Doublet Group distance statistics: 49797

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 4, 3, 3, 3, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.007, 0.021, 0.036, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.037, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.017, 0.033, 0.050, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.033 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.013, 0.031, 0.049, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.031 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.023, 0.043, 0.064, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.043 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.020, 0.041, 0.062, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.041 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.011, 0.041, 0.070, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.041 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.023, 0.054, 0.084, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.054 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.018, 0.052, 0.085, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.052 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.070, 0.205, 0.341, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.205 std_dev=0.135
C2'	A	0, 0.048, 0.239, 0.430, 0.669 max_d=0.669 avg_d=0.239 std_dev=0.191
C4	B	0, 0.324, 0.531, 0.738, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.531 std_dev=0.207
N3	B	0, 0.318, 0.533, 0.748, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.533 std_dev=0.215
O4	B	0, 0.370, 0.594, 0.818, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.594 std_dev=0.224
C4'	A	0, 0.156, 0.385, 0.615, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.385 std_dev=0.230
C2	B	0, 0.315, 0.552, 0.789, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.552 std_dev=0.237
O2	B	0, 0.348, 0.610, 0.872, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.610 std_dev=0.262
C5	B	0, 0.269, 0.531, 0.794, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.531 std_dev=0.262
O2'	A	0, 0.357, 0.631, 0.905, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.631 std_dev=0.274
N1	B	0, 0.292, 0.571, 0.849, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.571 std_dev=0.278
C6	B	0, 0.234, 0.550, 0.865, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.550 std_dev=0.316
C1'	B	0, 0.359, 0.680, 1.000, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.680 std_dev=0.321
C3'	A	0, 0.342, 0.676, 1.010, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.676 std_dev=0.334
O2'	B	0, 0.375, 0.733, 1.091, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.733 std_dev=0.358
C2'	B	0, 0.359, 0.734, 1.109, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.734 std_dev=0.375
O4'	B	0, 0.371, 0.772, 1.173, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.772 std_dev=0.401
C3'	B	0, 0.320, 0.800, 1.280, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.800 std_dev=0.480
C4'	B	0, 0.324, 0.812, 1.300, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.812 std_dev=0.488
C5'	A	0, 0.289, 0.779, 1.268, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.779 std_dev=0.489
O5'	B	0, 0.333, 0.826, 1.320, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.826 std_dev=0.493
C5'	B	0, 0.346, 0.873, 1.401, 1.916 max_d=1.916 avg_d=0.873 std_dev=0.527
O3'	B	0, 0.410, 0.937, 1.465, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.937 std_dev=0.528
OP2	B	0, 0.461, 1.076, 1.690, 2.024 max_d=2.024 avg_d=1.076 std_dev=0.614
P	B	0, 0.438, 1.064, 1.690, 1.997 max_d=1.997 avg_d=1.064 std_dev=0.626
OP1	B	0, 0.594, 1.326, 2.057, 2.500 max_d=2.500 avg_d=1.326 std_dev=0.732
O3'	A	0, 0.522, 1.286, 2.050, 2.099 max_d=2.099 avg_d=1.286 std_dev=0.764
O5'	A	0, 0.953, 1.768, 2.582, 2.836 max_d=2.836 avg_d=1.768 std_dev=0.814
OP1	A	0, 1.148, 2.150, 3.152, 4.420 max_d=4.420 avg_d=2.150 std_dev=1.002
P	A	0, 0.696, 1.703, 2.709, 3.169 max_d=3.169 avg_d=1.703 std_dev=1.006
OP2	A	0, 1.026, 2.230, 3.434, 5.276 max_d=5.276 avg_d=2.230 std_dev=1.204

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.11	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.03	0.31	0.02	0.31	0.03	0.74	0.47	0.44
C2	0.04	0.00	0.08	0.10	0.01	0.11	0.01	0.18	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.56	0.11	0.39	0.02	0.89	0.73	0.60
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.04	0.06	0.19	0.06	0.11	0.06	0.10	0.08	0.10	0.05	0.01	0.09	0.04	0.33	0.08	0.74	0.35	0.38
C3'	0.04	0.10	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.03	0.05	0.15	0.06	0.15	0.10	0.13	0.05	0.02	0.01	0.02	0.20	0.07	0.53	0.32	0.23
C4	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.39	0.07	0.46	0.02	0.92	0.75	0.65
C4'	0.03	0.11	0.04	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.19	0.08	0.17	0.11	0.17	0.07	0.11	0.07	0.01	0.04	0.10	0.42	0.31	0.17
C5	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.09	0.00	0.36	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.30	0.06	0.57	0.02	1.03	0.93	0.80
C5'	0.11	0.18	0.19	0.03	0.25	0.01	0.36	0.00	0.35	0.47	0.26	0.15	0.15	0.48	0.28	0.10	0.14	0.03	0.02	0.40	0.34	0.22	0.06
C6	0.03	0.02	0.06	0.05	0.01	0.08	0.01	0.35	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.20	0.37	0.07	0.56	0.01	1.04	0.97	0.81
C8	0.02	0.02	0.11	0.15	0.01	0.19	0.01	0.47	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.29	0.12	0.09	0.65	0.03	1.03	0.91	0.82
N1	0.03	0.01	0.06	0.06	0.01	0.08	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.48	0.10	0.47	0.02	0.97	0.85	0.71
N2	0.05	0.01	0.10	0.15	0.01	0.17	0.01	0.15	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.65	0.14	0.35	0.03	0.85	0.69	0.54
N3	0.03	0.01	0.08	0.10	0.01	0.11	0.01	0.15	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.54	0.11	0.36	0.02	0.85	0.66	0.55
N7	0.02	0.01	0.10	0.13	0.01	0.17	0.00	0.48	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.16	0.08	0.68	0.02	1.10	1.05	0.90
N9	0.01	0.02	0.05	0.05	0.01	0.07	0.01	0.28	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.14	0.26	0.05	0.48	0.02	0.90	0.69	0.63
O2'	0.03	0.14	0.01	0.02	0.11	0.11	0.21	0.10	0.20	0.29	0.13	0.20	0.14	0.30	0.14	0.00	0.14	0.07	0.31	0.25	0.80	0.37	0.37
O3'	0.31	0.56	0.09	0.01	0.39	0.07	0.30	0.14	0.37	0.12	0.48	0.65	0.54	0.16	0.26	0.14	0.00	0.20	0.34	0.33	0.60	0.55	0.42
O4'	0.02	0.11	0.04	0.02	0.07	0.01	0.06	0.03	0.07	0.09	0.10	0.14	0.11	0.08	0.05	0.07	0.20	0.00	0.31	0.07	0.69	0.47	0.44
O5'	0.31	0.39	0.33	0.20	0.46	0.04	0.57	0.02	0.56	0.65	0.47	0.35	0.36	0.68	0.48	0.31	0.34	0.31	0.00	0.62	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.08	0.07	0.02	0.10	0.02	0.40	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.25	0.33	0.07	0.62	0.00	1.10	1.08	0.89
OP1	0.74	0.89	0.74	0.53	0.92	0.42	1.03	0.34	1.04	1.03	0.97	0.85	0.85	1.10	0.90	0.80	0.60	0.69	0.02	1.10	0.00	0.01	0.01
OP2	0.47	0.73	0.35	0.32	0.75	0.31	0.93	0.22	0.97	0.91	0.85	0.69	0.66	1.05	0.69	0.37	0.55	0.47	0.02	1.08	0.01	0.00	0.01
P	0.44	0.60	0.38	0.23	0.65	0.17	0.80	0.06	0.81	0.82	0.71	0.54	0.55	0.90	0.63	0.37	0.42	0.44	0.01	0.89	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.17	0.21	0.21	0.20	0.30	0.20	0.35	0.22	0.20	0.19	0.16	0.21	0.19	0.22	0.32	0.24	0.29	0.30	0.25
C2	0.20	0.15	0.19	0.18	0.19	0.21	0.18	0.23	0.18	0.17	0.18	0.14	0.17	0.18	0.21	0.25	0.19	0.20	0.30	0.21
C2'	0.22	0.19	0.24	0.22	0.21	0.28	0.20	0.33	0.20	0.19	0.21	0.19	0.24	0.24	0.24	0.28	0.23	0.29	0.27	0.24
C3'	0.22	0.20	0.23	0.22	0.23	0.28	0.21	0.32	0.21	0.20	0.23	0.19	0.24	0.23	0.26	0.29	0.21	0.27	0.27	0.23
C4	0.22	0.17	0.18	0.19	0.19	0.28	0.20	0.32	0.21	0.19	0.19	0.16	0.17	0.17	0.21	0.30	0.21	0.25	0.29	0.23
C4'	0.25	0.20	0.22	0.21	0.23	0.31	0.24	0.36	0.25	0.23	0.22	0.19	0.22	0.20	0.25	0.33	0.24	0.29	0.33	0.28
C5	0.23	0.18	0.18	0.21	0.20	0.31	0.22	0.36	0.23	0.21	0.19	0.18	0.17	0.18	0.20	0.32	0.25	0.30	0.30	0.27
C5'	0.39	0.30	0.39	0.39	0.29	0.46	0.33	0.51	0.36	0.35	0.28	0.28	0.41	0.39	0.29	0.47	0.41	0.47	0.53	0.48
C6	0.22	0.19	0.18	0.20	0.20	0.29	0.22	0.33	0.24	0.21	0.19	0.19	0.17	0.18	0.20	0.31	0.23	0.26	0.29	0.24
C8	0.23	0.18	0.20	0.22	0.20	0.34	0.22	0.41	0.24	0.21	0.19	0.18	0.19	0.20	0.20	0.34	0.30	0.37	0.33	0.32
N1	0.19	0.16	0.16	0.17	0.19	0.22	0.19	0.24	0.20	0.18	0.18	0.16	0.15	0.15	0.20	0.26	0.19	0.20	0.28	0.20
N2	0.20	0.17	0.22	0.22	0.21	0.20	0.19	0.21	0.18	0.18	0.20	0.16	0.20	0.22	0.24	0.23	0.25	0.25	0.36	0.26
N3	0.20	0.16	0.19	0.18	0.19	0.23	0.18	0.26	0.18	0.17	0.19	0.15	0.18	0.18	0.22	0.27	0.19	0.21	0.29	0.20
N7	0.24	0.19	0.20	0.24	0.21	0.35	0.24	0.43	0.26	0.23	0.19	0.19	0.20	0.22	0.21	0.35	0.31	0.39	0.35	0.34
N9	0.23	0.17	0.19	0.20	0.19	0.30	0.20	0.36	0.22	0.20	0.19	0.16	0.19	0.18	0.21	0.32	0.25	0.30	0.30	0.26
O2'	0.27	0.24	0.30	0.31	0.26	0.39	0.23	0.43	0.24	0.23	0.27	0.24	0.32	0.34	0.29	0.34	0.33	0.43	0.28	0.34
O3'	0.49	0.56	0.47	0.46	0.61	0.50	0.57	0.52	0.53	0.53	0.61	0.56	0.45	0.43	0.65	0.50	0.48	0.52	0.45	0.47
O4'	0.26	0.20	0.20	0.22	0.22	0.33	0.25	0.39	0.26	0.24	0.21	0.18	0.20	0.18	0.24	0.36	0.28	0.33	0.36	0.31
O5'	0.62	0.49	0.61	0.66	0.48	0.72	0.52	0.76	0.56	0.55	0.46	0.47	0.63	0.68	0.46	0.72	0.65	0.71	0.68	0.69
O6	0.24	0.21	0.21	0.25	0.22	0.32	0.26	0.37	0.27	0.24	0.21	0.22	0.22	0.24	0.22	0.34	0.27	0.30	0.32	0.29
OP1	1.08	0.99	1.10	1.16	0.98	1.19	1.02	1.24	1.05	1.04	0.97	0.97	1.10	1.19	0.96	1.15	1.15	1.23	1.10	1.17
OP2	1.01	0.87	1.02	1.06	0.88	1.11	0.93	1.16	0.97	0.94	0.86	0.84	1.03	1.07	0.86	1.10	1.06	1.11	1.09	1.11
P	0.84	0.72	0.85	0.90	0.72	0.95	0.77	1.00	0.80	0.78	0.70	0.70	0.85	0.91	0.70	0.93	0.89	0.95	0.90	0.93

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.10	0.11	0.14	0.09
C2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.04	0.23	0.22	0.29	0.22
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.02	0.05	0.04	0.08	0.13	0.01	0.02	0.06	0.01	0.15	0.17	0.14	0.12
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.07	0.01	0.05	0.03	0.04	0.04	0.09	0.12	0.02	0.01	0.07	0.02	0.20	0.23	0.14	0.16
C4	0.03	0.02	0.07	0.07	0.00	0.08	0.01	0.17	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.08	0.01	0.06	0.36	0.38	0.45	0.38
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.08	0.05	0.06	0.06	0.07	0.02	0.08	0.01	0.03	0.10	0.15	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.05	0.38	0.39	0.43	0.40
C5'	0.03	0.10	0.02	0.03	0.17	0.01	0.18	0.00	0.16	0.10	0.13	0.08	0.07	0.06	0.18	0.03	0.01	0.12	0.21	0.05
C6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.05	0.33	0.31	0.30	0.31
N1	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.04	0.23	0.21	0.24	0.20
N3	0.03	0.01	0.08	0.09	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.10	0.01	0.05	0.29	0.30	0.39	0.30
O2	0.05	0.01	0.13	0.12	0.02	0.06	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.15	0.03	0.06	0.17	0.17	0.26	0.17
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.08	0.07	0.05	0.07	0.04	0.04	0.09	0.13	0.00	0.05	0.08	0.06	0.05	0.12	0.11	0.07
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.08	0.02	0.05	0.06	0.05	0.05	0.10	0.15	0.05	0.00	0.09	0.01	0.18	0.26	0.17	0.17
O4	0.03	0.02	0.06	0.07	0.01	0.08	0.01	0.18	0.02	0.02	0.01	0.03	0.08	0.09	0.00	0.05	0.38	0.43	0.51	0.42
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.06	0.06	0.01	0.05	0.00	0.06	0.09	0.16	0.09
O5'	0.10	0.23	0.15	0.20	0.36	0.03	0.38	0.01	0.33	0.23	0.29	0.17	0.05	0.18	0.38	0.06	0.00	0.04	0.04	0.01
OP1	0.11	0.22	0.17	0.23	0.38	0.10	0.39	0.12	0.31	0.21	0.30	0.17	0.12	0.26	0.43	0.09	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.29	0.14	0.14	0.45	0.15	0.43	0.21	0.30	0.24	0.39	0.26	0.11	0.17	0.51	0.16	0.04	0.02	0.00	0.00
P	0.09	0.22	0.12	0.16	0.38	0.05	0.40	0.05	0.31	0.20	0.30	0.17	0.07	0.17	0.42	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00