Doublet Group distance statistics: 49832

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 6, 1, 1, 4, 1, 0, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.001, 0.013, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.001, 0.014, 0.028, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.002, 0.019, 0.036, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.010, 0.029, 0.048, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.005, 0.024, 0.044, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.002, 0.045, 0.089, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.045 std_dev=0.043
C2'	A	0, 0.062, 0.206, 0.351, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.206 std_dev=0.144
O4'	A	0, 0.039, 0.184, 0.330, 0.476 max_d=0.476 avg_d=0.184 std_dev=0.145
N3	B	0, 0.236, 0.428, 0.621, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.428 std_dev=0.192
O2'	A	0, 0.048, 0.247, 0.445, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.247 std_dev=0.198
C2	B	0, 0.219, 0.444, 0.669, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.444 std_dev=0.225
N2	B	0, 0.200, 0.434, 0.667, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.434 std_dev=0.233
C4'	A	0, 0.092, 0.344, 0.597, 0.788 max_d=0.788 avg_d=0.344 std_dev=0.253
C3'	A	0, 0.114, 0.390, 0.667, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.390 std_dev=0.277
C4	B	0, 0.238, 0.548, 0.858, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.548 std_dev=0.310
C1'	B	0, 0.245, 0.572, 0.899, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.572 std_dev=0.327
N1	B	0, 0.197, 0.553, 0.908, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.553 std_dev=0.355
O4'	B	0, 0.211, 0.568, 0.924, 1.430 max_d=1.430 avg_d=0.568 std_dev=0.357
C5'	A	0, 0.160, 0.520, 0.880, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.520 std_dev=0.360
N9	B	0, 0.250, 0.615, 0.980, 1.552 max_d=1.552 avg_d=0.615 std_dev=0.365
C2'	B	0, 0.227, 0.602, 0.978, 1.521 max_d=1.521 avg_d=0.602 std_dev=0.375
C3'	B	0, 0.228, 0.635, 1.043, 1.705 max_d=1.705 avg_d=0.635 std_dev=0.407
O3'	A	0, 0.144, 0.567, 0.989, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.567 std_dev=0.422
C4'	B	0, 0.169, 0.595, 1.022, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.595 std_dev=0.426
O5'	A	0, 0.143, 0.578, 1.013, 1.792 max_d=1.792 avg_d=0.578 std_dev=0.435
O3'	B	0, 0.231, 0.694, 1.156, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.694 std_dev=0.463
O2'	B	0, 0.146, 0.609, 1.073, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.609 std_dev=0.463
C5	B	0, 0.200, 0.677, 1.153, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.677 std_dev=0.476
C6	B	0, 0.194, 0.683, 1.172, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.683 std_dev=0.489
C5'	B	0, 0.245, 0.744, 1.243, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.744 std_dev=0.499
O5'	B	0, 0.314, 0.829, 1.344, 1.807 max_d=1.807 avg_d=0.829 std_dev=0.515
OP2	A	0, 0.049, 0.574, 1.099, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.574 std_dev=0.525
P	A	0, 0.137, 0.664, 1.191, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.664 std_dev=0.527
C8	B	0, 0.219, 0.778, 1.337, 2.252 max_d=2.252 avg_d=0.778 std_dev=0.559
P	B	0, 0.388, 0.996, 1.604, 2.249 max_d=2.249 avg_d=0.996 std_dev=0.608
O6	B	0, 0.179, 0.810, 1.440, 2.243 max_d=2.243 avg_d=0.810 std_dev=0.631
N7	B	0, 0.170, 0.813, 1.457, 2.240 max_d=2.240 avg_d=0.813 std_dev=0.643
OP2	B	0, 0.529, 1.179, 1.830, 2.360 max_d=2.360 avg_d=1.179 std_dev=0.651
OP1	A	0, 0.186, 0.862, 1.538, 2.288 max_d=2.288 avg_d=0.862 std_dev=0.676
OP1	B	0, 0.411, 1.098, 1.785, 2.636 max_d=2.636 avg_d=1.098 std_dev=0.687

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.06	0.17	0.08
C2	0.03	0.00	0.19	0.21	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.17	0.26	0.05	0.11	0.12	0.18	0.11
C2'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.10	0.02	0.08	0.01	0.11	0.06	0.16	0.18	0.10	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.06	0.14	0.06
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.14	0.00	0.15	0.02	0.18	0.13	0.21	0.19	0.19	0.14	0.08	0.02	0.01	0.01	0.12	0.08	0.14	0.07
C4	0.01	0.01	0.10	0.14	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.16	0.03	0.10	0.10	0.17	0.09
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.08	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.11	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.18	0.03	0.14	0.12	0.17	0.11
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.09	0.09	0.08	0.07	0.11	0.10	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.10	0.09	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.18	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.23	0.04	0.15	0.14	0.18	0.12
C8	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.14	0.10	0.17	0.09
N1	0.03	0.01	0.16	0.21	0.02	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.14	0.26	0.04	0.13	0.14	0.18	0.12
N3	0.03	0.01	0.18	0.19	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.16	0.22	0.05	0.10	0.10	0.18	0.10
N6	0.03	0.02	0.10	0.19	0.02	0.08	0.01	0.11	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.08	0.24	0.04	0.18	0.17	0.19	0.15
N7	0.02	0.02	0.05	0.14	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.17	0.02	0.16	0.13	0.17	0.12
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.09	0.08	0.17	0.08
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.05	0.14	0.16	0.08	0.03	0.02	0.00	0.05	0.05	0.05	0.11	0.11	0.04
O3'	0.02	0.26	0.03	0.01	0.16	0.02	0.18	0.02	0.23	0.14	0.26	0.22	0.24	0.17	0.09	0.05	0.00	0.02	0.14	0.12	0.19	0.11
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.09	0.19	0.10
O5'	0.05	0.11	0.07	0.12	0.10	0.02	0.14	0.01	0.15	0.14	0.13	0.10	0.18	0.16	0.09	0.05	0.14	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.12	0.06	0.08	0.10	0.09	0.12	0.10	0.14	0.10	0.14	0.10	0.17	0.13	0.08	0.11	0.12	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.18	0.14	0.14	0.17	0.11	0.17	0.09	0.18	0.17	0.18	0.18	0.19	0.17	0.17	0.11	0.19	0.19	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.11	0.06	0.07	0.09	0.03	0.11	0.02	0.12	0.09	0.12	0.10	0.15	0.12	0.08	0.04	0.11	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.16	0.25	0.27	0.21	0.23	0.22	0.23	0.22	0.24	0.19	0.12	0.18	0.24	0.23	0.25	0.31	0.27	0.27	0.24	0.24	0.41	0.31
C2	0.25	0.15	0.30	0.31	0.16	0.29	0.16	0.29	0.16	0.19	0.17	0.16	0.15	0.17	0.19	0.30	0.34	0.28	0.26	0.18	0.28	0.32	0.27
C2'	0.20	0.15	0.22	0.24	0.16	0.19	0.17	0.19	0.19	0.18	0.18	0.13	0.15	0.18	0.17	0.23	0.28	0.23	0.22	0.22	0.20	0.37	0.26
C3'	0.16	0.16	0.19	0.20	0.15	0.16	0.18	0.14	0.20	0.16	0.19	0.15	0.14	0.18	0.15	0.25	0.26	0.17	0.16	0.24	0.16	0.35	0.21
C4	0.25	0.15	0.27	0.28	0.18	0.25	0.18	0.25	0.18	0.21	0.17	0.13	0.16	0.20	0.21	0.26	0.31	0.27	0.26	0.19	0.23	0.36	0.28
C4'	0.19	0.14	0.18	0.19	0.17	0.17	0.19	0.17	0.20	0.20	0.17	0.13	0.15	0.21	0.18	0.25	0.24	0.21	0.21	0.23	0.21	0.39	0.26
C5	0.24	0.15	0.27	0.28	0.17	0.25	0.17	0.25	0.17	0.20	0.16	0.15	0.16	0.18	0.20	0.25	0.30	0.27	0.25	0.18	0.23	0.34	0.27
C5'	0.17	0.13	0.14	0.14	0.15	0.13	0.17	0.12	0.18	0.18	0.15	0.15	0.13	0.19	0.16	0.25	0.20	0.18	0.19	0.22	0.21	0.40	0.26
C6	0.24	0.15	0.29	0.29	0.16	0.27	0.15	0.28	0.16	0.19	0.16	0.17	0.15	0.16	0.19	0.29	0.31	0.28	0.25	0.17	0.26	0.31	0.26
C8	0.25	0.16	0.24	0.27	0.21	0.22	0.21	0.23	0.20	0.24	0.18	0.11	0.18	0.23	0.23	0.23	0.30	0.27	0.27	0.21	0.25	0.41	0.31
N1	0.25	0.15	0.31	0.31	0.16	0.29	0.15	0.30	0.16	0.18	0.17	0.17	0.15	0.16	0.19	0.31	0.34	0.28	0.26	0.17	0.30	0.30	0.27
N3	0.25	0.15	0.29	0.30	0.17	0.27	0.17	0.27	0.18	0.20	0.17	0.14	0.16	0.19	0.20	0.28	0.32	0.28	0.26	0.19	0.25	0.34	0.28
N6	0.25	0.17	0.31	0.30	0.17	0.29	0.16	0.30	0.17	0.19	0.18	0.20	0.16	0.17	0.20	0.32	0.33	0.29	0.26	0.17	0.29	0.29	0.27
N7	0.25	0.15	0.24	0.26	0.19	0.22	0.19	0.23	0.18	0.22	0.16	0.13	0.17	0.20	0.22	0.22	0.29	0.27	0.26	0.18	0.23	0.37	0.29
N9	0.25	0.15	0.26	0.27	0.20	0.23	0.20	0.24	0.20	0.23	0.18	0.12	0.17	0.22	0.22	0.25	0.31	0.27	0.27	0.22	0.24	0.40	0.30
O2'	0.22	0.14	0.24	0.26	0.16	0.22	0.17	0.22	0.19	0.19	0.17	0.12	0.15	0.18	0.18	0.24	0.30	0.24	0.24	0.22	0.21	0.38	0.27
O3'	0.16	0.18	0.21	0.22	0.18	0.17	0.21	0.14	0.24	0.19	0.23	0.18	0.16	0.21	0.17	0.27	0.28	0.17	0.17	0.28	0.18	0.37	0.22
O4'	0.27	0.18	0.24	0.26	0.24	0.24	0.26	0.24	0.26	0.29	0.22	0.15	0.20	0.29	0.26	0.27	0.28	0.28	0.28	0.28	0.26	0.43	0.33
O5'	0.14	0.16	0.14	0.14	0.13	0.11	0.15	0.09	0.17	0.15	0.17	0.21	0.15	0.16	0.13	0.28	0.20	0.15	0.15	0.21	0.20	0.38	0.23
OP1	0.13	0.15	0.11	0.13	0.15	0.12	0.19	0.18	0.21	0.19	0.18	0.19	0.14	0.22	0.15	0.23	0.15	0.14	0.29	0.27	0.36	0.53	0.39
OP2	0.08	0.13	0.12	0.20	0.10	0.10	0.13	0.16	0.16	0.12	0.14	0.20	0.12	0.14	0.09	0.17	0.25	0.09	0.26	0.21	0.33	0.48	0.34
P	0.15	0.14	0.12	0.10	0.13	0.09	0.16	0.09	0.17	0.16	0.15	0.20	0.14	0.18	0.14	0.27	0.16	0.15	0.18	0.21	0.24	0.41	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.01	0.09	0.18	0.13
C2	0.04	0.00	0.17	0.21	0.01	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.26	0.07	0.24	0.01	0.28	0.44	0.31
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.09	0.01	0.04	0.02	0.08	0.09	0.14	0.21	0.18	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.08	0.05	0.03
C3'	0.02	0.21	0.01	0.00	0.13	0.00	0.11	0.02	0.14	0.12	0.19	0.24	0.20	0.09	0.07	0.02	0.01	0.01	0.09	0.12	0.11	0.08	0.07
C4	0.02	0.01	0.09	0.13	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.14	0.03	0.24	0.01	0.27	0.40	0.29
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.09	0.09	0.08	0.07	0.09	0.05	0.06	0.02	0.00	0.02	0.10	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.02	0.29	0.02	0.36	0.49	0.37
C5'	0.03	0.14	0.02	0.02	0.14	0.01	0.18	0.00	0.19	0.18	0.17	0.12	0.11	0.20	0.12	0.06	0.03	0.01	0.01	0.22	0.07	0.04	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.16	0.03	0.30	0.01	0.39	0.54	0.40
C8	0.02	0.01	0.09	0.12	0.00	0.09	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.14	0.05	0.27	0.03	0.31	0.40	0.33
N1	0.03	0.00	0.14	0.19	0.01	0.09	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.23	0.05	0.28	0.01	0.35	0.51	0.37
N2	0.04	0.00	0.21	0.24	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.22	0.31	0.09	0.23	0.02	0.25	0.42	0.29
N3	0.04	0.00	0.18	0.20	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.23	0.07	0.21	0.01	0.23	0.37	0.26
N7	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.09	0.00	0.20	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.04	0.30	0.04	0.39	0.50	0.40
N9	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.21	0.02	0.22	0.32	0.25
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.10	0.06	0.08	0.06	0.12	0.07	0.16	0.22	0.17	0.06	0.04	0.00	0.03	0.07	0.05	0.12	0.11	0.06	0.06
O3'	0.01	0.26	0.01	0.01	0.14	0.02	0.12	0.03	0.16	0.14	0.23	0.31	0.23	0.12	0.06	0.03	0.00	0.02	0.14	0.14	0.19	0.17	0.15
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.09	0.07	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.11	0.04	0.09	0.15	0.12
O5'	0.11	0.24	0.03	0.09	0.24	0.02	0.29	0.01	0.30	0.27	0.28	0.23	0.21	0.30	0.21	0.05	0.14	0.11	0.00	0.32	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.10	0.02	0.22	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.12	0.14	0.04	0.32	0.00	0.45	0.58	0.44
OP1	0.09	0.28	0.08	0.11	0.27	0.07	0.36	0.07	0.39	0.31	0.35	0.25	0.23	0.39	0.22	0.11	0.19	0.09	0.02	0.45	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.44	0.05	0.08	0.40	0.03	0.49	0.04	0.54	0.40	0.51	0.42	0.37	0.50	0.32	0.06	0.17	0.15	0.01	0.58	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.31	0.03	0.07	0.29	0.02	0.37	0.02	0.40	0.33	0.37	0.29	0.26	0.40	0.25	0.06	0.15	0.12	0.01	0.44	0.01	0.00	0.00