Doublet Group distance statistics: 49809

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.012, 0.026, 0.039, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.027 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.008, 0.025, 0.043, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.015, 0.037, 0.058, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.037 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.006, 0.033, 0.061, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.033 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.013, 0.044, 0.075, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.044 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.028, 0.075, 0.122, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.075 std_dev=0.047
O2'	A	0, 0.067, 0.134, 0.201, 0.210 max_d=0.210 avg_d=0.134 std_dev=0.067
C2'	A	0, 0.025, 0.095, 0.165, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.095 std_dev=0.070
O4'	A	0, 0.039, 0.118, 0.197, 0.265 max_d=0.265 avg_d=0.118 std_dev=0.079
C3'	A	0, 0.023, 0.166, 0.309, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.166 std_dev=0.143
C4'	A	0, 0.024, 0.174, 0.324, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.174 std_dev=0.150
C4	B	0, 0.164, 0.396, 0.628, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.396 std_dev=0.232
C5	B	0, 0.114, 0.346, 0.578, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.346 std_dev=0.232
C6	B	0, 0.132, 0.364, 0.597, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.364 std_dev=0.233
O3'	A	0, 0.026, 0.264, 0.502, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.264 std_dev=0.238
N1	B	0, 0.208, 0.453, 0.699, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.453 std_dev=0.245
N9	B	0, 0.152, 0.400, 0.647, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.400 std_dev=0.248
C5'	A	0, 0.036, 0.287, 0.538, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.287 std_dev=0.251
N7	B	0, 0.085, 0.369, 0.653, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.369 std_dev=0.284
C8	B	0, 0.108, 0.393, 0.677, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.393 std_dev=0.284
N3	B	0, 0.210, 0.495, 0.780, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.495 std_dev=0.285
N6	B	0, 0.073, 0.361, 0.649, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.361 std_dev=0.288
C2	B	0, 0.230, 0.518, 0.806, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.518 std_dev=0.288
C1'	B	0, 0.161, 0.466, 0.772, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.466 std_dev=0.306
C2'	B	0, 0.174, 0.485, 0.795, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.485 std_dev=0.311
C3'	B	0, 0.135, 0.458, 0.781, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.458 std_dev=0.323
C4'	B	0, 0.187, 0.518, 0.849, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.518 std_dev=0.331
O4'	B	0, 0.173, 0.510, 0.847, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.510 std_dev=0.337
C5'	B	0, 0.200, 0.548, 0.896, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.548 std_dev=0.348
P	A	0, 0.045, 0.395, 0.745, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.395 std_dev=0.350
O3'	B	0, 0.196, 0.563, 0.929, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.563 std_dev=0.366
O2'	B	0, 0.192, 0.580, 0.968, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.580 std_dev=0.388
O5'	B	0, 0.124, 0.515, 0.905, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.515 std_dev=0.390
O5'	A	0, 0.034, 0.428, 0.822, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.428 std_dev=0.394
P	B	0, 0.061, 0.486, 0.910, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.486 std_dev=0.425
OP2	A	0, 0.249, 0.687, 1.124, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.687 std_dev=0.437
OP2	B	0, 0.014, 0.657, 1.300, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.657 std_dev=0.643
OP1	A	0, 0.070, 0.799, 1.529, 2.382 max_d=2.382 avg_d=0.799 std_dev=0.730
OP1	B	0, -0.167, 0.813, 1.794, 2.995 max_d=2.995 avg_d=0.813 std_dev=0.980

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.27	0.15	0.09
C2	0.03	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.09	0.11	0.03	0.15	0.35	0.29	0.14
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.06	0.03	0.07	0.07	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.07	0.44	0.12	0.06
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.10	0.08	0.09	0.07	0.13	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.11	0.49	0.10	0.11
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.07	0.03	0.14	0.33	0.26	0.13
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.06	0.04	0.13	0.09	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.19	0.07	0.05
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.14	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.10	0.06	0.19	0.32	0.32	0.19
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.09	0.01	0.14	0.00	0.15	0.15	0.12	0.06	0.21	0.17	0.09	0.03	0.03	0.01	0.00	0.08	0.01	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.10	0.02	0.08	0.02	0.15	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.05	0.12	0.07	0.21	0.33	0.37	0.22
C8	0.03	0.03	0.03	0.08	0.02	0.09	0.03	0.15	0.05	0.00	0.04	0.02	0.08	0.00	0.01	0.03	0.10	0.06	0.20	0.28	0.26	0.17
N1	0.03	0.00	0.07	0.09	0.02	0.06	0.02	0.12	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.08	0.12	0.05	0.18	0.35	0.34	0.19
N3	0.04	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.09	0.03	0.12	0.34	0.25	0.12
N6	0.06	0.01	0.07	0.13	0.03	0.13	0.04	0.21	0.00	0.08	0.02	0.02	0.00	0.08	0.06	0.05	0.15	0.11	0.27	0.32	0.44	0.30
N7	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.09	0.01	0.17	0.04	0.00	0.03	0.02	0.08	0.00	0.01	0.02	0.11	0.06	0.22	0.30	0.33	0.21
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.09	0.04	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.13	0.30	0.21	0.12
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.08	0.08	0.05	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.35	0.11	0.06
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.07	0.03	0.10	0.03	0.12	0.10	0.12	0.09	0.15	0.11	0.05	0.03	0.00	0.03	0.15	0.51	0.12	0.15
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.07	0.06	0.05	0.03	0.11	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.08	0.18	0.15	0.12
O5'	0.06	0.15	0.07	0.11	0.14	0.01	0.19	0.00	0.21	0.20	0.18	0.12	0.27	0.22	0.13	0.04	0.15	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.27	0.35	0.44	0.49	0.33	0.19	0.32	0.08	0.33	0.28	0.35	0.34	0.32	0.30	0.30	0.35	0.51	0.18	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.29	0.12	0.10	0.26	0.07	0.32	0.01	0.37	0.26	0.34	0.25	0.44	0.33	0.21	0.11	0.12	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.06	0.11	0.13	0.05	0.19	0.01	0.22	0.17	0.19	0.12	0.30	0.21	0.12	0.06	0.15	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.11	0.19	0.13	0.19	0.23	0.23	0.25	0.17	0.32	0.12	0.13	0.20	0.32	0.24	0.26	0.13	0.29	0.28	1.01	0.37	0.26
C2	0.24	0.05	0.21	0.20	0.14	0.25	0.14	0.28	0.06	0.28	0.06	0.08	0.06	0.24	0.22	0.23	0.20	0.29	0.32	0.93	0.42	0.31
C2'	0.23	0.11	0.18	0.12	0.19	0.20	0.22	0.23	0.17	0.30	0.12	0.14	0.19	0.29	0.23	0.25	0.11	0.28	0.25	0.99	0.41	0.24
C3'	0.20	0.11	0.14	0.09	0.17	0.16	0.20	0.17	0.16	0.26	0.11	0.13	0.18	0.26	0.21	0.23	0.09	0.24	0.20	0.94	0.48	0.18
C4	0.23	0.05	0.19	0.15	0.15	0.23	0.17	0.25	0.08	0.30	0.05	0.09	0.07	0.28	0.22	0.23	0.14	0.29	0.29	1.00	0.38	0.27
C4'	0.20	0.09	0.14	0.11	0.17	0.17	0.21	0.18	0.17	0.28	0.10	0.12	0.21	0.28	0.21	0.23	0.11	0.24	0.21	0.95	0.45	0.20
C5	0.24	0.06	0.20	0.15	0.15	0.23	0.16	0.26	0.07	0.29	0.06	0.10	0.06	0.26	0.23	0.24	0.15	0.29	0.29	1.01	0.37	0.27
C5'	0.14	0.06	0.09	0.14	0.11	0.11	0.15	0.10	0.12	0.21	0.06	0.07	0.17	0.21	0.15	0.16	0.14	0.17	0.14	0.85	0.54	0.12
C6	0.26	0.10	0.22	0.20	0.16	0.25	0.14	0.27	0.10	0.28	0.10	0.12	0.13	0.23	0.23	0.24	0.19	0.30	0.31	0.99	0.39	0.29
C8	0.26	0.11	0.19	0.12	0.20	0.22	0.23	0.25	0.16	0.32	0.10	0.15	0.15	0.32	0.26	0.27	0.11	0.30	0.27	1.02	0.36	0.25
N1	0.25	0.09	0.23	0.22	0.15	0.26	0.14	0.28	0.09	0.28	0.09	0.11	0.11	0.22	0.22	0.24	0.22	0.30	0.32	0.92	0.42	0.31
N3	0.24	0.03	0.20	0.17	0.14	0.24	0.16	0.27	0.07	0.30	0.05	0.07	0.07	0.27	0.22	0.23	0.17	0.29	0.31	0.97	0.40	0.30
N6	0.28	0.18	0.25	0.23	0.20	0.26	0.19	0.28	0.19	0.28	0.19	0.19	0.23	0.23	0.25	0.26	0.22	0.32	0.31	1.00	0.37	0.29
N7	0.26	0.09	0.20	0.14	0.19	0.22	0.20	0.25	0.10	0.31	0.07	0.14	0.06	0.30	0.25	0.26	0.12	0.30	0.28	1.02	0.36	0.26
N9	0.24	0.09	0.18	0.13	0.18	0.22	0.21	0.25	0.14	0.31	0.10	0.12	0.15	0.30	0.23	0.25	0.12	0.29	0.27	1.01	0.37	0.25
O2'	0.25	0.11	0.19	0.13	0.20	0.23	0.23	0.26	0.18	0.32	0.12	0.14	0.20	0.32	0.25	0.26	0.13	0.30	0.28	1.02	0.37	0.27
O3'	0.17	0.09	0.11	0.09	0.15	0.12	0.17	0.13	0.14	0.22	0.10	0.11	0.16	0.22	0.18	0.20	0.11	0.21	0.15	0.90	0.53	0.14
O4'	0.25	0.13	0.19	0.15	0.20	0.23	0.25	0.24	0.20	0.33	0.14	0.15	0.24	0.34	0.25	0.27	0.15	0.29	0.27	1.00	0.39	0.25
O5'	0.12	0.07	0.05	0.11	0.10	0.06	0.13	0.07	0.11	0.16	0.08	0.08	0.15	0.17	0.12	0.18	0.10	0.14	0.11	0.80	0.57	0.07
OP1	0.12	0.23	0.15	0.18	0.11	0.12	0.15	0.20	0.12	0.22	0.17	0.18	0.23	0.25	0.13	0.16	0.22	0.13	0.34	1.03	0.35	0.36
OP2	0.16	0.17	0.16	0.25	0.15	0.17	0.15	0.19	0.16	0.15	0.17	0.16	0.17	0.15	0.15	0.18	0.23	0.14	0.22	0.63	0.71	0.22
P	0.11	0.15	0.15	0.24	0.12	0.15	0.11	0.10	0.11	0.13	0.13	0.14	0.12	0.14	0.12	0.07	0.23	0.12	0.10	0.67	0.63	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.00	0.12	0.32	0.05	0.08
C2	0.03	0.00	0.10	0.13	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.15	0.13	0.02	0.14	0.54	0.32	0.10
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.08	0.08	0.08	0.09	0.09	0.09	0.04	0.00	0.03	0.02	0.09	0.20	0.06	0.05
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.12	0.01	0.18	0.01	0.18	0.19	0.16	0.11	0.22	0.21	0.11	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.07	0.04
C4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.12	0.53	0.29	0.09
C4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.10	0.06	0.04	0.10	0.10	0.05	0.10	0.03	0.00	0.01	0.10	0.17	0.05
C5	0.02	0.02	0.07	0.18	0.01	0.08	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.16	0.02	0.11	0.60	0.45	0.11
C5'	0.04	0.06	0.02	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.08	0.11	0.07	0.06	0.11	0.11	0.05	0.08	0.10	0.03	0.01	0.21	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.18	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.16	0.03	0.11	0.62	0.51	0.11
C8	0.01	0.03	0.08	0.19	0.02	0.10	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.18	0.02	0.11	0.56	0.35	0.11
N1	0.03	0.01	0.08	0.16	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.14	0.03	0.12	0.59	0.44	0.10
N3	0.03	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.15	0.12	0.03	0.14	0.49	0.23	0.10
N6	0.03	0.01	0.09	0.22	0.02	0.10	0.02	0.11	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.21	0.04	0.13	0.64	0.63	0.14
N7	0.02	0.03	0.09	0.21	0.01	0.10	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.21	0.02	0.12	0.63	0.51	0.13
N9	0.00	0.02	0.04	0.11	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.11	0.47	0.21	0.08
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.07	0.10	0.04	0.08	0.07	0.04	0.12	0.15	0.05	0.03	0.02	0.00	0.07	0.08	0.02	0.11	0.05	0.04
O3'	0.03	0.13	0.03	0.01	0.09	0.03	0.16	0.10	0.16	0.18	0.14	0.12	0.21	0.21	0.08	0.07	0.00	0.01	0.15	0.22	0.09	0.14
O4'	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.11	0.22	0.14	0.11
O5'	0.12	0.14	0.09	0.04	0.12	0.01	0.11	0.01	0.11	0.11	0.12	0.14	0.13	0.12	0.11	0.02	0.15	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.32	0.54	0.20	0.02	0.53	0.10	0.60	0.21	0.62	0.56	0.59	0.49	0.64	0.63	0.47	0.11	0.22	0.22	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.32	0.06	0.07	0.29	0.17	0.45	0.30	0.51	0.35	0.44	0.23	0.63	0.51	0.21	0.05	0.09	0.14	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.10	0.05	0.04	0.09	0.05	0.11	0.02	0.11	0.11	0.10	0.10	0.14	0.13	0.08	0.04	0.14	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00