Doublet Group distance statistics: 49794

back

Distances from reference structure (by RMSD)

4, 7, 14, 13, 4, 7, 0, 5, 3, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C2	A	0, -0.004, 0.013, 0.029, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.013 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.013, 0.031, 0.048, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.031 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.027 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.002, 0.018, 0.038, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.018 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.016, 0.036, 0.057, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.036 std_dev=0.021
N2	A	0, -0.004, 0.035, 0.075, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.035 std_dev=0.040
O4'	A	0, -0.004, 0.085, 0.175, 0.453 max_d=0.453 avg_d=0.085 std_dev=0.090
C2'	A	0, -0.020, 0.093, 0.206, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.093 std_dev=0.113
O2'	A	0, 0.010, 0.141, 0.272, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.141 std_dev=0.131
C4'	A	0, -0.023, 0.134, 0.290, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.134 std_dev=0.156
C3'	A	0, -0.026, 0.142, 0.310, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.142 std_dev=0.168
O2	B	0, 0.109, 0.287, 0.465, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.287 std_dev=0.178
C2	B	0, 0.121, 0.304, 0.486, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.304 std_dev=0.183
O5'	A	0, 0.030, 0.226, 0.423, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.226 std_dev=0.196
N3	B	0, 0.085, 0.307, 0.529, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.307 std_dev=0.222
O3'	A	0, -0.005, 0.225, 0.454, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.225 std_dev=0.229
P	A	0, 0.003, 0.244, 0.485, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.244 std_dev=0.241
N1	B	0, 0.134, 0.395, 0.656, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.395 std_dev=0.261
C4	B	0, 0.117, 0.379, 0.641, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.379 std_dev=0.262
OP1	A	0, 0.019, 0.302, 0.585, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.302 std_dev=0.283
C5'	A	0, -0.077, 0.212, 0.502, 1.441 max_d=1.441 avg_d=0.212 std_dev=0.289
OP2	A	0, 0.015, 0.311, 0.607, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.311 std_dev=0.296
C5	B	0, 0.144, 0.452, 0.760, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.452 std_dev=0.308
O4	B	0, 0.117, 0.435, 0.753, 1.963 max_d=1.963 avg_d=0.435 std_dev=0.318
C1'	B	0, 0.111, 0.442, 0.773, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.442 std_dev=0.331
C6	B	0, 0.130, 0.463, 0.796, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.463 std_dev=0.333
C2'	B	0, 0.108, 0.459, 0.811, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.459 std_dev=0.352
O2'	B	0, 0.067, 0.478, 0.890, 2.455 max_d=2.455 avg_d=0.478 std_dev=0.411
C3'	B	0, 0.094, 0.510, 0.926, 1.631 max_d=1.631 avg_d=0.510 std_dev=0.416
O4'	B	0, 0.085, 0.507, 0.930, 1.906 max_d=1.906 avg_d=0.507 std_dev=0.422
O5'	B	0, 0.130, 0.562, 0.995, 1.841 max_d=1.841 avg_d=0.562 std_dev=0.432
OP2	B	0, 0.307, 0.740, 1.174, 1.993 max_d=1.993 avg_d=0.740 std_dev=0.433
P	B	0, 0.232, 0.686, 1.139, 1.885 max_d=1.885 avg_d=0.686 std_dev=0.454
C4'	B	0, 0.074, 0.543, 1.013, 1.951 max_d=1.951 avg_d=0.543 std_dev=0.469
O3'	B	0, 0.080, 0.558, 1.036, 2.195 max_d=2.195 avg_d=0.558 std_dev=0.478
OP1	B	0, 0.262, 0.767, 1.273, 2.235 max_d=2.235 avg_d=0.767 std_dev=0.505
C5'	B	0, 0.071, 0.601, 1.130, 2.227 max_d=2.227 avg_d=0.601 std_dev=0.530

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.02	0.09	0.04	0.06
C2	0.04	0.00	0.10	0.08	0.01	0.12	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.09	0.08	0.19	0.01	0.12	0.11	0.11
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.07	0.12	0.09	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.14	0.04	0.14	0.16	0.12
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.03	0.07	0.10	0.07	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.22	0.05	0.24	0.22	0.20
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.04	0.13	0.01	0.10	0.07	0.07
C4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.10	0.14	0.11	0.02	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.11	0.06	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.03	0.13	0.01	0.12	0.08	0.08
C5'	0.02	0.23	0.01	0.02	0.13	0.01	0.11	0.00	0.15	0.04	0.20	0.27	0.20	0.07	0.06	0.04	0.05	0.01	0.01	0.15	0.19	0.09	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.05	0.15	0.01	0.12	0.09	0.09
C8	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.04	0.09	0.02	0.14	0.08	0.11
N1	0.03	0.00	0.07	0.07	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.07	0.18	0.01	0.12	0.10	0.10
N2	0.06	0.01	0.12	0.10	0.01	0.14	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.12	0.10	0.22	0.02	0.16	0.14	0.15
N3	0.04	0.01	0.09	0.07	0.00	0.11	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.07	0.07	0.17	0.01	0.11	0.09	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.10	0.02	0.15	0.09	0.11
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.11	0.06	0.08
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.04	0.05	0.04	0.09	0.14	0.10	0.03	0.02	0.00	0.04	0.05	0.07	0.05	0.10	0.13	0.08
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.06	0.04	0.08	0.12	0.07	0.05	0.03	0.04	0.00	0.01	0.24	0.06	0.30	0.33	0.27
O4'	0.00	0.08	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.10	0.07	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.05	0.08	0.08	0.09
O5'	0.05	0.19	0.14	0.22	0.13	0.02	0.13	0.01	0.15	0.09	0.18	0.22	0.17	0.10	0.08	0.07	0.24	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.06	0.05	0.15	0.00	0.14	0.10	0.10
OP1	0.09	0.12	0.14	0.24	0.10	0.11	0.12	0.19	0.12	0.14	0.12	0.16	0.11	0.15	0.11	0.10	0.30	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.11	0.16	0.22	0.07	0.06	0.08	0.09	0.09	0.08	0.10	0.14	0.09	0.09	0.06	0.13	0.33	0.08	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.12	0.20	0.07	0.02	0.08	0.02	0.09	0.11	0.10	0.15	0.09	0.11	0.08	0.08	0.27	0.09	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.10	0.12	0.12	0.13	0.11	0.11	0.11	0.09	0.10	0.12	0.11	0.11	0.14	0.16	0.13	0.11	0.15	0.13	0.11
C2	0.11	0.10	0.12	0.13	0.14	0.11	0.12	0.11	0.10	0.10	0.13	0.11	0.13	0.14	0.17	0.12	0.12	0.14	0.16	0.13
C2'	0.11	0.12	0.13	0.13	0.18	0.12	0.15	0.11	0.11	0.11	0.17	0.11	0.12	0.15	0.23	0.13	0.12	0.14	0.16	0.12
C3'	0.12	0.11	0.12	0.13	0.17	0.12	0.14	0.12	0.11	0.11	0.15	0.12	0.11	0.15	0.21	0.14	0.11	0.13	0.16	0.12
C4	0.10	0.09	0.12	0.12	0.12	0.11	0.10	0.10	0.08	0.09	0.12	0.10	0.12	0.14	0.15	0.12	0.11	0.14	0.13	0.11
C4'	0.13	0.13	0.10	0.10	0.15	0.11	0.13	0.11	0.11	0.12	0.14	0.15	0.11	0.12	0.18	0.14	0.10	0.14	0.13	0.10
C5	0.11	0.10	0.13	0.13	0.11	0.11	0.09	0.11	0.09	0.09	0.12	0.11	0.13	0.15	0.13	0.13	0.11	0.16	0.12	0.11
C5'	0.19	0.22	0.13	0.12	0.22	0.15	0.20	0.14	0.18	0.19	0.23	0.25	0.15	0.12	0.24	0.20	0.13	0.16	0.15	0.14
C6	0.10	0.11	0.13	0.13	0.11	0.10	0.09	0.10	0.09	0.09	0.12	0.12	0.14	0.16	0.13	0.11	0.11	0.15	0.13	0.10
C8	0.11	0.10	0.13	0.12	0.12	0.12	0.09	0.12	0.09	0.09	0.12	0.11	0.12	0.16	0.14	0.14	0.11	0.17	0.12	0.11
N1	0.11	0.09	0.13	0.13	0.11	0.11	0.09	0.11	0.08	0.09	0.11	0.09	0.14	0.15	0.13	0.11	0.11	0.13	0.14	0.11
N2	0.14	0.14	0.14	0.14	0.18	0.13	0.16	0.14	0.14	0.13	0.17	0.14	0.14	0.15	0.21	0.14	0.15	0.16	0.20	0.17
N3	0.11	0.10	0.11	0.12	0.14	0.11	0.12	0.10	0.10	0.09	0.13	0.10	0.11	0.14	0.17	0.12	0.11	0.13	0.15	0.12
N7	0.12	0.11	0.14	0.13	0.12	0.12	0.10	0.13	0.10	0.10	0.12	0.12	0.14	0.17	0.13	0.14	0.12	0.18	0.13	0.12
N9	0.10	0.09	0.12	0.12	0.12	0.11	0.09	0.11	0.08	0.09	0.12	0.10	0.11	0.14	0.15	0.13	0.11	0.15	0.12	0.10
O2'	0.12	0.14	0.14	0.14	0.20	0.12	0.16	0.12	0.13	0.12	0.19	0.13	0.13	0.16	0.25	0.13	0.13	0.14	0.17	0.13
O3'	0.12	0.13	0.12	0.13	0.21	0.12	0.17	0.11	0.13	0.12	0.18	0.12	0.11	0.15	0.26	0.13	0.12	0.13	0.18	0.13
O4'	0.12	0.11	0.11	0.12	0.13	0.11	0.11	0.11	0.10	0.11	0.12	0.13	0.10	0.14	0.16	0.13	0.11	0.15	0.14	0.12
O5'	0.24	0.24	0.25	0.28	0.32	0.25	0.33	0.26	0.30	0.26	0.28	0.21	0.23	0.28	0.34	0.24	0.28	0.26	0.31	0.29
O6	0.11	0.14	0.17	0.15	0.13	0.11	0.12	0.11	0.11	0.12	0.14	0.16	0.16	0.19	0.14	0.13	0.12	0.16	0.14	0.12
OP1	0.19	0.18	0.20	0.24	0.26	0.21	0.28	0.23	0.25	0.20	0.21	0.18	0.19	0.25	0.29	0.19	0.24	0.23	0.27	0.25
OP2	0.16	0.17	0.16	0.18	0.24	0.16	0.25	0.18	0.22	0.18	0.20	0.17	0.15	0.19	0.28	0.16	0.20	0.21	0.26	0.23
P	0.17	0.18	0.18	0.21	0.26	0.18	0.27	0.20	0.24	0.19	0.21	0.16	0.16	0.22	0.29	0.17	0.22	0.21	0.27	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.07	0.06
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.09	0.10	0.16	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.09	0.00	0.02	0.04	0.00	0.04	0.10	0.07	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.02	0.05	0.04	0.07	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.06	0.13	0.10	0.08
C4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.02	0.13	0.17	0.23	0.18
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.03	0.14	0.17	0.22	0.18
C5'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.08	0.01	0.10	0.00	0.08	0.04	0.06	0.05	0.03	0.03	0.09	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.11	0.12	0.16	0.14
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.08	0.08	0.13	0.10
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01	0.02	0.11	0.14	0.20	0.15
O2	0.04	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.08	0.09	0.14	0.11
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.06	0.10	0.00	0.04	0.05	0.03	0.03	0.11	0.06	0.04
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.08	0.01	0.07	0.03	0.06	0.04	0.09	0.11	0.04	0.00	0.09	0.01	0.09	0.21	0.16	0.14
O4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.02	0.14	0.20	0.25	0.20
O4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.08	0.08
O5'	0.04	0.09	0.04	0.06	0.13	0.01	0.14	0.01	0.11	0.08	0.11	0.08	0.03	0.09	0.14	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.10	0.10	0.13	0.17	0.07	0.17	0.05	0.12	0.08	0.14	0.09	0.11	0.21	0.20	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.16	0.07	0.10	0.23	0.03	0.22	0.02	0.16	0.13	0.20	0.14	0.06	0.16	0.25	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.12	0.05	0.08	0.18	0.02	0.18	0.01	0.14	0.10	0.15	0.11	0.04	0.14	0.20	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00