Doublet Group distance statistics: 49862

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.001, 0.015, 0.030, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.006, 0.020, 0.035, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.007, 0.025, 0.042, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.025 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.001, 0.019, 0.037, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.018, 0.038, 0.058, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.038 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.006, 0.029, 0.052, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.029 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.006, 0.040, 0.074, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.040 std_dev=0.034
N7	A	0, 0.005, 0.047, 0.090, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.047 std_dev=0.043
C8	A	0, 0.008, 0.055, 0.102, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.055 std_dev=0.047
O2'	B	0, 0.120, 0.372, 0.624, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.372 std_dev=0.252
O3'	A	0, 0.231, 0.510, 0.789, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.510 std_dev=0.279
C5	B	0, 0.198, 0.481, 0.763, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.481 std_dev=0.283
C6	B	0, 0.078, 0.376, 0.673, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.376 std_dev=0.298
N1	B	0, 0.128, 0.431, 0.734, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.431 std_dev=0.303
C2	B	0, 0.249, 0.566, 0.882, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.566 std_dev=0.316
C4	B	0, 0.306, 0.629, 0.951, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.629 std_dev=0.323
N3	B	0, 0.318, 0.659, 1.000, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.659 std_dev=0.341
C1'	B	0, 0.146, 0.488, 0.830, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.488 std_dev=0.342
O2	B	0, 0.288, 0.633, 0.978, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.633 std_dev=0.345
C4'	A	0, 0.347, 0.703, 1.059, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.703 std_dev=0.356
C3'	A	0, 0.178, 0.562, 0.947, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.562 std_dev=0.385
O4	B	0, 0.382, 0.769, 1.156, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.769 std_dev=0.387
C5'	B	0, 0.032, 0.454, 0.876, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.454 std_dev=0.422
O4'	B	0, 0.071, 0.502, 0.932, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.502 std_dev=0.430
C2'	B	0, 0.312, 0.773, 1.235, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.773 std_dev=0.462
O4'	A	0, -0.030, 0.440, 0.909, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.440 std_dev=0.469
C2'	A	0, 0.032, 0.504, 0.976, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.504 std_dev=0.472
C4'	B	0, 0.326, 0.941, 1.557, 1.923 max_d=1.923 avg_d=0.941 std_dev=0.615
O5'	A	0, 0.587, 1.242, 1.898, 1.738 max_d=1.738 avg_d=1.242 std_dev=0.656
C5'	A	0, 0.716, 1.457, 2.197, 1.946 max_d=1.946 avg_d=1.457 std_dev=0.740
O5'	B	0, 0.528, 1.358, 2.189, 2.614 max_d=2.614 avg_d=1.358 std_dev=0.830
O2'	A	0, -0.060, 0.786, 1.633, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.786 std_dev=0.846
C3'	B	0, 0.828, 1.765, 2.701, 2.766 max_d=2.766 avg_d=1.765 std_dev=0.936
OP1	A	0, 0.973, 1.985, 2.998, 2.667 max_d=2.667 avg_d=1.985 std_dev=1.012
P	A	0, 1.235, 2.507, 3.780, 3.546 max_d=3.546 avg_d=2.507 std_dev=1.272
P	B	0, 1.132, 2.484, 3.836, 4.112 max_d=4.112 avg_d=2.484 std_dev=1.352
OP1	B	0, 1.250, 2.708, 4.165, 4.373 max_d=4.373 avg_d=2.708 std_dev=1.458
O3'	B	0, 1.463, 2.996, 4.530, 4.300 max_d=4.300 avg_d=2.996 std_dev=1.533
OP2	B	0, 1.548, 3.291, 5.033, 5.208 max_d=5.208 avg_d=3.291 std_dev=1.742
OP2	A	0, 1.894, 3.826, 5.758, 5.283 max_d=5.283 avg_d=3.826 std_dev=1.932

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.10	0.48	0.39	0.09
C2	0.01	0.00	0.25	0.10	0.00	0.12	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.46	0.04	0.22	0.16	0.41	0.56	0.20
C2'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.14	0.01	0.09	0.08	0.15	0.13	0.22	0.24	0.13	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.44	0.16	0.79	0.40
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.09	0.04	0.10	0.08	0.10	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.41	0.25	0.48	0.23
C4	0.01	0.00	0.14	0.06	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.03	0.11	0.18	0.38	0.57	0.19
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.17	0.07	0.12	0.07	0.15	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.65	0.14	0.22
C5	0.01	0.01	0.09	0.06	0.00	0.05	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04	0.25	0.28	0.67	0.23
C5'	0.05	0.12	0.08	0.01	0.13	0.01	0.21	0.00	0.20	0.33	0.14	0.11	0.25	0.32	0.16	0.07	0.05	0.02	0.01	0.17	0.19	0.02
C6	0.02	0.01	0.15	0.09	0.01	0.04	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.03	0.08	0.26	0.27	0.69	0.25
C8	0.01	0.01	0.13	0.04	0.01	0.17	0.00	0.33	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.27	0.08	0.16	0.29	0.26	0.65	0.21
N1	0.02	0.00	0.22	0.10	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.36	0.04	0.16	0.21	0.33	0.64	0.23
N3	0.01	0.00	0.24	0.08	0.01	0.12	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.43	0.03	0.22	0.14	0.44	0.51	0.17
N6	0.02	0.01	0.13	0.10	0.01	0.07	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.04	0.05	0.31	0.20	0.75	0.28
N7	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.15	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.06	0.09	0.32	0.19	0.72	0.24
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.16	0.38	0.53	0.17
O2'	0.01	0.46	0.00	0.00	0.19	0.01	0.07	0.07	0.19	0.27	0.36	0.43	0.14	0.17	0.03	0.00	0.02	0.01	0.50	0.19	0.97	0.49
O3'	0.06	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.08	0.04	0.03	0.04	0.06	0.05	0.02	0.00	0.07	0.30	0.54	0.37	0.06
O4'	0.00	0.22	0.02	0.00	0.11	0.00	0.04	0.02	0.08	0.16	0.16	0.22	0.05	0.09	0.01	0.01	0.07	0.00	0.17	0.75	0.05	0.33
O5'	0.10	0.16	0.44	0.41	0.18	0.01	0.25	0.01	0.26	0.29	0.21	0.14	0.31	0.32	0.16	0.50	0.30	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.48	0.41	0.16	0.25	0.38	0.65	0.28	0.17	0.27	0.26	0.33	0.44	0.20	0.19	0.38	0.19	0.54	0.75	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.39	0.56	0.79	0.48	0.57	0.14	0.67	0.19	0.69	0.65	0.64	0.51	0.75	0.72	0.53	0.97	0.37	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.20	0.40	0.23	0.19	0.22	0.23	0.02	0.25	0.21	0.23	0.17	0.28	0.24	0.17	0.49	0.06	0.33	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.07	0.17	0.17	0.08	0.09	0.07	0.04	0.03	0.05	0.05	0.12	0.15	0.12	0.13	0.06	0.12	0.14	0.31	0.17
C2	0.12	0.05	0.23	0.21	0.10	0.17	0.07	0.13	0.04	0.06	0.06	0.09	0.21	0.22	0.15	0.11	0.16	0.12	0.26	0.13
C2'	0.12	0.12	0.18	0.18	0.14	0.12	0.14	0.11	0.13	0.12	0.13	0.13	0.09	0.15	0.16	0.09	0.16	0.14	0.27	0.16
C3'	0.11	0.13	0.14	0.15	0.10	0.11	0.09	0.11	0.09	0.10	0.13	0.15	0.02	0.05	0.10	0.12	0.17	0.21	0.34	0.24
C4	0.12	0.05	0.21	0.19	0.09	0.14	0.07	0.09	0.03	0.05	0.03	0.11	0.19	0.17	0.15	0.09	0.14	0.11	0.28	0.14
C4'	0.28	0.28	0.23	0.29	0.36	0.30	0.38	0.35	0.36	0.30	0.30	0.25	0.12	0.14	0.37	0.34	0.42	0.50	0.63	0.53
C5	0.13	0.06	0.21	0.20	0.10	0.15	0.08	0.11	0.04	0.06	0.05	0.12	0.19	0.17	0.16	0.11	0.15	0.12	0.28	0.15
C5'	0.61	0.57	0.52	0.59	0.60	0.64	0.65	0.69	0.66	0.61	0.56	0.53	0.44	0.44	0.57	0.69	0.74	0.82	0.91	0.85
C6	0.13	0.05	0.23	0.22	0.11	0.17	0.08	0.14	0.04	0.06	0.08	0.10	0.21	0.21	0.16	0.12	0.17	0.14	0.27	0.15
C8	0.12	0.08	0.18	0.18	0.09	0.11	0.07	0.06	0.02	0.06	0.04	0.14	0.16	0.11	0.16	0.08	0.13	0.14	0.31	0.17
N1	0.12	0.05	0.23	0.22	0.11	0.18	0.08	0.14	0.04	0.05	0.08	0.08	0.21	0.23	0.16	0.11	0.17	0.14	0.26	0.14
N3	0.13	0.05	0.22	0.20	0.09	0.15	0.07	0.11	0.03	0.06	0.03	0.10	0.21	0.20	0.14	0.10	0.15	0.11	0.27	0.13
N6	0.13	0.06	0.23	0.23	0.13	0.19	0.09	0.16	0.05	0.06	0.11	0.10	0.21	0.23	0.17	0.13	0.19	0.16	0.28	0.17
N7	0.14	0.08	0.20	0.20	0.10	0.14	0.08	0.09	0.03	0.07	0.02	0.15	0.18	0.14	0.17	0.11	0.15	0.13	0.30	0.16
N9	0.11	0.06	0.18	0.18	0.09	0.10	0.08	0.05	0.02	0.05	0.03	0.12	0.16	0.13	0.14	0.07	0.12	0.13	0.30	0.16
O2'	0.35	0.30	0.34	0.35	0.37	0.36	0.41	0.38	0.40	0.35	0.31	0.22	0.28	0.33	0.37	0.36	0.40	0.37	0.41	0.38
O3'	0.14	0.13	0.20	0.18	0.09	0.11	0.07	0.09	0.07	0.11	0.12	0.15	0.16	0.13	0.11	0.09	0.15	0.16	0.32	0.19
O4'	0.12	0.14	0.12	0.17	0.29	0.14	0.31	0.19	0.25	0.16	0.20	0.12	0.06	0.03	0.35	0.17	0.27	0.34	0.49	0.37
O5'	0.44	0.46	0.44	0.52	0.52	0.47	0.52	0.49	0.49	0.46	0.49	0.44	0.34	0.40	0.55	0.46	0.58	0.67	0.77	0.67
OP1	0.20	0.19	0.23	0.30	0.22	0.24	0.26	0.28	0.25	0.21	0.21	0.19	0.19	0.27	0.25	0.23	0.28	0.28	0.32	0.29
OP2	0.88	0.93	0.93	0.95	0.92	0.82	0.83	0.77	0.82	0.89	0.96	0.93	0.87	0.84	0.95	0.79	0.80	0.81	0.88	0.81
P	0.30	0.36	0.38	0.43	0.35	0.27	0.26	0.23	0.25	0.31	0.39	0.38	0.29	0.32	0.40	0.22	0.29	0.36	0.46	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.13	0.04	0.01	0.05	0.06	0.09	0.04
C2	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.08	0.01	0.02	0.13	0.09	0.26	0.13
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.11	0.02	0.02	0.07	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.08	0.08	0.03
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.18	0.01	0.19	0.01	0.16	0.11	0.14	0.10	0.01	0.01	0.19	0.01	0.15	0.03	0.15	0.04
C4	0.03	0.01	0.05	0.18	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.12	0.10	0.00	0.03	0.18	0.23	0.42	0.27
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.07	0.06	0.13	0.01	0.07	0.01	0.01	0.12	0.06	0.11
C5	0.02	0.01	0.02	0.19	0.00	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.02	0.17	0.24	0.42	0.28
C5'	0.04	0.04	0.11	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.06	0.02	0.10	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.16	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.02	0.15	0.17	0.31	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.03	0.03	0.02	0.12	0.08	0.23	0.12
N3	0.03	0.01	0.07	0.14	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.08	0.01	0.03	0.16	0.16	0.35	0.20
O2	0.03	0.00	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.15	0.01	0.03	0.11	0.05	0.21	0.09
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.12	0.13	0.08	0.02	0.06	0.07	0.14	0.15	0.00	0.04	0.14	0.09	0.11	0.01	0.12	0.04
O3'	0.13	0.08	0.01	0.01	0.10	0.01	0.11	0.10	0.08	0.03	0.08	0.15	0.04	0.00	0.12	0.10	0.19	0.07	0.16	0.07
O4	0.04	0.01	0.06	0.19	0.00	0.07	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.14	0.12	0.00	0.03	0.18	0.27	0.47	0.31
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.09	0.10	0.03	0.00	0.03	0.09	0.06	0.08
O5'	0.05	0.13	0.03	0.15	0.18	0.01	0.17	0.01	0.15	0.12	0.16	0.11	0.11	0.19	0.18	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.06	0.09	0.08	0.03	0.23	0.12	0.24	0.03	0.17	0.08	0.16	0.05	0.01	0.07	0.27	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.26	0.08	0.15	0.42	0.06	0.42	0.00	0.31	0.23	0.35	0.21	0.12	0.16	0.47	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.13	0.03	0.04	0.27	0.11	0.28	0.01	0.21	0.12	0.20	0.09	0.04	0.07	0.31	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00