Doublet Group distance statistics: 49811

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.012, 0.021, 0.031, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.032 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.018, 0.035, 0.051, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.035 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.020, 0.037, 0.054, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.037 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.028, 0.051, 0.074, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.051 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.028, 0.052, 0.075, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.052 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.037, 0.068, 0.098, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.068 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.043, 0.079, 0.114, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.079 std_dev=0.036
C8	A	0, 0.049, 0.090, 0.130, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.090 std_dev=0.040
O4'	A	0, 0.080, 0.173, 0.265, 0.281 max_d=0.281 avg_d=0.173 std_dev=0.092
C4'	A	0, 0.118, 0.254, 0.390, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.254 std_dev=0.136
C2'	A	0, 0.128, 0.269, 0.409, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.269 std_dev=0.141
C3'	A	0, 0.132, 0.314, 0.497, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.314 std_dev=0.182
O2'	A	0, 0.209, 0.406, 0.604, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.406 std_dev=0.197
OP2	B	0, 0.270, 0.514, 0.758, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.514 std_dev=0.244
O3'	A	0, 0.127, 0.380, 0.633, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.380 std_dev=0.253
C5'	A	0, 0.241, 0.504, 0.767, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.504 std_dev=0.263
P	B	0, 0.337, 0.628, 0.919, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.628 std_dev=0.291
O5'	A	0, 0.269, 0.624, 0.979, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.624 std_dev=0.355
OP1	B	0, 0.285, 0.657, 1.030, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.657 std_dev=0.373
O5'	B	0, 0.403, 0.809, 1.215, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.809 std_dev=0.406
OP1	A	0, 0.388, 0.851, 1.313, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.851 std_dev=0.463
P	A	0, 0.384, 0.847, 1.309, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.847 std_dev=0.463
C5'	B	0, 0.569, 1.117, 1.665, 1.734 max_d=1.734 avg_d=1.117 std_dev=0.548
O4'	B	0, 0.583, 1.138, 1.693, 1.785 max_d=1.785 avg_d=1.138 std_dev=0.555
C4'	B	0, 0.647, 1.232, 1.816, 1.861 max_d=1.861 avg_d=1.232 std_dev=0.584
OP2	A	0, 0.384, 0.971, 1.558, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.971 std_dev=0.587
N3	B	0, 0.510, 1.135, 1.760, 1.854 max_d=1.854 avg_d=1.135 std_dev=0.625
C2	B	0, 0.490, 1.121, 1.753, 1.832 max_d=1.832 avg_d=1.121 std_dev=0.632
C1'	B	0, 0.599, 1.245, 1.891, 2.034 max_d=2.034 avg_d=1.245 std_dev=0.646
C4	B	0, 0.562, 1.211, 1.859, 1.979 max_d=1.979 avg_d=1.211 std_dev=0.649
N1	B	0, 0.525, 1.180, 1.835, 1.928 max_d=1.928 avg_d=1.180 std_dev=0.655
N9	B	0, 0.588, 1.244, 1.901, 2.046 max_d=2.046 avg_d=1.244 std_dev=0.656
C2'	B	0, 0.635, 1.298, 1.960, 2.058 max_d=2.058 avg_d=1.298 std_dev=0.662
C3'	B	0, 0.661, 1.330, 1.999, 2.093 max_d=2.093 avg_d=1.330 std_dev=0.669
C6	B	0, 0.573, 1.250, 1.928, 2.044 max_d=2.044 avg_d=1.250 std_dev=0.677
C5	B	0, 0.593, 1.271, 1.949, 2.075 max_d=2.075 avg_d=1.271 std_dev=0.678
C8	B	0, 0.620, 1.313, 2.005, 2.167 max_d=2.167 avg_d=1.313 std_dev=0.692
N6	B	0, 0.603, 1.299, 1.995, 2.112 max_d=2.112 avg_d=1.299 std_dev=0.696
N7	B	0, 0.619, 1.323, 2.028, 2.185 max_d=2.185 avg_d=1.323 std_dev=0.705
O3'	B	0, 0.666, 1.500, 2.333, 2.478 max_d=2.478 avg_d=1.500 std_dev=0.833
O2'	B	0, 0.733, 1.596, 2.458, 2.553 max_d=2.553 avg_d=1.596 std_dev=0.863

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.05	0.07
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.04	0.05	0.06	0.08
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.02	0.09	0.08
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.04	0.05	0.04	0.08	0.04	0.02	0.00	0.00	0.06	0.03	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.06	0.04	0.06	0.06
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.02	0.02	0.04	0.07	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.10	0.03	0.07	0.05
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.05	0.08	0.04	0.02	0.06	0.09	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00
C6	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02	0.09	0.03	0.06	0.05
C8	0.02	0.01	0.04	0.08	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.14	0.03	0.09	0.04
N1	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.06	0.03	0.05	0.07
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.05	0.06	0.08
N6	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.10	0.04	0.07	0.06
N7	0.02	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.15	0.03	0.11	0.04
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.07	0.04	0.06	0.06
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.07	0.06
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.09	0.05	0.07	0.04	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01	0.08	0.10	0.09	0.04
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.06	0.05	0.05
O5'	0.03	0.04	0.04	0.06	0.06	0.02	0.10	0.00	0.09	0.14	0.06	0.04	0.10	0.15	0.07	0.04	0.08	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.05	0.05	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.04	0.02	0.10	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.06	0.09	0.08	0.06	0.03	0.07	0.01	0.06	0.09	0.05	0.06	0.07	0.11	0.06	0.07	0.09	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.08	0.08	0.07	0.06	0.03	0.05	0.00	0.05	0.04	0.07	0.08	0.06	0.04	0.06	0.06	0.04	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.06	0.15	0.11	0.12	0.04	0.15	0.07	0.14	0.19	0.09	0.07	0.15	0.20	0.15	0.20	0.05	0.03	0.21	0.11	0.13	0.11
C2	0.10	0.12	0.19	0.14	0.16	0.05	0.18	0.06	0.17	0.18	0.16	0.12	0.17	0.19	0.16	0.27	0.08	0.06	0.20	0.17	0.15	0.13
C2'	0.12	0.12	0.17	0.14	0.16	0.05	0.19	0.06	0.18	0.21	0.15	0.12	0.19	0.23	0.18	0.24	0.09	0.03	0.17	0.11	0.10	0.09
C3'	0.07	0.07	0.11	0.07	0.11	0.01	0.14	0.02	0.14	0.16	0.10	0.07	0.15	0.18	0.12	0.17	0.04	0.03	0.20	0.14	0.14	0.13
C4	0.10	0.08	0.16	0.12	0.14	0.03	0.17	0.06	0.15	0.19	0.12	0.09	0.16	0.20	0.16	0.23	0.06	0.02	0.20	0.12	0.13	0.11
C4'	0.06	0.05	0.10	0.07	0.08	0.03	0.11	0.03	0.09	0.15	0.05	0.05	0.10	0.16	0.11	0.14	0.04	0.03	0.22	0.13	0.15	0.14
C5	0.10	0.07	0.16	0.12	0.14	0.03	0.16	0.05	0.14	0.19	0.11	0.09	0.14	0.19	0.16	0.22	0.06	0.02	0.19	0.10	0.11	0.10
C5'	0.05	0.07	0.06	0.04	0.05	0.03	0.07	0.03	0.05	0.12	0.04	0.06	0.07	0.13	0.08	0.10	0.05	0.04	0.23	0.14	0.16	0.15
C6	0.11	0.11	0.18	0.13	0.16	0.05	0.17	0.05	0.15	0.18	0.13	0.12	0.14	0.18	0.17	0.25	0.08	0.05	0.20	0.12	0.12	0.11
C8	0.10	0.06	0.14	0.11	0.12	0.06	0.16	0.08	0.13	0.20	0.07	0.07	0.13	0.20	0.16	0.18	0.05	0.04	0.18	0.07	0.09	0.08
N1	0.10	0.13	0.19	0.14	0.16	0.06	0.17	0.06	0.16	0.18	0.15	0.13	0.16	0.18	0.17	0.27	0.09	0.07	0.20	0.17	0.14	0.13
N3	0.09	0.10	0.17	0.12	0.15	0.04	0.17	0.05	0.17	0.19	0.15	0.10	0.17	0.20	0.16	0.25	0.07	0.04	0.20	0.15	0.14	0.12
N6	0.12	0.11	0.19	0.14	0.16	0.06	0.16	0.05	0.14	0.18	0.12	0.13	0.12	0.17	0.18	0.25	0.09	0.07	0.19	0.10	0.10	0.10
N7	0.11	0.06	0.15	0.11	0.13	0.05	0.16	0.08	0.13	0.20	0.07	0.07	0.12	0.20	0.16	0.19	0.06	0.03	0.18	0.07	0.08	0.08
N9	0.10	0.06	0.15	0.11	0.13	0.04	0.16	0.07	0.14	0.19	0.10	0.08	0.15	0.20	0.15	0.20	0.05	0.02	0.20	0.10	0.12	0.10
O2'	0.12	0.12	0.18	0.14	0.16	0.06	0.19	0.08	0.17	0.21	0.14	0.12	0.17	0.22	0.18	0.25	0.09	0.03	0.17	0.10	0.09	0.08
O3'	0.07	0.09	0.11	0.07	0.11	0.02	0.14	0.03	0.14	0.16	0.12	0.08	0.14	0.17	0.12	0.18	0.05	0.03	0.17	0.13	0.12	0.12
O4'	0.08	0.06	0.12	0.09	0.09	0.05	0.12	0.08	0.10	0.17	0.06	0.06	0.12	0.18	0.13	0.16	0.04	0.04	0.23	0.11	0.14	0.12
O5'	0.04	0.10	0.05	0.05	0.03	0.08	0.03	0.08	0.01	0.07	0.06	0.09	0.04	0.08	0.03	0.08	0.08	0.09	0.26	0.18	0.21	0.19
OP1	0.12	0.07	0.08	0.09	0.10	0.10	0.13	0.09	0.09	0.19	0.07	0.07	0.10	0.20	0.14	0.08	0.07	0.11	0.15	0.05	0.07	0.06
OP2	0.05	0.11	0.03	0.05	0.06	0.08	0.04	0.08	0.05	0.06	0.10	0.10	0.04	0.07	0.04	0.05	0.06	0.09	0.20	0.14	0.16	0.14
P	0.10	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.11	0.08	0.09	0.16	0.07	0.08	0.09	0.17	0.12	0.11	0.05	0.07	0.16	0.04	0.08	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.06	0.13	0.06	0.05
C2	0.02	0.00	0.09	0.04	0.02	0.09	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.18	0.04	0.14	0.13	0.09	0.08	0.06
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.05	0.03	0.07	0.06	0.10	0.03	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.22	0.16	0.20
C3'	0.03	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.22	0.21	0.15	0.18
C4	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.06	0.06	0.09	0.13	0.04	0.05
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.07	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.13	0.06	0.02
C5	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.09	0.12	0.05	0.04
C5'	0.01	0.08	0.05	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.04	0.06	0.06	0.04	0.03	0.03	0.05	0.03	0.01	0.01	0.15	0.05	0.02
C6	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.07	0.06	0.05	0.11	0.10	0.05	0.04
C8	0.01	0.03	0.07	0.06	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.15	0.10	0.08	0.08	0.15	0.06	0.07
N1	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.07	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.13	0.05	0.10	0.13	0.09	0.08	0.06
N3	0.03	0.01	0.10	0.04	0.01	0.08	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.17	0.05	0.15	0.11	0.10	0.05	0.04
N6	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.07	0.02	0.02	0.00	0.07	0.04	0.05	0.05	0.02	0.10	0.10	0.05	0.04
N7	0.01	0.02	0.06	0.06	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.07	0.00	0.02	0.12	0.10	0.04	0.08	0.14	0.05	0.04
N9	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.00	0.04	0.08	0.02	0.09	0.15	0.06	0.07
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.05	0.07	0.15	0.13	0.17	0.05	0.12	0.04	0.00	0.03	0.01	0.25	0.28	0.22	0.26
O3'	0.06	0.04	0.00	0.01	0.06	0.03	0.07	0.03	0.06	0.10	0.05	0.05	0.05	0.10	0.08	0.03	0.00	0.04	0.13	0.15	0.08	0.11
O4'	0.00	0.14	0.01	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.08	0.10	0.15	0.02	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.15	0.13	0.13	0.10
O5'	0.06	0.13	0.21	0.22	0.09	0.01	0.09	0.01	0.11	0.08	0.13	0.11	0.10	0.08	0.09	0.25	0.13	0.15	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.13	0.09	0.22	0.21	0.13	0.13	0.12	0.15	0.10	0.15	0.09	0.10	0.10	0.14	0.15	0.28	0.15	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.06	0.08	0.16	0.15	0.04	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.08	0.05	0.05	0.05	0.06	0.22	0.08	0.13	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.06	0.20	0.18	0.05	0.02	0.04	0.02	0.04	0.07	0.06	0.04	0.04	0.04	0.07	0.26	0.11	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00