Doublet Group distance statistics: 49803

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 6, 5, 5, 2, 8, 4, 1, 1, 2, 6, 2, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.009, 0.023, 0.038, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.005, 0.020, 0.036, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.032 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.010, 0.029, 0.049, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.010, 0.037, 0.064, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.037 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.016, 0.045, 0.074, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.045 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.017, 0.050, 0.082, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.050 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.025, 0.166, 0.306, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.166 std_dev=0.140
C2'	A	0, 0.038, 0.185, 0.333, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.185 std_dev=0.147
O2'	A	0, 0.076, 0.264, 0.452, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.264 std_dev=0.188
C4'	A	0, 0.046, 0.275, 0.504, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.275 std_dev=0.229
C3'	A	0, 0.043, 0.280, 0.517, 0.965 max_d=0.965 avg_d=0.280 std_dev=0.237
C6	B	0, 0.205, 0.458, 0.711, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.458 std_dev=0.253
N1	B	0, 0.105, 0.400, 0.695, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.400 std_dev=0.295
C5	B	0, 0.262, 0.573, 0.884, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.573 std_dev=0.311
N6	B	0, 0.250, 0.592, 0.935, 1.523 max_d=1.523 avg_d=0.592 std_dev=0.342
O3'	A	0, 0.063, 0.408, 0.752, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.408 std_dev=0.345
C4	B	0, 0.293, 0.645, 0.997, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.645 std_dev=0.352
C5'	A	0, 0.074, 0.442, 0.810, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.442 std_dev=0.368
P	A	0, 0.176, 0.576, 0.976, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.576 std_dev=0.400
O5'	A	0, 0.084, 0.486, 0.889, 1.794 max_d=1.794 avg_d=0.486 std_dev=0.403
OP2	A	0, 0.162, 0.579, 0.995, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.579 std_dev=0.416
C2	B	0, 0.106, 0.536, 0.966, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.536 std_dev=0.430
N7	B	0, 0.336, 0.776, 1.216, 1.903 max_d=1.903 avg_d=0.776 std_dev=0.440
OP1	A	0, 0.229, 0.670, 1.111, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.670 std_dev=0.441
N9	B	0, 0.372, 0.820, 1.269, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.820 std_dev=0.448
N3	B	0, 0.210, 0.670, 1.131, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.670 std_dev=0.460
C8	B	0, 0.373, 0.862, 1.351, 2.102 max_d=2.102 avg_d=0.862 std_dev=0.489
C2'	B	0, 0.443, 1.020, 1.597, 2.890 max_d=2.890 avg_d=1.020 std_dev=0.577
C1'	B	0, 0.432, 1.026, 1.619, 2.426 max_d=2.426 avg_d=1.026 std_dev=0.594
O2'	B	0, 0.601, 1.433, 2.265, 3.253 max_d=3.253 avg_d=1.433 std_dev=0.832
C3'	B	0, 0.548, 1.420, 2.293, 3.931 max_d=3.931 avg_d=1.420 std_dev=0.873
O4'	B	0, 0.267, 1.310, 2.353, 3.729 max_d=3.729 avg_d=1.310 std_dev=1.043
O3'	B	0, 0.474, 1.544, 2.614, 4.402 max_d=4.402 avg_d=1.544 std_dev=1.070
C4'	B	0, 0.341, 1.509, 2.678, 4.070 max_d=4.070 avg_d=1.509 std_dev=1.169
O5'	B	0, 0.219, 1.688, 3.158, 5.136 max_d=5.136 avg_d=1.688 std_dev=1.469
C5'	B	0, 0.154, 1.785, 3.416, 5.401 max_d=5.401 avg_d=1.785 std_dev=1.631
OP2	B	0, 0.201, 2.021, 3.842, 6.293 max_d=6.293 avg_d=2.021 std_dev=1.820
P	B	0, 0.053, 1.936, 3.820, 6.443 max_d=6.443 avg_d=1.936 std_dev=1.884
OP1	B	0, -0.106, 2.091, 4.289, 7.651 max_d=7.651 avg_d=2.091 std_dev=2.197

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.13	0.05
C2	0.03	0.00	0.13	0.13	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.17	0.03	0.25	0.21	0.16	0.18
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.08	0.05	0.11	0.13	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.18	0.22	0.07	0.12
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.02	0.09	0.10	0.12	0.12	0.10	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.25	0.29	0.07	0.17
C4	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.02	0.26	0.21	0.13	0.17
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.06	0.08	0.08	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.10	0.20	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.02	0.33	0.27	0.20	0.24
C5'	0.02	0.10	0.02	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.14	0.13	0.12	0.08	0.16	0.15	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.12	0.27	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.34	0.28	0.23	0.26
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.11	0.03	0.33	0.24	0.13	0.21
N1	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.03	0.30	0.26	0.20	0.23
N3	0.03	0.00	0.13	0.12	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.14	0.03	0.22	0.18	0.13	0.15
N6	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.12	0.03	0.38	0.32	0.29	0.31
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.38	0.29	0.22	0.27
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.24	0.18	0.11	0.14
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.04	0.06	0.03	0.09	0.04	0.13	0.14	0.08	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.08	0.16	0.10	0.05
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.08	0.02	0.08	0.04	0.11	0.11	0.15	0.14	0.12	0.10	0.04	0.04	0.00	0.02	0.21	0.33	0.09	0.18
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.05	0.24	0.10
O5'	0.10	0.25	0.18	0.25	0.26	0.02	0.33	0.01	0.34	0.33	0.30	0.22	0.38	0.38	0.24	0.08	0.21	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.21	0.22	0.29	0.21	0.10	0.27	0.12	0.28	0.24	0.26	0.18	0.32	0.29	0.18	0.16	0.33	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.16	0.07	0.07	0.13	0.20	0.20	0.27	0.23	0.13	0.20	0.13	0.29	0.22	0.11	0.10	0.09	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.18	0.12	0.17	0.17	0.03	0.24	0.02	0.26	0.21	0.23	0.15	0.31	0.27	0.14	0.05	0.18	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.22	0.32	0.36	0.13	0.16	0.16	0.19	0.15	0.20	0.16	0.19	0.23	0.24	0.14	0.24	0.25	0.30	0.30	0.49	0.90	0.52
C2	0.16	0.17	0.38	0.27	0.09	0.41	0.11	0.47	0.14	0.09	0.08	0.19	0.27	0.15	0.09	0.32	0.45	0.57	0.34	0.28	0.65	0.31
C2'	0.15	0.14	0.34	0.34	0.14	0.19	0.18	0.27	0.17	0.22	0.12	0.13	0.23	0.25	0.16	0.26	0.24	0.31	0.25	0.38	0.79	0.42
C3'	0.18	0.13	0.31	0.37	0.16	0.18	0.19	0.27	0.16	0.25	0.12	0.14	0.20	0.26	0.19	0.24	0.21	0.26	0.27	0.44	0.80	0.46
C4	0.12	0.20	0.34	0.31	0.11	0.25	0.13	0.29	0.14	0.15	0.12	0.18	0.25	0.20	0.10	0.24	0.32	0.41	0.28	0.34	0.77	0.39
C4'	0.15	0.18	0.27	0.40	0.14	0.15	0.17	0.22	0.14	0.23	0.15	0.15	0.18	0.25	0.16	0.25	0.19	0.21	0.32	0.59	0.93	0.59
C5	0.12	0.20	0.34	0.30	0.11	0.24	0.13	0.30	0.14	0.14	0.12	0.17	0.25	0.18	0.10	0.24	0.30	0.40	0.28	0.32	0.73	0.37
C5'	0.18	0.18	0.25	0.45	0.16	0.24	0.18	0.32	0.15	0.26	0.16	0.16	0.16	0.26	0.19	0.27	0.21	0.20	0.39	0.68	0.96	0.66
C6	0.13	0.17	0.36	0.26	0.09	0.35	0.11	0.42	0.14	0.10	0.08	0.17	0.26	0.15	0.09	0.29	0.39	0.52	0.33	0.28	0.64	0.32
C8	0.15	0.22	0.31	0.37	0.15	0.14	0.17	0.18	0.16	0.21	0.18	0.19	0.22	0.24	0.16	0.26	0.21	0.26	0.30	0.47	0.87	0.51
N1	0.17	0.16	0.39	0.26	0.10	0.44	0.10	0.51	0.15	0.09	0.08	0.18	0.27	0.14	0.10	0.35	0.47	0.60	0.37	0.29	0.60	0.31
N3	0.13	0.19	0.36	0.29	0.09	0.33	0.12	0.37	0.14	0.12	0.09	0.18	0.26	0.18	0.08	0.27	0.38	0.49	0.30	0.31	0.72	0.35
N6	0.14	0.15	0.36	0.24	0.09	0.38	0.10	0.47	0.15	0.09	0.09	0.16	0.26	0.13	0.09	0.32	0.40	0.54	0.36	0.29	0.59	0.32
N7	0.14	0.22	0.32	0.35	0.14	0.16	0.16	0.20	0.15	0.19	0.17	0.18	0.23	0.22	0.14	0.25	0.23	0.29	0.28	0.39	0.80	0.45
N9	0.13	0.21	0.32	0.35	0.13	0.17	0.16	0.21	0.15	0.19	0.15	0.18	0.24	0.23	0.13	0.24	0.25	0.32	0.29	0.44	0.85	0.48
O2'	0.14	0.16	0.35	0.35	0.14	0.20	0.18	0.26	0.17	0.22	0.13	0.15	0.23	0.25	0.16	0.27	0.26	0.32	0.26	0.40	0.82	0.44
O3'	0.22	0.13	0.33	0.37	0.19	0.22	0.21	0.32	0.18	0.27	0.12	0.14	0.21	0.28	0.22	0.26	0.20	0.27	0.27	0.42	0.75	0.44
O4'	0.14	0.24	0.29	0.41	0.14	0.13	0.16	0.18	0.15	0.22	0.19	0.20	0.21	0.25	0.15	0.28	0.22	0.23	0.36	0.63	1.00	0.64
O5'	0.45	0.57	0.41	0.47	0.47	0.40	0.44	0.37	0.48	0.40	0.55	0.53	0.45	0.40	0.44	0.55	0.43	0.47	0.64	0.83	1.19	0.88
OP1	0.46	0.49	0.41	0.53	0.45	0.46	0.43	0.48	0.44	0.44	0.49	0.47	0.43	0.43	0.45	0.55	0.41	0.47	0.67	0.93	1.21	0.95
OP2	0.45	0.48	0.42	0.51	0.45	0.42	0.43	0.40	0.45	0.43	0.48	0.47	0.44	0.42	0.44	0.55	0.42	0.44	0.63	0.83	1.16	0.88
P	0.42	0.50	0.38	0.48	0.43	0.40	0.41	0.39	0.44	0.40	0.50	0.47	0.43	0.39	0.41	0.55	0.38	0.43	0.65	0.89	1.21	0.92

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.31	0.00	0.27	0.41	0.39	0.27
C2	0.03	0.00	0.40	0.26	0.01	0.19	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.31	0.35	0.22	0.31	0.44	0.21
C2'	0.00	0.40	0.00	0.00	0.21	0.01	0.11	0.20	0.20	0.19	0.32	0.39	0.15	0.09	0.02	0.00	0.04	0.02	0.58	0.81	0.83	0.71
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.24	0.01	0.31	0.01	0.33	0.30	0.30	0.22	0.37	0.34	0.20	0.02	0.01	0.02	0.24	0.49	0.27	0.30
C4	0.02	0.01	0.21	0.24	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.18	0.19	0.26	0.30	0.53	0.30
C4'	0.01	0.19	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.04	0.25	0.11	0.19	0.07	0.20	0.08	0.27	0.02	0.00	0.02	0.28	0.17	0.12
C5	0.01	0.01	0.11	0.31	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.10	0.08	0.32	0.36	0.71	0.44
C5'	0.07	0.27	0.20	0.01	0.12	0.01	0.10	0.00	0.12	0.24	0.20	0.26	0.12	0.21	0.06	0.07	0.21	0.01	0.01	0.12	0.24	0.02
C6	0.02	0.01	0.20	0.33	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.13	0.16	0.29	0.35	0.71	0.41
C8	0.01	0.01	0.19	0.30	0.00	0.25	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.48	0.13	0.20	0.46	0.46	0.77	0.57
N1	0.02	0.00	0.32	0.30	0.01	0.11	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.27	0.23	0.29	0.57	0.28
N3	0.03	0.00	0.39	0.22	0.00	0.19	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.33	0.35	0.23	0.34	0.39	0.21
N6	0.02	0.01	0.15	0.37	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.21	0.13	0.11	0.32	0.45	0.82	0.50
N7	0.01	0.01	0.09	0.34	0.01	0.20	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.44	0.14	0.10	0.44	0.51	0.86	0.61
N9	0.00	0.01	0.02	0.20	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.12	0.01	0.31	0.33	0.54	0.35
O2'	0.02	0.33	0.00	0.02	0.09	0.27	0.20	0.07	0.14	0.48	0.18	0.34	0.21	0.44	0.19	0.00	0.08	0.19	0.46	0.82	0.92	0.67
O3'	0.31	0.31	0.04	0.01	0.18	0.02	0.10	0.21	0.13	0.13	0.22	0.33	0.13	0.14	0.12	0.08	0.00	0.22	0.17	0.21	0.23	0.13
O4'	0.00	0.35	0.02	0.02	0.19	0.00	0.08	0.01	0.16	0.20	0.27	0.35	0.11	0.10	0.01	0.19	0.22	0.00	0.10	0.31	0.15	0.16
O5'	0.27	0.22	0.58	0.24	0.26	0.02	0.32	0.01	0.29	0.46	0.23	0.23	0.32	0.44	0.31	0.46	0.17	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.41	0.31	0.81	0.49	0.30	0.28	0.36	0.12	0.35	0.46	0.29	0.34	0.45	0.51	0.33	0.82	0.21	0.31	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.39	0.44	0.83	0.27	0.53	0.17	0.71	0.24	0.71	0.77	0.57	0.39	0.82	0.86	0.54	0.92	0.23	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.27	0.21	0.71	0.30	0.30	0.12	0.44	0.02	0.41	0.57	0.28	0.21	0.50	0.61	0.35	0.67	0.13	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00