Doublet Group distance statistics: 49810

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.009, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.001, 0.016, 0.031, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.001, 0.017, 0.032, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.016
C4	A	0, -0.001, 0.016, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.002, 0.019, 0.037, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.019 std_dev=0.018
N6	A	0, -0.002, 0.020, 0.042, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.020 std_dev=0.022
C1'	A	0, -0.001, 0.023, 0.048, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.024
O2'	A	0, -0.009, 0.110, 0.229, 0.286 max_d=0.286 avg_d=0.110 std_dev=0.119
C2'	A	0, -0.021, 0.140, 0.300, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.140 std_dev=0.161
O4'	A	0, -0.020, 0.191, 0.403, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.191 std_dev=0.212
C3'	A	0, -0.035, 0.287, 0.609, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.287 std_dev=0.322
C4'	A	0, -0.026, 0.315, 0.656, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.315 std_dev=0.341
O3'	A	0, -0.063, 0.400, 0.863, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.400 std_dev=0.463
N6	B	0, 0.161, 0.650, 1.139, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.650 std_dev=0.489
C6	B	0, 0.177, 0.708, 1.238, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.708 std_dev=0.530
N1	B	0, 0.316, 0.861, 1.406, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.861 std_dev=0.545
C5'	A	0, -0.021, 0.526, 1.074, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.526 std_dev=0.548
C5	B	0, 0.150, 0.743, 1.337, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.743 std_dev=0.593
N7	B	0, 0.172, 0.796, 1.420, 1.982 max_d=1.982 avg_d=0.796 std_dev=0.624
C2	B	0, 0.386, 1.023, 1.660, 1.524 max_d=1.524 avg_d=1.023 std_dev=0.637
O5'	A	0, 0.003, 0.649, 1.296, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.649 std_dev=0.646
C4	B	0, 0.227, 0.879, 1.531, 1.828 max_d=1.828 avg_d=0.879 std_dev=0.652
N3	B	0, 0.382, 1.050, 1.718, 1.695 max_d=1.695 avg_d=1.050 std_dev=0.668
C8	B	0, 0.188, 0.879, 1.570, 2.216 max_d=2.216 avg_d=0.879 std_dev=0.691
N9	B	0, 0.184, 0.910, 1.635, 2.152 max_d=2.152 avg_d=0.910 std_dev=0.726
O4'	B	0, 0.385, 1.160, 1.936, 2.233 max_d=2.233 avg_d=1.160 std_dev=0.775
C1'	B	0, 0.249, 1.078, 1.907, 2.441 max_d=2.441 avg_d=1.078 std_dev=0.829
C5'	B	0, 0.409, 1.245, 2.081, 2.144 max_d=2.144 avg_d=1.245 std_dev=0.836
O5'	B	0, 0.396, 1.245, 2.093, 2.301 max_d=2.301 avg_d=1.245 std_dev=0.849
C4'	B	0, 0.428, 1.298, 2.169, 2.406 max_d=2.406 avg_d=1.298 std_dev=0.870
C2'	B	0, 0.293, 1.171, 2.048, 2.534 max_d=2.534 avg_d=1.171 std_dev=0.878
C3'	B	0, 0.433, 1.376, 2.319, 2.680 max_d=2.680 avg_d=1.376 std_dev=0.943
O2'	B	0, 0.477, 1.493, 2.509, 3.025 max_d=3.025 avg_d=1.493 std_dev=1.016
OP2	A	0, 0.051, 1.084, 2.117, 2.742 max_d=2.742 avg_d=1.084 std_dev=1.033
P	A	0, -0.005, 1.030, 2.064, 2.557 max_d=2.557 avg_d=1.030 std_dev=1.035
P	B	0, 0.292, 1.359, 2.426, 3.128 max_d=3.128 avg_d=1.359 std_dev=1.067
O3'	B	0, 0.555, 1.665, 2.774, 3.139 max_d=3.139 avg_d=1.665 std_dev=1.110
OP1	A	0, -0.094, 1.247, 2.588, 3.213 max_d=3.213 avg_d=1.247 std_dev=1.341
OP2	B	0, 0.122, 1.617, 3.112, 4.787 max_d=4.787 avg_d=1.617 std_dev=1.495
OP1	B	0, -0.038, 1.716, 3.470, 4.729 max_d=4.729 avg_d=1.716 std_dev=1.754

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.06	0.17	0.14
C2	0.04	0.00	0.10	0.16	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.20	0.05	0.12	0.13	0.15	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.08	0.10	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.14	0.07	0.04
C3'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.13	0.04	0.16	0.14	0.13	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.21	0.06	0.08
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.07	0.06	0.15	0.11
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.04	0.05	0.03	0.07	0.06	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.06	0.05	0.03
C5	0.02	0.00	0.04	0.10	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.01	0.10	0.09	0.16	0.12
C5'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.07	0.00	0.10	0.00	0.11	0.07	0.10	0.06	0.13	0.10	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.03	0.00	0.05	0.13	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.17	0.02	0.13	0.13	0.17	0.13
C8	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.03	0.10	0.23	0.16
N1	0.04	0.00	0.08	0.16	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.20	0.04	0.13	0.15	0.17	0.13
N3	0.03	0.00	0.10	0.14	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.16	0.05	0.08	0.08	0.13	0.11
N6	0.02	0.00	0.04	0.13	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.17	0.02	0.15	0.15	0.19	0.15
N7	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.09	0.19	0.12
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.18	0.13
O2'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.06	0.05	0.04	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.03	0.16	0.05	0.03
O3'	0.02	0.20	0.02	0.00	0.12	0.03	0.12	0.03	0.17	0.04	0.20	0.16	0.17	0.08	0.04	0.04	0.00	0.02	0.09	0.36	0.16	0.19
O4'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.08	0.13	0.22	0.20
O5'	0.04	0.12	0.03	0.05	0.07	0.01	0.10	0.00	0.13	0.03	0.13	0.08	0.15	0.07	0.02	0.03	0.09	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.06	0.13	0.14	0.21	0.06	0.06	0.09	0.03	0.13	0.10	0.15	0.08	0.15	0.09	0.05	0.16	0.36	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.17	0.15	0.07	0.06	0.15	0.05	0.16	0.01	0.17	0.23	0.17	0.13	0.19	0.19	0.18	0.05	0.16	0.22	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.12	0.04	0.08	0.11	0.03	0.12	0.01	0.13	0.16	0.13	0.11	0.15	0.12	0.13	0.03	0.19	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.16	0.17	0.29	0.13	0.24	0.12	0.24	0.07	0.26	0.16	0.14	0.05	0.23	0.19	0.27	0.18	0.24	0.58	1.82	0.73	0.91
C2	0.25	0.24	0.17	0.34	0.18	0.33	0.13	0.33	0.17	0.20	0.23	0.23	0.21	0.12	0.21	0.22	0.25	0.34	0.67	1.81	0.90	0.99
C2'	0.20	0.15	0.15	0.33	0.15	0.26	0.14	0.26	0.12	0.22	0.14	0.15	0.10	0.20	0.19	0.27	0.18	0.24	0.61	1.80	0.64	0.90
C3'	0.11	0.13	0.10	0.26	0.09	0.16	0.09	0.18	0.09	0.14	0.13	0.10	0.08	0.13	0.11	0.32	0.11	0.14	0.53	1.69	0.42	0.76
C4	0.23	0.21	0.17	0.31	0.16	0.27	0.11	0.27	0.13	0.23	0.21	0.19	0.15	0.17	0.20	0.24	0.19	0.28	0.61	1.82	0.78	0.93
C4'	0.13	0.13	0.16	0.20	0.09	0.12	0.11	0.12	0.08	0.20	0.14	0.09	0.09	0.20	0.14	0.36	0.18	0.13	0.45	1.68	0.47	0.73
C5	0.23	0.23	0.17	0.29	0.16	0.26	0.10	0.25	0.14	0.22	0.22	0.21	0.19	0.16	0.19	0.24	0.19	0.28	0.58	1.80	0.75	0.90
C5'	0.17	0.19	0.23	0.20	0.16	0.10	0.17	0.07	0.16	0.22	0.19	0.16	0.17	0.23	0.18	0.46	0.29	0.12	0.33	1.53	0.32	0.58
C6	0.25	0.25	0.18	0.31	0.18	0.30	0.12	0.29	0.18	0.19	0.24	0.24	0.24	0.12	0.20	0.23	0.22	0.32	0.62	1.81	0.82	0.94
C8	0.20	0.18	0.19	0.27	0.14	0.21	0.12	0.20	0.07	0.26	0.18	0.15	0.05	0.25	0.19	0.28	0.18	0.21	0.51	1.73	0.65	0.82
N1	0.26	0.26	0.18	0.33	0.19	0.33	0.14	0.33	0.19	0.18	0.25	0.24	0.24	0.11	0.20	0.22	0.26	0.35	0.65	1.80	0.89	0.98
N3	0.24	0.22	0.16	0.33	0.17	0.30	0.11	0.31	0.14	0.22	0.22	0.20	0.17	0.15	0.20	0.23	0.22	0.31	0.65	1.83	0.85	0.98
N6	0.25	0.27	0.19	0.30	0.19	0.30	0.14	0.28	0.21	0.16	0.25	0.26	0.27	0.13	0.19	0.23	0.22	0.33	0.59	1.78	0.80	0.91
N7	0.21	0.21	0.19	0.27	0.14	0.21	0.10	0.20	0.10	0.25	0.21	0.18	0.14	0.23	0.19	0.27	0.18	0.22	0.51	1.72	0.66	0.82
N9	0.21	0.19	0.18	0.29	0.14	0.24	0.12	0.24	0.09	0.25	0.18	0.16	0.08	0.22	0.20	0.26	0.18	0.24	0.57	1.80	0.72	0.89
O2'	0.22	0.14	0.17	0.35	0.15	0.29	0.14	0.30	0.10	0.25	0.13	0.14	0.08	0.22	0.21	0.26	0.20	0.28	0.66	1.87	0.75	0.98
O3'	0.10	0.15	0.11	0.29	0.10	0.18	0.10	0.22	0.11	0.11	0.14	0.12	0.10	0.11	0.10	0.35	0.13	0.13	0.56	1.67	0.32	0.75
O4'	0.18	0.15	0.18	0.23	0.10	0.19	0.12	0.20	0.06	0.27	0.15	0.09	0.07	0.26	0.18	0.30	0.21	0.20	0.50	1.75	0.65	0.83
O5'	0.13	0.13	0.21	0.19	0.11	0.06	0.13	0.08	0.10	0.17	0.13	0.11	0.12	0.18	0.13	0.44	0.25	0.08	0.34	1.49	0.26	0.54
OP1	0.09	0.18	0.21	0.17	0.09	0.10	0.03	0.21	0.04	0.05	0.14	0.15	0.06	0.06	0.07	0.43	0.25	0.14	0.39	1.43	0.21	0.48
OP2	0.10	0.16	0.21	0.17	0.09	0.11	0.04	0.23	0.06	0.06	0.14	0.13	0.08	0.05	0.08	0.45	0.25	0.15	0.39	1.43	0.21	0.49
P	0.09	0.15	0.22	0.16	0.08	0.05	0.07	0.17	0.07	0.09	0.12	0.12	0.10	0.11	0.08	0.46	0.28	0.09	0.36	1.47	0.22	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.27	0.00	0.20	0.61	0.17	0.22
C2	0.03	0.00	0.22	0.16	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.40	0.44	0.10	0.22	1.08	0.32	0.37
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.11	0.02	0.06	0.19	0.11	0.11	0.18	0.22	0.08	0.06	0.01	0.00	0.05	0.02	0.36	0.35	0.52	0.37
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.14	0.02	0.14	0.22	0.13	0.15	0.17	0.22	0.10	0.02	0.01	0.01	0.10	0.09	0.21	0.12
C4	0.02	0.00	0.11	0.09	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.26	0.06	0.29	1.08	0.25	0.40
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.10	0.02	0.05	0.06	0.09	0.04	0.13	0.03	0.00	0.01	0.11	0.19	0.04
C5	0.01	0.00	0.06	0.14	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.14	0.05	0.40	1.30	0.26	0.52
C5'	0.08	0.10	0.19	0.02	0.12	0.01	0.16	0.00	0.16	0.19	0.12	0.09	0.18	0.20	0.12	0.07	0.15	0.02	0.00	0.19	0.38	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.14	0.00	0.04	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.20	0.07	0.38	1.36	0.28	0.53
C8	0.01	0.00	0.11	0.22	0.00	0.10	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.06	0.04	0.51	1.23	0.27	0.56
N1	0.02	0.00	0.18	0.13	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.35	0.33	0.09	0.29	1.25	0.30	0.46
N3	0.03	0.00	0.22	0.15	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.45	0.09	0.19	0.95	0.30	0.33
N6	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.06	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.27	0.13	0.06	0.45	1.48	0.30	0.61
N7	0.01	0.00	0.06	0.22	0.00	0.09	0.00	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.03	0.02	0.52	1.40	0.30	0.62
N9	0.00	0.00	0.01	0.10	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.16	0.01	0.33	0.98	0.21	0.38
O2'	0.01	0.40	0.00	0.02	0.24	0.13	0.23	0.07	0.28	0.21	0.35	0.37	0.27	0.22	0.14	0.00	0.07	0.08	0.35	0.34	0.62	0.39
O3'	0.27	0.44	0.05	0.01	0.26	0.03	0.14	0.15	0.20	0.06	0.33	0.45	0.13	0.03	0.16	0.07	0.00	0.19	0.10	0.10	0.18	0.11
O4'	0.00	0.10	0.02	0.01	0.06	0.00	0.05	0.02	0.07	0.04	0.09	0.09	0.06	0.02	0.01	0.08	0.19	0.00	0.19	0.56	0.33	0.27
O5'	0.20	0.22	0.36	0.10	0.29	0.01	0.40	0.00	0.38	0.51	0.29	0.19	0.45	0.52	0.33	0.35	0.10	0.19	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.61	1.08	0.35	0.09	1.08	0.11	1.30	0.19	1.36	1.23	1.25	0.95	1.48	1.40	0.98	0.34	0.10	0.56	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.32	0.52	0.21	0.25	0.19	0.26	0.38	0.28	0.27	0.30	0.30	0.30	0.30	0.21	0.62	0.18	0.33	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.37	0.37	0.12	0.40	0.04	0.52	0.01	0.53	0.56	0.46	0.33	0.61	0.62	0.38	0.39	0.11	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00