Doublet Group distance statistics: 49838

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N7	A	0, 0.003, 0.007, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C8	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.032 std_dev=0.019
C2'	A	0, 0.095, 0.401, 0.707, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.401 std_dev=0.306
O4'	A	0, 0.090, 0.412, 0.734, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.412 std_dev=0.322
O2'	A	0, 0.112, 0.458, 0.805, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.458 std_dev=0.346
N2	B	0, 0.312, 0.740, 1.168, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.740 std_dev=0.428
C2	B	0, 0.328, 0.787, 1.247, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.787 std_dev=0.460
O5'	A	0, 0.356, 0.846, 1.337, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.846 std_dev=0.491
C4'	A	0, 0.115, 0.607, 1.100, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.607 std_dev=0.492
OP2	A	0, 0.362, 0.864, 1.366, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.864 std_dev=0.502
C3'	A	0, 0.131, 0.635, 1.138, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.635 std_dev=0.504
N1	B	0, 0.322, 0.861, 1.401, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.861 std_dev=0.540
N3	B	0, 0.348, 0.893, 1.438, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.893 std_dev=0.545
P	A	0, 0.408, 0.966, 1.525, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.966 std_dev=0.559
C4	B	0, 0.410, 1.012, 1.615, 1.586 max_d=1.586 avg_d=1.012 std_dev=0.603
C6	B	0, 0.454, 1.084, 1.713, 1.545 max_d=1.545 avg_d=1.084 std_dev=0.629
C5	B	0, 0.462, 1.100, 1.738, 1.550 max_d=1.550 avg_d=1.100 std_dev=0.638
N9	B	0, 0.420, 1.169, 1.918, 2.088 max_d=2.088 avg_d=1.169 std_dev=0.749
O6	B	0, 0.548, 1.300, 2.053, 1.781 max_d=1.781 avg_d=1.300 std_dev=0.753
O3'	A	0, 0.164, 0.921, 1.677, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.921 std_dev=0.757
OP1	A	0, 0.555, 1.314, 2.073, 1.796 max_d=1.796 avg_d=1.314 std_dev=0.759
N7	B	0, 0.522, 1.290, 2.058, 2.019 max_d=2.019 avg_d=1.290 std_dev=0.768
C8	B	0, 0.490, 1.288, 2.085, 2.185 max_d=2.185 avg_d=1.288 std_dev=0.797
C5'	A	0, 0.216, 1.030, 1.843, 2.280 max_d=2.280 avg_d=1.030 std_dev=0.814
C1'	B	0, 0.340, 1.265, 2.190, 2.612 max_d=2.612 avg_d=1.265 std_dev=0.925
P	B	0, 0.577, 1.504, 2.430, 2.523 max_d=2.523 avg_d=1.504 std_dev=0.927
OP2	B	0, 0.630, 1.629, 2.627, 2.705 max_d=2.705 avg_d=1.629 std_dev=0.999
O4'	B	0, 0.390, 1.418, 2.445, 2.903 max_d=2.903 avg_d=1.418 std_dev=1.027
OP1	B	0, 0.570, 1.613, 2.657, 2.910 max_d=2.910 avg_d=1.613 std_dev=1.044
O5'	B	0, 0.526, 1.648, 2.771, 3.166 max_d=3.166 avg_d=1.648 std_dev=1.123
C2'	B	0, 0.312, 1.463, 2.614, 3.227 max_d=3.227 avg_d=1.463 std_dev=1.151
O2'	B	0, 0.203, 1.546, 2.889, 3.700 max_d=3.700 avg_d=1.546 std_dev=1.343
C3'	B	0, 0.350, 1.694, 3.038, 3.764 max_d=3.764 avg_d=1.694 std_dev=1.344
C4'	B	0, 0.351, 1.727, 3.104, 3.851 max_d=3.851 avg_d=1.727 std_dev=1.376
C5'	B	0, 0.378, 1.918, 3.459, 4.304 max_d=4.304 avg_d=1.918 std_dev=1.540
O3'	B	0, 0.306, 1.920, 3.533, 4.473 max_d=4.473 avg_d=1.920 std_dev=1.613

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.12	0.41	0.45	0.51
C2	0.01	0.00	0.19	0.18	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.23	0.26	0.04	0.02	0.35	0.35	0.42
C2'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.03	0.11	0.04	0.16	0.19	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.07	0.14	0.14
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.06	0.14	0.13	0.16	0.04	0.09	0.04	0.01	0.00	0.00	0.32	0.38	0.09	0.15
C4	0.01	0.00	0.11	0.07	0.00	0.03	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.10	0.03	0.02	0.37	0.37	0.43
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.05	0.15	0.03	0.05	0.07	0.13	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.18	0.16
C5	0.01	0.00	0.07	0.02	0.00	0.06	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.03	0.05	0.35	0.32	0.37
C5'	0.07	0.10	0.03	0.01	0.15	0.00	0.22	0.00	0.21	0.31	0.15	0.08	0.25	0.31	0.18	0.04	0.03	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.06	0.00	0.05	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.12	0.04	0.06	0.33	0.29	0.35
C8	0.01	0.01	0.04	0.14	0.01	0.15	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.14	0.01	0.07	0.38	0.39	0.40
N1	0.01	0.00	0.16	0.13	0.01	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.21	0.04	0.02	0.34	0.31	0.38
N3	0.01	0.00	0.19	0.16	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.21	0.23	0.03	0.05	0.36	0.38	0.45
N6	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01	0.07	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.08	0.04	0.10	0.30	0.24	0.29
N7	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.13	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.02	0.10	0.35	0.32	0.33
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.39	0.41	0.46
O2'	0.02	0.23	0.01	0.01	0.11	0.04	0.08	0.04	0.13	0.04	0.19	0.21	0.11	0.01	0.02	0.00	0.02	0.09	0.12	0.07	0.13	0.14
O3'	0.02	0.26	0.01	0.00	0.10	0.02	0.05	0.03	0.12	0.14	0.21	0.23	0.08	0.08	0.03	0.02	0.00	0.03	0.49	0.78	0.31	0.43
O4'	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.09	0.03	0.00	0.30	0.59	0.61	0.67
O5'	0.12	0.02	0.13	0.32	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.07	0.02	0.05	0.10	0.10	0.03	0.12	0.49	0.30	0.00	0.03	0.00	0.00
OP1	0.41	0.35	0.07	0.38	0.37	0.04	0.35	0.02	0.33	0.38	0.34	0.36	0.30	0.35	0.39	0.07	0.78	0.59	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.45	0.35	0.14	0.09	0.37	0.18	0.32	0.05	0.29	0.39	0.31	0.38	0.24	0.32	0.41	0.13	0.31	0.61	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.51	0.42	0.14	0.15	0.43	0.16	0.37	0.01	0.35	0.40	0.38	0.45	0.29	0.33	0.46	0.14	0.43	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.17	0.36	0.35	0.27	0.34	0.32	0.20	0.31	0.35	0.23	0.04	0.20	0.37	0.29	0.43	0.45	0.28	0.73	0.34	0.73	0.73	0.66
C2	0.56	0.29	0.74	0.80	0.45	0.76	0.46	0.68	0.40	0.55	0.31	0.14	0.37	0.53	0.51	0.83	0.99	0.56	0.91	0.40	0.90	0.84	0.78
C2'	0.44	0.40	0.48	0.47	0.44	0.46	0.48	0.33	0.47	0.47	0.43	0.33	0.40	0.50	0.44	0.56	0.55	0.42	0.86	0.50	0.83	0.83	0.77
C3'	0.54	0.52	0.57	0.55	0.55	0.54	0.59	0.39	0.59	0.58	0.56	0.46	0.51	0.61	0.55	0.65	0.62	0.52	1.01	0.61	0.96	0.96	0.91
C4	0.44	0.24	0.57	0.60	0.39	0.56	0.42	0.46	0.37	0.47	0.28	0.07	0.30	0.47	0.43	0.64	0.74	0.43	0.84	0.39	0.82	0.80	0.73
C4'	0.39	0.30	0.44	0.42	0.39	0.40	0.45	0.24	0.44	0.46	0.37	0.17	0.32	0.49	0.41	0.50	0.50	0.38	0.91	0.49	0.90	0.90	0.84
C5	0.47	0.23	0.65	0.69	0.41	0.62	0.44	0.53	0.39	0.52	0.28	0.03	0.31	0.51	0.47	0.70	0.84	0.45	0.88	0.40	0.85	0.82	0.76
C5'	0.53	0.38	0.58	0.57	0.51	0.52	0.57	0.35	0.54	0.59	0.45	0.21	0.42	0.61	0.54	0.64	0.64	0.51	1.09	0.57	1.07	1.07	1.01
C6	0.57	0.25	0.80	0.87	0.46	0.79	0.47	0.71	0.40	0.58	0.29	0.05	0.35	0.55	0.54	0.88	1.06	0.56	0.93	0.41	0.91	0.85	0.80
C8	0.28	0.14	0.38	0.39	0.30	0.35	0.37	0.23	0.35	0.39	0.24	0.12	0.18	0.42	0.31	0.41	0.49	0.27	0.77	0.39	0.75	0.75	0.68
N1	0.60	0.28	0.82	0.90	0.47	0.84	0.48	0.78	0.40	0.59	0.30	0.11	0.37	0.55	0.55	0.92	1.11	0.60	0.94	0.41	0.93	0.86	0.81
N3	0.49	0.27	0.63	0.67	0.41	0.63	0.43	0.54	0.38	0.50	0.30	0.13	0.34	0.49	0.46	0.72	0.83	0.48	0.86	0.39	0.85	0.81	0.75
N6	0.63	0.23	0.92	1.00	0.47	0.90	0.49	0.83	0.40	0.62	0.28	0.02	0.34	0.58	0.58	1.01	1.21	0.62	0.98	0.41	0.95	0.87	0.82
N7	0.37	0.17	0.52	0.55	0.37	0.47	0.42	0.37	0.38	0.47	0.26	0.12	0.24	0.48	0.40	0.53	0.67	0.35	0.83	0.41	0.81	0.79	0.72
N9	0.33	0.19	0.43	0.44	0.32	0.41	0.37	0.29	0.34	0.40	0.25	0.03	0.23	0.42	0.34	0.49	0.55	0.32	0.77	0.37	0.76	0.75	0.68
O2'	0.40	0.38	0.43	0.42	0.42	0.42	0.47	0.29	0.47	0.46	0.43	0.31	0.37	0.49	0.41	0.51	0.49	0.39	0.82	0.52	0.80	0.82	0.74
O3'	0.59	0.61	0.60	0.58	0.61	0.58	0.66	0.42	0.67	0.63	0.65	0.57	0.58	0.66	0.60	0.68	0.63	0.57	1.06	0.70	1.01	1.02	0.97
O4'	0.18	0.03	0.24	0.23	0.15	0.20	0.21	0.06	0.19	0.25	0.09	0.17	0.05	0.27	0.18	0.31	0.34	0.17	0.67	0.25	0.68	0.68	0.61
O5'	0.29	0.27	0.22	0.16	0.32	0.19	0.40	0.02	0.43	0.37	0.37	0.17	0.26	0.42	0.31	0.30	0.16	0.29	0.80	0.50	0.80	0.81	0.77
OP1	0.30	0.15	0.54	0.68	0.19	0.53	0.08	0.71	0.09	0.18	0.03	0.18	0.24	0.09	0.24	0.46	0.79	0.28	0.16	0.26	0.20	0.27	0.22
OP2	0.03	0.04	0.14	0.17	0.09	0.09	0.27	0.23	0.38	0.20	0.24	0.25	0.06	0.31	0.08	0.10	0.22	0.06	0.62	0.56	0.63	0.68	0.62
P	0.08	0.03	0.24	0.30	0.05	0.20	0.23	0.34	0.35	0.14	0.22	0.20	0.09	0.27	0.03	0.21	0.37	0.05	0.51	0.55	0.54	0.63	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.09	0.04	0.01	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.32	0.03	0.28	0.11	0.17
C2	0.03	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.07	0.03	0.47	0.02	0.41	0.34	0.36
C2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.23	0.04	0.28	0.13	0.15
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.04	0.06	0.01	0.08	0.11	0.07	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.18	0.06	0.32	0.09	0.15
C4	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.25	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.04	0.01	0.49	0.02	0.42	0.32	0.36
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.00	0.12	0.02	0.10	0.12	0.08	0.04	0.04	0.14	0.07	0.03	0.02	0.01	0.02	0.13	0.15	0.21	0.08
C5	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.12	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.04	0.02	0.55	0.01	0.48	0.40	0.44
C5'	0.09	0.24	0.05	0.04	0.25	0.02	0.33	0.00	0.33	0.32	0.29	0.21	0.19	0.37	0.22	0.01	0.02	0.02	0.02	0.37	0.35	0.36	0.04
C6	0.04	0.01	0.03	0.06	0.02	0.10	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.11	0.05	0.01	0.56	0.01	0.50	0.45	0.47
C8	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.12	0.01	0.32	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.57	0.01	0.47	0.34	0.42
N1	0.04	0.01	0.02	0.08	0.01	0.08	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.12	0.06	0.03	0.53	0.02	0.47	0.41	0.43
N2	0.03	0.00	0.04	0.11	0.01	0.04	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.04	0.44	0.03	0.39	0.32	0.34
N3	0.03	0.00	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.19	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.03	0.45	0.03	0.39	0.29	0.32
N7	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.14	0.00	0.37	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.58	0.01	0.51	0.43	0.47
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.07	0.01	0.22	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.01	0.48	0.02	0.40	0.26	0.33
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.08	0.03	0.08	0.01	0.11	0.04	0.12	0.10	0.10	0.06	0.05	0.00	0.02	0.02	0.03	0.10	0.08	0.04	0.04
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.06	0.08	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.07	0.05	0.18	0.04	0.02
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.23	0.02	0.21	0.05	0.06
O5'	0.32	0.47	0.23	0.18	0.49	0.02	0.55	0.02	0.56	0.57	0.53	0.44	0.45	0.58	0.48	0.03	0.07	0.23	0.00	0.57	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.13	0.01	0.37	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.10	0.05	0.02	0.57	0.00	0.52	0.49	0.50
OP1	0.28	0.41	0.28	0.32	0.42	0.15	0.48	0.35	0.50	0.47	0.47	0.39	0.39	0.51	0.40	0.08	0.18	0.21	0.01	0.52	0.00	0.02	0.02
OP2	0.11	0.34	0.13	0.09	0.32	0.21	0.40	0.36	0.45	0.34	0.41	0.32	0.29	0.43	0.26	0.04	0.04	0.05	0.01	0.49	0.02	0.00	0.01
P	0.17	0.36	0.15	0.15	0.36	0.08	0.44	0.04	0.47	0.42	0.43	0.34	0.32	0.47	0.33	0.04	0.02	0.06	0.01	0.50	0.02	0.01	0.00