Doublet Group distance statistics: 49828

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 6, 16, 29, 50, 59, 27, 26, 16, 16, 15, 5, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.001, 0.013, 0.026, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.140 max_d=0.140 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.008, 0.023, 0.039, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.014, 0.035, 0.056, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.035 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.018, 0.042, 0.065, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.042 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.033 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.132, 0.245, 0.359, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.245 std_dev=0.114
C2'	A	0, 0.124, 0.240, 0.356, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.240 std_dev=0.116
O2'	A	0, 0.115, 0.235, 0.355, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.235 std_dev=0.120
C4'	A	0, 0.237, 0.422, 0.608, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.422 std_dev=0.186
C3'	A	0, 0.238, 0.434, 0.630, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.434 std_dev=0.196
N2	B	0, 0.372, 0.570, 0.768, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.570 std_dev=0.198
O5'	A	0, 0.409, 0.633, 0.856, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.633 std_dev=0.223
C2	B	0, 0.355, 0.587, 0.818, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.587 std_dev=0.231
N3	B	0, 0.281, 0.514, 0.748, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.514 std_dev=0.233
P	A	0, 0.522, 0.763, 1.004, 1.918 max_d=1.918 avg_d=0.763 std_dev=0.241
OP2	A	0, 0.490, 0.732, 0.973, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.732 std_dev=0.241
C4	B	0, 0.317, 0.585, 0.852, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.585 std_dev=0.268
O3'	A	0, 0.336, 0.618, 0.899, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.618 std_dev=0.282
C5'	A	0, 0.390, 0.677, 0.964, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.677 std_dev=0.287
N1	B	0, 0.450, 0.746, 1.042, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.746 std_dev=0.296
N9	B	0, 0.311, 0.623, 0.935, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.623 std_dev=0.312
OP1	A	0, 0.611, 0.946, 1.281, 2.997 max_d=2.997 avg_d=0.946 std_dev=0.335
C5	B	0, 0.365, 0.703, 1.040, 1.891 max_d=1.891 avg_d=0.703 std_dev=0.338
C6	B	0, 0.460, 0.818, 1.176, 2.196 max_d=2.196 avg_d=0.818 std_dev=0.358
C8	B	0, 0.338, 0.697, 1.056, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.697 std_dev=0.359
N7	B	0, 0.366, 0.757, 1.147, 2.087 max_d=2.087 avg_d=0.757 std_dev=0.390
C1'	B	0, 0.266, 0.665, 1.063, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.665 std_dev=0.399
O6	B	0, 0.588, 1.011, 1.433, 2.711 max_d=2.711 avg_d=1.011 std_dev=0.423
O4'	B	0, 0.265, 0.689, 1.114, 2.039 max_d=2.039 avg_d=0.689 std_dev=0.424
C3'	B	0, 0.375, 0.804, 1.232, 2.320 max_d=2.320 avg_d=0.804 std_dev=0.429
C4'	B	0, 0.314, 0.763, 1.213, 2.172 max_d=2.172 avg_d=0.763 std_dev=0.449
O5'	B	0, 0.451, 0.912, 1.374, 2.560 max_d=2.560 avg_d=0.912 std_dev=0.461
C5'	B	0, 0.376, 0.842, 1.307, 2.727 max_d=2.727 avg_d=0.842 std_dev=0.466
O3'	B	0, 0.467, 0.937, 1.406, 2.796 max_d=2.796 avg_d=0.937 std_dev=0.470
C2'	B	0, 0.253, 0.727, 1.200, 2.165 max_d=2.165 avg_d=0.727 std_dev=0.473
P	B	0, 0.531, 1.053, 1.574, 3.196 max_d=3.196 avg_d=1.053 std_dev=0.521
OP2	B	0, 0.533, 1.097, 1.660, 3.086 max_d=3.086 avg_d=1.097 std_dev=0.564
O2'	B	0, 0.337, 0.914, 1.492, 2.537 max_d=2.537 avg_d=0.914 std_dev=0.577
OP1	B	0, 0.625, 1.205, 1.786, 3.879 max_d=3.879 avg_d=1.205 std_dev=0.581

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.05	0.09	0.06
C2	0.03	0.00	0.14	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.15	0.09	0.10	0.12	0.16	0.13
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.01	0.09	0.06	0.12	0.13	0.08	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.09	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.12	0.08	0.13	0.10	0.12	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.05	0.10	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.10	0.05	0.09	0.10	0.14	0.10
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.03	0.04	0.06	0.08	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.12	0.14	0.18	0.13
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.09	0.11	0.08	0.07	0.11	0.12	0.05	0.05	0.05	0.02	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.12	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.05	0.13	0.15	0.20	0.15
C8	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.06	0.13	0.13	0.15	0.13
N1	0.02	0.00	0.12	0.13	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.16	0.08	0.12	0.13	0.19	0.14
N3	0.03	0.00	0.13	0.10	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.09	0.09	0.10	0.14	0.11
N6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.16	0.05	0.15	0.19	0.24	0.18
N7	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04	0.15	0.17	0.20	0.16
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.08	0.08	0.12	0.08
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.05	0.12	0.12	0.08	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.04	0.09	0.07	0.05
O3'	0.02	0.15	0.03	0.01	0.10	0.02	0.12	0.05	0.14	0.09	0.16	0.12	0.16	0.11	0.05	0.05	0.00	0.02	0.09	0.16	0.11	0.10
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.09	0.05	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.07	0.08	0.09	0.08
O5'	0.05	0.10	0.04	0.05	0.09	0.02	0.12	0.01	0.13	0.13	0.12	0.09	0.15	0.15	0.08	0.04	0.09	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.05	0.12	0.07	0.10	0.10	0.06	0.14	0.06	0.15	0.13	0.13	0.10	0.19	0.17	0.08	0.09	0.16	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.16	0.09	0.08	0.14	0.04	0.18	0.02	0.20	0.15	0.19	0.14	0.24	0.20	0.12	0.07	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.05	0.06	0.10	0.02	0.13	0.02	0.15	0.13	0.14	0.11	0.18	0.16	0.08	0.05	0.10	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.12	0.22	0.19	0.12	0.16	0.13	0.16	0.14	0.13	0.14	0.12	0.13	0.13	0.13	0.24	0.22	0.16	0.13	0.16	0.15	0.16	0.14
C2	0.20	0.15	0.33	0.33	0.15	0.26	0.15	0.26	0.15	0.17	0.16	0.16	0.15	0.15	0.17	0.38	0.42	0.22	0.23	0.16	0.27	0.23	0.24
C2'	0.17	0.14	0.24	0.21	0.15	0.19	0.14	0.19	0.15	0.15	0.14	0.14	0.15	0.14	0.15	0.27	0.24	0.18	0.14	0.16	0.16	0.17	0.15
C3'	0.14	0.13	0.21	0.18	0.13	0.14	0.13	0.15	0.14	0.13	0.14	0.13	0.13	0.13	0.13	0.23	0.19	0.14	0.12	0.16	0.14	0.17	0.14
C4	0.16	0.12	0.27	0.25	0.12	0.20	0.12	0.20	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.12	0.14	0.31	0.31	0.18	0.16	0.14	0.19	0.17	0.17
C4'	0.11	0.11	0.19	0.15	0.11	0.12	0.12	0.13	0.14	0.11	0.13	0.11	0.11	0.13	0.11	0.21	0.16	0.13	0.12	0.17	0.13	0.18	0.14
C5	0.18	0.14	0.30	0.28	0.13	0.22	0.13	0.22	0.14	0.14	0.15	0.16	0.13	0.13	0.15	0.35	0.35	0.19	0.18	0.15	0.20	0.19	0.18
C5'	0.11	0.11	0.18	0.15	0.11	0.11	0.13	0.12	0.16	0.12	0.14	0.11	0.10	0.14	0.11	0.19	0.14	0.13	0.14	0.19	0.14	0.20	0.17
C6	0.22	0.17	0.36	0.35	0.17	0.28	0.16	0.27	0.17	0.18	0.18	0.19	0.17	0.17	0.19	0.44	0.44	0.22	0.24	0.17	0.27	0.23	0.24
C8	0.17	0.12	0.24	0.21	0.13	0.18	0.12	0.18	0.12	0.13	0.13	0.12	0.14	0.12	0.14	0.27	0.24	0.17	0.15	0.14	0.16	0.17	0.15
N1	0.23	0.17	0.37	0.37	0.17	0.29	0.17	0.29	0.17	0.19	0.17	0.18	0.17	0.18	0.19	0.44	0.48	0.24	0.26	0.17	0.30	0.26	0.26
N3	0.17	0.13	0.28	0.27	0.13	0.22	0.13	0.22	0.14	0.14	0.14	0.14	0.13	0.13	0.14	0.32	0.35	0.19	0.18	0.15	0.22	0.19	0.19
N6	0.26	0.21	0.42	0.41	0.20	0.32	0.20	0.31	0.20	0.21	0.21	0.22	0.20	0.20	0.22	0.52	0.51	0.26	0.28	0.21	0.30	0.27	0.27
N7	0.18	0.12	0.28	0.25	0.13	0.20	0.12	0.20	0.13	0.13	0.14	0.14	0.13	0.12	0.15	0.32	0.29	0.18	0.16	0.14	0.17	0.17	0.16
N9	0.15	0.12	0.24	0.21	0.12	0.17	0.12	0.17	0.13	0.12	0.13	0.12	0.12	0.12	0.13	0.27	0.25	0.17	0.14	0.14	0.16	0.16	0.15
O2'	0.17	0.13	0.24	0.21	0.14	0.19	0.13	0.19	0.14	0.14	0.14	0.13	0.14	0.13	0.15	0.26	0.23	0.18	0.14	0.16	0.16	0.16	0.15
O3'	0.14	0.13	0.21	0.17	0.13	0.15	0.13	0.15	0.15	0.13	0.14	0.13	0.13	0.14	0.13	0.23	0.19	0.14	0.13	0.18	0.15	0.20	0.17
O4'	0.14	0.13	0.20	0.17	0.13	0.14	0.15	0.15	0.17	0.14	0.16	0.13	0.13	0.15	0.14	0.22	0.18	0.15	0.13	0.19	0.14	0.18	0.15
O5'	0.11	0.11	0.18	0.16	0.11	0.11	0.13	0.13	0.15	0.12	0.14	0.11	0.11	0.14	0.11	0.20	0.16	0.13	0.15	0.18	0.15	0.20	0.17
OP1	0.13	0.11	0.17	0.16	0.14	0.14	0.18	0.16	0.20	0.17	0.16	0.09	0.11	0.20	0.14	0.18	0.17	0.17	0.21	0.25	0.23	0.28	0.25
OP2	0.12	0.10	0.17	0.16	0.12	0.13	0.14	0.14	0.16	0.14	0.14	0.10	0.11	0.15	0.12	0.19	0.19	0.15	0.18	0.18	0.19	0.23	0.21
P	0.11	0.10	0.17	0.15	0.12	0.11	0.15	0.12	0.17	0.14	0.15	0.10	0.10	0.16	0.12	0.18	0.15	0.13	0.17	0.21	0.18	0.23	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.00	0.09	0.02	0.09	0.11	0.09
C2	0.03	0.00	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.12	0.07	0.14	0.02	0.15	0.21	0.17
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.03	0.08	0.05	0.10	0.13	0.11	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.08	0.10	0.13	0.10
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.11	0.09	0.11	0.11	0.09	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.08	0.12	0.11	0.08	0.07
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.04	0.15	0.01	0.15	0.19	0.16
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.04	0.07	0.05	0.07	0.03	0.07	0.02	0.00	0.02	0.05	0.07	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.08	0.03	0.17	0.01	0.18	0.23	0.20
C5'	0.02	0.07	0.03	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.12	0.08	0.08	0.07	0.13	0.07	0.06	0.05	0.02	0.01	0.11	0.10	0.09	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.18	0.01	0.19	0.25	0.21
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.08	0.05	0.18	0.02	0.18	0.20	0.18
N1	0.03	0.01	0.10	0.11	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.11	0.05	0.16	0.01	0.17	0.23	0.19
N2	0.04	0.01	0.13	0.11	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.14	0.09	0.14	0.02	0.14	0.20	0.17
N3	0.03	0.01	0.11	0.09	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.07	0.13	0.01	0.13	0.18	0.15
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.03	0.19	0.02	0.21	0.25	0.21
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.14	0.02	0.13	0.17	0.14
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.06	0.07	0.07	0.06	0.09	0.08	0.11	0.16	0.11	0.08	0.04	0.00	0.05	0.05	0.06	0.10	0.09	0.11	0.07
O3'	0.06	0.12	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.05	0.10	0.08	0.11	0.14	0.10	0.09	0.04	0.05	0.00	0.04	0.11	0.11	0.18	0.14	0.13
O4'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.05	0.09	0.07	0.03	0.01	0.05	0.04	0.00	0.09	0.03	0.10	0.10	0.09
O5'	0.09	0.14	0.10	0.08	0.15	0.02	0.17	0.01	0.18	0.18	0.16	0.14	0.13	0.19	0.14	0.06	0.11	0.09	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.12	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.11	0.03	0.19	0.00	0.22	0.28	0.23
OP1	0.09	0.15	0.10	0.11	0.15	0.07	0.18	0.10	0.19	0.18	0.17	0.14	0.13	0.21	0.13	0.09	0.18	0.10	0.02	0.22	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.21	0.13	0.08	0.19	0.07	0.23	0.09	0.25	0.20	0.23	0.20	0.18	0.25	0.17	0.11	0.14	0.10	0.02	0.28	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.17	0.10	0.07	0.16	0.02	0.20	0.02	0.21	0.18	0.19	0.17	0.15	0.21	0.14	0.07	0.13	0.09	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00