Doublet Group distance statistics: 49833

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 1, 0, 2, 2, 3, 2, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.011 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.003, 0.022, 0.042, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.022 std_dev=0.019
O4'	A	0, -0.021, 0.130, 0.282, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.130 std_dev=0.151
C2'	A	0, -0.024, 0.131, 0.285, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.131 std_dev=0.155
O2'	A	0, -0.020, 0.151, 0.323, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.151 std_dev=0.172
C2	B	0, 0.284, 0.487, 0.690, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.487 std_dev=0.203
O5'	A	0, 0.077, 0.318, 0.559, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.318 std_dev=0.241
N2	B	0, 0.238, 0.487, 0.736, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.487 std_dev=0.249
C3'	A	0, -0.016, 0.236, 0.488, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.236 std_dev=0.252
C4'	A	0, -0.017, 0.244, 0.506, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.244 std_dev=0.261
N3	B	0, 0.251, 0.513, 0.776, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.513 std_dev=0.263
C4	B	0, 0.266, 0.545, 0.824, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.545 std_dev=0.279
O3'	A	0, 0.006, 0.355, 0.704, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.355 std_dev=0.349
N1	B	0, 0.278, 0.670, 1.061, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.670 std_dev=0.391
C5	B	0, 0.258, 0.653, 1.047, 1.681 max_d=1.681 avg_d=0.653 std_dev=0.395
OP2	A	0, 0.141, 0.543, 0.946, 1.592 max_d=1.592 avg_d=0.543 std_dev=0.402
N9	B	0, 0.220, 0.657, 1.095, 1.866 max_d=1.866 avg_d=0.657 std_dev=0.437
P	A	0, 0.062, 0.501, 0.941, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.501 std_dev=0.440
C8	B	0, 0.265, 0.714, 1.163, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.714 std_dev=0.449
N7	B	0, 0.255, 0.753, 1.251, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.753 std_dev=0.498
C5'	A	0, -0.084, 0.450, 0.984, 2.119 max_d=2.119 avg_d=0.450 std_dev=0.534
C6	B	0, 0.221, 0.773, 1.325, 2.442 max_d=2.442 avg_d=0.773 std_dev=0.552
C1'	B	0, 0.286, 0.907, 1.527, 2.454 max_d=2.454 avg_d=0.907 std_dev=0.620
O2'	B	0, 0.584, 1.271, 1.957, 3.002 max_d=3.002 avg_d=1.271 std_dev=0.686
C2'	B	0, 0.470, 1.281, 2.092, 3.108 max_d=3.108 avg_d=1.281 std_dev=0.811
O6	B	0, 0.138, 1.004, 1.869, 3.634 max_d=3.634 avg_d=1.004 std_dev=0.866
OP1	A	0, -0.187, 0.714, 1.615, 3.572 max_d=3.572 avg_d=0.714 std_dev=0.901
OP2	B	0, 0.320, 1.272, 2.224, 4.122 max_d=4.122 avg_d=1.272 std_dev=0.952
O4'	B	0, 0.305, 1.294, 2.283, 3.591 max_d=3.591 avg_d=1.294 std_dev=0.989
O5'	B	0, 0.306, 1.343, 2.380, 4.306 max_d=4.306 avg_d=1.343 std_dev=1.037
P	B	0, 0.267, 1.327, 2.386, 4.434 max_d=4.434 avg_d=1.327 std_dev=1.060
OP1	B	0, 0.231, 1.543, 2.855, 5.234 max_d=5.234 avg_d=1.543 std_dev=1.312
C4'	B	0, 0.301, 1.671, 3.041, 4.722 max_d=4.722 avg_d=1.671 std_dev=1.370
C5'	B	0, 0.359, 1.782, 3.205, 4.950 max_d=4.950 avg_d=1.782 std_dev=1.423
C3'	B	0, 0.281, 1.750, 3.219, 5.049 max_d=5.049 avg_d=1.750 std_dev=1.469
O3'	B	0, 0.273, 2.316, 4.359, 6.468 max_d=6.468 avg_d=2.316 std_dev=2.043

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.23	0.16	0.18
C2	0.01	0.00	0.12	0.14	0.00	0.05	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.17	0.06	0.09	0.50	0.30	0.27
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.02	0.04	0.05	0.07	0.07	0.10	0.12	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.09	0.23	0.13
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.11	0.10	0.13	0.12	0.11	0.09	0.05	0.01	0.00	0.02	0.22	0.15	0.30	0.17
C4	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.05	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.10	0.03	0.09	0.47	0.28	0.25
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.06	0.04	0.09	0.09	0.05	0.08	0.02	0.00	0.01	0.08	0.04	0.06
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.08	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.02	0.13	0.59	0.34	0.29
C5'	0.09	0.21	0.05	0.02	0.22	0.00	0.27	0.00	0.28	0.27	0.25	0.18	0.31	0.29	0.20	0.06	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.03	0.13	0.64	0.37	0.30
C8	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.08	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.04	0.13	0.51	0.29	0.26
N1	0.01	0.00	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.05	0.11	0.59	0.34	0.29
N3	0.01	0.00	0.12	0.12	0.00	0.04	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.06	0.08	0.43	0.27	0.25
N6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.31	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.15	0.03	0.15	0.71	0.40	0.33
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.09	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.15	0.63	0.37	0.31
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.08	0.40	0.23	0.22
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.08	0.03	0.06	0.05	0.05	0.08	0.10	0.04	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.11	0.11	0.16	0.14
O3'	0.02	0.17	0.02	0.00	0.10	0.02	0.11	0.07	0.14	0.12	0.17	0.15	0.15	0.12	0.05	0.05	0.00	0.04	0.25	0.34	0.35	0.24
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.10	0.22	0.16	0.21
O5'	0.04	0.09	0.13	0.22	0.09	0.01	0.13	0.01	0.13	0.13	0.11	0.08	0.15	0.15	0.08	0.11	0.25	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.23	0.50	0.09	0.15	0.47	0.08	0.59	0.05	0.64	0.51	0.59	0.43	0.71	0.63	0.40	0.11	0.34	0.22	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.30	0.23	0.30	0.28	0.04	0.34	0.02	0.37	0.29	0.34	0.27	0.40	0.37	0.23	0.16	0.35	0.16	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.27	0.13	0.17	0.25	0.06	0.29	0.01	0.30	0.26	0.29	0.25	0.33	0.31	0.22	0.14	0.24	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.18	0.60	0.46	0.21	0.37	0.18	0.38	0.22	0.21	0.19	0.20	0.25	0.19	0.25	0.57	0.53	0.41	0.38	0.30	0.29	0.55	0.35
C2	0.46	0.11	0.61	0.67	0.22	0.60	0.18	0.60	0.22	0.28	0.20	0.10	0.21	0.21	0.32	0.73	0.99	0.61	0.56	0.30	0.44	0.60	0.47
C2'	0.35	0.19	0.58	0.46	0.21	0.43	0.16	0.45	0.21	0.18	0.18	0.24	0.26	0.16	0.25	0.60	0.61	0.48	0.43	0.32	0.37	0.58	0.43
C3'	0.33	0.23	0.57	0.44	0.21	0.40	0.17	0.43	0.21	0.18	0.18	0.30	0.28	0.17	0.24	0.57	0.55	0.46	0.43	0.32	0.40	0.60	0.46
C4	0.39	0.11	0.59	0.53	0.20	0.49	0.16	0.49	0.20	0.23	0.19	0.08	0.21	0.17	0.27	0.65	0.75	0.52	0.47	0.29	0.36	0.57	0.41
C4'	0.28	0.23	0.62	0.48	0.23	0.26	0.24	0.25	0.28	0.23	0.24	0.26	0.25	0.25	0.24	0.50	0.44	0.29	0.31	0.37	0.26	0.51	0.33
C5	0.42	0.11	0.59	0.58	0.21	0.52	0.18	0.53	0.22	0.25	0.21	0.10	0.21	0.20	0.30	0.68	0.83	0.55	0.51	0.30	0.39	0.59	0.44
C5'	0.34	0.32	0.69	0.60	0.33	0.30	0.36	0.24	0.38	0.35	0.34	0.33	0.33	0.37	0.33	0.48	0.51	0.27	0.34	0.44	0.29	0.50	0.34
C6	0.49	0.14	0.63	0.71	0.24	0.63	0.22	0.62	0.24	0.32	0.23	0.16	0.22	0.25	0.35	0.76	1.05	0.63	0.59	0.32	0.46	0.62	0.50
C8	0.34	0.15	0.58	0.46	0.20	0.38	0.16	0.40	0.20	0.21	0.18	0.14	0.24	0.17	0.25	0.57	0.56	0.42	0.40	0.28	0.31	0.56	0.38
N1	0.50	0.14	0.63	0.75	0.24	0.66	0.21	0.65	0.24	0.33	0.22	0.15	0.22	0.26	0.35	0.77	1.11	0.66	0.61	0.32	0.48	0.63	0.51
N3	0.41	0.11	0.59	0.57	0.20	0.52	0.16	0.53	0.20	0.24	0.19	0.08	0.20	0.18	0.28	0.68	0.83	0.55	0.50	0.29	0.38	0.57	0.42
N6	0.54	0.20	0.67	0.83	0.29	0.71	0.27	0.69	0.28	0.38	0.27	0.24	0.25	0.32	0.40	0.82	1.21	0.69	0.65	0.35	0.52	0.66	0.55
N7	0.38	0.11	0.58	0.50	0.20	0.45	0.16	0.46	0.21	0.23	0.20	0.09	0.21	0.18	0.27	0.62	0.68	0.49	0.46	0.29	0.35	0.58	0.41
N9	0.35	0.15	0.59	0.47	0.20	0.41	0.16	0.42	0.20	0.21	0.18	0.14	0.23	0.17	0.25	0.59	0.60	0.44	0.41	0.29	0.31	0.55	0.37
O2'	0.34	0.18	0.59	0.45	0.20	0.41	0.17	0.43	0.22	0.18	0.18	0.22	0.25	0.17	0.24	0.59	0.58	0.46	0.41	0.33	0.34	0.56	0.41
O3'	0.36	0.26	0.56	0.44	0.24	0.45	0.21	0.49	0.26	0.21	0.23	0.33	0.31	0.21	0.26	0.58	0.56	0.52	0.49	0.37	0.48	0.63	0.54
O4'	0.32	0.22	0.64	0.52	0.24	0.33	0.23	0.32	0.25	0.24	0.22	0.25	0.27	0.23	0.26	0.53	0.50	0.33	0.34	0.32	0.27	0.55	0.33
O5'	0.25	0.22	0.63	0.54	0.23	0.21	0.25	0.16	0.28	0.25	0.23	0.26	0.24	0.27	0.24	0.43	0.46	0.19	0.29	0.34	0.25	0.50	0.32
OP1	0.70	0.67	0.98	1.01	0.67	0.69	0.63	0.61	0.58	0.66	0.63	0.66	0.68	0.63	0.68	0.72	0.97	0.60	0.63	0.49	0.57	0.62	0.59
OP2	0.30	0.31	0.62	0.61	0.30	0.29	0.32	0.25	0.34	0.30	0.35	0.32	0.28	0.31	0.29	0.40	0.55	0.28	0.34	0.35	0.32	0.54	0.39
P	0.31	0.24	0.71	0.70	0.26	0.31	0.24	0.16	0.20	0.28	0.19	0.26	0.27	0.26	0.28	0.45	0.65	0.17	0.29	0.18	0.23	0.45	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.13	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.33	0.02	0.30	0.42	0.31
C2	0.04	0.00	0.30	0.26	0.00	0.06	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.19	0.20	0.39	0.01	0.37	0.61	0.44
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.17	0.04	0.10	0.19	0.16	0.12	0.25	0.35	0.29	0.06	0.03	0.01	0.06	0.01	0.53	0.14	0.54	0.61	0.51
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.25	0.00	0.31	0.02	0.34	0.27	0.31	0.24	0.22	0.32	0.20	0.02	0.01	0.02	0.28	0.37	0.30	0.20	0.22
C4	0.02	0.00	0.17	0.25	0.00	0.03	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.16	0.10	0.39	0.01	0.39	0.61	0.44
C4'	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.11	0.04	0.08	0.06	0.11	0.05	0.30	0.03	0.00	0.01	0.07	0.13	0.20	0.06
C5	0.01	0.00	0.10	0.31	0.00	0.06	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.23	0.26	0.05	0.40	0.01	0.46	0.70	0.51
C5'	0.13	0.19	0.19	0.02	0.18	0.01	0.21	0.00	0.22	0.19	0.20	0.19	0.18	0.21	0.16	0.12	0.19	0.02	0.00	0.23	0.11	0.26	0.01
C6	0.02	0.01	0.16	0.34	0.01	0.06	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.29	0.09	0.40	0.00	0.47	0.72	0.53
C8	0.01	0.01	0.12	0.27	0.01	0.11	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.26	0.25	0.12	0.40	0.01	0.47	0.66	0.50
N1	0.03	0.01	0.25	0.31	0.01	0.04	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.24	0.15	0.40	0.01	0.42	0.68	0.49
N2	0.05	0.00	0.35	0.24	0.01	0.08	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.21	0.24	0.38	0.02	0.35	0.59	0.42
N3	0.04	0.00	0.29	0.22	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.16	0.19	0.38	0.01	0.35	0.57	0.41
N7	0.01	0.00	0.06	0.32	0.00	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.28	0.31	0.07	0.40	0.01	0.52	0.75	0.55
N9	0.01	0.01	0.03	0.20	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.17	0.11	0.01	0.39	0.01	0.38	0.56	0.41
O2'	0.03	0.18	0.01	0.02	0.16	0.30	0.23	0.12	0.22	0.26	0.19	0.22	0.16	0.28	0.17	0.00	0.08	0.16	0.34	0.25	0.36	0.53	0.34
O3'	0.12	0.19	0.06	0.01	0.16	0.03	0.26	0.19	0.29	0.25	0.24	0.21	0.16	0.31	0.11	0.08	0.00	0.11	0.32	0.34	0.45	0.39	0.36
O4'	0.00	0.20	0.01	0.02	0.10	0.00	0.05	0.02	0.09	0.12	0.15	0.24	0.19	0.07	0.01	0.16	0.11	0.00	0.11	0.07	0.18	0.26	0.17
O5'	0.33	0.39	0.53	0.28	0.39	0.01	0.40	0.00	0.40	0.40	0.40	0.38	0.38	0.40	0.39	0.34	0.32	0.11	0.00	0.39	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.14	0.37	0.01	0.07	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.25	0.34	0.07	0.39	0.00	0.52	0.76	0.56
OP1	0.30	0.37	0.54	0.30	0.39	0.13	0.46	0.11	0.47	0.47	0.42	0.35	0.35	0.52	0.38	0.36	0.45	0.18	0.02	0.52	0.00	0.01	0.00
OP2	0.42	0.61	0.61	0.20	0.61	0.20	0.70	0.26	0.72	0.66	0.68	0.59	0.57	0.75	0.56	0.53	0.39	0.26	0.01	0.76	0.01	0.00	0.01
P	0.31	0.44	0.51	0.22	0.44	0.06	0.51	0.01	0.53	0.50	0.49	0.42	0.41	0.55	0.41	0.34	0.36	0.17	0.00	0.56	0.00	0.01	0.00