Doublet Group distance statistics: 49812

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.022, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.022 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.036
C2	A	0, 0.000, 0.036, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.036 std_dev=0.036
C1'	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N1	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.000, 0.044, 0.088, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.044 std_dev=0.044
N3	A	0, 0.000, 0.044, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.044 std_dev=0.044
N6	A	0, 0.000, 0.064, 0.128, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.064 std_dev=0.064
O2'	A	0, 0.000, 0.073, 0.146, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.073 std_dev=0.073
O5'	A	0, 0.000, 0.169, 0.339, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.169 std_dev=0.169
C2'	A	0, 0.000, 0.216, 0.432, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.216 std_dev=0.216
C6	B	0, 0.000, 0.320, 0.640, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.320 std_dev=0.320
C5	B	0, 0.000, 0.323, 0.647, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.323 std_dev=0.323
O4'	A	0, 0.000, 0.323, 0.647, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.323 std_dev=0.323
N6	B	0, 0.000, 0.350, 0.700, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.350 std_dev=0.350
OP2	A	0, 0.000, 0.410, 0.821, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.410 std_dev=0.410
C3'	A	0, 0.000, 0.572, 1.143, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.572 std_dev=0.572
C4'	A	0, 0.000, 0.624, 1.247, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.624 std_dev=0.624
N7	B	0, 0.000, 0.625, 1.251, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.625 std_dev=0.625
C4	B	0, 0.000, 0.657, 1.314, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.657 std_dev=0.657
P	A	0, 0.000, 0.659, 1.317, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.659 std_dev=0.659
O3'	A	0, 0.000, 0.810, 1.620, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.810 std_dev=0.810
N1	B	0, 0.000, 0.833, 1.665, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.833 std_dev=0.833
N9	B	0, 0.000, 0.866, 1.733, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.866 std_dev=0.866
C8	B	0, 0.000, 0.889, 1.779, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.889 std_dev=0.889
N3	B	0, 0.000, 0.967, 1.935, 1.935 max_d=1.935 avg_d=0.967 std_dev=0.967
C2	B	0, 0.000, 1.042, 2.085, 2.085 max_d=2.085 avg_d=1.042 std_dev=1.042
C5'	A	0, 0.000, 1.060, 2.120, 2.120 max_d=2.120 avg_d=1.060 std_dev=1.060
P	B	0, 0.000, 1.091, 2.181, 2.181 max_d=2.181 avg_d=1.091 std_dev=1.091
C1'	B	0, 0.000, 1.195, 2.390, 2.390 max_d=2.390 avg_d=1.195 std_dev=1.195
O5'	B	0, 0.000, 1.240, 2.480, 2.480 max_d=2.480 avg_d=1.240 std_dev=1.240
OP1	A	0, 0.000, 1.255, 2.509, 2.509 max_d=2.509 avg_d=1.255 std_dev=1.255
O4'	B	0, 0.000, 1.274, 2.547, 2.547 max_d=2.547 avg_d=1.274 std_dev=1.274
O2'	B	0, 0.000, 1.364, 2.727, 2.727 max_d=2.727 avg_d=1.364 std_dev=1.364
C5'	B	0, 0.000, 1.426, 2.852, 2.852 max_d=2.852 avg_d=1.426 std_dev=1.426
C4'	B	0, 0.000, 1.476, 2.952, 2.952 max_d=2.952 avg_d=1.476 std_dev=1.476
C2'	B	0, 0.000, 1.567, 3.134, 3.134 max_d=3.134 avg_d=1.567 std_dev=1.567
C3'	B	0, 0.000, 1.610, 3.219, 3.219 max_d=3.219 avg_d=1.610 std_dev=1.610
OP1	B	0, 0.000, 1.693, 3.387, 3.387 max_d=3.387 avg_d=1.693 std_dev=1.693
O3'	B	0, 0.000, 1.912, 3.823, 3.823 max_d=3.823 avg_d=1.912 std_dev=1.912
OP2	B	0, 0.000, 2.095, 4.189, 4.189 max_d=4.189 avg_d=2.095 std_dev=2.095

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.03	0.17	0.20
C2	0.05	0.00	0.09	0.25	0.01	0.09	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.28	0.07	0.13	0.09	0.28	0.25
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.04	0.06	0.02	0.07	0.09	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.23	0.06	0.27	0.24
C3'	0.02	0.25	0.01	0.00	0.22	0.00	0.21	0.04	0.25	0.08	0.26	0.22	0.27	0.14	0.13	0.01	0.00	0.01	0.33	0.07	0.23	0.24
C4	0.02	0.01	0.08	0.22	0.00	0.11	0.01	0.26	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.03	0.12	0.04	0.27	0.26
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.11	0.00	0.14	0.00	0.15	0.10	0.12	0.06	0.20	0.13	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.05	0.02
C5	0.02	0.00	0.04	0.21	0.01	0.14	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.24	0.02	0.12	0.02	0.29	0.27
C5'	0.05	0.26	0.04	0.04	0.26	0.00	0.33	0.00	0.36	0.26	0.31	0.20	0.42	0.33	0.21	0.01	0.04	0.00	0.00	0.14	0.22	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.25	0.01	0.15	0.00	0.36	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.29	0.03	0.11	0.06	0.29	0.26
C8	0.01	0.00	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.26	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.09	0.00	0.13	0.06	0.27	0.30
N1	0.05	0.01	0.07	0.26	0.03	0.12	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.30	0.07	0.13	0.08	0.29	0.26
N3	0.06	0.00	0.09	0.22	0.01	0.06	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.23	0.08	0.14	0.06	0.28	0.26
N6	0.00	0.00	0.07	0.27	0.00	0.20	0.02	0.42	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.33	0.01	0.06	0.08	0.24	0.22
N7	0.02	0.00	0.01	0.14	0.01	0.13	0.00	0.33	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.02	0.03	0.17	0.01	0.12	0.04	0.30	0.30
N9	0.00	0.03	0.02	0.13	0.01	0.09	0.01	0.21	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.12	0.00	0.11	0.01	0.24	0.25
O2'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.08	0.18	0.14	0.10
O3'	0.00	0.28	0.01	0.00	0.22	0.01	0.24	0.04	0.29	0.09	0.30	0.23	0.33	0.17	0.12	0.05	0.00	0.01	0.29	0.21	0.15	0.12
O4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.06	0.05	0.03	0.11
O5'	0.09	0.13	0.23	0.33	0.12	0.00	0.12	0.00	0.11	0.13	0.13	0.14	0.06	0.12	0.11	0.08	0.29	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.03	0.09	0.06	0.07	0.04	0.18	0.02	0.14	0.06	0.06	0.08	0.06	0.08	0.04	0.01	0.18	0.21	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.28	0.27	0.23	0.27	0.05	0.29	0.22	0.29	0.27	0.29	0.28	0.24	0.30	0.24	0.14	0.15	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.25	0.24	0.24	0.26	0.02	0.27	0.01	0.26	0.30	0.26	0.26	0.22	0.30	0.25	0.10	0.12	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.49	0.07	0.24	0.09	0.05	0.01	0.04	0.22	0.30	0.51	0.30	0.13	0.29	0.09	0.32	0.10	0.25	0.28	0.81	0.99	0.17
C2	0.40	0.20	0.42	0.01	0.13	0.26	0.10	0.15	0.14	0.46	0.30	0.01	0.21	0.35	0.33	0.60	0.02	0.50	0.06	0.89	0.80	0.00
C2'	0.12	0.39	0.07	0.30	0.05	0.00	0.01	0.10	0.16	0.27	0.40	0.24	0.09	0.26	0.10	0.37	0.19	0.24	0.33	0.71	1.11	0.24
C3'	0.07	0.45	0.16	0.53	0.19	0.21	0.12	0.33	0.25	0.07	0.45	0.34	0.17	0.07	0.07	0.18	0.41	0.05	0.57	0.44	1.38	0.48
C4	0.27	0.29	0.26	0.14	0.05	0.14	0.07	0.02	0.16	0.39	0.36	0.11	0.18	0.34	0.23	0.49	0.07	0.38	0.21	0.83	0.98	0.13
C4'	0.13	0.63	0.25	0.53	0.28	0.19	0.18	0.28	0.34	0.05	0.61	0.48	0.22	0.07	0.13	0.06	0.36	0.03	0.54	0.54	1.26	0.42
C5	0.28	0.20	0.27	0.15	0.08	0.10	0.08	0.03	0.14	0.38	0.29	0.05	0.21	0.33	0.25	0.51	0.09	0.36	0.25	0.76	1.06	0.19
C5'	0.37	0.75	0.53	0.80	0.48	0.45	0.39	0.55	0.50	0.22	0.73	0.64	0.38	0.19	0.37	0.18	0.60	0.21	0.82	0.23	1.54	0.70
C6	0.39	0.10	0.41	0.06	0.16	0.18	0.12	0.05	0.11	0.44	0.21	0.06	0.23	0.34	0.34	0.61	0.06	0.45	0.15	0.80	1.00	0.11
C8	0.08	0.39	0.03	0.32	0.08	0.04	0.01	0.16	0.21	0.23	0.44	0.24	0.14	0.24	0.07	0.32	0.17	0.18	0.40	0.66	1.15	0.30
N1	0.44	0.11	0.47	0.01	0.18	0.26	0.12	0.14	0.11	0.47	0.22	0.06	0.22	0.34	0.36	0.64	0.03	0.51	0.06	0.86	0.84	0.01
N3	0.33	0.27	0.33	0.07	0.08	0.21	0.09	0.10	0.15	0.43	0.35	0.08	0.18	0.36	0.28	0.54	0.03	0.44	0.13	0.89	0.87	0.05
N6	0.42	0.02	0.46	0.05	0.19	0.17	0.11	0.02	0.10	0.42	0.14	0.13	0.26	0.28	0.36	0.65	0.09	0.45	0.16	0.74	1.06	0.14
N7	0.16	0.26	0.12	0.28	0.00	0.02	0.03	0.16	0.17	0.27	0.33	0.13	0.19	0.27	0.14	0.40	0.16	0.23	0.38	0.64	1.18	0.31
N9	0.16	0.40	0.12	0.23	0.04	0.05	0.02	0.06	0.20	0.32	0.44	0.22	0.15	0.30	0.13	0.38	0.11	0.27	0.29	0.78	1.04	0.20
O2'	0.12	0.48	0.08	0.26	0.08	0.06	0.00	0.02	0.20	0.30	0.48	0.30	0.11	0.29	0.10	0.35	0.15	0.27	0.25	0.83	0.97	0.13
O3'	0.15	0.48	0.27	0.65	0.25	0.31	0.18	0.42	0.29	0.02	0.46	0.39	0.22	0.01	0.15	0.10	0.55	0.03	0.66	0.34	1.47	0.56
O4'	0.04	0.57	0.04	0.30	0.15	0.02	0.04	0.07	0.25	0.25	0.57	0.39	0.11	0.25	0.03	0.22	0.11	0.21	0.32	0.79	1.00	0.20
O5'	0.16	0.57	0.27	0.51	0.23	0.21	0.07	0.27	0.16	0.09	0.48	0.46	0.08	0.16	0.12	0.08	0.30	0.01	0.47	0.59	1.15	0.33
OP1	0.04	0.16	0.26	0.48	0.04	0.15	0.06	0.25	0.08	0.09	0.05	0.15	0.21	0.15	0.01	0.16	0.26	0.09	0.48	0.44	1.22	0.39
OP2	0.14	0.43	0.28	0.49	0.15	0.21	0.05	0.26	0.06	0.11	0.26	0.36	0.37	0.22	0.07	0.11	0.28	0.01	0.41	0.58	1.05	0.26
P	0.02	0.33	0.19	0.39	0.05	0.07	0.13	0.13	0.10	0.22	0.19	0.26	0.35	0.30	0.03	0.17	0.17	0.13	0.33	0.68	0.99	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.23	0.01	0.08	0.53	0.04	0.18
C2	0.06	0.00	0.08	0.03	0.02	0.02	0.01	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.54	0.35	0.04	0.22	0.48	0.77	0.18
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.13	0.03	0.10	0.04	0.08	0.07	0.11	0.02	0.00	0.00	0.01	0.30	0.47	0.16	0.36
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.19	0.00	0.38	0.02	0.34	0.52	0.18	0.01	0.46	0.55	0.26	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.00
C4	0.02	0.02	0.00	0.19	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.35	0.10	0.02	0.27	0.48	0.68	0.16
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.08	0.00	0.19	0.02	0.17	0.31	0.07	0.04	0.24	0.31	0.14	0.27	0.02	0.00	0.03	0.08	0.19	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.38	0.00	0.19	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.15	0.01	0.48	0.39	1.03	0.37
C5'	0.04	0.10	0.13	0.02	0.17	0.02	0.31	0.00	0.32	0.38	0.21	0.04	0.41	0.44	0.17	0.11	0.11	0.03	0.01	0.10	0.32	0.02
C6	0.02	0.00	0.03	0.34	0.00	0.17	0.00	0.32	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.39	0.09	0.02	0.50	0.35	1.17	0.43
C8	0.01	0.03	0.10	0.52	0.02	0.31	0.01	0.38	0.02	0.00	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.07	0.38	0.00	0.50	0.43	0.77	0.27
N1	0.05	0.01	0.04	0.18	0.02	0.07	0.01	0.21	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.50	0.15	0.03	0.38	0.40	1.03	0.33
N3	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.49	0.39	0.04	0.13	0.51	0.56	0.07
N6	0.01	0.00	0.07	0.46	0.01	0.24	0.01	0.41	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.34	0.26	0.01	0.63	0.26	1.41	0.58
N7	0.02	0.02	0.11	0.55	0.00	0.31	0.00	0.44	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.41	0.01	0.63	0.34	1.15	0.48
N9	0.00	0.03	0.02	0.26	0.01	0.14	0.00	0.17	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.18	0.02	0.00	0.21	0.50	0.47	0.06
O2'	0.00	0.54	0.00	0.02	0.35	0.27	0.31	0.11	0.39	0.07	0.50	0.49	0.34	0.16	0.18	0.00	0.00	0.21	0.18	0.30	0.12	0.25
O3'	0.23	0.35	0.00	0.00	0.10	0.02	0.15	0.11	0.09	0.38	0.15	0.39	0.26	0.41	0.02	0.00	0.00	0.14	0.16	0.41	0.16	0.23
O4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.01	0.00	0.21	0.14	0.00	0.08	0.51	0.13	0.19
O5'	0.08	0.22	0.30	0.01	0.27	0.03	0.48	0.01	0.50	0.50	0.38	0.13	0.63	0.63	0.21	0.18	0.16	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.53	0.48	0.47	0.06	0.48	0.08	0.39	0.10	0.35	0.43	0.40	0.51	0.26	0.34	0.50	0.30	0.41	0.51	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.77	0.16	0.02	0.68	0.19	1.03	0.32	1.17	0.77	1.03	0.56	1.41	1.15	0.47	0.12	0.16	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.18	0.36	0.00	0.16	0.06	0.37	0.02	0.43	0.27	0.33	0.07	0.58	0.48	0.06	0.25	0.23	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00