Doublet Group distance statistics: 49851

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 2, 4, 6, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.006, 0.015, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.009, 0.024, 0.038, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.010, 0.025, 0.041, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.025 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.010, 0.029, 0.048, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.029 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.013, 0.038, 0.062, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.038 std_dev=0.025
C2'	A	0, 0.040, 0.100, 0.160, 0.213 max_d=0.213 avg_d=0.100 std_dev=0.060
O4'	A	0, 0.006, 0.073, 0.140, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.073 std_dev=0.067
O2'	A	0, 0.073, 0.163, 0.253, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.163 std_dev=0.090
N3	B	0, 0.195, 0.298, 0.401, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.298 std_dev=0.103
C2	B	0, 0.210, 0.322, 0.433, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.322 std_dev=0.112
O2	B	0, 0.222, 0.346, 0.470, 0.545 max_d=0.545 avg_d=0.346 std_dev=0.124
C4'	A	0, 0.023, 0.153, 0.282, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.153 std_dev=0.130
C3'	A	0, 0.036, 0.169, 0.302, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.169 std_dev=0.133
C4	B	0, 0.205, 0.350, 0.495, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.350 std_dev=0.145
O4	B	0, 0.230, 0.387, 0.545, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.387 std_dev=0.158
N1	B	0, 0.269, 0.446, 0.623, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.446 std_dev=0.177
C5'	A	0, 0.053, 0.237, 0.421, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.237 std_dev=0.184
O5'	A	0, 0.092, 0.287, 0.483, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.287 std_dev=0.195
C5	B	0, 0.268, 0.479, 0.691, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.479 std_dev=0.211
C6	B	0, 0.333, 0.544, 0.756, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.544 std_dev=0.211
O3'	A	0, 0.070, 0.302, 0.534, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.302 std_dev=0.232
C1'	B	0, 0.312, 0.548, 0.784, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.548 std_dev=0.236
C2'	B	0, 0.255, 0.509, 0.762, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.509 std_dev=0.253
P	A	0, 0.140, 0.438, 0.737, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.438 std_dev=0.299
O2'	B	0, 0.302, 0.611, 0.919, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.611 std_dev=0.308
OP1	A	0, 0.257, 0.567, 0.878, 1.472 max_d=1.472 avg_d=0.567 std_dev=0.311
C3'	B	0, 0.318, 0.655, 0.991, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.655 std_dev=0.337
O4'	B	0, 0.372, 0.709, 1.046, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.709 std_dev=0.337
O3'	B	0, 0.341, 0.731, 1.122, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.731 std_dev=0.390
C4'	B	0, 0.379, 0.788, 1.197, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.788 std_dev=0.409
O5'	B	0, 0.384, 0.830, 1.275, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.830 std_dev=0.445
OP2	A	0, 0.097, 0.546, 0.996, 2.096 max_d=2.096 avg_d=0.546 std_dev=0.450
OP2	B	0, 0.532, 1.026, 1.521, 1.739 max_d=1.739 avg_d=1.026 std_dev=0.495
C5'	B	0, 0.415, 0.937, 1.459, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.937 std_dev=0.522
P	B	0, 0.441, 0.975, 1.508, 1.979 max_d=1.979 avg_d=0.975 std_dev=0.534
OP1	B	0, 0.461, 1.195, 1.929, 2.797 max_d=2.797 avg_d=1.195 std_dev=0.734

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.17	0.07	0.10
C2	0.02	0.00	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.11	0.14	0.09	0.11
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.05	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.13	0.04	0.06
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.11	0.07	0.11	0.08	0.12	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.04	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.02	0.12	0.14	0.10	0.12
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.08	0.06	0.07	0.05	0.09	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.11	0.03	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.11	0.02	0.15	0.15	0.15	0.14
C5'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.11	0.00	0.14	0.00	0.15	0.12	0.14	0.09	0.17	0.15	0.09	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.11	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.03	0.16	0.15	0.15	0.14
C8	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.08	0.02	0.16	0.15	0.15	0.15
N1	0.02	0.00	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.03	0.14	0.14	0.12	0.12
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.10	0.15	0.08	0.11
N6	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.09	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.15	0.03	0.18	0.16	0.18	0.15
N7	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.11	0.02	0.17	0.16	0.18	0.16
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.11	0.15	0.10	0.12
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.02	0.01	0.00	0.05	0.05	0.05	0.16	0.07	0.08
O3'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.08	0.02	0.11	0.03	0.13	0.08	0.13	0.08	0.15	0.11	0.05	0.05	0.00	0.02	0.04	0.12	0.08	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.02	0.00	0.06	0.18	0.07	0.11
O5'	0.06	0.11	0.03	0.02	0.12	0.01	0.15	0.01	0.16	0.16	0.14	0.10	0.18	0.17	0.11	0.05	0.04	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.14	0.13	0.09	0.14	0.11	0.15	0.02	0.15	0.15	0.14	0.15	0.16	0.16	0.15	0.16	0.12	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.09	0.04	0.04	0.10	0.03	0.15	0.04	0.15	0.15	0.12	0.08	0.18	0.18	0.10	0.07	0.08	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.11	0.06	0.04	0.12	0.05	0.14	0.01	0.14	0.15	0.12	0.11	0.15	0.16	0.12	0.08	0.10	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.09	0.10	0.13	0.11	0.09	0.13	0.19	0.09	0.06	0.07	0.16	0.18	0.16	0.16	0.06	0.31	0.38	0.60	0.37
C2	0.17	0.14	0.15	0.14	0.12	0.12	0.11	0.13	0.10	0.13	0.10	0.21	0.27	0.17	0.17	0.15	0.22	0.28	0.47	0.27
C2'	0.12	0.12	0.12	0.10	0.09	0.06	0.10	0.13	0.06	0.09	0.08	0.20	0.22	0.14	0.15	0.09	0.25	0.32	0.56	0.32
C3'	0.17	0.17	0.16	0.10	0.08	0.10	0.08	0.09	0.08	0.13	0.12	0.24	0.26	0.13	0.13	0.14	0.19	0.22	0.49	0.25
C4	0.13	0.12	0.11	0.11	0.11	0.08	0.11	0.13	0.08	0.10	0.08	0.19	0.22	0.15	0.17	0.10	0.23	0.28	0.49	0.29
C4'	0.11	0.13	0.12	0.09	0.08	0.07	0.10	0.14	0.07	0.09	0.10	0.19	0.20	0.12	0.12	0.08	0.25	0.30	0.55	0.31
C5	0.14	0.13	0.12	0.11	0.12	0.09	0.10	0.11	0.09	0.12	0.09	0.20	0.22	0.14	0.17	0.13	0.19	0.22	0.43	0.24
C5'	0.17	0.19	0.18	0.12	0.12	0.12	0.12	0.14	0.12	0.15	0.17	0.24	0.24	0.14	0.14	0.14	0.20	0.21	0.46	0.23
C6	0.18	0.14	0.15	0.13	0.12	0.13	0.10	0.12	0.11	0.14	0.10	0.21	0.26	0.16	0.16	0.17	0.17	0.19	0.38	0.22
C8	0.09	0.10	0.09	0.09	0.10	0.06	0.11	0.13	0.07	0.07	0.07	0.16	0.17	0.12	0.17	0.07	0.23	0.26	0.49	0.28
N1	0.19	0.15	0.16	0.14	0.12	0.14	0.11	0.13	0.11	0.15	0.10	0.21	0.28	0.17	0.16	0.18	0.19	0.23	0.41	0.24
N3	0.14	0.13	0.13	0.13	0.12	0.10	0.11	0.14	0.09	0.11	0.09	0.20	0.24	0.17	0.17	0.12	0.24	0.31	0.51	0.30
N6	0.21	0.15	0.17	0.15	0.12	0.17	0.11	0.14	0.13	0.17	0.11	0.20	0.28	0.17	0.15	0.20	0.15	0.15	0.31	0.18
N7	0.11	0.11	0.10	0.09	0.11	0.07	0.10	0.10	0.08	0.09	0.08	0.17	0.19	0.11	0.16	0.10	0.19	0.20	0.42	0.23
N9	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.07	0.12	0.15	0.08	0.08	0.07	0.17	0.19	0.14	0.17	0.07	0.26	0.31	0.53	0.31
O2'	0.09	0.10	0.10	0.13	0.09	0.08	0.12	0.19	0.08	0.07	0.07	0.18	0.20	0.16	0.14	0.06	0.32	0.41	0.64	0.39
O3'	0.22	0.21	0.20	0.13	0.10	0.14	0.09	0.10	0.11	0.18	0.15	0.28	0.30	0.15	0.13	0.19	0.17	0.19	0.48	0.23
O4'	0.07	0.07	0.09	0.14	0.11	0.11	0.15	0.21	0.11	0.06	0.06	0.13	0.15	0.16	0.15	0.07	0.32	0.39	0.61	0.39
O5'	0.17	0.21	0.19	0.13	0.15	0.12	0.13	0.15	0.13	0.16	0.21	0.25	0.24	0.13	0.15	0.14	0.21	0.21	0.44	0.21
OP1	0.17	0.20	0.19	0.13	0.16	0.14	0.15	0.18	0.15	0.16	0.20	0.24	0.24	0.13	0.16	0.15	0.24	0.21	0.43	0.21
OP2	0.21	0.24	0.22	0.20	0.22	0.20	0.21	0.25	0.20	0.21	0.24	0.26	0.24	0.19	0.22	0.20	0.30	0.22	0.43	0.23
P	0.18	0.22	0.19	0.14	0.18	0.15	0.16	0.18	0.16	0.18	0.22	0.25	0.24	0.14	0.18	0.16	0.23	0.21	0.42	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.07	0.08	0.15	0.12
C2	0.03	0.00	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.01	0.03	0.15	0.14	0.30	0.19
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.12	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.14	0.12	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.05	0.04	0.08	0.13	0.02	0.01	0.07	0.01	0.05	0.19	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.03	0.18	0.20	0.35	0.23
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.07	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.07	0.04	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.16	0.20	0.29	0.21
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.14	0.01	0.14	0.00	0.11	0.08	0.12	0.09	0.04	0.03	0.16	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.03	0.15	0.15	0.22	0.18
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.12	0.12	0.23	0.16
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.02	0.17	0.17	0.35	0.22
O2	0.05	0.00	0.12	0.13	0.01	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.15	0.02	0.05	0.16	0.15	0.30	0.19
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.07	0.12	0.00	0.04	0.06	0.05	0.05	0.13	0.10	0.06
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.07	0.01	0.06	0.03	0.05	0.04	0.10	0.15	0.04	0.00	0.08	0.02	0.09	0.28	0.12	0.11
O4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.08	0.01	0.16	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.08	0.00	0.04	0.19	0.23	0.39	0.26
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.05	0.02	0.04	0.00	0.08	0.13	0.14	0.15
O5'	0.07	0.15	0.05	0.05	0.18	0.02	0.16	0.01	0.15	0.12	0.17	0.16	0.05	0.09	0.19	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.08	0.14	0.14	0.19	0.20	0.07	0.20	0.06	0.15	0.12	0.17	0.15	0.13	0.28	0.23	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.30	0.12	0.10	0.35	0.04	0.29	0.02	0.22	0.23	0.35	0.30	0.10	0.12	0.39	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.19	0.07	0.07	0.23	0.04	0.21	0.02	0.18	0.16	0.22	0.19	0.06	0.11	0.26	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00