Doublet Group distance statistics: 49902

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.018 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.019, 0.038, 0.057, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.038 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.030 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.016, 0.037, 0.057, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.037 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.021, 0.046, 0.071, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.046 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.026, 0.052, 0.078, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.052 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.003, 0.029, 0.056, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.029 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.003, 0.039, 0.075, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.039 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.007, 0.220, 0.432, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.220 std_dev=0.212
C4'	A	0, 0.170, 0.398, 0.626, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.398 std_dev=0.228
C3'	A	0, -0.031, 0.202, 0.434, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.202 std_dev=0.233
C5'	B	0, 0.213, 0.451, 0.689, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.451 std_dev=0.238
O4'	B	0, 0.231, 0.470, 0.709, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.470 std_dev=0.239
C4'	B	0, 0.208, 0.451, 0.694, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.451 std_dev=0.243
C6	B	0, 0.155, 0.399, 0.643, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.399 std_dev=0.244
C5	B	0, 0.168, 0.413, 0.658, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.413 std_dev=0.245
N1	B	0, 0.160, 0.407, 0.655, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.407 std_dev=0.247
P	B	0, 0.162, 0.414, 0.667, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.414 std_dev=0.252
C4	B	0, 0.213, 0.468, 0.723, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.468 std_dev=0.255
C3'	B	0, 0.203, 0.465, 0.727, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.465 std_dev=0.262
C2'	A	0, -0.079, 0.190, 0.460, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.190 std_dev=0.269
N4	B	0, 0.310, 0.589, 0.869, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.589 std_dev=0.280
C1'	B	0, 0.158, 0.443, 0.727, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.443 std_dev=0.284
O3'	B	0, 0.228, 0.513, 0.797, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.513 std_dev=0.285
OP1	B	0, 0.141, 0.477, 0.813, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.477 std_dev=0.336
P	A	0, 0.279, 0.619, 0.959, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.619 std_dev=0.340
C2'	B	0, 0.111, 0.458, 0.804, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.458 std_dev=0.347
C2	B	0, 0.101, 0.462, 0.823, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.462 std_dev=0.361
N3	B	0, 0.131, 0.498, 0.866, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.498 std_dev=0.367
OP2	A	0, 0.346, 0.717, 1.088, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.717 std_dev=0.371
O3'	A	0, 0.123, 0.495, 0.867, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.495 std_dev=0.372
C5'	A	0, 0.396, 0.771, 1.146, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.771 std_dev=0.375
O2	B	0, 0.132, 0.573, 1.013, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.573 std_dev=0.441
O2'	B	0, 0.093, 0.538, 0.982, 1.631 max_d=1.631 avg_d=0.538 std_dev=0.444
O2'	A	0, -0.071, 0.436, 0.943, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.436 std_dev=0.507
OP1	A	0, 0.334, 0.849, 1.364, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.849 std_dev=0.515
O5'	A	0, 0.175, 0.750, 1.324, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.750 std_dev=0.574
O5'	B	0, 0.178, 0.815, 1.453, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.815 std_dev=0.637
OP2	B	0, 0.108, 0.778, 1.448, 1.795 max_d=1.795 avg_d=0.778 std_dev=0.670

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.24	0.00	0.39	0.01	0.34	0.50	0.20
C2	0.02	0.00	0.17	0.06	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.22	0.10	0.55	0.00	0.26	0.38	0.16
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.02	0.04	0.17	0.07	0.09	0.13	0.21	0.18	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.42	0.04	0.51	0.41	0.23
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.07	0.07	0.07	0.06	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.02	0.18	0.08	0.43	0.46	0.13
C4	0.01	0.01	0.09	0.06	0.00	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.18	0.06	0.58	0.01	0.29	0.41	0.18
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.04	0.08	0.05	0.07	0.03	0.10	0.06	0.00	0.01	0.05	0.34	0.46	0.11
C5	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.14	0.03	0.66	0.01	0.28	0.35	0.21
C5'	0.08	0.12	0.17	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.19	0.23	0.15	0.11	0.10	0.24	0.15	0.08	0.09	0.02	0.00	0.21	0.42	0.37	0.02
C6	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.16	0.05	0.67	0.00	0.25	0.32	0.20
C8	0.01	0.01	0.09	0.07	0.00	0.08	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.10	0.06	0.67	0.01	0.33	0.40	0.24
N1	0.02	0.00	0.13	0.07	0.01	0.04	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.19	0.08	0.62	0.00	0.25	0.34	0.17
N2	0.03	0.00	0.21	0.06	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.25	0.13	0.50	0.01	0.25	0.39	0.14
N3	0.02	0.01	0.18	0.05	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.23	0.10	0.51	0.01	0.28	0.41	0.16
N7	0.00	0.00	0.06	0.07	0.00	0.07	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.10	0.04	0.70	0.01	0.30	0.34	0.25
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.17	0.02	0.57	0.01	0.33	0.44	0.19
O2'	0.03	0.20	0.00	0.02	0.08	0.10	0.08	0.08	0.07	0.18	0.12	0.28	0.21	0.17	0.07	0.00	0.03	0.06	0.33	0.09	0.48	0.47	0.26
O3'	0.24	0.22	0.01	0.01	0.18	0.06	0.14	0.09	0.16	0.10	0.19	0.25	0.23	0.10	0.17	0.03	0.00	0.22	0.10	0.14	0.35	0.43	0.09
O4'	0.00	0.10	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.13	0.10	0.04	0.02	0.06	0.22	0.00	0.31	0.04	0.31	0.57	0.23
O5'	0.39	0.55	0.42	0.18	0.58	0.01	0.66	0.00	0.67	0.67	0.62	0.50	0.51	0.70	0.57	0.33	0.10	0.31	0.00	0.69	0.02	0.03	0.01
O6	0.01	0.00	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.04	0.69	0.00	0.24	0.29	0.22
OP1	0.34	0.26	0.51	0.43	0.29	0.34	0.28	0.42	0.25	0.33	0.25	0.25	0.28	0.30	0.33	0.48	0.35	0.31	0.02	0.24	0.00	0.01	0.00
OP2	0.50	0.38	0.41	0.46	0.41	0.46	0.35	0.37	0.32	0.40	0.34	0.39	0.41	0.34	0.44	0.47	0.43	0.57	0.03	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.16	0.23	0.13	0.18	0.11	0.21	0.02	0.20	0.24	0.17	0.14	0.16	0.25	0.19	0.26	0.09	0.23	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.29	0.32	0.27	0.20	0.27	0.17	0.18	0.22	0.28	0.25	0.23	0.35	0.39	0.26	0.33	0.75	0.17	0.28	0.15
C2	0.26	0.32	0.25	0.20	0.21	0.15	0.20	0.10	0.23	0.26	0.30	0.21	0.41	0.29	0.19	0.18	0.66	0.12	0.28	0.06
C2'	0.47	0.36	0.48	0.44	0.21	0.45	0.19	0.40	0.29	0.37	0.29	0.18	0.43	0.58	0.44	0.47	0.88	0.33	0.38	0.38
C3'	0.28	0.22	0.26	0.23	0.14	0.25	0.11	0.21	0.16	0.21	0.18	0.16	0.27	0.35	0.22	0.28	0.65	0.27	0.15	0.17
C4	0.30	0.32	0.28	0.22	0.20	0.18	0.17	0.10	0.22	0.28	0.29	0.19	0.40	0.32	0.21	0.23	0.67	0.10	0.35	0.06
C4'	0.39	0.27	0.39	0.37	0.15	0.39	0.18	0.36	0.27	0.31	0.20	0.13	0.31	0.46	0.37	0.42	0.69	0.31	0.39	0.28
C5	0.26	0.33	0.26	0.19	0.18	0.13	0.15	0.10	0.20	0.26	0.29	0.16	0.41	0.28	0.18	0.17	0.58	0.09	0.43	0.06
C5'	0.57	0.40	0.58	0.57	0.23	0.61	0.25	0.59	0.39	0.45	0.30	0.15	0.44	0.67	0.57	0.62	0.75	0.45	0.61	0.48
C6	0.21	0.32	0.22	0.16	0.18	0.10	0.16	0.11	0.19	0.22	0.29	0.16	0.42	0.24	0.16	0.12	0.54	0.09	0.41	0.06
C8	0.33	0.30	0.30	0.24	0.16	0.21	0.11	0.11	0.19	0.28	0.25	0.15	0.37	0.34	0.22	0.28	0.63	0.09	0.51	0.09
N1	0.22	0.32	0.23	0.17	0.20	0.12	0.19	0.09	0.21	0.23	0.30	0.19	0.42	0.25	0.17	0.14	0.59	0.10	0.34	0.04
N2	0.26	0.32	0.25	0.20	0.22	0.16	0.22	0.10	0.24	0.25	0.30	0.23	0.41	0.29	0.19	0.19	0.68	0.13	0.23	0.08
N3	0.29	0.33	0.28	0.22	0.22	0.19	0.20	0.11	0.23	0.27	0.30	0.22	0.41	0.32	0.21	0.23	0.69	0.13	0.27	0.08
N7	0.29	0.32	0.27	0.20	0.16	0.14	0.11	0.11	0.18	0.27	0.27	0.13	0.39	0.29	0.19	0.18	0.53	0.11	0.51	0.09
N9	0.33	0.31	0.30	0.25	0.19	0.22	0.16	0.13	0.22	0.28	0.27	0.19	0.38	0.36	0.23	0.29	0.70	0.10	0.38	0.09
O2'	0.62	0.47	0.65	0.60	0.25	0.62	0.22	0.54	0.34	0.47	0.36	0.22	0.57	0.81	0.62	0.61	0.99	0.58	0.62	0.64
O3'	0.31	0.30	0.27	0.21	0.21	0.21	0.20	0.17	0.24	0.28	0.26	0.19	0.35	0.33	0.18	0.29	0.61	0.37	0.15	0.16
O4'	0.31	0.26	0.30	0.29	0.21	0.29	0.22	0.27	0.26	0.27	0.23	0.22	0.29	0.33	0.28	0.32	0.68	0.26	0.47	0.25
O5'	0.92	0.87	0.85	0.76	0.71	0.76	0.72	0.62	0.83	0.89	0.80	0.61	0.91	0.82	0.66	0.91	0.90	0.24	0.28	0.29
O6	0.16	0.30	0.18	0.13	0.17	0.09	0.15	0.14	0.16	0.18	0.28	0.14	0.41	0.19	0.14	0.09	0.46	0.11	0.45	0.09
OP1	0.41	0.24	0.43	0.45	0.19	0.49	0.20	0.51	0.27	0.30	0.18	0.25	0.27	0.42	0.45	0.47	0.77	0.72	0.30	0.53
OP2	0.32	0.33	0.39	0.40	0.27	0.26	0.28	0.17	0.32	0.33	0.30	0.23	0.33	0.33	0.39	0.26	0.37	0.28	0.90	0.35
P	0.48	0.41	0.50	0.49	0.30	0.45	0.32	0.38	0.41	0.44	0.34	0.23	0.43	0.46	0.46	0.48	0.65	0.36	0.47	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.17	0.36	0.41	0.10
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.12	0.01	0.20	0.35	0.45	0.04
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.06	0.04	0.07	0.03	0.06	0.03	0.07	0.07	0.12	0.00	0.02	0.02	0.08	0.41	0.39	0.13
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.03	0.07	0.03	0.09	0.05	0.15	0.02	0.01	0.02	0.17	0.47	0.35	0.06
C4	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.06	0.04	0.26	0.29	0.61	0.14
C4'	0.02	0.04	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.03	0.04	0.05	0.07	0.12	0.01	0.00	0.02	0.41	0.35	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.06	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.06	0.29	0.28	0.65	0.18
C5'	0.04	0.10	0.03	0.03	0.16	0.00	0.19	0.00	0.18	0.11	0.13	0.18	0.07	0.12	0.02	0.01	0.01	0.41	0.39	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.07	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.06	0.28	0.29	0.59	0.13
N1	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.22	0.33	0.47	0.05
N3	0.02	0.00	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.10	0.11	0.02	0.22	0.32	0.52	0.06
N4	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.05	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.07	0.04	0.27	0.29	0.66	0.18
O2	0.03	0.00	0.12	0.15	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.19	0.03	0.17	0.40	0.37	0.10
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.08	0.12	0.04	0.12	0.03	0.04	0.10	0.09	0.13	0.00	0.03	0.07	0.25	0.40	0.47	0.30
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.08	0.03	0.11	0.07	0.19	0.03	0.00	0.01	0.38	0.51	0.27	0.08
O4'	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.03	0.07	0.01	0.00	0.27	0.32	0.41	0.07
O5'	0.17	0.20	0.08	0.17	0.26	0.02	0.29	0.01	0.28	0.22	0.22	0.27	0.17	0.25	0.38	0.27	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.36	0.35	0.41	0.47	0.29	0.41	0.28	0.41	0.29	0.33	0.32	0.29	0.40	0.40	0.51	0.32	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.41	0.45	0.39	0.35	0.61	0.35	0.65	0.39	0.59	0.47	0.52	0.66	0.37	0.47	0.27	0.41	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.04	0.13	0.06	0.14	0.06	0.18	0.02	0.13	0.05	0.06	0.18	0.10	0.30	0.08	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00