Doublet Group distance statistics: 49859

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 2, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.013, 0.025, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.024 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.015, 0.034, 0.054, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.034 std_dev=0.019
N1	B	0, 0.120, 0.237, 0.353, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.237 std_dev=0.117
P	B	0, 0.116, 0.250, 0.384, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.250 std_dev=0.134
O5'	B	0, 0.095, 0.261, 0.426, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.261 std_dev=0.166
C1'	B	0, 0.099, 0.280, 0.462, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.280 std_dev=0.182
OP2	B	0, 0.129, 0.312, 0.496, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.312 std_dev=0.184
O4'	B	0, 0.087, 0.282, 0.476, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.282 std_dev=0.194
C6	B	0, 0.123, 0.327, 0.531, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.327 std_dev=0.204
C2	B	0, 0.106, 0.316, 0.526, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.316 std_dev=0.210
OP1	B	0, 0.121, 0.332, 0.544, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.332 std_dev=0.212
N3	B	0, 0.075, 0.336, 0.596, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.336 std_dev=0.260
C5'	B	0, 0.055, 0.343, 0.631, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.343 std_dev=0.288
C5	B	0, 0.142, 0.463, 0.785, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.463 std_dev=0.321
C4'	B	0, 0.043, 0.371, 0.699, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.371 std_dev=0.328
C4	B	0, 0.094, 0.426, 0.758, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.426 std_dev=0.332
C2'	B	0, 0.056, 0.410, 0.764, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.410 std_dev=0.354
O2	B	0, 0.092, 0.452, 0.812, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.452 std_dev=0.360
C3'	B	0, 0.019, 0.428, 0.837, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.428 std_dev=0.409
O2'	B	0, 0.038, 0.486, 0.934, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.486 std_dev=0.448
O4	B	0, 0.076, 0.566, 1.055, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.566 std_dev=0.490
O4'	A	0, -0.269, 0.353, 0.976, 1.844 max_d=1.844 avg_d=0.353 std_dev=0.623
O3'	B	0, -0.062, 0.607, 1.277, 2.060 max_d=2.060 avg_d=0.607 std_dev=0.669
C2'	A	0, -0.308, 0.365, 1.037, 1.983 max_d=1.983 avg_d=0.365 std_dev=0.672
C3'	A	0, -0.385, 0.424, 1.233, 2.391 max_d=2.391 avg_d=0.424 std_dev=0.809
C4'	A	0, -0.392, 0.443, 1.278, 2.469 max_d=2.469 avg_d=0.443 std_dev=0.835
O3'	A	0, -0.373, 0.468, 1.310, 2.509 max_d=2.509 avg_d=0.468 std_dev=0.841
O2'	A	0, -0.448, 0.552, 1.552, 2.944 max_d=2.944 avg_d=0.552 std_dev=1.000
C5'	A	0, -0.593, 0.716, 2.024, 3.849 max_d=3.849 avg_d=0.716 std_dev=1.309
O5'	A	0, -0.508, 0.845, 2.198, 3.949 max_d=3.949 avg_d=0.845 std_dev=1.353
P	A	0, -0.563, 1.173, 2.909, 4.782 max_d=4.782 avg_d=1.173 std_dev=1.736
OP1	A	0, -0.588, 1.434, 3.456, 4.774 max_d=4.774 avg_d=1.434 std_dev=2.022
OP2	A	0, -0.529, 1.610, 3.749, 5.249 max_d=5.249 avg_d=1.610 std_dev=2.139

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.01	0.20	0.70	0.32	0.29
C2	0.02	0.00	0.44	0.26	0.00	0.10	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.37	0.11	0.28	0.15	1.08	0.74	0.59
C2'	0.00	0.44	0.00	0.00	0.24	0.02	0.14	0.16	0.23	0.17	0.36	0.42	0.18	0.06	0.03	0.00	0.01	0.02	0.52	0.62	0.65	0.50
C3'	0.02	0.26	0.00	0.00	0.22	0.00	0.26	0.02	0.30	0.16	0.30	0.22	0.31	0.23	0.15	0.01	0.00	0.04	0.32	0.37	0.38	0.32
C4	0.01	0.00	0.24	0.22	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.16	0.13	1.08	0.52	0.50
C4'	0.01	0.10	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.07	0.10	0.02	0.08	0.03	0.27	0.02	0.00	0.02	0.22	0.16	0.10
C5	0.01	0.00	0.14	0.26	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.06	0.09	0.11	1.24	0.50	0.54
C5'	0.07	0.22	0.16	0.02	0.14	0.00	0.11	0.00	0.15	0.08	0.19	0.20	0.13	0.07	0.08	0.12	0.17	0.02	0.01	0.08	0.03	0.01
C6	0.01	0.00	0.23	0.30	0.00	0.02	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.09	0.15	0.10	1.29	0.63	0.60
C8	0.01	0.01	0.17	0.16	0.01	0.11	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.39	0.04	0.13	0.20	1.16	0.20	0.37
N1	0.02	0.00	0.36	0.30	0.00	0.07	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.09	0.23	0.12	1.21	0.73	0.62
N3	0.02	0.00	0.42	0.22	0.00	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.37	0.14	0.27	0.16	0.98	0.64	0.52
N6	0.01	0.00	0.18	0.31	0.01	0.02	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.12	0.09	1.37	0.61	0.62
N7	0.01	0.01	0.06	0.23	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.33	0.05	0.06	0.16	1.29	0.30	0.47
N9	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.11	0.02	0.16	1.00	0.34	0.39
O2'	0.02	0.37	0.00	0.01	0.09	0.27	0.12	0.12	0.07	0.39	0.22	0.37	0.11	0.33	0.14	0.00	0.01	0.14	0.48	0.45	0.76	0.45
O3'	0.26	0.11	0.01	0.00	0.09	0.02	0.06	0.17	0.09	0.04	0.09	0.14	0.11	0.05	0.11	0.01	0.00	0.16	0.29	0.25	0.30	0.26
O4'	0.01	0.28	0.02	0.04	0.16	0.00	0.09	0.02	0.15	0.13	0.23	0.27	0.12	0.06	0.02	0.14	0.16	0.00	0.09	0.71	0.47	0.40
O5'	0.20	0.15	0.52	0.32	0.13	0.02	0.11	0.01	0.10	0.20	0.12	0.16	0.09	0.16	0.16	0.48	0.29	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.70	1.08	0.62	0.37	1.08	0.22	1.24	0.08	1.29	1.16	1.21	0.98	1.37	1.29	1.00	0.45	0.25	0.71	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.74	0.65	0.38	0.52	0.16	0.50	0.03	0.63	0.20	0.73	0.64	0.61	0.30	0.34	0.76	0.30	0.47	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.29	0.59	0.50	0.32	0.50	0.10	0.54	0.01	0.60	0.37	0.62	0.52	0.62	0.47	0.39	0.45	0.26	0.40	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.14	0.21	0.22	0.08	0.12	0.07	0.10	0.06	0.10	0.12	0.20	0.18	0.29	0.09	0.09	0.12	0.13	0.21	0.11
C2	0.12	0.15	0.17	0.17	0.14	0.13	0.10	0.11	0.08	0.10	0.15	0.21	0.17	0.21	0.17	0.11	0.10	0.10	0.18	0.10
C2'	0.06	0.09	0.13	0.09	0.26	0.06	0.30	0.11	0.21	0.08	0.10	0.21	0.16	0.16	0.36	0.10	0.15	0.24	0.38	0.26
C3'	0.50	0.51	0.53	0.53	0.35	0.48	0.32	0.45	0.38	0.46	0.46	0.58	0.52	0.57	0.29	0.46	0.44	0.39	0.36	0.39
C4	0.12	0.14	0.20	0.21	0.12	0.13	0.09	0.11	0.07	0.10	0.13	0.20	0.19	0.26	0.16	0.10	0.11	0.11	0.19	0.11
C4'	0.37	0.37	0.39	0.43	0.35	0.39	0.33	0.41	0.35	0.37	0.37	0.38	0.34	0.47	0.33	0.36	0.43	0.44	0.46	0.44
C5	0.13	0.13	0.20	0.21	0.15	0.14	0.11	0.12	0.08	0.10	0.14	0.19	0.20	0.26	0.21	0.11	0.11	0.11	0.18	0.10
C5'	0.37	0.35	0.35	0.41	0.38	0.40	0.39	0.44	0.38	0.37	0.36	0.33	0.30	0.44	0.39	0.39	0.48	0.53	0.55	0.53
C6	0.13	0.13	0.18	0.18	0.18	0.14	0.13	0.12	0.09	0.10	0.18	0.18	0.19	0.22	0.23	0.11	0.10	0.10	0.17	0.09
C8	0.13	0.14	0.23	0.24	0.10	0.15	0.09	0.12	0.07	0.11	0.11	0.20	0.21	0.31	0.16	0.10	0.13	0.13	0.19	0.11
N1	0.12	0.15	0.16	0.16	0.17	0.14	0.12	0.12	0.09	0.11	0.17	0.20	0.17	0.20	0.21	0.12	0.10	0.10	0.17	0.10
N3	0.12	0.14	0.18	0.19	0.11	0.13	0.09	0.11	0.07	0.10	0.13	0.21	0.18	0.24	0.15	0.10	0.11	0.11	0.19	0.10
N6	0.13	0.14	0.17	0.16	0.22	0.15	0.17	0.13	0.12	0.11	0.21	0.15	0.19	0.21	0.26	0.12	0.10	0.10	0.16	0.09
N7	0.14	0.13	0.23	0.23	0.15	0.15	0.11	0.13	0.08	0.10	0.11	0.20	0.22	0.30	0.22	0.11	0.12	0.12	0.18	0.11
N9	0.12	0.14	0.21	0.22	0.09	0.13	0.08	0.11	0.06	0.10	0.12	0.20	0.19	0.29	0.13	0.09	0.12	0.13	0.20	0.11
O2'	0.49	0.43	0.33	0.38	0.68	0.55	0.77	0.63	0.71	0.55	0.50	0.28	0.32	0.28	0.72	0.63	0.64	0.72	0.81	0.75
O3'	0.39	0.39	0.40	0.42	0.31	0.39	0.29	0.39	0.32	0.37	0.37	0.43	0.36	0.44	0.29	0.38	0.40	0.38	0.36	0.38
O4'	0.29	0.30	0.34	0.40	0.31	0.33	0.30	0.36	0.30	0.30	0.31	0.29	0.28	0.45	0.31	0.28	0.40	0.43	0.45	0.42
O5'	0.55	0.51	0.45	0.50	0.61	0.57	0.65	0.61	0.62	0.56	0.53	0.44	0.42	0.48	0.64	0.61	0.60	0.56	0.54	0.61
OP1	1.28	1.33	1.41	1.41	1.11	1.26	1.03	1.23	1.11	1.24	1.28	1.42	1.41	1.51	1.02	1.18	1.23	1.24	1.19	1.18
OP2	0.59	0.52	0.51	0.54	0.72	0.64	0.86	0.73	0.76	0.60	0.51	0.55	0.52	0.57	0.82	0.71	0.75	0.75	0.80	0.85
P	0.62	0.62	0.67	0.70	0.55	0.64	0.58	0.67	0.58	0.60	0.58	0.69	0.67	0.78	0.55	0.62	0.68	0.69	0.66	0.70

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.06	0.04	0.16	0.08
C2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.01	0.01	0.14	0.16	0.27	0.17
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.04	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.11	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.13	0.06	0.09	0.15	0.01	0.00	0.09	0.01	0.04	0.04	0.07	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.00	0.02	0.12	0.17	0.26	0.17
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.03	0.06	0.04	0.04	0.05	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.15	0.00	0.02	0.12	0.15	0.21	0.15
C5'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.08	0.09	0.04	0.03	0.08	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.14	0.01	0.02	0.11	0.11	0.18	0.12
N1	0.00	0.00	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.11	0.21	0.13
N3	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.11	0.01	0.01	0.14	0.18	0.29	0.19
O2	0.01	0.01	0.13	0.15	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.17	0.01	0.02	0.16	0.18	0.29	0.19
O2'	0.02	0.05	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.04	0.02	0.05	0.06	0.06	0.11	0.06
O3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.12	0.04	0.15	0.03	0.14	0.06	0.11	0.17	0.04	0.00	0.13	0.03	0.04	0.08	0.09	0.05
O4	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.02	0.12	0.19	0.26	0.18
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.12	0.06
O5'	0.06	0.14	0.05	0.04	0.12	0.01	0.12	0.00	0.11	0.10	0.14	0.16	0.06	0.04	0.12	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.16	0.03	0.04	0.17	0.05	0.15	0.06	0.11	0.11	0.18	0.18	0.06	0.08	0.19	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.27	0.11	0.07	0.26	0.05	0.21	0.01	0.18	0.21	0.29	0.29	0.11	0.09	0.26	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.17	0.05	0.04	0.17	0.01	0.15	0.01	0.12	0.13	0.19	0.19	0.06	0.05	0.18	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00