Doublet Group distance statistics: 49863

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.012, 0.029, 0.045, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.032 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.009, 0.029, 0.050, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.012, 0.039, 0.066, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.039 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.016, 0.043, 0.070, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.043 std_dev=0.027
N6	A	0, 0.010, 0.040, 0.070, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.040 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.030, 0.113, 0.196, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.113 std_dev=0.083
C2'	A	0, 0.040, 0.126, 0.211, 0.235 max_d=0.235 avg_d=0.126 std_dev=0.086
N3	B	0, 0.132, 0.374, 0.616, 0.671 max_d=0.671 avg_d=0.374 std_dev=0.242
C2	B	0, 0.167, 0.455, 0.743, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.455 std_dev=0.288
C4'	A	0, 0.198, 0.499, 0.800, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.499 std_dev=0.301
N1	B	0, 0.203, 0.522, 0.842, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.522 std_dev=0.319
C4	B	0, 0.210, 0.533, 0.855, 0.832 max_d=0.832 avg_d=0.533 std_dev=0.323
C1'	B	0, 0.250, 0.629, 1.008, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.629 std_dev=0.379
O4	B	0, 0.249, 0.630, 1.010, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.630 std_dev=0.380
C6	B	0, 0.251, 0.653, 1.056, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.653 std_dev=0.402
O2	B	0, 0.208, 0.617, 1.026, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.617 std_dev=0.409
C5	B	0, 0.243, 0.698, 1.153, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.698 std_dev=0.455
C3'	A	0, 0.173, 0.655, 1.137, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.655 std_dev=0.482
O2'	A	0, 0.133, 0.669, 1.206, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.669 std_dev=0.537
C5'	A	0, 0.388, 0.954, 1.520, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.954 std_dev=0.566
O4'	B	0, 0.221, 0.811, 1.401, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.811 std_dev=0.590
C2'	B	0, 0.313, 0.948, 1.583, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.948 std_dev=0.635
O2'	B	0, 0.326, 1.037, 1.748, 1.895 max_d=1.895 avg_d=1.037 std_dev=0.711
O5'	A	0, 0.196, 0.928, 1.660, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.928 std_dev=0.732
C4'	B	0, 0.324, 1.101, 1.878, 2.147 max_d=2.147 avg_d=1.101 std_dev=0.777
P	A	0, 0.397, 1.191, 1.985, 2.225 max_d=2.225 avg_d=1.191 std_dev=0.794
C3'	B	0, 0.358, 1.187, 2.017, 2.100 max_d=2.100 avg_d=1.187 std_dev=0.830
O5'	B	0, 0.221, 1.055, 1.889, 2.205 max_d=2.205 avg_d=1.055 std_dev=0.834
O3'	A	0, 0.113, 1.040, 1.968, 2.137 max_d=2.137 avg_d=1.040 std_dev=0.927
O3'	B	0, 0.390, 1.442, 2.494, 2.631 max_d=2.631 avg_d=1.442 std_dev=1.052
C5'	B	0, 0.368, 1.430, 2.492, 2.924 max_d=2.924 avg_d=1.430 std_dev=1.062
P	B	0, 0.366, 1.548, 2.730, 3.288 max_d=3.288 avg_d=1.548 std_dev=1.182
OP2	B	0, 0.603, 1.916, 3.229, 3.645 max_d=3.645 avg_d=1.916 std_dev=1.313
OP1	A	0, 0.710, 2.092, 3.474, 3.759 max_d=3.759 avg_d=2.092 std_dev=1.382
OP1	B	0, 0.432, 1.831, 3.229, 3.930 max_d=3.930 avg_d=1.831 std_dev=1.399
OP2	A	0, 0.886, 2.745, 4.603, 4.836 max_d=4.836 avg_d=2.745 std_dev=1.858

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.27	0.00	0.20	0.35	0.27	0.16
C2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.46	0.01	0.16	0.51	0.33	0.26
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.13	0.03	0.07	0.02	0.04	0.04	0.06	0.03	0.01	0.05	0.02	0.38	0.66	0.33	0.28
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.06	0.00	0.12	0.03	0.10	0.21	0.04	0.04	0.14	0.20	0.10	0.03	0.01	0.02	0.36	0.97	0.37	0.47
C4	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.29	0.01	0.22	0.35	0.43	0.19
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.03	0.01	0.09	0.10	0.06	0.15	0.03	0.01	0.01	0.39	0.15	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.07	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.18	0.02	0.29	0.37	0.59	0.21
C5'	0.06	0.13	0.13	0.03	0.16	0.01	0.21	0.00	0.21	0.22	0.17	0.11	0.24	0.24	0.15	0.07	0.16	0.04	0.01	0.33	0.34	0.02
C6	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.07	0.01	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.25	0.02	0.26	0.47	0.57	0.23
C8	0.00	0.01	0.07	0.21	0.00	0.10	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.08	0.03	0.42	0.34	0.69	0.26
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.38	0.01	0.20	0.54	0.45	0.26
N3	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.46	0.01	0.14	0.42	0.29	0.22
N6	0.02	0.00	0.04	0.14	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.19	0.04	0.31	0.50	0.67	0.24
N7	0.00	0.01	0.06	0.20	0.00	0.10	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.06	0.03	0.40	0.31	0.75	0.24
N9	0.00	0.01	0.03	0.10	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.17	0.01	0.28	0.31	0.46	0.18
O2'	0.04	0.06	0.01	0.03	0.12	0.15	0.21	0.07	0.20	0.26	0.13	0.05	0.25	0.28	0.14	0.00	0.11	0.13	0.36	0.76	0.27	0.28
O3'	0.27	0.46	0.05	0.01	0.29	0.03	0.18	0.16	0.25	0.08	0.38	0.46	0.19	0.06	0.17	0.11	0.00	0.19	0.32	1.30	0.59	0.69
O4'	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.13	0.19	0.00	0.12	0.26	0.11	0.18
O5'	0.20	0.16	0.38	0.36	0.22	0.01	0.29	0.01	0.26	0.42	0.20	0.14	0.31	0.40	0.28	0.36	0.32	0.12	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.35	0.51	0.66	0.97	0.35	0.39	0.37	0.33	0.47	0.34	0.54	0.42	0.50	0.31	0.31	0.76	1.30	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.27	0.33	0.33	0.37	0.43	0.15	0.59	0.34	0.57	0.69	0.45	0.29	0.67	0.75	0.46	0.27	0.59	0.11	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.26	0.28	0.47	0.19	0.07	0.21	0.02	0.23	0.26	0.26	0.22	0.24	0.24	0.18	0.28	0.69	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.03	0.13	0.12	0.12	0.05	0.13	0.11	0.09	0.05	0.06	0.03	0.14	0.20	0.15	0.10	0.09	0.09	0.09	0.10
C2	0.07	0.12	0.22	0.21	0.09	0.08	0.08	0.07	0.04	0.05	0.13	0.19	0.25	0.30	0.12	0.12	0.07	0.08	0.13	0.12
C2'	0.09	0.08	0.12	0.14	0.17	0.15	0.20	0.23	0.17	0.11	0.11	0.06	0.10	0.18	0.21	0.16	0.23	0.23	0.23	0.22
C3'	0.20	0.19	0.29	0.30	0.22	0.18	0.23	0.12	0.21	0.20	0.20	0.18	0.29	0.37	0.24	0.15	0.16	0.19	0.20	0.19
C4	0.03	0.06	0.15	0.15	0.11	0.03	0.09	0.06	0.06	0.03	0.10	0.09	0.17	0.23	0.14	0.09	0.04	0.06	0.10	0.09
C4'	0.08	0.10	0.20	0.23	0.08	0.10	0.09	0.08	0.07	0.08	0.08	0.13	0.20	0.31	0.11	0.06	0.09	0.16	0.15	0.12
C5	0.02	0.05	0.16	0.16	0.10	0.03	0.08	0.03	0.05	0.02	0.10	0.07	0.17	0.23	0.13	0.07	0.02	0.07	0.11	0.09
C5'	0.21	0.22	0.27	0.30	0.20	0.22	0.22	0.22	0.21	0.21	0.20	0.26	0.26	0.38	0.22	0.22	0.21	0.29	0.29	0.27
C6	0.04	0.10	0.21	0.21	0.09	0.06	0.05	0.03	0.03	0.04	0.13	0.15	0.22	0.29	0.12	0.07	0.05	0.08	0.14	0.11
C8	0.04	0.04	0.13	0.13	0.12	0.06	0.12	0.08	0.09	0.05	0.06	0.05	0.13	0.20	0.16	0.07	0.06	0.07	0.06	0.05
N1	0.07	0.13	0.24	0.23	0.09	0.09	0.05	0.07	0.02	0.05	0.14	0.21	0.27	0.33	0.11	0.10	0.07	0.09	0.15	0.13
N3	0.05	0.09	0.18	0.17	0.10	0.05	0.09	0.07	0.06	0.04	0.11	0.14	0.21	0.26	0.13	0.11	0.06	0.07	0.12	0.11
N6	0.04	0.11	0.24	0.24	0.09	0.08	0.03	0.05	0.01	0.05	0.13	0.17	0.24	0.33	0.11	0.05	0.08	0.11	0.17	0.13
N7	0.03	0.02	0.13	0.14	0.11	0.04	0.10	0.04	0.06	0.03	0.06	0.05	0.13	0.20	0.15	0.05	0.02	0.07	0.09	0.06
N9	0.03	0.03	0.13	0.13	0.11	0.03	0.11	0.08	0.08	0.04	0.07	0.03	0.14	0.20	0.15	0.08	0.06	0.07	0.08	0.08
O2'	0.43	0.41	0.34	0.42	0.55	0.53	0.60	0.65	0.56	0.47	0.44	0.34	0.27	0.37	0.58	0.55	0.64	0.64	0.63	0.63
O3'	0.10	0.09	0.17	0.21	0.21	0.11	0.25	0.09	0.20	0.12	0.12	0.10	0.12	0.27	0.27	0.11	0.16	0.23	0.30	0.26
O4'	0.05	0.05	0.16	0.17	0.15	0.07	0.15	0.07	0.11	0.06	0.08	0.06	0.16	0.26	0.19	0.07	0.06	0.07	0.03	0.04
O5'	0.56	0.56	0.63	0.71	0.66	0.65	0.66	0.67	0.63	0.58	0.59	0.52	0.58	0.77	0.69	0.58	0.71	0.75	0.73	0.71
OP1	0.27	0.27	0.21	0.35	0.55	0.37	0.60	0.49	0.49	0.34	0.35	0.18	0.15	0.39	0.67	0.39	0.57	0.73	0.82	0.72
OP2	1.16	1.13	1.20	1.28	1.22	1.27	1.27	1.30	1.23	1.17	1.14	1.09	1.16	1.32	1.24	1.21	1.34	1.34	1.31	1.32
P	0.39	0.38	0.41	0.50	0.55	0.48	0.60	0.54	0.52	0.42	0.43	0.35	0.38	0.54	0.63	0.45	0.60	0.66	0.67	0.64

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.08	0.07	0.05
C2	0.02	0.00	0.13	0.13	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.15	0.01	0.06	0.07	0.13	0.10	0.05
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.11	0.21	0.00	0.02	0.05	0.00	0.07	0.20	0.11	0.08
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.12	0.19	0.02	0.01	0.06	0.02	0.10	0.25	0.16	0.14
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.10	0.13	0.13	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.06	0.00	0.02	0.11	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.07	0.11	0.14	0.19	0.15
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.10	0.01	0.10	0.00	0.07	0.04	0.08	0.03	0.02	0.02	0.11	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.10	0.01	0.08	0.10	0.12	0.18	0.14
N1	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.07	0.09	0.06
N3	0.01	0.00	0.11	0.12	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.16	0.01	0.05	0.09	0.14	0.12	0.08
O2	0.03	0.00	0.21	0.19	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.23	0.01	0.10	0.06	0.17	0.11	0.04
O2'	0.03	0.10	0.00	0.02	0.05	0.03	0.05	0.02	0.08	0.03	0.09	0.18	0.00	0.04	0.05	0.04	0.06	0.22	0.11	0.08
O3'	0.03	0.15	0.02	0.01	0.08	0.03	0.06	0.02	0.10	0.03	0.16	0.23	0.04	0.00	0.09	0.03	0.11	0.37	0.26	0.22
O4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.12	0.15	0.14	0.13
O4'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.04	0.00	0.07	0.01	0.08	0.01	0.05	0.10	0.04	0.03	0.05	0.00	0.08	0.08	0.12	0.11
O5'	0.03	0.07	0.07	0.10	0.10	0.02	0.11	0.01	0.10	0.04	0.09	0.06	0.06	0.11	0.12	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.13	0.20	0.25	0.13	0.11	0.14	0.05	0.12	0.07	0.14	0.17	0.22	0.37	0.15	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00
OP2	0.07	0.10	0.11	0.16	0.13	0.06	0.19	0.04	0.18	0.09	0.12	0.11	0.11	0.26	0.14	0.12	0.02	0.04	0.00	0.00
P	0.05	0.05	0.08	0.14	0.12	0.03	0.15	0.02	0.14	0.06	0.08	0.04	0.08	0.22	0.13	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00