Doublet Group distance statistics: 49829

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 11, 6, 12, 4, 8, 3, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C2	A	0, -0.001, 0.010, 0.022, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.010 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.014 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.001, 0.015, 0.028, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.019 std_dev=0.016
C1'	A	0, -0.002, 0.015, 0.033, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.015 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.003, 0.020, 0.037, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.020 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.003, 0.027, 0.051, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.027 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.005, 0.030, 0.055, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.030 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.004, 0.034, 0.065, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.034 std_dev=0.031
O4'	A	0, -0.007, 0.078, 0.164, 0.394 max_d=0.394 avg_d=0.078 std_dev=0.085
C2'	A	0, 0.003, 0.101, 0.199, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.101 std_dev=0.098
C4'	A	0, 0.008, 0.129, 0.250, 0.615 max_d=0.615 avg_d=0.129 std_dev=0.121
O2'	A	0, 0.024, 0.151, 0.279, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.151 std_dev=0.128
C3'	A	0, 0.011, 0.150, 0.289, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.150 std_dev=0.139
O3'	A	0, 0.018, 0.224, 0.430, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.224 std_dev=0.206
C5'	A	0, 0.010, 0.224, 0.437, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.224 std_dev=0.213
O2'	B	0, 0.176, 0.490, 0.803, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.490 std_dev=0.313
N3	B	0, 0.123, 0.437, 0.751, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.437 std_dev=0.314
N2	B	0, 0.039, 0.363, 0.687, 1.933 max_d=1.933 avg_d=0.363 std_dev=0.324
C2'	B	0, 0.194, 0.534, 0.874, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.534 std_dev=0.340
C2	B	0, 0.082, 0.426, 0.770, 1.683 max_d=1.683 avg_d=0.426 std_dev=0.344
C1'	B	0, 0.212, 0.558, 0.904, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.558 std_dev=0.346
C4	B	0, 0.161, 0.524, 0.886, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.524 std_dev=0.362
N9	B	0, 0.200, 0.573, 0.946, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.573 std_dev=0.373
O5'	A	0, -0.074, 0.309, 0.691, 1.892 max_d=1.892 avg_d=0.309 std_dev=0.382
P	A	0, -0.023, 0.371, 0.765, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.371 std_dev=0.394
OP2	A	0, -0.004, 0.396, 0.796, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.396 std_dev=0.400
N1	B	0, 0.081, 0.504, 0.926, 2.027 max_d=2.027 avg_d=0.504 std_dev=0.422
C3'	B	0, 0.241, 0.664, 1.087, 1.898 max_d=1.898 avg_d=0.664 std_dev=0.423
O4'	B	0, 0.250, 0.677, 1.104, 1.963 max_d=1.963 avg_d=0.677 std_dev=0.427
C8	B	0, 0.228, 0.668, 1.108, 2.142 max_d=2.142 avg_d=0.668 std_dev=0.440
C5	B	0, 0.167, 0.609, 1.050, 2.090 max_d=2.090 avg_d=0.609 std_dev=0.441
O3'	B	0, 0.246, 0.699, 1.151, 2.063 max_d=2.063 avg_d=0.699 std_dev=0.452
C4'	B	0, 0.266, 0.725, 1.185, 2.064 max_d=2.064 avg_d=0.725 std_dev=0.459
C6	B	0, 0.128, 0.609, 1.089, 2.315 max_d=2.315 avg_d=0.609 std_dev=0.480
N7	B	0, 0.211, 0.700, 1.188, 2.280 max_d=2.280 avg_d=0.700 std_dev=0.488
C5'	B	0, 0.296, 0.861, 1.427, 2.564 max_d=2.564 avg_d=0.861 std_dev=0.566
O6	B	0, 0.136, 0.702, 1.268, 2.735 max_d=2.735 avg_d=0.702 std_dev=0.566
OP1	A	0, -0.093, 0.498, 1.088, 2.691 max_d=2.691 avg_d=0.498 std_dev=0.590
O5'	B	0, 0.274, 0.873, 1.471, 2.622 max_d=2.622 avg_d=0.873 std_dev=0.599
P	B	0, 0.304, 1.001, 1.697, 3.022 max_d=3.022 avg_d=1.001 std_dev=0.696
OP2	B	0, 0.317, 1.036, 1.756, 3.041 max_d=3.041 avg_d=1.036 std_dev=0.720
OP1	B	0, 0.268, 1.050, 1.832, 3.520 max_d=3.520 avg_d=1.050 std_dev=0.782

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.06	0.29	0.12
C2	0.03	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.25	0.13	0.23	0.11
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.07	0.08	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.16	0.15	0.24	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.08	0.08	0.08	0.07	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.20	0.24	0.19	0.09
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.24	0.11	0.23	0.10
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.05	0.01	0.00	0.02	0.09	0.26	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.28	0.14	0.22	0.12
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.05	0.08	0.08	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.12	0.22	0.01
C6	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.29	0.15	0.22	0.13
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.08	0.03	0.27	0.10	0.22	0.10
N1	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.28	0.15	0.23	0.12
N3	0.03	0.00	0.08	0.08	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.22	0.11	0.24	0.10
N6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.09	0.02	0.30	0.18	0.22	0.15
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.29	0.14	0.20	0.13
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.21	0.08	0.25	0.09
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.03	0.08	0.09	0.06	0.03	0.02	0.00	0.04	0.04	0.09	0.14	0.24	0.07
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.03	0.09	0.08	0.10	0.10	0.09	0.08	0.04	0.04	0.00	0.01	0.17	0.32	0.17	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.12	0.33	0.19
O5'	0.10	0.25	0.16	0.20	0.24	0.02	0.28	0.01	0.29	0.27	0.28	0.22	0.30	0.29	0.21	0.09	0.17	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.13	0.15	0.24	0.11	0.09	0.14	0.12	0.15	0.10	0.15	0.11	0.18	0.14	0.08	0.14	0.32	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.29	0.23	0.24	0.19	0.23	0.26	0.22	0.22	0.22	0.22	0.23	0.24	0.22	0.20	0.25	0.24	0.17	0.33	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.11	0.06	0.09	0.10	0.07	0.12	0.01	0.13	0.10	0.12	0.10	0.15	0.13	0.09	0.07	0.12	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.14	0.20	0.20	0.16	0.20	0.16	0.19	0.18	0.16	0.16	0.15	0.16	0.16	0.16	0.21	0.22	0.20	0.18	0.22	0.18	0.22	0.18
C2	0.19	0.11	0.21	0.21	0.12	0.22	0.11	0.21	0.14	0.13	0.15	0.12	0.12	0.11	0.14	0.24	0.25	0.21	0.19	0.18	0.20	0.17	0.16
C2'	0.20	0.12	0.22	0.21	0.13	0.21	0.11	0.20	0.13	0.13	0.11	0.14	0.16	0.12	0.16	0.24	0.24	0.21	0.17	0.18	0.17	0.19	0.16
C3'	0.20	0.13	0.21	0.20	0.13	0.21	0.10	0.20	0.12	0.12	0.10	0.16	0.17	0.11	0.15	0.24	0.22	0.21	0.17	0.17	0.16	0.18	0.15
C4	0.18	0.11	0.20	0.20	0.12	0.20	0.11	0.19	0.14	0.12	0.14	0.10	0.13	0.12	0.14	0.22	0.23	0.19	0.17	0.18	0.17	0.18	0.15
C4'	0.18	0.14	0.18	0.17	0.15	0.19	0.14	0.19	0.15	0.15	0.13	0.18	0.16	0.15	0.15	0.19	0.19	0.19	0.17	0.20	0.18	0.23	0.18
C5	0.18	0.10	0.20	0.20	0.12	0.20	0.11	0.19	0.13	0.12	0.14	0.10	0.12	0.11	0.14	0.22	0.23	0.19	0.17	0.17	0.18	0.17	0.15
C5'	0.16	0.14	0.14	0.14	0.13	0.17	0.14	0.18	0.15	0.14	0.12	0.18	0.15	0.15	0.14	0.15	0.14	0.18	0.16	0.20	0.18	0.24	0.19
C6	0.19	0.12	0.21	0.21	0.12	0.22	0.11	0.21	0.14	0.13	0.15	0.14	0.12	0.12	0.15	0.24	0.25	0.21	0.19	0.17	0.21	0.18	0.17
C8	0.19	0.13	0.20	0.19	0.14	0.19	0.14	0.19	0.15	0.14	0.15	0.14	0.16	0.14	0.16	0.21	0.22	0.19	0.17	0.19	0.17	0.20	0.16
N1	0.20	0.12	0.22	0.22	0.12	0.23	0.12	0.22	0.14	0.14	0.15	0.14	0.12	0.12	0.15	0.25	0.26	0.22	0.20	0.17	0.22	0.18	0.17
N3	0.18	0.11	0.20	0.20	0.12	0.20	0.11	0.20	0.14	0.12	0.14	0.11	0.12	0.11	0.14	0.23	0.24	0.19	0.17	0.18	0.18	0.17	0.15
N6	0.20	0.14	0.22	0.23	0.13	0.23	0.13	0.23	0.14	0.15	0.16	0.17	0.13	0.13	0.16	0.24	0.26	0.22	0.21	0.16	0.23	0.19	0.19
N7	0.18	0.11	0.20	0.19	0.13	0.19	0.12	0.18	0.14	0.13	0.13	0.10	0.14	0.12	0.15	0.21	0.22	0.19	0.17	0.17	0.17	0.18	0.15
N9	0.19	0.13	0.20	0.20	0.14	0.19	0.14	0.19	0.16	0.14	0.14	0.13	0.15	0.14	0.15	0.21	0.22	0.19	0.17	0.20	0.17	0.20	0.16
O2'	0.20	0.13	0.21	0.21	0.14	0.21	0.12	0.20	0.13	0.13	0.12	0.14	0.16	0.12	0.16	0.24	0.24	0.21	0.17	0.18	0.17	0.20	0.16
O3'	0.23	0.15	0.23	0.22	0.16	0.24	0.12	0.22	0.13	0.14	0.12	0.18	0.19	0.12	0.18	0.26	0.25	0.24	0.19	0.18	0.18	0.18	0.16
O4'	0.21	0.18	0.20	0.20	0.19	0.21	0.20	0.22	0.22	0.20	0.20	0.19	0.19	0.21	0.19	0.20	0.21	0.22	0.21	0.26	0.22	0.27	0.23
O5'	0.17	0.18	0.18	0.16	0.13	0.16	0.11	0.14	0.12	0.11	0.12	0.25	0.18	0.11	0.13	0.21	0.17	0.16	0.11	0.17	0.12	0.19	0.12
OP1	0.24	0.20	0.24	0.26	0.25	0.25	0.28	0.27	0.29	0.28	0.23	0.19	0.21	0.30	0.25	0.22	0.25	0.25	0.28	0.33	0.29	0.33	0.29
OP2	0.15	0.15	0.15	0.15	0.16	0.15	0.18	0.15	0.20	0.17	0.18	0.16	0.15	0.18	0.16	0.16	0.15	0.15	0.16	0.23	0.16	0.23	0.17
P	0.10	0.10	0.08	0.08	0.10	0.10	0.13	0.11	0.14	0.12	0.11	0.14	0.10	0.14	0.10	0.10	0.08	0.11	0.10	0.20	0.11	0.18	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.04
C2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.04	0.07	0.01	0.08	0.17	0.10
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.06	0.08	0.07	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.06	0.04	0.03
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.06	0.07	0.08	0.06	0.07	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.07	0.05	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.07	0.01	0.08	0.15	0.10
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.10	0.01	0.12	0.19	0.13
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.09	0.10	0.07	0.05	0.04	0.11	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.02	0.11	0.00	0.14	0.22	0.15
C8	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.03	0.10	0.02	0.11	0.15	0.12
N1	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.03	0.09	0.01	0.11	0.20	0.13
N2	0.04	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.10	0.05	0.07	0.02	0.07	0.16	0.09
N3	0.03	0.00	0.07	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.04	0.06	0.01	0.06	0.14	0.08
N7	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03	0.12	0.02	0.15	0.20	0.15
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.11	0.08
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.10	0.07	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.04	0.07	0.04	0.03
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.07	0.01	0.08	0.03	0.09	0.07	0.09	0.10	0.08	0.08	0.05	0.03	0.00	0.01	0.05	0.10	0.11	0.08	0.06
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.02	0.06	0.06	0.05
O5'	0.03	0.07	0.02	0.03	0.07	0.01	0.10	0.01	0.11	0.10	0.09	0.07	0.06	0.12	0.06	0.03	0.05	0.05	0.00	0.13	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.10	0.02	0.13	0.00	0.18	0.25	0.17
OP1	0.04	0.08	0.06	0.07	0.08	0.05	0.12	0.05	0.14	0.11	0.11	0.07	0.06	0.15	0.06	0.07	0.11	0.06	0.02	0.18	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.17	0.04	0.05	0.15	0.02	0.19	0.02	0.22	0.15	0.20	0.16	0.14	0.20	0.11	0.04	0.08	0.06	0.01	0.25	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.10	0.03	0.03	0.10	0.01	0.13	0.01	0.15	0.12	0.13	0.09	0.08	0.15	0.08	0.03	0.06	0.05	0.00	0.17	0.01	0.01	0.00