	0.04	0.08	0.04	0.13	0.12	0.03	0.00	0.01	0.01	0.24	0.17	0.20	0.20	0.26	0.03
N2	0.09	0.07	0.16	0.19	0.02	0.04	0.06	0.05	0.09	0.10	0.01	0.00	0.11	0.03	0.28	0.18	0.26	0.22	0.32	0.01
N3	0.11	0.03	0.17	0.24	0.02	0.00	0.04	0.00	0.09	0.09	0.05	0.04	0.05	0.01	0.35	0.16	0.19	0.18	0.25	0.03
N7	0.08	0.03	0.15	0.24	0.04	0.06	0.03	0.10	0.07	0.06	0.08	0.06	0.07	0.01	0.36	0.09	0.02	0.09	0.18	0.02
N9	0.10	0.01	0.17	0.26	0.04	0.03	0.03	0.06	0.08	0.08	0.07	0.06	0.00	0.01	0.39	0.13	0.11	0.14	0.19	0.04
O2'	0.13	0.03	0.01	0.06	0.06	0.08	0.05	0.06	0.12	0.09	0.12	0.10	0.06	0.17	0.12	0.16	0.18	0.22	0.21	0.08
O3'	0.27	0.46	0.46	0.53	0.60	0.31	0.50	0.34	0.39	0.37	0.61	0.67	0.40	0.22	0.59	0.20	0.12	0.16	0.58	0.29
O4'	0.17	0.06	0.21	0.34	0.10	0.01	0.05	0.03	0.05	0.10	0.07	0.16	0.15	0.02	0.53	0.25	0.26	0.23	0.03	0.18
O5'	0.00	0.47	0.31	0.47	0.91	0.03	0.74	0.13	0.47	0.31	0.80	1.13	0.26	0.15	0.55	0.13	0.24	0.16	0.09	0.17
O6	0.12	0.02	0.07	0.10	0.01	0.03	0.08	0.01	0.13	0.09	0.05	0.00	0.12	0.06	0.17	0.12	0.08	0.16	0.20	0.04
OP1	0.37	0.17	0.04	0.23	0.74	0.33	0.57	0.23	0.24	0.02	0.57	1.03	0.10	0.47	0.36	0.55	0.71	0.59	0.51	0.70
OP2	0.51	0.25	0.32	0.21	0.88	0.65	0.59	0.54	0.17	0.02	0.75	1.26	0.01	0.90	0.26	0.70	0.92	0.84	0.54	0.86
P	0.39	0.24	0.09	0.07	0.82	0.43	0.60	0.31	0.24	0.03	0.68	1.15	0.02	0.63	0.12	0.57	0.73	0.63	0.41	0.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.02	0.00	0.00	0.05	0.07	0.59	0.20
C2	0.03	0.00	0.19	0.22	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.25	0.05	0.14	0.10	0.65	0.19
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.03	0.15	0.06	0.33	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.51	0.10
C3'	0.02	0.22	0.00	0.00	0.13	0.00	0.03	0.01	0.02	0.09	0.20	0.14	0.31	0.02	0.00	0.00	0.01	0.22	0.47	0.03
C4	0.00	0.01	0.05	0.13	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.17	0.04	0.13	0.08	0.87	0.29
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.10	0.09	0.01	0.01	0.01	0.14	0.37	0.05
C5	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	1.05	0.39
C5'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.03	0.01	0.04	0.06	0.09	0.02	0.01	0.00	0.19	0.34	0.00
C6	0.01	0.00	0.10	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03	0.01	0.01	1.02	0.40
N1	0.00	0.01	0.03	0.09	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.07	0.05	0.77	0.27
N3	0.01	0.01	0.15	0.20	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.08	0.25	0.07	0.18	0.13	0.70	0.20
N4	0.00	0.02	0.06	0.14	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.20	0.04	0.13	0.08	0.90	0.30
O2	0.08	0.00	0.33	0.31	0.01	0.10	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.23	0.36	0.03	0.13	0.09	0.51	0.15
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.01	0.09	0.05	0.09	0.07	0.01	0.08	0.01	0.23	0.00	0.02	0.09	0.13	0.02	0.45	0.16
O3'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.17	0.01	0.05	0.02	0.02	0.09	0.25	0.20	0.36	0.02	0.00	0.01	0.05	0.27	0.30	0.08
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.04	0.03	0.09	0.01	0.00	0.06	0.04	0.53	0.20
O5'	0.05	0.14	0.00	0.01	0.13	0.01	0.04	0.00	0.01	0.07	0.18	0.13	0.13	0.13	0.05	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01
OP1	0.07	0.10	0.15	0.22	0.08	0.14	0.01	0.19	0.01	0.05	0.13	0.08	0.09	0.02	0.27	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00
OP2	0.59	0.65	0.51	0.47	0.87	0.37	1.05	0.34	1.02	0.77	0.70	0.90	0.51	0.45	0.30	0.53	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.20	0.19	0.10	0.03	0.29	0.05	0.39	0.00	0.40	0.27	0.20	0.30	0.15	0.16	0.08	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00