Doublet Group distance statistics: 49855

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 2, 0, 0, 2, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.014, 0.028, 0.043, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.032 std_dev=0.019
O4'	A	0, 0.060, 0.148, 0.235, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.148 std_dev=0.087
C2'	A	0, 0.088, 0.210, 0.333, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.210 std_dev=0.123
N3	B	0, 0.206, 0.382, 0.558, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.382 std_dev=0.176
C4	B	0, 0.236, 0.440, 0.643, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.440 std_dev=0.204
O4	B	0, 0.245, 0.455, 0.665, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.455 std_dev=0.210
O2	B	0, 0.201, 0.455, 0.710, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.455 std_dev=0.255
C2	B	0, 0.177, 0.434, 0.692, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.434 std_dev=0.257
C5	B	0, 0.253, 0.527, 0.801, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.527 std_dev=0.274
C6	B	0, 0.225, 0.557, 0.888, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.557 std_dev=0.331
O4'	B	0, 0.190, 0.528, 0.866, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.528 std_dev=0.338
N1	B	0, 0.181, 0.525, 0.868, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.525 std_dev=0.344
C4'	A	0, 0.210, 0.595, 0.980, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.595 std_dev=0.385
C1'	B	0, 0.207, 0.646, 1.084, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.646 std_dev=0.439
C3'	B	0, 0.251, 0.744, 1.238, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.744 std_dev=0.494
C4'	B	0, 0.210, 0.705, 1.200, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.705 std_dev=0.495
C5'	A	0, 0.323, 0.952, 1.581, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.952 std_dev=0.629
O3'	B	0, 0.333, 0.983, 1.633, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.983 std_dev=0.650
O2'	A	0, 0.254, 1.052, 1.850, 1.841 max_d=1.841 avg_d=1.052 std_dev=0.798
O5'	B	0, 0.295, 1.109, 1.924, 2.048 max_d=2.048 avg_d=1.109 std_dev=0.815
C3'	A	0, 0.225, 1.064, 1.902, 1.967 max_d=1.967 avg_d=1.064 std_dev=0.839
C2'	B	0, 0.276, 1.116, 1.956, 2.134 max_d=2.134 avg_d=1.116 std_dev=0.840
C5'	B	0, 0.306, 1.222, 2.138, 2.262 max_d=2.262 avg_d=1.222 std_dev=0.916
P	B	0, 0.366, 1.362, 2.357, 2.463 max_d=2.463 avg_d=1.362 std_dev=0.996
OP2	B	0, 0.418, 1.432, 2.446, 2.585 max_d=2.585 avg_d=1.432 std_dev=1.014
OP1	B	0, 0.435, 1.607, 2.779, 2.974 max_d=2.974 avg_d=1.607 std_dev=1.172
OP2	A	0, 0.480, 1.867, 3.254, 3.218 max_d=3.218 avg_d=1.867 std_dev=1.387
O5'	A	0, 0.405, 1.868, 3.332, 3.292 max_d=3.292 avg_d=1.868 std_dev=1.463
O2'	B	0, 0.434, 1.978, 3.521, 3.698 max_d=3.698 avg_d=1.978 std_dev=1.544
O3'	A	0, 0.277, 2.025, 3.772, 3.778 max_d=3.778 avg_d=2.025 std_dev=1.747
P	A	0, 0.524, 2.470, 4.416, 4.362 max_d=4.362 avg_d=2.470 std_dev=1.946
OP1	A	0, 0.704, 4.039, 7.373, 7.207 max_d=7.207 avg_d=4.039 std_dev=3.335

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.29	0.01	0.34	0.30	0.72	0.33
C2	0.02	0.00	0.04	0.16	0.00	0.08	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.39	0.33	0.05	0.13	0.37	0.67	0.23
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.18	0.03	0.05	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.00	0.04	0.01	0.72	0.88	0.78	0.70
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.29	0.00	0.47	0.02	0.44	0.63	0.30	0.11	0.52	0.63	0.35	0.01	0.00	0.01	0.39	0.49	0.14	0.29
C4	0.01	0.00	0.02	0.29	0.00	0.14	0.01	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.34	0.05	0.03	0.17	0.17	0.84	0.16
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.22	0.28	0.16	0.05	0.27	0.30	0.16	0.31	0.04	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.47	0.01	0.23	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.40	0.28	0.02	0.27	0.46	0.97	0.29
C5'	0.04	0.29	0.18	0.02	0.26	0.00	0.35	0.00	0.40	0.24	0.37	0.22	0.45	0.34	0.17	0.12	0.21	0.01	0.00	0.03	0.11	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.44	0.01	0.22	0.00	0.40	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.45	0.20	0.03	0.14	0.24	0.89	0.13
C8	0.01	0.00	0.05	0.63	0.00	0.28	0.00	0.24	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.27	0.61	0.03	0.65	1.05	1.14	0.74
N1	0.02	0.00	0.04	0.30	0.00	0.16	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.44	0.09	0.04	0.08	0.18	0.75	0.15
N3	0.02	0.00	0.04	0.11	0.00	0.05	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.32	0.39	0.05	0.08	0.28	0.68	0.14
N6	0.01	0.01	0.03	0.52	0.01	0.27	0.01	0.45	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.48	0.38	0.02	0.18	0.41	0.93	0.19
N7	0.01	0.00	0.04	0.63	0.01	0.30	0.00	0.34	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.36	0.62	0.02	0.52	0.98	1.15	0.63
N9	0.00	0.00	0.02	0.35	0.00	0.16	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.11	0.01	0.39	0.49	0.91	0.40
O2'	0.02	0.39	0.00	0.01	0.34	0.31	0.40	0.12	0.45	0.27	0.44	0.32	0.48	0.36	0.24	0.00	0.10	0.27	0.33	0.56	0.47	0.39
O3'	0.29	0.33	0.04	0.00	0.05	0.04	0.28	0.21	0.20	0.61	0.09	0.39	0.38	0.62	0.11	0.10	0.00	0.24	0.08	0.16	0.34	0.05
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.27	0.24	0.00	0.04	0.18	0.48	0.05
O5'	0.34	0.13	0.72	0.39	0.17	0.01	0.27	0.00	0.14	0.65	0.08	0.08	0.18	0.52	0.39	0.33	0.08	0.04	0.00	0.03	0.03	0.00
OP1	0.30	0.37	0.88	0.49	0.17	0.06	0.46	0.03	0.24	1.05	0.18	0.28	0.41	0.98	0.49	0.56	0.16	0.18	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.72	0.67	0.78	0.14	0.84	0.09	0.97	0.11	0.89	1.14	0.75	0.68	0.93	1.15	0.91	0.47	0.34	0.48	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.33	0.23	0.70	0.29	0.16	0.02	0.29	0.01	0.13	0.74	0.15	0.14	0.19	0.63	0.40	0.39	0.05	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.07	0.47	0.45	0.22	0.08	0.21	0.09	0.15	0.09	0.14	0.05	0.14	0.08	0.29	0.31	0.17	0.24	0.52	0.31
C2	0.07	0.07	0.69	0.39	0.16	0.15	0.13	0.19	0.08	0.06	0.13	0.06	0.57	0.14	0.22	0.37	0.07	0.07	0.33	0.14
C2'	0.05	0.07	0.39	0.42	0.24	0.09	0.25	0.12	0.18	0.10	0.14	0.07	0.08	0.07	0.31	0.31	0.14	0.23	0.49	0.29
C3'	0.73	0.73	0.34	0.23	0.99	0.70	1.01	0.73	0.93	0.80	0.83	0.58	0.73	0.57	1.07	0.95	0.54	0.45	0.23	0.39
C4	0.04	0.06	0.54	0.43	0.19	0.10	0.17	0.12	0.12	0.07	0.14	0.05	0.28	0.07	0.25	0.33	0.12	0.16	0.44	0.24
C4'	0.45	0.44	0.05	0.13	0.61	0.35	0.64	0.33	0.58	0.49	0.50	0.33	0.48	0.24	0.67	0.63	0.12	0.09	0.25	0.07
C5	0.04	0.07	0.51	0.42	0.19	0.10	0.17	0.12	0.12	0.07	0.14	0.05	0.23	0.08	0.24	0.33	0.12	0.15	0.42	0.24
C5'	0.67	0.61	0.30	0.10	0.68	0.48	0.73	0.40	0.72	0.67	0.62	0.54	0.88	0.41	0.68	0.77	0.19	0.13	0.25	0.08
C6	0.04	0.06	0.59	0.39	0.16	0.13	0.13	0.16	0.09	0.05	0.13	0.05	0.40	0.11	0.20	0.35	0.07	0.08	0.34	0.16
C8	0.09	0.09	0.37	0.45	0.23	0.09	0.23	0.08	0.18	0.12	0.15	0.07	0.08	0.11	0.29	0.30	0.19	0.27	0.52	0.34
N1	0.07	0.08	0.69	0.37	0.15	0.16	0.12	0.20	0.08	0.07	0.13	0.07	0.59	0.16	0.20	0.37	0.06	0.07	0.29	0.12
N3	0.04	0.06	0.63	0.41	0.18	0.12	0.15	0.16	0.10	0.06	0.13	0.05	0.43	0.09	0.24	0.35	0.09	0.11	0.39	0.19
N6	0.04	0.06	0.57	0.37	0.15	0.13	0.12	0.17	0.08	0.05	0.13	0.05	0.38	0.13	0.17	0.35	0.06	0.07	0.30	0.14
N7	0.08	0.09	0.38	0.44	0.22	0.09	0.21	0.09	0.16	0.11	0.15	0.07	0.08	0.11	0.27	0.30	0.17	0.23	0.49	0.31
N9	0.06	0.07	0.46	0.44	0.22	0.09	0.21	0.10	0.15	0.09	0.14	0.05	0.14	0.08	0.28	0.32	0.16	0.23	0.50	0.30
O2'	0.50	0.46	0.86	0.84	0.23	0.39	0.23	0.34	0.32	0.42	0.35	0.57	0.56	0.41	0.14	0.22	0.56	0.63	0.87	0.71
O3'	0.76	0.78	0.39	0.29	1.26	0.77	1.31	0.87	1.15	0.90	0.96	0.51	0.72	0.57	1.43	1.01	0.76	0.71	0.59	0.68
O4'	0.10	0.10	0.41	0.46	0.23	0.06	0.24	0.04	0.19	0.13	0.16	0.04	0.06	0.10	0.29	0.31	0.24	0.32	0.60	0.39
O5'	0.05	0.17	0.33	0.57	0.33	0.25	0.27	0.40	0.19	0.14	0.27	0.14	0.37	0.15	0.42	0.04	0.67	0.80	1.17	0.92
OP1	0.45	0.68	0.59	0.92	1.23	0.75	1.17	1.08	0.92	0.69	0.95	0.46	0.32	0.39	1.50	0.58	1.44	1.63	2.18	1.82
OP2	0.65	0.83	0.89	1.27	0.93	0.99	0.82	1.17	0.75	0.75	0.93	0.82	0.09	0.92	1.01	0.72	1.38	1.48	1.78	1.58
P	0.06	0.23	0.26	0.59	0.54	0.34	0.47	0.57	0.31	0.19	0.40	0.14	0.57	0.17	0.72	0.11	0.87	1.02	1.44	1.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.35	0.01	0.01	0.13	0.23	0.13	0.09
C2	0.01	0.00	0.29	0.32	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.01	0.19	0.10	0.09	0.27	0.20
C2'	0.00	0.29	0.00	0.00	0.08	0.01	0.11	0.21	0.18	0.05	0.24	0.45	0.00	0.02	0.09	0.02	0.47	0.71	0.64	0.56
C3'	0.00	0.32	0.00	0.00	0.51	0.01	0.50	0.01	0.42	0.30	0.44	0.20	0.01	0.01	0.55	0.03	0.03	0.34	0.07	0.12
C4	0.01	0.00	0.08	0.51	0.00	0.23	0.00	0.27	0.01	0.01	0.00	0.01	0.38	0.24	0.00	0.03	0.43	0.51	0.70	0.60
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.23	0.00	0.35	0.00	0.34	0.12	0.09	0.18	0.32	0.02	0.24	0.00	0.01	0.10	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.11	0.50	0.00	0.35	0.00	0.40	0.00	0.01	0.01	0.01	0.54	0.31	0.00	0.18	0.52	0.58	0.70	0.67
C5'	0.07	0.04	0.21	0.01	0.27	0.00	0.40	0.00	0.35	0.09	0.09	0.21	0.10	0.22	0.30	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.18	0.42	0.01	0.34	0.00	0.35	0.00	0.00	0.01	0.01	0.50	0.20	0.01	0.23	0.39	0.36	0.40	0.46
N1	0.00	0.00	0.05	0.30	0.01	0.12	0.01	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.05	0.01	0.01	0.13	0.09	0.19	0.19
N3	0.01	0.00	0.24	0.44	0.00	0.09	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.07	0.01	0.12	0.26	0.29	0.50	0.39
O2	0.01	0.00	0.45	0.20	0.01	0.18	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.30	0.31	0.01	0.35	0.07	0.12	0.15	0.06
O2'	0.02	0.03	0.00	0.01	0.38	0.32	0.54	0.10	0.50	0.22	0.16	0.30	0.00	0.06	0.41	0.22	0.34	0.63	0.72	0.49
O3'	0.35	0.11	0.02	0.01	0.24	0.02	0.31	0.22	0.20	0.05	0.07	0.31	0.06	0.00	0.29	0.23	0.24	0.09	0.25	0.19
O4	0.01	0.01	0.09	0.55	0.00	0.24	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.01	0.41	0.29	0.00	0.03	0.49	0.63	0.84	0.69
O4'	0.01	0.19	0.02	0.03	0.03	0.00	0.18	0.01	0.23	0.01	0.12	0.35	0.22	0.23	0.03	0.00	0.04	0.06	0.10	0.12
O5'	0.13	0.10	0.47	0.03	0.43	0.01	0.52	0.00	0.39	0.13	0.26	0.07	0.34	0.24	0.49	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.23	0.09	0.71	0.34	0.51	0.10	0.58	0.04	0.36	0.09	0.29	0.12	0.63	0.09	0.63	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.27	0.64	0.07	0.70	0.03	0.70	0.01	0.40	0.19	0.50	0.15	0.72	0.25	0.84	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.20	0.56	0.12	0.60	0.01	0.67	0.01	0.46	0.19	0.39	0.06	0.49	0.19	0.69	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00