Doublet Group distance statistics: 49913

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C5	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N3	A	0, 0.000, 0.033, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C4	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
N1	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N9	A	0, 0.000, 0.045, 0.090, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.045 std_dev=0.045
O6	A	0, 0.000, 0.047, 0.094, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.047 std_dev=0.047
N2	A	0, 0.000, 0.049, 0.098, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.049 std_dev=0.049
N7	A	0, 0.000, 0.059, 0.118, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.059 std_dev=0.059
C5'	B	0, 0.000, 0.059, 0.119, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.059 std_dev=0.059
C8	A	0, 0.000, 0.083, 0.167, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.083 std_dev=0.083
O5'	B	0, 0.000, 0.110, 0.219, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.110 std_dev=0.110
O4'	A	0, 0.000, 0.122, 0.245, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.122 std_dev=0.122
C2'	A	0, 0.000, 0.130, 0.261, 0.261 max_d=0.261 avg_d=0.130 std_dev=0.130
OP1	B	0, 0.000, 0.132, 0.264, 0.264 max_d=0.264 avg_d=0.132 std_dev=0.132
P	B	0, 0.000, 0.167, 0.335, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.167 std_dev=0.167
C4'	B	0, 0.000, 0.214, 0.428, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.214 std_dev=0.214
OP2	B	0, 0.000, 0.232, 0.465, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.232 std_dev=0.232
OP1	A	0, 0.000, 0.273, 0.546, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.273 std_dev=0.273
C3'	A	0, 0.000, 0.292, 0.583, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.292 std_dev=0.292
C4'	A	0, 0.000, 0.306, 0.612, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.306 std_dev=0.306
O4'	B	0, 0.000, 0.348, 0.695, 0.695 max_d=0.695 avg_d=0.348 std_dev=0.348
P	A	0, 0.000, 0.357, 0.714, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.357 std_dev=0.357
C6	B	0, 0.000, 0.376, 0.752, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.376 std_dev=0.376
C3'	B	0, 0.000, 0.406, 0.812, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.406 std_dev=0.406
C5'	A	0, 0.000, 0.445, 0.890, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.445 std_dev=0.445
C5	B	0, 0.000, 0.470, 0.941, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.470 std_dev=0.470
O2'	A	0, 0.000, 0.503, 1.006, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.503 std_dev=0.503
O5'	A	0, 0.000, 0.505, 1.010, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.505 std_dev=0.505
O3'	B	0, 0.000, 0.515, 1.030, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.515 std_dev=0.515
C1'	B	0, 0.000, 0.540, 1.080, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.540 std_dev=0.540
N1	B	0, 0.000, 0.553, 1.105, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.553 std_dev=0.553
OP2	A	0, 0.000, 0.567, 1.134, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.567 std_dev=0.567
C2'	B	0, 0.000, 0.579, 1.159, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.579 std_dev=0.579
O2'	B	0, 0.000, 0.667, 1.335, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.667 std_dev=0.667
C4	B	0, 0.000, 0.679, 1.357, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.679 std_dev=0.679
N4	B	0, 0.000, 0.756, 1.512, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.756 std_dev=0.756
C2	B	0, 0.000, 0.850, 1.701, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.850 std_dev=0.850
O3'	A	0, 0.000, 0.860, 1.720, 1.720 max_d=1.720 avg_d=0.860 std_dev=0.860
N3	B	0, 0.000, 0.884, 1.768, 1.768 max_d=1.768 avg_d=0.884 std_dev=0.884
O2	B	0, 0.000, 1.089, 2.178, 2.178 max_d=2.178 avg_d=1.089 std_dev=1.089

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.26	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00
C2	0.03	0.00	0.06	0.12	0.01	0.18	0.00	0.30	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.06	0.08	0.29	0.01	0.05	0.24	0.17
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.02	0.07	0.02	0.08	0.03	0.07	0.05	0.06	0.05	0.05	0.00	0.11	0.02	0.03	0.09	0.08	0.03	0.03
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.02	0.10	0.14	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.04	0.11	0.09	0.11
C4	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.10	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.13	0.05	0.17	0.01	0.05	0.12	0.07
C4'	0.00	0.18	0.02	0.01	0.10	0.00	0.10	0.01	0.14	0.03	0.18	0.19	0.15	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.13	0.05	0.06	0.07
C5	0.00	0.00	0.07	0.03	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.18	0.06	0.21	0.01	0.04	0.16	0.10
C5'	0.04	0.30	0.02	0.03	0.20	0.01	0.21	0.00	0.26	0.10	0.31	0.31	0.25	0.17	0.11	0.02	0.10	0.00	0.01	0.26	0.05	0.02	0.02
C6	0.00	0.01	0.08	0.05	0.00	0.14	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.25	0.12	0.07	0.27	0.00	0.00	0.24	0.15
C8	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.32	0.02	0.08	0.03	0.11	0.04	0.01
N1	0.03	0.00	0.07	0.10	0.01	0.18	0.01	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.24	0.01	0.09	0.32	0.01	0.06	0.29	0.20
N2	0.04	0.00	0.05	0.14	0.01	0.19	0.00	0.31	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.16	0.08	0.31	0.01	0.12	0.28	0.21
N3	0.03	0.00	0.06	0.10	0.00	0.15	0.01	0.25	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.19	0.02	0.06	0.21	0.02	0.01	0.15	0.10
N7	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.27	0.05	0.16	0.03	0.07	0.12	0.06
N9	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.24	0.02	0.08	0.02	0.09	0.04	0.01
O2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.19	0.02	0.21	0.02	0.25	0.09	0.24	0.22	0.19	0.16	0.11	0.00	0.10	0.03	0.01	0.27	0.09	0.00	0.01
O3'	0.26	0.06	0.11	0.00	0.13	0.01	0.18	0.10	0.12	0.32	0.01	0.16	0.02	0.27	0.24	0.10	0.00	0.14	0.12	0.16	0.31	0.22	0.29
O4'	0.01	0.08	0.02	0.02	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.09	0.08	0.06	0.05	0.02	0.03	0.14	0.00	0.01	0.06	0.10	0.01	0.03
O5'	0.02	0.29	0.03	0.05	0.17	0.02	0.21	0.01	0.27	0.08	0.32	0.31	0.21	0.16	0.08	0.01	0.12	0.01	0.00	0.28	0.02	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01	0.13	0.01	0.26	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.27	0.16	0.06	0.28	0.00	0.02	0.27	0.17
OP1	0.07	0.05	0.08	0.11	0.05	0.05	0.04	0.05	0.00	0.11	0.06	0.12	0.01	0.07	0.09	0.09	0.31	0.10	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.01	0.24	0.03	0.09	0.12	0.06	0.16	0.02	0.24	0.04	0.29	0.28	0.15	0.12	0.04	0.00	0.22	0.01	0.02	0.27	0.00	0.00	0.00
P	0.00	0.17	0.03	0.11	0.07	0.07	0.10	0.02	0.15	0.01	0.20	0.21	0.10	0.06	0.01	0.01	0.29	0.03	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.11	0.04	0.04	0.21	0.03	0.22	0.03	0.15	0.11	0.15	0.27	0.09	0.04	0.05	0.05	0.04	0.06	0.11	0.10
C2	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.07	0.05	0.00	0.10	0.03	0.07	0.09	0.17	0.13
C2'	0.06	0.14	0.03	0.01	0.25	0.01	0.23	0.07	0.15	0.11	0.19	0.33	0.11	0.03	0.02	0.03	0.07	0.11	0.13	0.14
C3'	0.12	0.17	0.09	0.08	0.23	0.07	0.22	0.02	0.16	0.15	0.20	0.28	0.16	0.10	0.09	0.11	0.01	0.05	0.04	0.00
C4	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.11	0.02	0.07	0.02	0.01	0.13	0.04	0.00	0.08	0.00	0.04	0.07	0.15	0.11
C4'	0.13	0.19	0.11	0.09	0.24	0.08	0.21	0.02	0.16	0.16	0.22	0.29	0.19	0.11	0.10	0.11	0.00	0.03	0.03	0.01
C5	0.07	0.12	0.04	0.02	0.05	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.12	0.01	0.16	0.04	0.09	0.05	0.04	0.06	0.16	0.10
C5'	0.11	0.18	0.08	0.06	0.22	0.06	0.17	0.00	0.12	0.14	0.21	0.28	0.18	0.09	0.07	0.10	0.03	0.01	0.02	0.04
C6	0.10	0.18	0.05	0.02	0.12	0.01	0.04	0.02	0.04	0.11	0.20	0.11	0.23	0.06	0.10	0.07	0.04	0.06	0.16	0.10
C8	0.02	0.04	0.02	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.08	0.00	0.02	0.11	0.08	0.02	0.06	0.01	0.03	0.08	0.17	0.10
N1	0.07	0.13	0.03	0.02	0.08	0.02	0.02	0.04	0.03	0.08	0.14	0.06	0.16	0.04	0.10	0.06	0.06	0.08	0.17	0.12
N2	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.00	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.09	0.02	0.02	0.10	0.02	0.07	0.09	0.16	0.13
N3	0.02	0.04	0.03	0.04	0.12	0.01	0.12	0.04	0.07	0.04	0.07	0.18	0.01	0.03	0.09	0.00	0.06	0.09	0.16	0.13
N7	0.09	0.16	0.06	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.15	0.03	0.20	0.07	0.07	0.05	0.03	0.07	0.17	0.10
N9	0.02	0.03	0.01	0.03	0.13	0.01	0.17	0.03	0.11	0.05	0.06	0.19	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.08	0.16	0.11
O2'	0.05	0.05	0.07	0.09	0.18	0.13	0.16	0.19	0.07	0.02	0.12	0.28	0.02	0.07	0.08	0.09	0.17	0.24	0.25	0.28
O3'	0.43	0.42	0.43	0.44	0.41	0.43	0.43	0.40	0.44	0.43	0.41	0.39	0.43	0.44	0.46	0.44	0.40	0.48	0.50	0.42
O4'	0.09	0.16	0.07	0.06	0.24	0.03	0.22	0.03	0.14	0.13	0.20	0.30	0.15	0.07	0.07	0.06	0.06	0.06	0.07	0.09
O5'	0.16	0.24	0.14	0.11	0.25	0.10	0.16	0.03	0.13	0.18	0.27	0.29	0.25	0.15	0.12	0.13	0.02	0.01	0.01	0.01
O6	0.13	0.27	0.08	0.02	0.20	0.01	0.08	0.00	0.07	0.15	0.30	0.20	0.32	0.09	0.12	0.09	0.02	0.03	0.14	0.08
OP1	0.31	0.43	0.32	0.28	0.43	0.22	0.30	0.12	0.27	0.34	0.47	0.50	0.45	0.33	0.30	0.24	0.07	0.04	0.03	0.02
OP2	0.22	0.33	0.22	0.18	0.26	0.14	0.11	0.05	0.12	0.22	0.36	0.27	0.38	0.23	0.20	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01
P	0.21	0.33	0.21	0.17	0.31	0.12	0.17	0.03	0.15	0.23	0.37	0.37	0.36	0.22	0.18	0.15	0.02	0.01	0.01	0.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.03	0.02
C2	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.02
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.03	0.02
C3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.05	0.04
C4	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.01	0.03	0.09	0.05
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.07	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.11	0.01	0.02	0.08	0.14	0.09
C5'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.05	0.09	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.01	0.05	0.12	0.08
N1	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.06	0.04
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02
N4	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.09	0.01	0.00	0.06	0.12	0.07
O2	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.04	0.03	0.04	0.06	0.01	0.01
O2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.02	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01	0.08	0.01	0.01
O3'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.11	0.04	0.02	0.09	0.04	0.02	0.00	0.00	0.03	0.16	0.05	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06
O5'	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.04	0.11	0.14	0.03	0.07	0.08	0.06	0.05	0.02	0.02	0.06	0.06	0.08	0.16	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.03	0.03	0.03	0.05	0.09	0.02	0.14	0.01	0.12	0.06	0.04	0.12	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.02	0.09	0.01	0.08	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00