Doublet Group distance statistics: 49888

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N3	A	0, 0.000, 0.033, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.033 std_dev=0.033
N1	A	0, 0.000, 0.037, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.000, 0.044, 0.087, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.044 std_dev=0.044
C2	A	0, 0.000, 0.046, 0.092, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.046 std_dev=0.046
C1'	A	0, 0.000, 0.053, 0.106, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.053 std_dev=0.053
C4'	A	0, 0.000, 0.070, 0.141, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.070 std_dev=0.070
N2	A	0, 0.000, 0.071, 0.141, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.071 std_dev=0.071
C5'	A	0, 0.000, 0.094, 0.188, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.094 std_dev=0.094
O5'	A	0, 0.000, 0.116, 0.231, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.116 std_dev=0.116
C3'	A	0, 0.000, 0.118, 0.236, 0.236 max_d=0.236 avg_d=0.118 std_dev=0.118
C2'	A	0, 0.000, 0.121, 0.242, 0.242 max_d=0.242 avg_d=0.121 std_dev=0.121
O3'	A	0, 0.000, 0.130, 0.259, 0.259 max_d=0.259 avg_d=0.130 std_dev=0.130
P	A	0, 0.000, 0.208, 0.415, 0.415 max_d=0.415 avg_d=0.208 std_dev=0.208
O2'	A	0, 0.000, 0.213, 0.425, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.213 std_dev=0.213
OP2	A	0, 0.000, 0.228, 0.456, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.228 std_dev=0.228
OP1	A	0, 0.000, 0.231, 0.461, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.231 std_dev=0.231
C3'	B	0, 0.000, 0.283, 0.565, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.283 std_dev=0.283
O3'	B	0, 0.000, 0.287, 0.573, 0.573 max_d=0.573 avg_d=0.287 std_dev=0.287
C5'	B	0, 0.000, 0.288, 0.576, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.288 std_dev=0.288
C4'	B	0, 0.000, 0.289, 0.578, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.289 std_dev=0.289
C2'	B	0, 0.000, 0.322, 0.645, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.322 std_dev=0.322
O5'	B	0, 0.000, 0.327, 0.654, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.327 std_dev=0.327
O2'	B	0, 0.000, 0.331, 0.663, 0.663 max_d=0.663 avg_d=0.331 std_dev=0.331
O4'	B	0, 0.000, 0.355, 0.711, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.355 std_dev=0.355
C1'	B	0, 0.000, 0.375, 0.749, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.375 std_dev=0.375
OP1	B	0, 0.000, 0.378, 0.755, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.378 std_dev=0.378
P	B	0, 0.000, 0.392, 0.783, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.392 std_dev=0.392
N1	B	0, 0.000, 0.423, 0.845, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.423 std_dev=0.423
C6	B	0, 0.000, 0.436, 0.873, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.436 std_dev=0.436
OP2	B	0, 0.000, 0.465, 0.930, 0.930 max_d=0.930 avg_d=0.465 std_dev=0.465
C5	B	0, 0.000, 0.496, 0.992, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.496 std_dev=0.496
C2	B	0, 0.000, 0.499, 0.997, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.499 std_dev=0.499
O2	B	0, 0.000, 0.501, 1.002, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.501 std_dev=0.501
N3	B	0, 0.000, 0.547, 1.095, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.547 std_dev=0.547
C4	B	0, 0.000, 0.562, 1.124, 1.124 max_d=1.124 avg_d=0.562 std_dev=0.562
O4	B	0, 0.000, 0.631, 1.261, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.631 std_dev=0.631

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.08	0.06	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01
C2	0.07	0.00	0.09	0.08	0.03	0.06	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.07	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.07	0.11	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01
C3'	0.00	0.08	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.06	0.10	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02
C4	0.03	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.02
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.09	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01
C5	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.05	0.04
C5'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.02	0.05	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01
C6	0.04	0.01	0.04	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.04	0.01	0.01	0.07	0.06	0.05
C8	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03
N1	0.06	0.01	0.07	0.06	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.05	0.05	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03
N2	0.08	0.01	0.11	0.10	0.03	0.09	0.02	0.05	0.02	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.05	0.16	0.10	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01
N3	0.06	0.01	0.08	0.07	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.12	0.06	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00
N7	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.07	0.06	0.06
N9	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01
O2'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.10	0.16	0.12	0.02	0.03	0.00	0.00	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.03
O3'	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.10	0.06	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.06	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.01	0.03
O5'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.03	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01
O6	0.04	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.09	0.07	0.06
OP1	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.06	0.01	0.07	0.03	0.05	0.02	0.02	0.07	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.09	0.00	0.00	0.00
OP2	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.06	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00
C2	0.05	0.03	0.05	0.05	0.02	0.05	0.05	0.08	0.05	0.05	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.05	0.06	0.05	0.02	0.03
C2'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00
C3'	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01
C4	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01
C4'	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02
C5	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.06	0.05
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.08	0.04	0.05
C6	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.05	0.00	0.00	0.02	0.07	0.05
C8	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.05	0.07	0.07
N1	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01
N2	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05	0.07	0.07	0.11	0.07	0.07	0.05	0.03	0.06	0.04	0.04	0.07	0.09	0.07	0.04	0.06
N3	0.05	0.04	0.06	0.05	0.03	0.05	0.05	0.08	0.05	0.05	0.03	0.02	0.05	0.03	0.02	0.05	0.07	0.05	0.03	0.04
N7	0.03	0.05	0.02	0.03	0.06	0.05	0.04	0.03	0.03	0.03	0.06	0.05	0.01	0.05	0.07	0.03	0.04	0.07	0.10	0.10
N9	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02
O2'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.06	0.03	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.07	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01
O3'	0.03	0.03	0.04	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04
O4'	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00
O5'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.03	0.02	0.11	0.07	0.08
O6	0.02	0.05	0.02	0.03	0.06	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.06	0.03	0.05	0.07	0.01	0.02	0.04	0.09	0.07
OP1	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.16	0.11	0.11
OP2	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.14	0.08	0.08
P	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.14	0.09	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01
C2	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.01	0.07	0.04	0.05
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.09	0.05	0.06
C4	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.06	0.03	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02
C4'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.01
C5	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01
C5'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02
C6	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.02	0.03
O2	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.03
O2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.02	0.10	0.08	0.07
O3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.12	0.07	0.07
O4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.03	0.00	0.01	0.04	0.06	0.01	0.03
O4'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.03
O5'	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.06	0.07	0.09	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.04	0.07	0.08	0.10	0.12	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.08	0.07	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.01	0.02	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.07	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00