Doublet Group distance statistics: 49808

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.009, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N7	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C8	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.001, 0.016, 0.031, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.015 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.016, 0.041, 0.065, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.041 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.027, 0.116, 0.205, 0.319 max_d=0.319 avg_d=0.116 std_dev=0.089
C2'	A	0, 0.021, 0.127, 0.234, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.127 std_dev=0.107
C4'	A	0, 0.075, 0.240, 0.405, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.240 std_dev=0.165
C3'	A	0, 0.063, 0.229, 0.395, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.229 std_dev=0.166
O2'	A	0, 0.069, 0.251, 0.432, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.251 std_dev=0.182
N1	B	0, 0.153, 0.406, 0.659, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.406 std_dev=0.253
O3'	A	0, 0.106, 0.376, 0.646, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.376 std_dev=0.270
C5'	A	0, 0.141, 0.437, 0.732, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.437 std_dev=0.295
C6	B	0, 0.272, 0.597, 0.921, 1.019 max_d=1.019 avg_d=0.597 std_dev=0.325
C2	B	0, 0.294, 0.664, 1.034, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.664 std_dev=0.370
O5'	A	0, 0.128, 0.526, 0.923, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.526 std_dev=0.398
C5	B	0, 0.357, 0.795, 1.234, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.795 std_dev=0.439
N6	B	0, 0.386, 0.850, 1.314, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.850 std_dev=0.464
C4	B	0, 0.426, 0.937, 1.447, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.937 std_dev=0.510
O3'	B	0, 0.319, 0.846, 1.373, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.846 std_dev=0.527
N3	B	0, 0.430, 0.963, 1.497, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.963 std_dev=0.533
P	A	0, 0.396, 0.949, 1.502, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.949 std_dev=0.553
N7	B	0, 0.456, 1.054, 1.652, 1.602 max_d=1.602 avg_d=1.054 std_dev=0.598
C3'	B	0, 0.290, 0.889, 1.488, 1.928 max_d=1.928 avg_d=0.889 std_dev=0.599
N9	B	0, 0.555, 1.229, 1.903, 1.776 max_d=1.776 avg_d=1.229 std_dev=0.674
C8	B	0, 0.528, 1.223, 1.917, 1.838 max_d=1.838 avg_d=1.223 std_dev=0.694
OP1	A	0, 0.449, 1.151, 1.853, 2.172 max_d=2.172 avg_d=1.151 std_dev=0.702
C2'	B	0, 0.493, 1.198, 1.902, 2.198 max_d=2.198 avg_d=1.198 std_dev=0.705
OP2	A	0, 0.503, 1.210, 1.916, 2.055 max_d=2.055 avg_d=1.210 std_dev=0.707
C1'	B	0, 0.708, 1.575, 2.443, 2.250 max_d=2.250 avg_d=1.575 std_dev=0.867
O2'	B	0, 0.737, 1.791, 2.845, 3.211 max_d=3.211 avg_d=1.791 std_dev=1.054
C4'	B	0, 0.646, 1.719, 2.793, 3.539 max_d=3.539 avg_d=1.719 std_dev=1.073
O4'	B	0, 0.842, 2.021, 3.201, 3.566 max_d=3.566 avg_d=2.021 std_dev=1.179
C5'	B	0, 0.899, 2.517, 4.135, 5.359 max_d=5.359 avg_d=2.517 std_dev=1.618
O5'	B	0, 1.794, 4.265, 6.737, 6.913 max_d=6.913 avg_d=4.265 std_dev=2.472
P	B	0, 2.420, 5.629, 8.837, 8.027 max_d=8.027 avg_d=5.629 std_dev=3.209
OP2	B	0, 2.586, 6.009, 9.432, 8.531 max_d=8.531 avg_d=6.009 std_dev=3.423
OP1	B	0, 2.658, 6.180, 9.701, 8.562 max_d=8.562 avg_d=6.180 std_dev=3.522

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.13	0.33	0.14
C2	0.03	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.12	0.03	0.39	0.25	0.32	0.23
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.22	0.23	0.22	0.10
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.10	0.08	0.10	0.09	0.10	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.27	0.34	0.20	0.16
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.08	0.02	0.38	0.23	0.32	0.22
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.05	0.03	0.08	0.08	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.15	0.32	0.07
C5	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.09	0.02	0.44	0.28	0.36	0.29
C5'	0.03	0.08	0.01	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.15	0.12	0.06	0.18	0.17	0.09	0.05	0.02	0.02	0.01	0.22	0.32	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.46	0.31	0.38	0.31
C8	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.42	0.24	0.34	0.25
N1	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.11	0.02	0.44	0.29	0.36	0.28
N3	0.03	0.00	0.07	0.09	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.10	0.03	0.35	0.21	0.30	0.19
N6	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.12	0.02	0.48	0.35	0.42	0.35
N7	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.02	0.46	0.29	0.37	0.31
N9	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.34	0.19	0.32	0.19
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.09	0.05	0.08	0.05	0.10	0.02	0.13	0.14	0.09	0.04	0.04	0.00	0.03	0.05	0.07	0.14	0.29	0.09
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.02	0.11	0.09	0.11	0.10	0.12	0.10	0.05	0.03	0.00	0.02	0.22	0.43	0.24	0.22
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.11	0.16	0.41	0.22
O5'	0.18	0.39	0.22	0.27	0.38	0.02	0.44	0.01	0.46	0.42	0.44	0.35	0.48	0.46	0.34	0.07	0.22	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.13	0.25	0.23	0.34	0.23	0.15	0.28	0.22	0.31	0.24	0.29	0.21	0.35	0.29	0.19	0.14	0.43	0.16	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.32	0.22	0.20	0.32	0.32	0.36	0.32	0.38	0.34	0.36	0.30	0.42	0.37	0.32	0.29	0.24	0.41	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.23	0.10	0.16	0.22	0.07	0.29	0.02	0.31	0.25	0.28	0.19	0.35	0.31	0.19	0.09	0.22	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.22	0.35	0.33	0.23	0.25	0.30	0.34	0.28	0.37	0.21	0.20	0.38	0.41	0.27	0.61	0.34	0.22	0.52	0.70	1.23	0.82
C2	0.19	0.21	0.27	0.28	0.18	0.13	0.23	0.20	0.26	0.23	0.18	0.21	0.39	0.28	0.18	0.45	0.34	0.25	0.17	0.20	0.85	0.39
C2'	0.27	0.25	0.36	0.31	0.26	0.22	0.32	0.25	0.30	0.38	0.24	0.23	0.41	0.42	0.29	0.58	0.33	0.23	0.39	0.57	1.12	0.70
C3'	0.29	0.22	0.38	0.31	0.25	0.25	0.31	0.30	0.26	0.40	0.19	0.22	0.36	0.42	0.31	0.59	0.31	0.24	0.49	0.70	1.18	0.80
C4	0.20	0.21	0.31	0.31	0.20	0.18	0.27	0.25	0.27	0.30	0.19	0.19	0.40	0.35	0.22	0.55	0.34	0.19	0.35	0.46	1.06	0.62
C4'	0.31	0.22	0.40	0.34	0.27	0.33	0.32	0.42	0.26	0.43	0.20	0.21	0.34	0.45	0.33	0.65	0.34	0.30	0.68	0.92	1.37	1.00
C5	0.20	0.21	0.31	0.31	0.20	0.18	0.26	0.25	0.26	0.29	0.18	0.18	0.40	0.33	0.22	0.55	0.34	0.19	0.37	0.46	1.05	0.62
C5'	0.45	0.28	0.50	0.44	0.38	0.48	0.41	0.56	0.33	0.54	0.27	0.31	0.36	0.53	0.45	0.73	0.41	0.46	0.88	1.15	1.53	1.21
C6	0.19	0.20	0.28	0.29	0.17	0.14	0.23	0.20	0.25	0.23	0.17	0.19	0.39	0.28	0.18	0.49	0.34	0.22	0.23	0.27	0.90	0.46
C8	0.27	0.22	0.37	0.33	0.24	0.28	0.31	0.37	0.28	0.38	0.21	0.20	0.38	0.41	0.29	0.64	0.34	0.25	0.60	0.77	1.29	0.90
N1	0.20	0.21	0.26	0.28	0.18	0.14	0.22	0.19	0.25	0.21	0.18	0.21	0.38	0.26	0.18	0.44	0.34	0.27	0.16	0.17	0.81	0.36
N3	0.19	0.21	0.29	0.30	0.18	0.14	0.25	0.21	0.26	0.26	0.19	0.19	0.40	0.32	0.20	0.50	0.34	0.20	0.25	0.32	0.96	0.50
N6	0.19	0.20	0.27	0.29	0.17	0.13	0.21	0.19	0.24	0.21	0.15	0.19	0.37	0.25	0.17	0.47	0.34	0.24	0.22	0.23	0.85	0.42
N7	0.25	0.21	0.35	0.33	0.23	0.25	0.30	0.33	0.27	0.35	0.20	0.19	0.40	0.38	0.27	0.62	0.34	0.23	0.54	0.67	1.21	0.81
N9	0.24	0.22	0.34	0.32	0.22	0.23	0.29	0.32	0.28	0.35	0.21	0.19	0.39	0.39	0.26	0.61	0.34	0.21	0.49	0.65	1.20	0.78
O2'	0.27	0.29	0.36	0.31	0.27	0.22	0.32	0.25	0.31	0.37	0.27	0.26	0.41	0.41	0.29	0.58	0.33	0.24	0.38	0.55	1.11	0.68
O3'	0.31	0.23	0.40	0.30	0.26	0.25	0.31	0.30	0.25	0.41	0.18	0.23	0.35	0.43	0.32	0.58	0.32	0.25	0.46	0.68	1.14	0.77
O4'	0.27	0.22	0.38	0.33	0.24	0.31	0.31	0.42	0.26	0.40	0.22	0.19	0.35	0.42	0.29	0.67	0.33	0.27	0.66	0.88	1.37	0.98
O5'	0.63	0.73	0.70	0.53	0.64	0.51	0.62	0.47	0.65	0.61	0.71	0.69	0.64	0.61	0.62	0.93	0.54	0.58	0.89	1.23	1.63	1.30
OP1	0.74	0.63	0.76	0.64	0.66	0.75	0.64	0.83	0.57	0.76	0.58	0.65	0.52	0.72	0.72	0.95	0.59	0.77	1.26	1.62	1.89	1.64
OP2	0.72	0.66	0.76	0.60	0.68	0.65	0.65	0.65	0.60	0.71	0.62	0.68	0.54	0.69	0.70	0.97	0.57	0.70	1.11	1.45	1.79	1.50
P	0.65	0.62	0.71	0.55	0.62	0.61	0.60	0.65	0.57	0.66	0.60	0.62	0.54	0.64	0.64	0.94	0.53	0.65	1.11	1.47	1.81	1.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.20	0.00	0.14	0.23	0.28	0.17
C2	0.03	0.00	0.31	0.28	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.37	0.35	0.16	0.19	0.18	0.64	0.28
C2'	0.00	0.31	0.00	0.01	0.17	0.02	0.09	0.17	0.14	0.17	0.24	0.32	0.10	0.11	0.03	0.00	0.03	0.01	0.47	0.38	0.58	0.44
C3'	0.02	0.28	0.01	0.00	0.21	0.00	0.24	0.03	0.26	0.28	0.28	0.25	0.28	0.28	0.17	0.01	0.01	0.02	0.41	0.27	0.36	0.31
C4	0.02	0.01	0.17	0.21	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.17	0.10	0.25	0.23	0.65	0.37
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.12	0.07	0.04	0.12	0.13	0.07	0.22	0.04	0.00	0.02	0.32	0.17	0.12
C5	0.02	0.01	0.09	0.24	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.29	0.15	0.06	0.38	0.44	0.89	0.58
C5'	0.08	0.16	0.17	0.03	0.15	0.01	0.20	0.00	0.22	0.20	0.19	0.13	0.25	0.23	0.13	0.08	0.14	0.02	0.00	0.15	0.30	0.01
C6	0.02	0.01	0.14	0.26	0.01	0.10	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.19	0.09	0.35	0.44	0.93	0.57
C8	0.01	0.01	0.17	0.28	0.00	0.12	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.27	0.07	0.54	0.56	0.86	0.71
N1	0.03	0.00	0.24	0.28	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.36	0.27	0.14	0.26	0.29	0.80	0.42
N3	0.03	0.00	0.32	0.25	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.34	0.15	0.15	0.16	0.54	0.21
N6	0.02	0.01	0.10	0.28	0.01	0.12	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.34	0.21	0.08	0.42	0.59	1.07	0.69
N7	0.02	0.01	0.11	0.28	0.00	0.13	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.30	0.26	0.03	0.55	0.65	1.05	0.79
N9	0.01	0.02	0.03	0.17	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.08	0.02	0.30	0.27	0.58	0.39
O2'	0.01	0.37	0.00	0.01	0.25	0.22	0.29	0.08	0.33	0.26	0.36	0.34	0.34	0.30	0.15	0.00	0.07	0.16	0.32	0.50	0.54	0.35
O3'	0.20	0.35	0.03	0.01	0.17	0.04	0.15	0.14	0.19	0.27	0.27	0.34	0.21	0.26	0.08	0.07	0.00	0.15	0.34	0.29	0.35	0.22
O4'	0.00	0.16	0.01	0.02	0.10	0.00	0.06	0.02	0.09	0.07	0.14	0.15	0.08	0.03	0.02	0.16	0.15	0.00	0.15	0.38	0.17	0.24
O5'	0.14	0.19	0.47	0.41	0.25	0.02	0.38	0.00	0.35	0.54	0.26	0.15	0.42	0.55	0.30	0.32	0.34	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.18	0.38	0.27	0.23	0.32	0.44	0.15	0.44	0.56	0.29	0.16	0.59	0.65	0.27	0.50	0.29	0.38	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.64	0.58	0.36	0.65	0.17	0.89	0.30	0.93	0.86	0.80	0.54	1.07	1.05	0.58	0.54	0.35	0.17	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.28	0.44	0.31	0.37	0.12	0.58	0.01	0.57	0.71	0.42	0.21	0.69	0.79	0.39	0.35	0.22	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00