Doublet Group distance statistics: 49835

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 2, 3, 1, 2, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.015, 0.021, 0.027, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.021 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.013, 0.019, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.012, 0.019, 0.026, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.014, 0.023, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.023 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.026, 0.038, 0.050, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.038 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.026, 0.037, 0.049, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.037 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.042, 0.060, 0.078, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.060 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.035, 0.055, 0.074, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.055 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.053, 0.076, 0.098, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.076 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.064, 0.089, 0.115, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.089 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.223, 0.372, 0.521, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.372 std_dev=0.149
C2'	A	0, 0.239, 0.389, 0.539, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.389 std_dev=0.150
O2'	A	0, 0.280, 0.443, 0.606, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.443 std_dev=0.163
C4'	A	0, 0.387, 0.626, 0.865, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.626 std_dev=0.239
C3'	A	0, 0.371, 0.613, 0.855, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.613 std_dev=0.242
O5'	A	0, 0.291, 0.547, 0.804, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.547 std_dev=0.257
C2	B	0, 0.332, 0.618, 0.903, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.618 std_dev=0.286
N2	B	0, 0.357, 0.644, 0.931, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.644 std_dev=0.287
OP2	A	0, 0.300, 0.593, 0.886, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.593 std_dev=0.293
N1	B	0, 0.321, 0.619, 0.918, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.619 std_dev=0.298
C6	B	0, 0.406, 0.716, 1.026, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.716 std_dev=0.310
P	A	0, 0.223, 0.537, 0.852, 1.336 max_d=1.336 avg_d=0.537 std_dev=0.315
N3	B	0, 0.341, 0.663, 0.986, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.663 std_dev=0.323
C5	B	0, 0.442, 0.768, 1.095, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.768 std_dev=0.326
C4	B	0, 0.373, 0.712, 1.050, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.712 std_dev=0.339
O2'	B	0, 0.534, 0.885, 1.236, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.885 std_dev=0.351
C2'	B	0, 0.441, 0.792, 1.144, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.792 std_dev=0.351
C5'	A	0, 0.564, 0.921, 1.278, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.921 std_dev=0.357
O3'	A	0, 0.626, 0.985, 1.344, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.985 std_dev=0.359
N9	B	0, 0.388, 0.748, 1.107, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.748 std_dev=0.359
C3'	B	0, 0.496, 0.857, 1.218, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.857 std_dev=0.361
O3'	B	0, 0.561, 0.926, 1.291, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.926 std_dev=0.365
O4'	B	0, 0.475, 0.848, 1.221, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.848 std_dev=0.373
C1'	B	0, 0.356, 0.740, 1.123, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.740 std_dev=0.383
N7	B	0, 0.503, 0.889, 1.275, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.889 std_dev=0.386
O6	B	0, 0.392, 0.783, 1.173, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.783 std_dev=0.391
C8	B	0, 0.481, 0.874, 1.268, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.874 std_dev=0.394
C4'	B	0, 0.516, 0.927, 1.337, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.927 std_dev=0.411
OP1	A	0, 0.080, 0.536, 0.991, 1.790 max_d=1.790 avg_d=0.536 std_dev=0.455
C5'	B	0, 0.595, 1.081, 1.566, 1.844 max_d=1.844 avg_d=1.081 std_dev=0.485
O5'	B	0, 0.508, 1.000, 1.492, 1.854 max_d=1.854 avg_d=1.000 std_dev=0.492
P	B	0, 0.382, 1.027, 1.672, 2.400 max_d=2.400 avg_d=1.027 std_dev=0.645
OP2	B	0, 0.330, 1.000, 1.669, 2.462 max_d=2.462 avg_d=1.000 std_dev=0.669
OP1	B	0, 0.408, 1.113, 1.817, 2.836 max_d=2.836 avg_d=1.113 std_dev=0.705

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.07	0.04	0.04
C2	0.02	0.00	0.07	0.09	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.11	0.12	0.13	0.10
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.04	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.08	0.06	0.04
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.08	0.07	0.09	0.08	0.09	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.08	0.05
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.11	0.11	0.11	0.10
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.02	0.06	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C5	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02	0.13	0.14	0.15	0.13
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.08	0.09	0.07	0.04	0.11	0.10	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.02	0.14	0.16	0.17	0.15
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.08	0.02	0.13	0.13	0.11	0.11
N1	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.03	0.13	0.14	0.16	0.13
N3	0.02	0.00	0.07	0.08	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.10	0.10	0.11	0.08
N6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.02	0.06	0.02	0.11	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.11	0.03	0.15	0.19	0.20	0.17
N7	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.08	0.02	0.14	0.15	0.15	0.15
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.10	0.10	0.08	0.08
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.05	0.03	0.04	0.08	0.05	0.03
O3'	0.01	0.12	0.02	0.00	0.07	0.01	0.08	0.02	0.10	0.08	0.12	0.10	0.11	0.08	0.04	0.05	0.00	0.01	0.07	0.14	0.13	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.07	0.04	0.05
O5'	0.06	0.11	0.04	0.05	0.11	0.01	0.13	0.00	0.14	0.13	0.13	0.10	0.15	0.14	0.10	0.04	0.07	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.12	0.08	0.10	0.11	0.06	0.14	0.06	0.16	0.13	0.14	0.10	0.19	0.15	0.10	0.08	0.14	0.07	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.13	0.06	0.08	0.11	0.02	0.15	0.01	0.17	0.11	0.16	0.11	0.20	0.15	0.08	0.05	0.13	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.10	0.04	0.05	0.10	0.01	0.13	0.01	0.15	0.11	0.13	0.08	0.17	0.15	0.08	0.03	0.08	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.16	0.17	0.18	0.15	0.17	0.16	0.17	0.16	0.16	0.16	0.16	0.16	0.16	0.16	0.18	0.20	0.17	0.16	0.16	0.17	0.33	0.18
C2	0.31	0.21	0.32	0.32	0.25	0.34	0.23	0.34	0.20	0.27	0.19	0.18	0.24	0.25	0.28	0.33	0.33	0.32	0.31	0.19	0.36	0.38	0.31
C2'	0.19	0.19	0.18	0.18	0.19	0.19	0.18	0.19	0.18	0.18	0.18	0.19	0.19	0.18	0.19	0.19	0.19	0.20	0.19	0.18	0.19	0.34	0.21
C3'	0.16	0.17	0.15	0.15	0.16	0.17	0.17	0.16	0.17	0.16	0.17	0.17	0.16	0.17	0.16	0.19	0.17	0.17	0.17	0.17	0.16	0.31	0.17
C4	0.22	0.18	0.23	0.24	0.19	0.24	0.18	0.24	0.17	0.20	0.16	0.17	0.19	0.19	0.21	0.24	0.25	0.23	0.22	0.16	0.24	0.34	0.23
C4'	0.13	0.14	0.12	0.14	0.13	0.13	0.14	0.13	0.16	0.13	0.15	0.14	0.13	0.15	0.13	0.15	0.16	0.13	0.16	0.17	0.14	0.34	0.19
C5	0.23	0.20	0.24	0.24	0.21	0.24	0.20	0.24	0.19	0.22	0.19	0.18	0.21	0.21	0.22	0.24	0.25	0.23	0.22	0.18	0.25	0.34	0.23
C5'	0.09	0.10	0.10	0.12	0.09	0.10	0.12	0.10	0.14	0.11	0.12	0.11	0.08	0.13	0.09	0.14	0.14	0.09	0.16	0.16	0.14	0.35	0.20
C6	0.30	0.23	0.31	0.31	0.26	0.31	0.25	0.31	0.23	0.28	0.22	0.20	0.26	0.26	0.28	0.31	0.30	0.30	0.29	0.22	0.33	0.37	0.30
C8	0.15	0.15	0.15	0.16	0.15	0.16	0.16	0.15	0.15	0.16	0.15	0.15	0.15	0.16	0.15	0.17	0.17	0.16	0.16	0.15	0.16	0.33	0.18
N1	0.33	0.23	0.34	0.34	0.28	0.36	0.26	0.36	0.23	0.30	0.22	0.20	0.27	0.28	0.31	0.35	0.34	0.34	0.34	0.23	0.38	0.39	0.34
N3	0.26	0.18	0.27	0.27	0.21	0.28	0.19	0.28	0.17	0.22	0.17	0.17	0.21	0.21	0.23	0.28	0.28	0.27	0.25	0.17	0.29	0.35	0.26
N6	0.33	0.26	0.34	0.33	0.30	0.33	0.29	0.33	0.27	0.32	0.26	0.22	0.29	0.31	0.32	0.33	0.32	0.32	0.32	0.27	0.35	0.38	0.32
N7	0.17	0.17	0.18	0.18	0.17	0.18	0.17	0.17	0.17	0.18	0.17	0.17	0.17	0.18	0.18	0.18	0.19	0.17	0.17	0.17	0.18	0.33	0.19
N9	0.18	0.16	0.18	0.19	0.16	0.19	0.16	0.18	0.15	0.16	0.15	0.15	0.16	0.16	0.17	0.19	0.20	0.18	0.17	0.15	0.18	0.33	0.19
O2'	0.19	0.18	0.18	0.19	0.18	0.19	0.17	0.19	0.17	0.18	0.18	0.18	0.19	0.17	0.18	0.19	0.20	0.21	0.19	0.17	0.19	0.34	0.21
O3'	0.17	0.15	0.15	0.15	0.16	0.17	0.17	0.16	0.17	0.17	0.16	0.15	0.16	0.17	0.16	0.20	0.17	0.18	0.16	0.17	0.15	0.28	0.15
O4'	0.14	0.15	0.14	0.16	0.14	0.15	0.16	0.15	0.17	0.15	0.16	0.16	0.14	0.16	0.14	0.16	0.18	0.14	0.15	0.18	0.14	0.34	0.18
O5'	0.07	0.09	0.10	0.11	0.08	0.09	0.12	0.09	0.14	0.10	0.13	0.10	0.07	0.12	0.07	0.16	0.15	0.07	0.15	0.17	0.12	0.35	0.19
OP1	0.08	0.06	0.08	0.11	0.09	0.09	0.14	0.13	0.15	0.13	0.10	0.09	0.06	0.16	0.09	0.13	0.14	0.08	0.22	0.20	0.22	0.41	0.27
OP2	0.08	0.06	0.09	0.13	0.09	0.10	0.13	0.14	0.14	0.12	0.11	0.10	0.07	0.14	0.09	0.09	0.14	0.09	0.21	0.17	0.21	0.40	0.26
P	0.07	0.06	0.09	0.11	0.07	0.08	0.11	0.10	0.13	0.10	0.09	0.12	0.05	0.13	0.07	0.14	0.13	0.07	0.18	0.16	0.16	0.36	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.29	0.11
C2	0.04	0.00	0.09	0.07	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.09	0.03	0.09	0.02	0.07	0.34	0.16
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.08	0.06	0.13	0.09	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.11	0.05	0.12	0.18	0.02
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.09	0.16	0.07	0.10	0.07	0.16	0.08	0.01	0.00	0.01	0.19	0.12	0.18	0.14	0.09
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.12	0.01	0.10	0.34	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.12	0.03	0.08	0.05	0.11	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.07	0.21	0.04
C5	0.00	0.01	0.03	0.10	0.00	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.01	0.20	0.01	0.18	0.36	0.21
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.16	0.07	0.06	0.04	0.17	0.08	0.05	0.03	0.01	0.01	0.14	0.06	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.21	0.00	0.19	0.36	0.23
C8	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.12	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.20	0.03	0.21	0.01	0.20	0.37	0.21
N1	0.03	0.01	0.06	0.07	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.01	0.15	0.01	0.13	0.35	0.19
N2	0.07	0.00	0.13	0.10	0.01	0.08	0.01	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.20	0.15	0.06	0.06	0.04	0.05	0.33	0.15
N3	0.04	0.00	0.09	0.07	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.14	0.08	0.03	0.06	0.01	0.06	0.33	0.15
N7	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.21	0.03	0.25	0.01	0.25	0.39	0.25
N9	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.10	0.01	0.09	0.34	0.15
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.06	0.05	0.04	0.05	0.07	0.06	0.11	0.20	0.14	0.05	0.01	0.00	0.05	0.05	0.03	0.06	0.10	0.22	0.06
O3'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.06	0.02	0.13	0.03	0.12	0.20	0.08	0.15	0.08	0.21	0.08	0.05	0.00	0.02	0.21	0.16	0.28	0.13	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.03	0.03	0.00	0.05	0.02	0.00	0.09	0.02	0.07	0.31	0.14
O5'	0.02	0.09	0.11	0.19	0.12	0.01	0.20	0.01	0.21	0.21	0.15	0.06	0.06	0.25	0.10	0.03	0.21	0.09	0.00	0.25	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.02	0.25	0.00	0.24	0.38	0.26
OP1	0.03	0.07	0.12	0.18	0.10	0.07	0.18	0.06	0.19	0.20	0.13	0.05	0.06	0.25	0.09	0.10	0.28	0.07	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.34	0.18	0.14	0.34	0.21	0.36	0.18	0.36	0.37	0.35	0.33	0.33	0.39	0.34	0.22	0.13	0.31	0.01	0.38	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.16	0.02	0.09	0.16	0.04	0.21	0.01	0.23	0.21	0.19	0.15	0.15	0.25	0.15	0.06	0.16	0.14	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00