Doublet Group distance statistics: 49821

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 8, 6, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.011, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.010, 0.024, 0.037, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C8	A	0, 0.011, 0.025, 0.040, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C4	B	0, 0.109, 0.238, 0.368, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.238 std_dev=0.130
C2'	A	0, -0.055, 0.086, 0.228, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.086 std_dev=0.142
O2'	A	0, -0.004, 0.146, 0.297, 0.682 max_d=0.682 avg_d=0.146 std_dev=0.150
O4'	A	0, -0.077, 0.085, 0.248, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.085 std_dev=0.162
C6	B	0, 0.129, 0.292, 0.455, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.292 std_dev=0.163
N4	B	0, 0.093, 0.259, 0.425, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.259 std_dev=0.166
N3	B	0, 0.103, 0.269, 0.436, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.269 std_dev=0.167
C5	B	0, 0.115, 0.283, 0.451, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.283 std_dev=0.168
N1	B	0, 0.081, 0.298, 0.515, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.298 std_dev=0.217
C4'	A	0, -0.102, 0.129, 0.359, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.129 std_dev=0.231
C3'	A	0, -0.120, 0.118, 0.356, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.118 std_dev=0.238
C2	B	0, 0.057, 0.309, 0.560, 1.369 max_d=1.369 avg_d=0.309 std_dev=0.252
C3'	B	0, 0.142, 0.411, 0.679, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.411 std_dev=0.269
O4'	B	0, 0.089, 0.379, 0.668, 1.530 max_d=1.530 avg_d=0.379 std_dev=0.290
C1'	B	0, 0.064, 0.365, 0.665, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.365 std_dev=0.300
C2'	B	0, 0.111, 0.424, 0.738, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.424 std_dev=0.313
C4'	B	0, 0.100, 0.432, 0.763, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.432 std_dev=0.331
O3'	B	0, 0.131, 0.468, 0.805, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.468 std_dev=0.337
O3'	A	0, -0.167, 0.175, 0.518, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.175 std_dev=0.343
O5'	A	0, -0.075, 0.280, 0.635, 1.868 max_d=1.868 avg_d=0.280 std_dev=0.355
C5'	A	0, -0.165, 0.223, 0.611, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.223 std_dev=0.388
O2	B	0, -0.007, 0.383, 0.774, 2.176 max_d=2.176 avg_d=0.383 std_dev=0.391
OP2	A	0, -0.029, 0.370, 0.769, 2.179 max_d=2.179 avg_d=0.370 std_dev=0.399
C5'	B	0, 0.013, 0.483, 0.953, 2.544 max_d=2.544 avg_d=0.483 std_dev=0.470
O2'	B	0, 0.090, 0.567, 1.044, 2.516 max_d=2.516 avg_d=0.567 std_dev=0.477
O5'	B	0, -0.013, 0.471, 0.955, 2.599 max_d=2.599 avg_d=0.471 std_dev=0.484
P	A	0, -0.187, 0.350, 0.888, 2.854 max_d=2.854 avg_d=0.350 std_dev=0.537
OP2	B	0, -0.039, 0.547, 1.133, 3.117 max_d=3.117 avg_d=0.547 std_dev=0.586
P	B	0, -0.143, 0.553, 1.250, 3.724 max_d=3.724 avg_d=0.553 std_dev=0.697
OP1	A	0, -0.316, 0.444, 1.204, 4.025 max_d=4.025 avg_d=0.444 std_dev=0.760
OP1	B	0, -0.390, 0.651, 1.691, 5.535 max_d=5.535 avg_d=0.651 std_dev=1.040

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.11	0.19	0.10	0.13
C2	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.15	0.06	0.24	0.35	0.16	0.31
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.10	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.15	0.08	0.14
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.05	0.10	0.11	0.06	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.17	0.14	0.05	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.03	0.24	0.33	0.15	0.30
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.09	0.14	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.02	0.30	0.39	0.20	0.36
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.07	0.05	0.03	0.07	0.07	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.12	0.18	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.31	0.41	0.22	0.39
C8	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.04	0.04	0.31	0.35	0.16	0.33
N1	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.05	0.28	0.39	0.20	0.36
N3	0.02	0.00	0.10	0.11	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.06	0.20	0.31	0.13	0.27
N6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.34	0.45	0.26	0.42
N7	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.03	0.34	0.40	0.22	0.39
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.23	0.30	0.12	0.25
O2'	0.02	0.09	0.00	0.03	0.05	0.05	0.06	0.06	0.07	0.05	0.08	0.08	0.07	0.05	0.03	0.00	0.03	0.03	0.04	0.09	0.08	0.04
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.10	0.04	0.13	0.13	0.09	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.11	0.07	0.05	0.07
O4'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.05	0.06	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.15	0.17	0.05
O5'	0.11	0.24	0.15	0.17	0.24	0.01	0.30	0.01	0.31	0.31	0.28	0.20	0.34	0.34	0.23	0.04	0.11	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.19	0.35	0.15	0.14	0.33	0.09	0.39	0.12	0.41	0.35	0.39	0.31	0.45	0.40	0.30	0.09	0.07	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.16	0.08	0.05	0.15	0.14	0.20	0.18	0.22	0.16	0.20	0.13	0.26	0.22	0.12	0.08	0.05	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.31	0.14	0.13	0.30	0.02	0.36	0.01	0.39	0.33	0.36	0.27	0.42	0.39	0.25	0.04	0.07	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.09	0.12	0.15	0.07	0.05	0.07	0.06	0.05	0.06	0.09	0.10	0.14	0.08	0.12	0.07	0.18	0.15	0.18	0.20
C2	0.11	0.09	0.09	0.12	0.07	0.10	0.08	0.07	0.09	0.10	0.08	0.08	0.11	0.17	0.11	0.14	0.16	0.15	0.17	0.13
C2'	0.06	0.09	0.12	0.11	0.11	0.08	0.14	0.09	0.10	0.05	0.09	0.17	0.17	0.09	0.09	0.10	0.08	0.29	0.30	0.34
C3'	0.17	0.20	0.24	0.22	0.11	0.08	0.12	0.06	0.08	0.13	0.16	0.18	0.30	0.20	0.18	0.08	0.14	0.28	0.26	0.29
C4	0.07	0.07	0.10	0.14	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.08	0.10	0.11	0.11	0.09	0.18	0.12	0.17	0.15
C4'	0.19	0.20	0.24	0.25	0.10	0.14	0.09	0.15	0.10	0.16	0.16	0.15	0.27	0.19	0.21	0.14	0.24	0.17	0.16	0.18
C5	0.08	0.08	0.10	0.15	0.06	0.07	0.06	0.08	0.07	0.08	0.07	0.07	0.10	0.12	0.13	0.10	0.20	0.14	0.15	0.12
C5'	0.29	0.27	0.31	0.33	0.16	0.25	0.15	0.26	0.18	0.24	0.22	0.19	0.34	0.27	0.30	0.25	0.33	0.14	0.12	0.12
C6	0.12	0.11	0.09	0.13	0.08	0.09	0.08	0.07	0.09	0.11	0.09	0.09	0.14	0.17	0.12	0.13	0.20	0.20	0.15	0.11
C8	0.09	0.10	0.13	0.17	0.07	0.08	0.06	0.11	0.06	0.08	0.09	0.10	0.14	0.09	0.15	0.08	0.22	0.13	0.17	0.16
N1	0.13	0.12	0.10	0.12	0.08	0.11	0.09	0.08	0.10	0.12	0.10	0.09	0.15	0.20	0.12	0.15	0.17	0.20	0.16	0.11
N3	0.08	0.07	0.10	0.12	0.06	0.08	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.08	0.09	0.13	0.11	0.11	0.16	0.11	0.17	0.16
N6	0.15	0.16	0.11	0.14	0.10	0.10	0.10	0.09	0.11	0.14	0.14	0.11	0.21	0.21	0.14	0.15	0.22	0.27	0.15	0.10
N7	0.09	0.10	0.12	0.17	0.06	0.08	0.06	0.11	0.06	0.08	0.09	0.08	0.12	0.10	0.15	0.09	0.23	0.14	0.15	0.13
N9	0.07	0.08	0.12	0.15	0.06	0.06	0.06	0.07	0.05	0.06	0.08	0.09	0.12	0.08	0.12	0.07	0.19	0.13	0.17	0.18
O2'	0.07	0.08	0.08	0.07	0.13	0.14	0.16	0.15	0.13	0.08	0.09	0.17	0.12	0.10	0.09	0.15	0.07	0.33	0.32	0.37
O3'	0.22	0.25	0.30	0.25	0.12	0.11	0.14	0.07	0.10	0.17	0.19	0.20	0.38	0.28	0.22	0.12	0.13	0.35	0.29	0.33
O4'	0.15	0.15	0.19	0.23	0.09	0.13	0.08	0.17	0.10	0.13	0.13	0.10	0.20	0.11	0.19	0.12	0.29	0.13	0.13	0.13
O5'	0.18	0.22	0.18	0.13	0.36	0.19	0.36	0.16	0.29	0.22	0.28	0.46	0.18	0.22	0.16	0.20	0.11	0.47	0.41	0.45
OP1	0.11	0.20	0.14	0.10	0.37	0.11	0.33	0.11	0.23	0.17	0.29	0.50	0.18	0.15	0.11	0.11	0.12	0.42	0.36	0.37
OP2	0.10	0.15	0.11	0.09	0.29	0.10	0.29	0.09	0.20	0.13	0.21	0.41	0.15	0.12	0.09	0.10	0.09	0.42	0.36	0.37
P	0.17	0.24	0.19	0.13	0.39	0.16	0.37	0.12	0.28	0.22	0.32	0.51	0.21	0.22	0.15	0.17	0.09	0.44	0.38	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.11	0.25	0.18
C2	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.17	0.16	0.19	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.05	0.04	0.06	0.07	0.09	0.00	0.01	0.00	0.04	0.21	0.21	0.10
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.17	0.00	0.18	0.02	0.15	0.10	0.15	0.19	0.10	0.02	0.01	0.01	0.06	0.29	0.10	0.07
C4	0.01	0.00	0.06	0.17	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.17	0.02	0.26	0.18	0.16	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.04	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.09	0.13	0.08
C5	0.01	0.00	0.06	0.18	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.18	0.02	0.27	0.16	0.16	0.13
C5'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.14	0.00	0.16	0.00	0.14	0.08	0.11	0.15	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.15	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.15	0.01	0.23	0.14	0.19	0.14
N1	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.16	0.13	0.21	0.14
N3	0.01	0.00	0.06	0.15	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.13	0.02	0.22	0.18	0.17	0.12
N4	0.01	0.00	0.07	0.19	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.19	0.02	0.28	0.19	0.16	0.12
O2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.10	0.01	0.13	0.17	0.21	0.14
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.06	0.04	0.10	0.00	0.07	0.03	0.04	0.22	0.18	0.08
O3'	0.03	0.09	0.01	0.01	0.17	0.02	0.18	0.03	0.15	0.08	0.13	0.19	0.10	0.07	0.00	0.02	0.09	0.45	0.09	0.18
O4'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.15	0.27	0.24
O5'	0.05	0.17	0.04	0.06	0.26	0.01	0.27	0.01	0.23	0.16	0.22	0.28	0.13	0.04	0.09	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.11	0.16	0.21	0.29	0.18	0.09	0.16	0.05	0.14	0.13	0.18	0.19	0.17	0.22	0.45	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.19	0.21	0.10	0.16	0.13	0.16	0.03	0.19	0.21	0.17	0.16	0.21	0.18	0.09	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.13	0.10	0.07	0.12	0.08	0.13	0.01	0.14	0.14	0.12	0.12	0.14	0.08	0.18	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00