Doublet Group distance statistics: 49830

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 4, 10, 3, 3, 2, 5, 3, 1, 2, 1, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.015 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.011, 0.029, 0.047, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.029 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.014, 0.033, 0.052, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.033 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.004, 0.024, 0.043, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.024 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.008, 0.031, 0.054, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.031 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.011, 0.037, 0.063, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.037 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.009, 0.036, 0.063, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.036 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.014, 0.046, 0.078, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.046 std_dev=0.032
O4'	A	0, 0.017, 0.169, 0.320, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.169 std_dev=0.152
C2'	A	0, 0.035, 0.201, 0.368, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.201 std_dev=0.166
N2	B	0, 0.165, 0.339, 0.514, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.339 std_dev=0.175
C2	B	0, 0.148, 0.341, 0.533, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.341 std_dev=0.193
O2'	A	0, 0.073, 0.291, 0.509, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.291 std_dev=0.218
N3	B	0, 0.156, 0.377, 0.598, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.377 std_dev=0.221
C4	B	0, 0.161, 0.395, 0.630, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.395 std_dev=0.235
C4'	A	0, 0.026, 0.286, 0.547, 0.959 max_d=0.959 avg_d=0.286 std_dev=0.260
C3'	A	0, 0.045, 0.306, 0.566, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.306 std_dev=0.260
C5	B	0, 0.138, 0.423, 0.708, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.423 std_dev=0.285
N7	B	0, 0.162, 0.475, 0.788, 1.384 max_d=1.384 avg_d=0.475 std_dev=0.313
C8	B	0, 0.181, 0.505, 0.829, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.505 std_dev=0.324
N1	B	0, 0.098, 0.458, 0.818, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.458 std_dev=0.360
N9	B	0, 0.162, 0.533, 0.903, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.533 std_dev=0.371
O5'	A	0, 0.073, 0.458, 0.843, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.458 std_dev=0.385
O3'	A	0, 0.063, 0.452, 0.841, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.452 std_dev=0.389
C5'	A	0, 0.050, 0.444, 0.838, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.444 std_dev=0.394
C6	B	0, 0.074, 0.508, 0.941, 2.030 max_d=2.030 avg_d=0.508 std_dev=0.434
P	A	0, 0.082, 0.572, 1.062, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.572 std_dev=0.490
OP2	A	0, 0.069, 0.613, 1.157, 2.153 max_d=2.153 avg_d=0.613 std_dev=0.544
O6	B	0, 0.042, 0.674, 1.306, 2.847 max_d=2.847 avg_d=0.674 std_dev=0.632
OP1	A	0, 0.119, 0.770, 1.420, 1.877 max_d=1.877 avg_d=0.770 std_dev=0.650
C1'	B	0, 0.125, 0.778, 1.431, 2.552 max_d=2.552 avg_d=0.778 std_dev=0.653
O4'	B	0, 0.174, 0.908, 1.642, 2.894 max_d=2.894 avg_d=0.908 std_dev=0.734
OP2	B	0, 0.275, 1.056, 1.837, 2.760 max_d=2.760 avg_d=1.056 std_dev=0.781
O5'	B	0, 0.204, 1.029, 1.855, 3.099 max_d=3.099 avg_d=1.029 std_dev=0.825
P	B	0, 0.242, 1.077, 1.911, 2.914 max_d=2.914 avg_d=1.077 std_dev=0.835
C5'	B	0, 0.328, 1.185, 2.042, 3.389 max_d=3.389 avg_d=1.185 std_dev=0.857
C4'	B	0, 0.200, 1.078, 1.957, 3.538 max_d=3.538 avg_d=1.078 std_dev=0.878
C2'	B	0, 0.054, 0.953, 1.852, 3.369 max_d=3.369 avg_d=0.953 std_dev=0.899
C3'	B	0, 0.133, 1.062, 1.991, 3.524 max_d=3.524 avg_d=1.062 std_dev=0.929
OP1	B	0, 0.376, 1.384, 2.391, 3.406 max_d=3.406 avg_d=1.384 std_dev=1.008
O2'	B	0, -0.025, 1.151, 2.326, 4.417 max_d=4.417 avg_d=1.151 std_dev=1.175
O3'	B	0, 0.056, 1.295, 2.533, 4.686 max_d=4.686 avg_d=1.295 std_dev=1.239

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.09	0.12	0.11	0.09
C2	0.04	0.00	0.15	0.12	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.19	0.16	0.07	0.13	0.13	0.19	0.14
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.09	0.07	0.13	0.14	0.07	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.09	0.11	0.06
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.09	0.10	0.11	0.11	0.09	0.09	0.04	0.03	0.01	0.02	0.08	0.11	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.08	0.07	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.08	0.05	0.12	0.12	0.17	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.03	0.03	0.07	0.08	0.03	0.06	0.03	0.00	0.02	0.10	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.05	0.12	0.12	0.18	0.11
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.11	0.10	0.06	0.15	0.14	0.06	0.06	0.04	0.02	0.01	0.14	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.06	0.12	0.13	0.20	0.13
C8	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.11	0.04	0.11	0.10	0.14	0.09
N1	0.04	0.00	0.13	0.11	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.16	0.15	0.07	0.13	0.13	0.20	0.14
N3	0.04	0.01	0.14	0.11	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.14	0.06	0.12	0.13	0.17	0.12
N6	0.02	0.02	0.07	0.09	0.02	0.07	0.01	0.15	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.10	0.12	0.06	0.12	0.15	0.21	0.14
N7	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.11	0.04	0.11	0.12	0.17	0.10
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.11	0.11	0.14	0.10
O2'	0.02	0.19	0.01	0.03	0.09	0.06	0.07	0.06	0.11	0.05	0.16	0.17	0.10	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.12	0.10	0.05
O3'	0.03	0.16	0.03	0.01	0.08	0.03	0.09	0.04	0.12	0.11	0.15	0.14	0.12	0.11	0.05	0.05	0.00	0.03	0.15	0.18	0.17	0.15
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.02	0.06	0.04	0.07	0.06	0.06	0.04	0.02	0.05	0.03	0.00	0.13	0.16	0.11	0.13
O5'	0.09	0.13	0.05	0.08	0.12	0.02	0.12	0.01	0.12	0.11	0.13	0.12	0.12	0.11	0.11	0.05	0.15	0.13	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.12	0.13	0.09	0.11	0.12	0.10	0.12	0.14	0.13	0.10	0.13	0.13	0.15	0.12	0.11	0.12	0.18	0.16	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.19	0.11	0.12	0.17	0.05	0.18	0.06	0.20	0.14	0.20	0.17	0.21	0.17	0.14	0.10	0.17	0.11	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.06	0.08	0.11	0.03	0.11	0.02	0.13	0.09	0.14	0.12	0.14	0.10	0.10	0.05	0.15	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.14	0.20	0.19	0.17	0.23	0.15	0.23	0.14	0.18	0.13	0.14	0.18	0.15	0.20	0.27	0.21	0.26	0.19	0.17	0.21	0.22	0.15
C2	0.31	0.17	0.36	0.38	0.21	0.33	0.20	0.32	0.19	0.24	0.18	0.16	0.20	0.22	0.25	0.37	0.48	0.34	0.28	0.20	0.36	0.27	0.26
C2'	0.21	0.17	0.21	0.21	0.19	0.21	0.17	0.23	0.16	0.19	0.16	0.17	0.19	0.17	0.20	0.22	0.23	0.23	0.19	0.18	0.21	0.23	0.14
C3'	0.18	0.17	0.17	0.18	0.17	0.18	0.17	0.21	0.17	0.17	0.16	0.17	0.18	0.17	0.18	0.18	0.19	0.20	0.21	0.19	0.21	0.23	0.16
C4	0.26	0.14	0.26	0.27	0.18	0.26	0.16	0.25	0.16	0.20	0.15	0.13	0.17	0.17	0.21	0.29	0.32	0.29	0.21	0.17	0.26	0.21	0.17
C4'	0.21	0.15	0.18	0.18	0.17	0.20	0.15	0.23	0.15	0.17	0.14	0.17	0.18	0.15	0.18	0.24	0.17	0.22	0.20	0.18	0.19	0.24	0.15
C5	0.27	0.16	0.30	0.30	0.19	0.27	0.18	0.26	0.17	0.21	0.17	0.16	0.18	0.19	0.23	0.32	0.38	0.30	0.23	0.18	0.27	0.21	0.18
C5'	0.22	0.17	0.22	0.21	0.18	0.22	0.16	0.27	0.15	0.18	0.14	0.19	0.20	0.16	0.20	0.27	0.22	0.23	0.23	0.18	0.22	0.27	0.20
C6	0.31	0.19	0.41	0.41	0.23	0.34	0.22	0.32	0.21	0.26	0.20	0.19	0.21	0.23	0.26	0.42	0.52	0.34	0.29	0.21	0.35	0.27	0.26
C8	0.23	0.13	0.20	0.19	0.17	0.22	0.14	0.23	0.13	0.17	0.13	0.12	0.17	0.15	0.19	0.25	0.21	0.25	0.19	0.15	0.20	0.20	0.14
N1	0.33	0.19	0.42	0.44	0.23	0.37	0.23	0.36	0.21	0.27	0.20	0.19	0.21	0.24	0.27	0.44	0.56	0.36	0.32	0.22	0.40	0.30	0.30
N3	0.28	0.15	0.29	0.30	0.19	0.29	0.17	0.28	0.17	0.21	0.16	0.14	0.18	0.19	0.22	0.31	0.37	0.32	0.23	0.18	0.30	0.22	0.20
N6	0.35	0.23	0.51	0.51	0.26	0.39	0.26	0.36	0.24	0.30	0.23	0.23	0.24	0.27	0.30	0.54	0.63	0.36	0.34	0.24	0.40	0.31	0.30
N7	0.24	0.14	0.24	0.24	0.18	0.23	0.16	0.23	0.15	0.19	0.15	0.14	0.17	0.17	0.20	0.27	0.29	0.26	0.20	0.16	0.22	0.19	0.14
N9	0.24	0.13	0.21	0.21	0.17	0.23	0.14	0.23	0.14	0.18	0.13	0.12	0.17	0.15	0.20	0.26	0.24	0.27	0.19	0.16	0.21	0.20	0.14
O2'	0.22	0.16	0.20	0.20	0.18	0.21	0.17	0.23	0.16	0.19	0.16	0.16	0.19	0.17	0.20	0.22	0.22	0.24	0.18	0.18	0.21	0.22	0.14
O3'	0.19	0.18	0.19	0.20	0.19	0.19	0.20	0.22	0.21	0.19	0.20	0.19	0.18	0.20	0.19	0.19	0.20	0.20	0.24	0.24	0.24	0.25	0.19
O4'	0.27	0.15	0.23	0.21	0.18	0.26	0.16	0.26	0.16	0.19	0.15	0.15	0.20	0.16	0.21	0.33	0.22	0.28	0.21	0.20	0.20	0.24	0.17
O5'	0.18	0.15	0.19	0.19	0.15	0.18	0.14	0.23	0.15	0.15	0.14	0.17	0.16	0.14	0.16	0.26	0.21	0.18	0.21	0.18	0.20	0.26	0.17
OP1	0.11	0.11	0.14	0.14	0.12	0.12	0.15	0.24	0.18	0.14	0.14	0.12	0.11	0.17	0.12	0.21	0.18	0.12	0.27	0.23	0.28	0.39	0.29
OP2	0.12	0.11	0.12	0.13	0.11	0.11	0.12	0.22	0.14	0.12	0.12	0.13	0.11	0.12	0.11	0.19	0.16	0.12	0.26	0.17	0.25	0.32	0.23
P	0.16	0.12	0.19	0.17	0.12	0.16	0.12	0.23	0.13	0.13	0.12	0.14	0.13	0.12	0.13	0.27	0.20	0.15	0.24	0.17	0.22	0.29	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.18	0.03	0.19	0.16	0.14
C2	0.05	0.00	0.12	0.13	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.16	0.05	0.25	0.02	0.25	0.29	0.22
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.04	0.06	0.07	0.09	0.15	0.13	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.17	0.06	0.20	0.11	0.12
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.10	0.12	0.11	0.16	0.13	0.11	0.06	0.03	0.01	0.02	0.20	0.12	0.23	0.09	0.14
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.03	0.25	0.02	0.24	0.27	0.22
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.13	0.07	0.08	0.06	0.14	0.07	0.07	0.02	0.00	0.02	0.14	0.13	0.18	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.10	0.00	0.26	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.28	0.03	0.27	0.33	0.26
C5'	0.06	0.16	0.04	0.03	0.19	0.01	0.26	0.00	0.27	0.28	0.22	0.13	0.13	0.31	0.18	0.07	0.04	0.02	0.02	0.33	0.22	0.28	0.03
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.10	0.01	0.27	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.11	0.04	0.28	0.01	0.28	0.36	0.27
C8	0.02	0.02	0.07	0.12	0.01	0.13	0.02	0.28	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.13	0.05	0.28	0.05	0.25	0.27	0.24
N1	0.04	0.01	0.09	0.11	0.01	0.07	0.01	0.22	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.13	0.04	0.27	0.01	0.27	0.33	0.25
N2	0.06	0.01	0.15	0.16	0.02	0.08	0.02	0.13	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.21	0.06	0.24	0.03	0.25	0.28	0.21
N3	0.05	0.01	0.13	0.13	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.15	0.16	0.05	0.24	0.02	0.24	0.25	0.20
N7	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.14	0.01	0.31	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.13	0.04	0.30	0.05	0.29	0.34	0.28
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.24	0.03	0.23	0.23	0.20
O2'	0.02	0.16	0.01	0.03	0.08	0.07	0.07	0.07	0.10	0.05	0.13	0.19	0.15	0.06	0.03	0.00	0.05	0.07	0.06	0.10	0.15	0.11	0.06
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.10	0.02	0.10	0.04	0.11	0.13	0.13	0.21	0.16	0.13	0.06	0.05	0.00	0.02	0.19	0.12	0.23	0.15	0.16
O4'	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.04	0.02	0.07	0.02	0.00	0.17	0.06	0.20	0.16	0.15
O5'	0.18	0.25	0.17	0.20	0.25	0.02	0.28	0.02	0.28	0.28	0.27	0.24	0.24	0.30	0.24	0.06	0.19	0.17	0.00	0.30	0.03	0.03	0.01
O6	0.03	0.02	0.06	0.12	0.02	0.14	0.03	0.33	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.03	0.10	0.12	0.06	0.30	0.00	0.32	0.41	0.31
OP1	0.19	0.25	0.20	0.23	0.24	0.13	0.27	0.22	0.28	0.25	0.27	0.25	0.24	0.29	0.23	0.15	0.23	0.20	0.03	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.29	0.11	0.09	0.27	0.18	0.33	0.28	0.36	0.27	0.33	0.28	0.25	0.34	0.23	0.11	0.15	0.16	0.03	0.41	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.22	0.12	0.14	0.22	0.03	0.26	0.03	0.27	0.24	0.25	0.21	0.20	0.28	0.20	0.06	0.16	0.15	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00